G92729 (LOC107716350,LOC107673932,LOC107707381,LOC107588636,LOC107585302)


Basic Information

Item Value
gene id G92729
gene name LOC107716350,LOC107673932,LOC107707381,LOC107588636,LOC107585302
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056711.1
NCBI id CM032080.1
chromosome length 25085836
location 10820942 ~ 10947919 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU137260
ttttttttttttttttttttttttttttTTTTcagatatacacacattttattcaattaagaAAAAGATTAATATTGATTCATAACAAAACTCACGGTACAACTCGCAAAACTCTTCCACTTATAGAAATTTTGGTTTATGGTACATGAAACAACATTCCTTGAAAATGTGCCCATTAAGGCTCCCAGACATCAAAGGTCAacactgtataaataattaaGCTGAAAAACGTAGTGTCAGTTTGTGTTTCTTCTTAAACAtgggttttaaatatataaagcatttggctttttttttttttggaaaatgcgtACCAATATCAACCTATCAAacatttatgagaaaaaaatataggGAGCTACAGATGGTCATTCATTCGTCACAGAAGAGCCAAGAAAACAGCCCACCCTGAATGACTTAAAACTTTATaagtttgaattaatttttcTGATGCTATACATCATCTTTGTGTTTTCAATTTTGAGTCCAACCcaaaatctgtatatatatatatagagagagagaggcctaTTTTATAAGGCAAAGGGCAAGATTCTATCTGATGAAGACATTTGAATATTCCAATCCTTGGATTATATCATGAGGACAAATAAATGTCCTAGTAAGTGTACACCTTAACACTTTTACCCCAACAgacaaattttttttcaaaatgtttttggttaaatatgttttataatacttGAAAAAATCCTTTCATACttcaatatatttgtaattaaaaaagtttaccGTATAGGCCTACCTGGTCATTTTGACAGGTACTTTTTTTACAGGACCACAAGAGTCCAAGGAAACTTGATAGAGCACTATGCaacatggaaaataataattaagaaattcattttattgatgAATTGCTCACTCCTCATTACAAGAGTCACTAATCTGATGACCTTTGCAGGCATatagactaaaaataaaattaaataataattaaaattaattttaaatattttgatcaatAATGGCAATGTATTTTGATGTATACTGTCACTACTAACAAACCTATTCTAAACAGAACTAACCAGAGTTATATACGTCAACATTTTAGGTCAACTGAGACCAGTTTTCCCGTGGACTTTTCTATGGCACAGTCTTCTTTGACTATATAtgctataaataacttttttggtggtcgttaattttttttcccagtttcaaatggaaaaaaagcttttatcttttaagaaaatctaaaatagtGCCAGTGTGTTATTAGCGTGTCATCTTATTTTTACAGCTTGTATAGAACCATAGCAGCAACTGCTTAGCCAGAGAAAACATGGGTCAACCTGTTCATGAGAGAGGGCTGTAATGAGGCACATGGCTGTTTAAACTAGTGAAGTACCATCTCTTGCCTCTTGAGGCAGACTGAGATATAATTATCCTCCCAATCTATGGCCTTTACCATCTCTGAAAATAATCTCCCGCAGTCCGGAACATGTCATGAAAAGGAAAGAATTCTTAAGAACACATATTAGTCCAACACACTCTAGAGTTTCTTATTTCATATGAGAGTGTATATAGATCAATCTTCGTTGCACACTAAGAAATGCTGCAAATGCTTTTGTATACGTTgccttataattttttttgtttctttgtttttttgtcatatacACTGAATAAATCAACCACTTTTGTGGCTGCCATCGCCGGTGCGTTGAACGCGGGCTATGATAGTCTCATGAGTTACCCTCCTGCAATCCTTGGCCAGTCCAAAGAAGCACATGAGATCTATAAATGCCTTGGTCAGATTCAGCCGACTGCCAAACTCGCTTGCAGCGTAATCATGGGGGAATGTGTGATGATAGTTGTGAAATCCTTCACctgaaattaaatcattaaatcatatattttcCAATAAGTACATACaaaattatctttatttaatttttttttttactttccagTCATCACTAatcctaaaaaataaattaaataaatggtttaataatactataaatactataatactaaaaataataatactataaaatatactataatattaaaaaattaattaataatactaatactatatatatatatacacaaacacccacacacacacgcattttaatttatgcttttgtatttttttcaatatgtcaaataaatgtgcaaactAGAATATTAGAACATTTCCAACAAGACTGacttaattaatattaagcTGTGAAAGAAAAGACATTGTTCTTACCGATGGCGCTGAAGGCGACAAACTTGTTCTCTCTGGGATTGATGTTGTGGTCATAAGGCCTCATTCCCCACATGTGAGCTGCACTGTTGACCAGCCAGGTCGCATTAAGGCACACAGTGTATCTCAACAGGCAAGGAACTAAGTAACCGGTCAAAAGACTCTCTTCCCAAAAGAACCAAGGTACAAATGTGGGAATGAGAAAGCACATCACAACCACGGATAACTTGTAATGCCTATGGACAGAAAAATGAAagattaaaacaacaaatgcaatAGCCGTTTCATCACTGTTTTACACTTGATTGTCACGTGTGCTTCTCTGTATGTCATTGGTTTTCTGAACGAACAATGGCTGTTAAACCTCAGCTGAAACACAACATACAGTTCGAAGTGCTTATTAACCAGCTATTTTCCTATTATCTGATCTGGCAATTCTATGAAACGTGTTTTTATAGCTTATCAAAACGCTTAGGACATTTGCTGGAATTCATTCAAAGTGATGAGAAGGGATATTGATTATTCCACATTAGCTAGTACAAAAATGTGGGGCCTGGTTCAGATGAATAAACCTGAATCAAACTTTGAATCAAACCCTGTATTGGTAAGGTTTGATCCGGTAAATGAATACATTGTTCAGCGTCACCGTATCGAGTTTTGATTTATCAGttgtaattttgtgtttatatattcatttatttggggTCATTCAGgtttgtaaaacatttctgaatgaagcctttttaacgtttatttaataaaaatcacagtaaaattgtagttaaatattgttacaatttaaatgaaccattttctattgtaatatttgttgttgttttttttagcgtaataattaataattgtttataatgcctttaaaatgtcacatgacCTTTTAGAATATATTCTGATTTTGTGCTctttttatcaatattaaaaacagtagtgctgcttaatattttgtggaaaaatgttatattcCTTAGGACTGTTTGATGAACGGAAAGCTCaaatgaacagtatttatttaaaatgttaaatattctgTAACGATAcgaatgtctttactgtaattTCTGATCAAACTCATGCATtcttactgtattaaaaaaaattcttatagGCCCCAAACATTTATACAGCAGTGTAGGTTAAGAAGATcaaaactgaatataaaatatcacaatttccCACTGACCTCCTCTGAAACATCACAACCCCATCCGCTTTTAGATCAGTGAGCTCTAGTTTGCGTCCTTTCTCAATAACTTCTGGGTGTTTGCGGACCAGCAGCCAGCCGATGTGAGCAAAGAAGAATCCTCTGCGGGCATTGTGTGGGTCCGCATGAGTCTCTGAAAACTTGTGATGGACACGATGGTCTCTGGCCCACTCATAGATATCATTCtaaatggatatatatatacatatacatcattattgtaattgtatatTGTATGAGTCATACTCTAAGTTGAGTacaagagagtgtgtgtgtaatatatatatatatatatatatatatataagtgtaaaTAGTCATTAGGCAGATGTTTTCGTGCAAGTGTCTTACACTACACTTATTACAGGGACAATCCCATGTGGATACCCTAAGGTTAATTGCTTTGTTCAAGGGCACTATGGCTATCGCACTCGGCTCTTGTGAGGTTTGAACCTATTAGCCCAGATCTTTAGCCACTATCTGAGCTGCATTCAGGTTTACTGCATTAATGCGGAGTTTTACCTGAAAAGCCATGGAGTTTGCGATTGCTAGGAAGATTCGTAACGGCAGCGAGGCTTTGTAAGACCTGTGGCTCCAAAGGCGATGGGCGCCGGCGGTTATTCCTAGAGCGCTTAGCATGAAACACACTCCCGCTGTCACGTTAAGagagaaaatagaaaacaaattagTCTGAACTACACACAGCTTCTATAGCGTTTAACGGTGTGTGCGCCCTTGATTCGCTCCATGAGAGGACAAAATGTCTCGCTGTGTGTTGTCAGACGAGGCTGCAAGGGATGTGGGATACCAGGCCACAGACTGTGAAGAAGGGCACACTGTTATGACCCGGCTCAATTTACAATGGAGAGCCTATTTCAACAGCAATTGTTCTTTGTTCAACAGGGTGCAATATTATGCGGCGCTGTGATGCCAAAAATGTGCACAACAGTGGAGCAGTTATAGCTTTTGGTAGGATTTCAAGTTATTCACGGGACTGTCTCGCTACCACTCACAGACACGCGCACATGCTTACCAAACGATTTTAGCATTGGTCTACATAACAAATTTAGACGAGGCCACGTGGCCTGACATATTTTGGCTTTTGGAACGAAAACGTGACACAGTAACTGATAATATCTGAGAATAGTAATCGCAACTTTGAATCTGTAAGAGAAGGACACCTCCGCCCTTACGAGAGGAAATACCTGCAGAACAAGCAAGAGAAACCAGGGAGCGTTGCTGAGTTTAACCACATTAATGCTTCACATTAGCAATAGGGGTTAAATCATATATAACCATTATCtgcatgaggaaaaaaagagctaGGAAAGTTAAATGGCATGTTTGATTCATAATCGCATCGTGGATATATAAGATCTATACTAATGAATCGATTATCAATATATGTCTACAttctaaatgtgaaattaactaacaactttatattttattaaaattgctgTGTTCTATTCACAGTTGGTCTGAATCAAATGTACACAACACGTTTACCATCTTGAGTCAAGATGAAAAGAAATGGTTACGGTGGGGATCGTTCAGGCCTATAAGGAGactatattataaaatgcatgacCGTGttcatcatctatctatccacacacacacacacacat

Function

NR:

description
PREDICTED: acyl-CoA desaturase-like isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU137260 True 5074 lncRNA 0.35 3 10820942 10947919

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
chst3a chst3a,LOC107708342,LOC107588701,LOC107673894,LOC107683746,LOC107585362,LOC107716304 coding upstream 131504 10681748 ~ 10689438 (+)
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parga parg,LOC107716337,LOC107673942,LOC107585315,LOC107708050,LOC107683745 coding upstream 209451 10584381 ~ 10611491 (+)
pald1b pald1b,LOC107588630,LOC107707320,LOC107668836,LOC107716354,LOC107673876 coding downstream 21424 10969343 ~ 10981784 (+)
qrfpra LOC107668764,LOC107673889,LOC107716286,LOC107564357,LOC107564360,LOC107588699 coding downstream 38166 10986085 ~ 10989734 (+)
rps24 rps24,LOC107673958 coding downstream 42643 10990562 ~ 10993312 (+)
zmiz1a zmiz1a,LOC107588626,LOC108443181 coding downstream 86028 11033947 ~ 11146626 (+)
ppifa ppifa,LOC107668776,LOC107588732,LOC107564349,LOC107673899,LOC108442288,LOC108263515 coding downstream 202077 11149996 ~ 11152447 (+)
LOC122357062 NA non-coding upstream 57251 10753233 ~ 10763691 (+)
G92675 NA non-coding upstream 118839 10657508 ~ 10702103 (+)
G92671 slc18a3,slc18a3a,LOC107708354,LOC107683739,LOC107716340,LOC108442244 non-coding upstream 175705 10642556 ~ 10645237 (+)
G92563 NA non-coding upstream 511166 10309237 ~ 10309776 (+)
G92552 NA non-coding upstream 544764 10275584 ~ 10276178 (+)
G92731 NA non-coding downstream 11501 10959420 ~ 10961696 (+)
G92746 NA non-coding downstream 35021 10982940 ~ 10983279 (+)
G92748 NA non-coding downstream 36319 10984238 ~ 10984645 (+)
LOC122356274 NA non-coding downstream 56991 11004910 ~ 11022056 (+)
G92767 NA non-coding downstream 254735 11202654 ~ 11203684 (+)
ly6pge si:ch73-28h20.1,LOC107716297,LOC107673896,LOC107585320,LOC105890420,LOC106578825 other upstream 400516 10416240 ~ 10420426 (+)
LOC122356813 adka,LOC107743514,LOC107666490,LOC107601874,LOC107655429,LOC107725426,LOC100196663 other upstream 571217 10205113 ~ 10249725 (+)
atoh7 atoh7,LOC107726941,LOC107601814,LOC107666420,LOC107743508,LOC107655428,LOC108426756 other upstream 1386337 9430178 ~ 9434605 (+)
zgc:153981 zgc:153981,LOC107725455,LOC107666543,LOC107601871,LOC107671561,LOC107552921,LOC108426808 other upstream 1656828 9161517 ~ 9164114 (+)
spef1 zgc:66426,LOC107601866,LOC107725472,LOC107666492,LOC107743614 other upstream 1731821 9080848 ~ 9089121 (+)
eif4ebp2 eif4ebp2,LOC107668794,LOC107588631,LOC107716353,LOC107564345,LOC107707337,LOC107673927 other downstream 16936 10964855 ~ 10968914 (+)
G92772 LOC107588620,LOC107707271,LOC107707282 other downstream 265607 11213526 ~ 11218175 (+)
cxcl12a cxcl12a,LOC107588617,LOC107707253,LOC107548639,LOC107673912,LOC107757152 other downstream 307675 11255594 ~ 11262620 (+)
arhgap22 arhgap22,LOC107668831,LOC107708000,LOC107673870,LOC107588697,LOC108443345 other downstream 441466 11389385 ~ 11413515 (+)
lrrc9 lrrc9,LOC107707153,LOC107588606,LOC107668786,LOC107757140,LOC107668789,LOC107708221,LOC107588691,LOC107673872,LOC107757098 other downstream 623741 11571660 ~ 11592600 (+)

Expression


Co-expression Network