sema4ga (sema4ga,LOC107690158,LOC107582524,LOC107733683,LOC107678493,LOC107708465)



Basic Information


Item Value
gene id sema4ga
gene name sema4ga,LOC107690158,LOC107582524,LOC107733683,LOC107678493,LOC107708465
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056711.1
NCBI id CM032080.1
chromosome length 25085836
location 5008572 ~ 5040509 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


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atttgaattaggATTTGTTTTCTTACCCTGTTGacagatgctttttttgtttaaagcataTAATTTCATTAAGTTGTCTTCTTTTCTAAAAGAAAGTATGTTGTTGTGCTTctgtaaaagtaaatgtatcttgatttaaaacTGTTCTGATATTTCTATTGGAAAACAAGATGAAAATACTAggtaagaaaattatttttgcagtgtagaAATACAACAAGCCAGATTCAAAATGCGTTGCCTTTGACTCAAAAACATTACGGGAGCAGAccttttataatgaatatagcAAACGCATTTTATTGTACCTTTGTCATTTTTTGAGCTTGACAGATTGTttcctccattttttttctccatcatcGCTCTGAATCCCCCAACGCCaccttttttgtttgcatttgacAAATGGCTTTCATGTCCGTGCATACACCTCCATCATGGTGTCTAATGAGAGCAGAATAGATCTGCATACGCATCTGACCTCCACTTTCCCAGAGGGTCACAATCTGTGATTAGATGCTTGTCCTCATGCAGCTCATATGGTCTGTTCCTGCAATGTTTACATCCCTTGAGTCTTATATTCCTATGAGAGAGGTGCTCCTGCGGATTCTTCTAACATGCCAGGACAGGTTTGTGGATGAGAAATATTTCATCTGCTGCCCGCATTCAAAGTGAATTTAAAGTGCACTACAGAGAACGAGATTGACAGAGAAAGATCAAAAGAGAGTCTGGAGAATGTATTGAAATAGATTAGAAAATGGTCATTAAGCCTTTTAGTCTCATTTAGAGCAACTACAGAGCCCTCAGCAGAGCCGTATCTGATCCCAGATTCAAAAATGGCATGTTAATGTTGCTAAAATGCCATTGGTCCTCTTGGGTGAAGTAGCTGAACACGATGCTCTACTTTTGGACTTAATGTACCACATAAAGAGTCATATCGACCACTTTAATGATggttttttaatgttgtgtaCTGGCAAGAGCTACATAATGATTTCAGTTTTAGGAAATATTTGcagcatacaggtttggaatgacatgagggagagaaaataatgaaagaataaagaaagatGAAAATACCCATTTCTATGTAAACCAACAAGTCACAGAACAGTTTGGCTCAGacatttttagtacatttttattgacatAGAGCACAGTCCCAAAAACTGAACAATGTTGAACAAGACAACAATAAAATAGGACATTTTCAGACATTTCAGTCCTTACACAAAAATAGATCTTTGTGGCATTATCTATAAAGCATAGAGGTTTATTGGAGAATTGttattgatgtgtgtgtgtgtgtgtgatttgttgTTTCACTATTAAGCCATTCACCTTTTTCAATATAACacttaatgaaaaattaaagagGTTTATGCCCCGCATAGATGACCAGAAGAGACATATTCGGTTGAATGAGTCCCTTCAGCCATGCATACTTTATTCTAGTATACAACGCAACTGAAAAACGTGTCAgtggaaatatttattttatagctttgtacagttttgtgtatatttattttcgtAATGTTTCAAACTGGGATTTTCTAAATTGTGGTCGGTTAGTGGTGCATGAATATGCATTTCTGAGAagattatttacaatttttgaaAACGGAGAACCATATAATGGCTTTTAAAACGTAATATAAACGTGATGCTTATaataacagaaatgaaaataaacccaaataattctaataaagcATGCGTTGATTCCATTTCCCTTATTACAGCAGGTTGTATATGTGGAAACGCGTTCCTACTAAGATGGTGTGCTTCCTATTTCTCGTCTTGCGTTCAGAAAATACTGTTAACCCTCCTGCAGAGCCAGCCACGTCTCAGAGTCACTTCAGTGCACAGTTGTATGCCTCTTCAGTCGTGGGTAGGATTGTGTGGGCTGCCTCTGGAACTGCATTTAATGAAGCTGGTTAGACCTGTGCTTGTCACCATGGTGAAAAAGACCATAGAATTATCAATTCGCTTCATGTTTATTTCTCCGCCGCTCTCTACATTCAAGAAACATTCTCTACTGTCTTGCCCCGTGTGCGTTTAAACAGCCCAAGGTATGCATTTGATGTGTACGTCTCTTCTTTTGTCCAAGGGTAAAGTGTTTAATTAACACAGTAATACTACAGggaggaggctgagaagtgtgaatTCATTACGTTCAACTTGTAAGTCTGTttacattttaccttttaataaaCAGTATTGATGCTTC

Function


symbol description
sema4ga Predicted to enable chemorepellent activity and semaphorin receptor binding activity. Predicted to be involved in several processes, including generation of neurons; neural crest cell migration; and semaphorin-plexin signaling pathway. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in extracellular space. Predicted to be integral component of plasma membrane. Orthologous to human SEMA4G (semaphorin 4G).

NR:

description
PREDICTED: semaphorin-4G-like

GO: NA

KEGG:

id description
K06521 SEMA4, CD100; semaphorin 4

RNA


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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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col13a1 col13a1,LOC107678564,LOC107708413,LOC107589579,LOC107727372,LOC107586491 other downstream 228840 4690882 ~ 4779732 (-)
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Expression



Co-expression Network