G94176



Basic Information


Item Value
gene id G94176
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056711.1
NCBI id CM032080.1
chromosome length 25085836
location 15774767 ~ 15788230 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>TU139336
TTTGAATCAAATCTTAATTTATTGGGAGGTCAATGGTACTTCTCATTCTGAAATACCACATCAAGACTTAATAGAACATTTGATATTCtctttatgtgtatatatatatatatatatgtatgttatataATCAGAGCATCGTTTGTAAAGTCATACACAATTCATCAGGTGTTTTCAAATAGAATTCTTGTAAACTCTGTAGAAACATATATCTATCCTTCGGCCAACTCACTGTACAGAGAGCGAAAGCTGGAGACGATTTAGCAAATACCCGCAGTTTAAGGCTTAAATATACACGTCATTGAATGTGTTGTCCGACTCAATCAGAGTGGATGTGTTTGTTTGAAGGGGTTGATCCAGACGTCAACATGCGTCACTCGGCCCACCCTGCAATGCAGCACGATGACGTCAAAAAGTGCTGCCCCCTCTcctttccctctttttttctctgtcagCATGCGCTCTCCGTACAGTGACTTTAGCTCACAGTATTGCACAACGCAAAGTGTCCATGTGACCTGAAAGCAAGCGGGCACATTCAGTTCGCTCCAGATCATCAAGATGCAAAGCAACTTTATAAAAAGGGCTAGCTTGGTTATTGCTATTAAATATTCGGGATAAATATCAAGGGCAAAGTAACAGACACTCAGTGGTTTCCTGCCTGAGTCTTTGTGCTTTCTGTGTTCGACTTCCTGGTGGTACGGTAGGTCACTCTTAGCAAAAGAGGCAAAAAAGTGTCTCGCTTGTGGCCCAACAGTCTCTACATATCACCAGTGTCTGCTGCGTGCATGCAGGAGAGAGGTATTAACTCGACATACTCTGTAAAAAACAGCCTTTCATGCAAAACACATCCTATGTATAATCCCCTGGCATAATGTAATCATGTGACCTGTTGTTGGCAGGGATGAGCTGATTGGTTAGTTTGTCATGAACACATGCTGGGAAAGTCATGGCAGTGTACCAGTGatcagatatttttttctgatgctTGAGTGATCATGTACTTCCGGTCAagagtttgaggtcagtaagatttttttgtttatgaaaaaagtctcttatactcaatacatttatttgattgaaaatacagtaaaacgcCAATACTGTCAAATgtcattataaattaaaatagctattttctaTCTAAATAtgctttgaaatgtaatttatttctgtgatgcaaagctgaattttcagcttaatttctccagtcttcagtgccacagGATCCTTTTTTCTGAAATCCgtcatattattaattactctTATTAAAGTtctgccttttttaaatattattagatgTTCAAATAagctatttgtttaaaatatgttttttaaaatgacataaatatctCTTTTTTAATCAGTATAAAGCATCctttctaaataaaagtgttaattgcttataaaaaaaatcttaccatcttcaaacttttgaatggtggtATGAACGCCATTTTAAAAAGGCTCTAATTTACAGAAGGTATGAAGCTTGAAGATGAAATTCATGTAGTGGCATGCTTATGAAACGTGGATGAGATTTTCAGCTTGTTGCAGTAAATTATTAGGGCTCAAAACAAAATACTATATAGGcttcttgcatgttttggaTATTgcttatgatttttatatatatttatatctgaGGTGACGTTTTAGTATCAATGCTTCAAGTTTGTTCAAGTTATGGCTTGTGCATATCCTAACTATTTCATACAGTAAACACAATGCTGTtctagtaataacaataataacactgcTGTTTGAGAAAAGCATGCTGATATACTAAATGTCAttatcattaaacaaataattatattgtcaaATATATGTGCTTGGACCATTAGCACTCCCATCTCgggctatttttaaaaactattgaaTATGGCCTAAAAtagcttaaaagaaaaaagccatATCTCTTTGTACCCTGTGCTCTCAGCTGAAAGGAAGTGCAAAAATCGAAGCGAAATGATAAGAAATCAACATAAGACATTCATACTTTGAACAcaggaaatagaaaaaaaaagattctgacAGCTTTTACCTAATATAGGTATTTTTCTCTGTCAACACCTCGGCTATTCAAcagaatatgaaataaatgggTCTGATCTGTCTCAAAGTGCGCTGATATTAAGCTCCAGGCACAGCCTGACAAATACCTTACTTAATATGATAGAAAATCACACGATAAACACTTTGTTTCTACTGAAAGATGACCATACTAAAGGTTCTGCCCTCTCATTGGTCAAACGGTTGGCTTCGGGTCTCCAGGCTTGTGCTTGCTGGCTTTGCCcgggggtcagaggtcagaatGTCATTGCCACAGTGACTGTAGATGACATCATCATAAACCGCCATCAAAATTGTAGCGTATCAACGGTTACGTAGCATCTcgtcaatgaaaaaaacaaacaaaaaaaaacatgtgtcTTGCTGCATGTTGTATGTTTCAGGTTTGTTGTAACAGTATTTTCCTGAAGGCAAGGTTTTCTGATGCTACATCTGTTGTGGTGGTCTTTGTACACTGGGTTGTGCTTTCTCTCACTCGGGATCCAGAGGAAGGCTGGAGAAGATTTCACATTTGTGGGAGAAGCAAGAGATGAGCAAACCCATGCAATGAGTGCTAGGTCTTCACCTGCGATTGTTCAGGATTGTCTTCCAAAGGTTTATCTCCATCACGagacttctttctttttttTGATGCTGAGACAGAAGCTCTTTGCGGTGgaacaaagcattttttgttaATCATCAGTCCGCCAGATTTGGAATATCATTTCAGGCGAAGAAGATTAAATGCATAATCCTCAACCTTTGGATAGAGAGAACCTAAGGGACGGAAGCCTCTCTCGCGCCGTGGTCTCCATGGCAGCGGCACACACGCCGAGTGAAGTGAGGGATTCTGCAGGAGTCAGGTGGAGAGCAAGGGCAATGCAGCACTCGGCTCGATGCACCTCAAAGCTGATGTTCAG
>TU139337
TTTGAATCAAATCTTAATTTATTGGGAGGTCAATGGTACTTCTCATTCTGAAATACCACATCAAGACTTAATAGAACATTTGATATTCtctttatgtgtatatatataATCAGAGCATCGTTTGTAAAGTCATACACAATTCATCAGGTGTTTTCAAATAGAATTCTTGTAAACTCTGTAGAAACATATATCTATCCTTCGGCCAACTCACTGTACAGAGAGCGAAAGCTGGAGACGATTTAGCAAATACCCGCAGTTTAAGGCTTAAATATACACGTCATTGAATGTGTTGTCCGACTCAATCAGAGTGGATGTGTTTGTTTGAAGGGGTTGATCCAGACGTCAACATGCGTCACTCGGCCCACCCTGCAATGCAGCACGATGACGTCAAAAAGTGCTGCCCCCTCTcctttccctctttttttctctgtcagCATGCGCTCTCCGTACAGTGACTTTAGCTCACAGTATTGCACAACGCAAAGTGTCCATGTGACCTGAAAGCAAGCGGGCACATTCAGTTCGCTCCAGATCATCAAGATGCAAAGCAACTTTATAAAAAGGGCTAGCTTGGTTATTGCTATTAAATATTCGGGATAAATATCAAGGGCAAAGTAACAGACACTCAGTGGTTTCCTGCCTGAGTCTTTGTGCTTTCTGTGTTCGACTTCCTGGTGGTACGGTAGGTCACTCTTAGCAAAAGAGGCAAAAAAGTGTCTCGCTTGTGGCCCAACAGTCTCTACATATCACCAGTGTCTGCTGCGTGCATGCAGGAGAGAGGTATTAACTCGACATACTCTGTAAAAAACAGCCTTTCATGCAAAACACATCCTATGTATAATCCCCTGGCATAATGTAATCATGTGACCTGTTGTTGGCAGGGATGAGCTGATTGGTTAGTTTGTCATGAACACATGCTGGGAAAGTCATGGCAGTGTACCAGTGatcagatatttttttctgatgctTGAGTGATCATGTACTTCCGGTCAagagtttgaggtcagtaagatttttttgtttatgaaaaaagtctcttatactcaatacatttatttgattgaaaatacagtaaaacgcCAATACTGTCAAATgtcattataaattaaaatagctattttctaTCTAAATAtgctttgaaatgtaatttatttctgtgatgcaaagctgaattttcagcttaatttctccagtcttcagtgccacagGATCCTTTTTTCTGAAATCCgtcatattattaattactctTATTAAAGTtctgccttttttaaatattattagatgTTCAAATAagctatttgtttaaaatatgttttttaaaatgacataaatatctCTTTTTTAATCAGTATAAAGCATCctttctaaataaaagtgttaattgcttataaaaaaaatcttaccatcttcaaacttttgaatggtggtATGAACGCCATTTTAAAAAGGCTCTAATTTACAGAAGGTATGAAGCTTGAAGATGAAATTCATGTAGTGGCATGCTTATGAAACGTGGATGAGATTTTCAGCTTGTTGCAGTAAATTATTAGGGCTCAAAACAAAATACTATATAGGcttcttgcatgttttggaTATTgcttatgatttttatatatatttatatctgaGGTGACGTTTTAGTATCAATGCTTCAAGTTTGTTCAAGTTATGGCTTGTGCATATCCTAACTATTTCATACAGTAAACACAATGCTGTtctagtaataacaataataacactgcTGTTTGAGAAAAGCATGCTGATATACTAAATGTCAttatcattaaacaaataattatattgtcaaATATATGTGCTTGGACCATTAGCACTCCCATCTCgggctatttttaaaaactattgaaTATGGCCTAAAAtagcttaaaagaaaaaagccatATCTCTTTGTACCCTGTGCTCTCAGCTGAAAGGAAGTGCAAAAATCGAAGCGAAATGATAAGAAATCAACATAAGACATTCATACTTTGAACAcaggaaatagaaaaaaaaagattctgacAGCTTTTACCTAATATAGGTATTTTTCTCTGTCAACACCTCGGCTATTCAAcagaatatgaaataaatgggTCTGATCTGTCTCAAAGTGCGCTGATATTAAGCTCCAGGCACAGCCTGACAAATACCTTACTTAATATGATAGAAAATCACACGATAAACACTTTGTTTCTACTGAAAGATGACCATACTAAAGGTTCTGCCCTCTCATTGGTCAAACGGTTGGCTTCGGGTCTCCAGGCTTGTGCTTGCTGGCTTTGCCcgggggtcagaggtcagaatGTCATTGCCACAGTGACTGTAGATGACATCATCATAAACCGCCATCAAAATTGTAGCGTATCAACGGTTACGTAGCATCTcgtcaatgaaaaaaacaaacaaaaaaaaacatgtgtcTTGCTGCATGTTGTATGTTTCAGGTTTGTTGTAACAGTATTTTCCTGAAGGCAAGGTTTTCTGATGCTACATCTGTTGTGGTGGTCTTTGTACACTGGGTTGTGCTTTCTCTCACTCGGGATCCAGAGGAAGGCTGGAGAAGATTTCACATTTGTGGGAGAAGCAAGAGATGAGCAAACCCATGCAATGAGTGCTAGGTCTTCACCTGCGATTGTTCAGGATTGTCTTCCAAAGGTTTATCTCCATCACGagacttctttctttttttgttgcctGGAGAGTAGAAAGTGAAACGTAAAATGCCTAGTTTTGAACCGAactgaatatttgaaataaaaaagtatgaataaGCGATGAAATTGTCCGATTTGGTGAAGACGGCGGTTTAGCGAATAGAACAGGTTTCTGGCAGGATTTAAAGTGAGGCGAAATGCTGGTAAAATTCTTGAATTAAATCTGAACTGAAATGAGATTTCAGTAGAATTAAAATCAACTGAACGAAagcatttgtaaaacaaaaattgaaaattaaatattttctacgagtggtgaaaaaataaatgaatatactaaaaagccctttaaagtttttcGGGggtttttagaaatataaaagaacaaataaaatacggattttaaaaaataaaaaataattaattaatataattaatacaaaatgtatttaatattaaatactctgtatttaattaatattgctGATTGTAGAATATTGATTGCAGAATATTAAATTcctgtattaatttatattattgaatatatgtgttttctTATAGAAAAAAGTGGCTactaaatgcatgaatgaaaacaGGAAACATTACCGAACGATGACTGTTGACTAGGCCAGTCAAAAAGCTTTGCCAGAGCAATTTTTTAACAGCATGAATGATTTCCTGATAATGTTTTTCCAGGAACAACAAAAGCTGCCGACCCAGAAATATCTCCTATTTACGTAAATCACATTGTTCTGAGTgacttgtctttttttattaaacagatgTGTGGGCTGCAGTTTGCCTGCCTGGTTGCTAGGAAACAGATGGGAGTTTGAAAATGCCGACTaaaagcaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgcagctGTAAACGCAGGTGTCGTGTCATTACTGGGCAGATTCAGAAATTTGCGATTCAGTCAGGTGCTTGTCAGCTGATACACACTGAGTTTCCGGAGCAGTTTTTTCCCCAGGTTCTCATCCGAGCCGCCCAGAGAGTGAGATCCGATGAGCTGGGATGTGGACAGGTCCGTCTCCATGGCTACGGCCGTTGCATCTGAAATAGATCGGACACACTATGATAACGGGCCACGATCACATGACAAACTGAGCTGGAAAGTCATTGGTtagtttcttctcttctcttctcttctcttctcttctcttctcttctcttctctatACATCCAAACGTCTTGATTCTCGGAGCAGTCATTCCCGTTAACCTCTAGTCATAACAAGCAGAGCTGAAACGGACAGTTCTAGCCTGATGTCAGCATTCCTTTCGCGGGTCGTATAAACAGAGACTGGAGCTCATGCATTTCCTCTCCCTGCAGTCTGTCACACGTCTCGCTCGCTGTCAAACAGAGCAGACCACCACccttcttaaaggaacagtccgGCCAAAAACCAACATTTGTCAGGCCATTACCGAACCTGCATGctgtgttcgtttttttttttttaactacaataACTATATTCTAAAGTCTCGAAGTCGTGTAATTGCttgaaaaactgacaaaaaatgtaaaatgactgagaaagtaataataaaaaaatttcgtTGTGTGCCTATGGAAAGGACACGGGTTTGAAATGGCATGACGGCgaataaataattgtgaaaataaaacaaaataaaataaacaatatttttgcattaaaaaaaagtgcagtttcTGCAGTGATTTATATTCACCTAATGCCCAGTctcttttgatttggtttttaGCAgcttttctattcatttttgggCTTTGCTAGAGTAAACGCTGTACAATGGTGCATACAATTACGTCATGGTATGGTTTCAGAAATCATCTTCAGTTCACCCACCGGTTCCTTCTTTTCTCTCCATGCGATTGTCTCTTATATATGGGGTATCATCCATACGCAGGAACACAGAGTCACTGGGGCTCTTCTGTCCATCTGACTT

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU139336 False 2981 lncRNA 0.38 3 15774767 15788230
TU139337 True 4618 lncRNA 0.37 2 15774767 15779441

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
got1 got1,LOC107665595,LOC107601049,LOC107586067,LOC107702745 coding upstream 1222 15764954 ~ 15773545 (+)
slc25a28 slc25a28,LOC107601050,LOC107747263,LOC107719215,LOC107665596 coding upstream 51024 15714193 ~ 15723743 (+)
golga7bb golga7bb,LOC107728443,LOC107702732,LOC107665585,LOC103368019,LOC108247940 coding upstream 166886 15581868 ~ 15607881 (+)
zgc:172136 LOC107665601,LOC107601056,LOC107747271,LOC107664217,LOC107736845 coding upstream 479573 15278360 ~ 15295194 (+)
adgrb3 adgrb3,LOC107664175,LOC107665593,LOC107736840,LOC107747274 coding upstream 763757 14873915 ~ 15011010 (+)
hpse2 hpse2,LOC107747298,LOC107665577,LOC107702736,LOC107719234,LOC107586094 coding downstream 9203 15797433 ~ 15861462 (+)
ankrd2 LOC107586109,LOC107747258 coding downstream 89284 15877514 ~ 15888102 (+)
prkg1a prkg1a,prkg1b,LOC107747254,LOC107665604,LOC107702750,LOC108263833,LOC108443637,LOC107586071,LOC103355670 coding downstream 128602 15916832 ~ 15966825 (+)
dkk1a LOC107601033,LOC107665569,LOC107747256,LOC107719231,LOC107702737,LOC107586111 coding downstream 180525 15968755 ~ 15971312 (+)
polr1b polr1b coding downstream 504531 16292761 ~ 16302095 (+)
G94175 NA non-coding upstream 372 15773969 ~ 15774395 (+)
G94174 NA non-coding upstream 10193 15764340 ~ 15764574 (+)
G94173 NA non-coding upstream 12800 15761692 ~ 15761967 (+)
G94163 NA non-coding upstream 64613 15707116 ~ 15710154 (+)
G94162 NA non-coding upstream 67789 15701427 ~ 15706978 (+)
LOC122356273 NA non-coding downstream 110641 15898871 ~ 15914946 (+)
LOC122356350 NA non-coding downstream 573442 16361672 ~ 16381076 (+)
G94361 NA non-coding downstream 752955 16541185 ~ 16542938 (+)
G94365 NA non-coding downstream 769606 16557836 ~ 16558137 (+)
G94397 NA non-coding downstream 953237 16741467 ~ 16796842 (+)
LOC122356934 LOC107747267,LOC107665602,LOC107601027 other upstream 456590 15314814 ~ 15318177 (+)
tarbp1 tarbp1,si:dkey-85a20.4,LOC107736847,LOC107564676,LOC107683215 other upstream 460111 15295849 ~ 15314656 (+)
fam135a LOC107747270,LOC107665594,LOC107736843,LOC107664195,LOC107564672 other upstream 499533 15255074 ~ 15275234 (+)
LOC122357077 zgc:153049,LOC107747287,LOC107736842,LOC107665562,LOC107664273,LOC107573610,LOC107553186 other upstream 548045 15106458 ~ 15226722 (+)
frmd6 frmd6,LOC107654939,LOC107683538,LOC107736757,LOC107726597 other upstream 1405210 14354115 ~ 14369557 (+)
hps1 hps1,LOC107747297,LOC107665607,LOC107719211,LOC107702747,LOC107586068 other downstream 76609 15864839 ~ 15871816 (+)
G94186 st3gal7,LOC107665608,LOC107601047,LOC107747259 other downstream 85214 15873444 ~ 15877422 (+)
nkx1.2la nkx1-2,nkx1.2la,LOC107601042,LOC107702751,LOC107665606,LOC107586110,LOC107719237 other downstream 113310 15901540 ~ 15904909 (+)
G94324 NA other downstream 727597 16515827 ~ 16518826 (+)
G94378 capn1a,LOC107549131,LOC107676389,LOC107586085,LOC107679188,LOC107734280 other downstream 809551 16597781 ~ 16605383 (+)

Expression



Co-expression Network