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Basic Information


Item Value
gene id si:ch211-223a10.1
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gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056711.1
NCBI id CM032080.1
chromosome length 25085836
location 11379144 ~ 11388193 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043254841.1
tACCTGCAGGCTTTTCTGACACTCTCTGCTGTATATGAGAGACAAGAGCTTCTCCAACCTGCAGTGCCAAGCCCTGAAGGTTCAGATCTTCAAGGACACTGCTGCTCTCCGAGACCTTATCAAGAGCTTGTTAACAGTGAACGCACAGCATGATTAGCACTTACCacaaagaagaaacaaatacaACTAATCAGAAGCTCTGTGGGACTTTCCAAGTGGATGTGGTGCCTTACTCCTTACTCTATGGTTGGTTAAATCCCAGTAGGAATCCAGGAGTTTTGGTCGAGAGTTTCTTCAGCGTGGAGAAGAAGGCGTAAATACACGGTGGCAGAATGCTGCATGCTTCAGGAAGTTGTGTGTTTGAATCGATTCAACGGGGGGAAATCGATCGGGTTTCCCATTTATTACAGCAGGATCGAGgtgttttgaaacaaaaagGTTGGGGAGGTTTCACGGCCCTTCACTTTGCTGCTCTCCATGGGAACCGGCCAATGGCTGAGCTTCTGCTGAACAGCGGCGCTGATCCGAACATTCCCTGTGATGCAGGACAAACCCCTTTTCACTTTGCTTGCAGAAATGGCAATATTTATGTCATGCAAAAAATGATGCAGCACGGTGCAGACTTACACGCAGTGGATGAGCAAGGAAAAACATCCCTTCATCATGCAGTTGGCGGTGGAAGCGTAATTGCCACGCAGTATCTGTGGGAGACTGGAATGTTCCACTTCACGGATACAGATTACTATAAGGTCACCCCGCTGCATTTGGCAGCTTCCACAGGCAATTCTGACGTAGTCCGCTATCTCCTTAGAGCTAATAGATGCAGGCCAGAGGCGGTTGACCACCAGGGGGCGACAGCACTTCACGTGGCTGCAGAGAAAGGCATGATTGAGGTGTGCTGGCTACTGTTGAAGAGTGCTGGACTCCACATTTTACACATGAAAAACCACACTGGCCTCACACCTCTAGACCTCTGTAATCAAGGGAATACATTTAGACATCGGCAGCTCTCGAGGATGTTGACGCATTTCAGTCAACGACCAAAAGATCTGGTTCCTAAGGACTCGTACGGGATGTACGTCTGGATGCTGCTGTTACCGTCTCTCAGCGGGGCTGCTGTTCTCATTATAGCTGCGGCTCTTGGTGAATATGGGGCTATGTTTTCTGCAGTGCTTTTCCCCTGTATGGCAAAATTTGTTCTTTCTCAGTATCATAGACTGAGCAGCTTTCAAAGGTTACCAAACCCTGTTTACCTTGGAACACTGACTGCGGGCCTAATTCATTCCATAGCTTGCTTTCTCTATAAAATTGTACCTAGTTTTTGGCCAGCTTATACTCTCTTGAATGTTTCACTTGTCCATTTGTGTGTGCTCGCTGGACTTTTTTGgaaagttttaaagcagaaccCAGGACAACTCAAAGAAGCTGACACAGATTCCCAGTTTTCCAGCATAGGAGACTTAATAGAAGCTGGAAAGACCCCAGACAGATTCTGTATTTACTGTGAGCTGATCCAAGTGGACAACTGTAAACACTGCCGTTTGTGTGACATGTGCATCCAAGACTATGACCACCACTGCCTCTTCCTTAATCAATGTGTGGGACGGGACAACCACCGAATCTTCATCCTCTTCATTATGTCTATGGTAATGGCTCACCTCGTCTTCATCCTCTGTGCGGTGTATTACCTCTACCTGAAACTCTCAGGCTTGCAGCTGTTTGACTGGGGCTCAGCGGCAGGAAGAGAGGCCTGGGTCCTCCTGCTGACTCTGCTCAACTTCCTCTCTTTGACCTGGGTGGGATGGTTGCTAATTGAGCAGCTTCATGCCATTTCTATGGGAACCACTACCTACTTTAGGCGGTACAACCACAAAGGGCCTTCTAAAAGACAACGGCTGGGCACAATCCTCTCTTTTCTGTTTGAGGGGAAGAGAAGACAGGAGCACAGTCAGTCTTTTAACATATAGAGACTTTGAAATAACAAACTAATGCTACAGAttagtttttacttttgtttgtaAAGGCTTGAGTATGTAACTTTTGTCTAAGTGTTGCTCTGTAATACAGTCTAAATGAGCAGACACTAGTTTCTGAAAGTCAAAGTCAGTTGCCGATTTTGGACAGTCAAGATTatgtatttcacaattttagaCCAAATGTGTCCATTTCTCATTCATCTCCTTGCATTTTTCCATTATAGTTGTGATGTGACAGTTGaagtaaactttatttattttgtgtataatgcctacactgtaaaataaaaaataattgagccaatttcaaattttaaaccaatctgctgaagctggttggcctgactttgttttttgcttttttttaataacagtgtcattttttttctataaccATTTACAATGTAAGCAATTCTTTTAAAGTCTTAAGAGTCTAAAAGTTGCATAGTATATTCCAGCCTTAATTTACAGAGAATATTTCCTCAATTTAAAGTTGCAGTCTGTAAATTTTGCCTGGTGGGAATCCTGTAGTATTTAGTAATCACAGATTCTAGACTACATCTAAGATTATGTTAACATACTGTTAATCAGTATTGCTTGAATATAAGCATAATGTGTATTAGCATGTAGACTTAAATTTCTGTACAGTCTAATATCTAATTGTGAAATCATTCAAATTTCGTATTAGGAAATTCTTAATCCAAAAAACAAATTGTGCTCCCTTCAAActggttgtttttttatatataaatggaatataatttaatttcattcacgTGTTTCAAAATggtctaaataattttttgacatTGAATTATTCCAGTTTTTGTGAGAGTAGGTCATAATTAAATGATGCGCCGAATGAGGCCATAGCCTGTACTTGCGGGACagcttctttatgtttacagaatAATGCAGTGCCATGTTTGAAATTCCTGTGAAAACCTGTCTAtaccactcaaattagaaaGCATTATTACAACCTGATTGTGAATCAGGCTAAAGGCTTAGatttgaacactggctggttatgtactGTACTtactcaaatattgattttggatcatttttaccaaaaaaactTACGTGCTGCAGCTTTAAGATTGTTAAATTGTGACTCACatagtttgtaaaaacaaatgaaaaaaaaatattacctagattatttttttgtaataacgTTTTACATGAACAGAGGTCATCGCTGCCTTGTCTTACTATAACTGTCTTACTATatctatattgtaattttgtatgtgtaaaaatgtatgtgtttttataggaaacattttaaatgtattttattcatgcatttcatgTCTACATGCATTTCATGTCTACATATCAATCTCTCattgaatattttgaaatatatttgaataaatattgaataaaatttgaaaatacataCGTATTTGAATGAGGTCAAATGTATATGCAAAGTgagatatttgtaaaaacaatgcACCTAAAATGGATGCCCAGTCATTTACTGGTATATTATGTCAGGATAaagtatttgattttaattattcaacaAATTAAAGATTAGTTTTG
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Function


symbol description
si:ch211-223a10.1 Predicted to enable protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity. Predicted to be located in Golgi membrane and cytoplasmic vesicle membrane. Predicted to be integral component of membrane.

NR:

description
probable protein S-acyltransferase 23 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043254841.1 True 3533 mRNA 0.39 13 11379144 11388193
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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cxcl12a cxcl12a,LOC107588617,LOC107707253,LOC107548639,LOC107673912,LOC107757152 other upstream 116524 11255594 ~ 11262620 (+)
G92772 LOC107588620,LOC107707271,LOC107707282 other upstream 160969 11213526 ~ 11218175 (+)
eif4ebp2 eif4ebp2,LOC107668794,LOC107588631,LOC107716353,LOC107564345,LOC107707337,LOC107673927 other upstream 410230 10964855 ~ 10968914 (+)
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LOC122356813 adka,LOC107743514,LOC107666490,LOC107601874,LOC107655429,LOC107725426,LOC100196663 other upstream 1129419 10205113 ~ 10249725 (+)
arhgap22 arhgap22,LOC107668831,LOC107708000,LOC107673870,LOC107588697,LOC108443345 other downstream 1192 11389385 ~ 11413515 (+)
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G92977 dhrs7,LOC107588602,LOC107548599,LOC107757139 other downstream 215504 11603697 ~ 11604852 (+)
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jag2a jag2a,LOC107654986,LOC107675567,LOC107724379,LOC107585503,LOC107705348,LOC107600569 other downstream 1114192 12502385 ~ 12535071 (+)

Expression



Co-expression Network