G93592


Basic Information

Item Value
gene id G93592
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056711.1
NCBI id CM032080.1
chromosome length 25085836
location 14031382 ~ 14161320 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU138490
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>TU138492
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>TU138494
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU138490 False 2068 lncRNA 0.33 2 14127864 14161320
TU138492 False 4076 lncRNA 0.38 4 14031382 14161320
TU138494 True 4535 lncRNA 0.38 2 14031382 14130370

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122356869 ttc9,LOC107602957,LOC107553202,LOC107654962,LOC107739879 coding upstream 15512 14012249 ~ 14015870 (+)
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LOC122356401 agpat4,LOC107739871,LOC107553196 coding upstream 172577 13852587 ~ 13858805 (+)
LOC122356827 LOC107736840,LOC107664175,LOC107568695,LOC107747274 coding upstream 230143 13798911 ~ 13801239 (+)
cnih1 cnih1,LOC107736564,LOC107683416,LOC107553211,LOC106611446 coding downstream 29862 14191182 ~ 14196252 (+)
LOC122356518 LOC107705440,LOC107654948,LOC107736540,LOC107682154,LOC100538248 coding downstream 39530 14200850 ~ 14209385 (+)
dmac2l atp5s,LOC107705443,LOC107602971,LOC107654946,LOC107736634,LOC107553216 coding downstream 71054 14232374 ~ 14236033 (+)
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tmx1 tmx1,LOC107654918,LOC107602932,LOC107736746,LOC107683560,LOC107705366 coding downstream 178571 14339891 ~ 14344861 (+)
G93659 LOC107654964,LOC107680818,LOC107602919,LOC107705424,LOC107553200,LOC107739876 non-coding upstream 80777 13945330 ~ 13950605 (+)
G93643 NA non-coding upstream 101095 13761052 ~ 13930287 (+)
G93649 NA non-coding upstream 168722 13862051 ~ 13862660 (+)
G93512 NA non-coding upstream 683344 13346861 ~ 13348038 (+)
LOC122357146 NA non-coding upstream 814625 13216658 ~ 13216757 (+)
G93723 NA non-coding downstream 63663 14224983 ~ 14227711 (+)
G93733 NA non-coding downstream 82088 14243408 ~ 14245542 (+)
G93736 NA non-coding downstream 87445 14248765 ~ 14249522 (+)
G93743 NA non-coding downstream 115295 14276615 ~ 14276875 (+)
G93745 sav1,LOC107705447,LOC107654943,LOC107736858,LOC107602931,LOC107682971,LOC107553191 non-coding downstream 121449 14282769 ~ 14284777 (+)
G93613 NA other upstream 121779 13739607 ~ 13909603 (+)
LOC122356417 mfsd2aa,LOC107654966,LOC107705421,LOC107602949,LOC107739898 other upstream 270648 13749135 ~ 13760734 (+)
tasp1 tasp1,LOC107705405,LOC107654993,LOC107600565,LOC107662811,LOC107585512,LOC107739887 other upstream 872942 13134473 ~ 13158440 (+)
mgme1 mgme1,LOC107675546,LOC107654997,LOC107585523 other upstream 1442384 12586886 ~ 12588998 (+)
G93296 rrbp1 other upstream 1456170 12571631 ~ 12575212 (+)
gmfb gmfb,LOC107705437,LOC107553212,LOC107602964,LOC102779377 other downstream 23995 14185315 ~ 14188993 (+)
frmd6 frmd6,LOC107654939,LOC107683538,LOC107736757,LOC107726597 other downstream 192795 14354115 ~ 14369557 (+)
LOC122357077 zgc:153049,LOC107747287,LOC107736842,LOC107665562,LOC107664273,LOC107573610,LOC107553186 other downstream 945138 15106458 ~ 15226722 (+)
fam135a LOC107747270,LOC107665594,LOC107736843,LOC107664195,LOC107564672 other downstream 1093754 15255074 ~ 15275234 (+)
tarbp1 tarbp1,si:dkey-85a20.4,LOC107736847,LOC107564676,LOC107683215 other downstream 1134529 15295849 ~ 15314656 (+)

Expression


Co-expression Network