inpp5f (inpp5f,LOC107726944,LOC107666413,LOC107743504)


Basic Information

Item Value
gene id inpp5f
gene name inpp5f,LOC107726944,LOC107666413,LOC107743504
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056711.1
NCBI id CM032080.1
chromosome length 25085836
location 9457557 ~ 9473534 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
inpp5f Predicted to enable inositol monophosphate 4-phosphatase activity and protein homodimerization activity. Predicted to be involved in clathrin-dependent endocytosis and regulation of endocytic recycling. Predicted to be located in clathrin-coated endocytic vesicle; early endosome; and recycling endosome. Orthologous to human INPP5F (inositol polyphosphate-5-phosphatase F).

NR:

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122357057 LOC107726934,LOC107666357,LOC107559322,LOC107601796,LOC107743586,LOC107601813 coding upstream 40700 9414341 ~ 9416857 (+)
LOC122356643 sec23ip,LOC107666414,LOC107655440,LOC107743502 coding downstream 8677 9482211 ~ 9491406 (+)
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fancl fancl,LOC107585345,LOC107718841 coding downstream 577553 10051087 ~ 10067172 (+)
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spef1 zgc:66426,LOC107601866,LOC107725472,LOC107666492,LOC107743614 other upstream 368436 9080848 ~ 9089121 (+)
fuom fuom,LOC107676595,LOC107666397,LOC107601808 other upstream 429648 9025943 ~ 9027909 (+)
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cxcl12a cxcl12a,LOC107588617,LOC107707253,LOC107548639,LOC107673912,LOC107757152 other downstream 1782060 11255594 ~ 11262620 (+)

Expression


Co-expression Network