pde10a (pde10a,LOC107754764,LOC107717825,LOC107564529)


Basic Information

Item Value
gene id pde10a
gene name pde10a,LOC107754764,LOC107717825,LOC107564529
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056711.1
NCBI id CM032080.1
chromosome length 25085836
location 23332820 ~ 23416851 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
pde10a Predicted to enable cGMP-stimulated cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity. Predicted to be involved in negative regulation of cGMP-mediated signaling and signal transduction. Is expressed in chordo neural hinge; epidermis; nervous system; and notochord. Orthologous to human PDE10A (phosphodiesterase 10A).

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XM_043255475.1 False 5908 mRNA 0.43 22 23332820 23416212
XM_043255476.1 False 5935 mRNA 0.43 22 23332820 23416239
XM_043255477.1 True 6241 mRNA 0.44 22 23332820 23387434
XM_043255478.1 False 5695 mRNA 0.42 22 23332820 23416844

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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micu1 micu1,LOC107702683,LOC107754762,LOC107717828,LOC107660220 coding downstream 94303 23183915 ~ 23238517 (-)
mrps6 LOC107717855,LOC107702688,LOC107660242,LOC107754760,LOC107575615 coding downstream 163917 23167873 ~ 23168903 (-)
LOC122356317 psap,LOC107575616 coding downstream 165729 23157102 ~ 23167091 (-)
c1d c1d,LOC107551342,LOC107754748,LOC107717833,LOC107702672,LOC107660245 coding downstream 196178 23134818 ~ 23136642 (-)
tbxtb tb,t,LOC107717823,LOC107660241,LOC107564521,LOC107702670,LOC107572025,LOC107750753 coding upstream 8181 23425032 ~ 23429064 (-)
prr18 prr18,LOC107750748,LOC107702669,LOC107717824,LOC107660240,LOC107564522 coding upstream 27328 23444179 ~ 23446166 (-)
sft2d1 sft2d1,LOC107660214,LOC102776618 coding upstream 30482 23447333 ~ 23464851 (-)
rps6ka2 rps6ka2,LOC107750746,LOC107717821,LOC107702677 coding upstream 48938 23465789 ~ 23505692 (-)
rnaset2 LOC107750751,LOC107702666,LOC107717820,LOC107566062,LOC107660213 coding upstream 96964 23513815 ~ 23519654 (-)
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G96254 myom2,LOC107566060,LOC107660212,LOC107702662,LOC107717844,LOC107572023 non-coding upstream 121927 23538778 ~ 23542300 (-)
G96265 NA non-coding upstream 510480 23927331 ~ 23928060 (-)
G96279 NA non-coding upstream 625677 24042528 ~ 24067735 (-)
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G96053 NA other downstream 337221 22994037 ~ 22995599 (-)
G96036 mios,LOC107688218,LOC107592123,LOC107592481,LOC107671474 other downstream 509561 22821981 ~ 22823259 (-)
LOC122356262 stk32c,LOC107570736,LOC107708193,LOC107670801,LOC107653186,LOC107717191 other downstream 884809 22371567 ~ 22448011 (-)
G95972 NA other downstream 909951 22420936 ~ 22422869 (-)
ypel5 ypel5,slc30a10,LOC107568027,LOC108441457,LOC103458748,LOC102788175,LOC102210471 other downstream 1003528 22326705 ~ 22329292 (-)
si:ch211-130h14.4 LOC107660236 other upstream 12795 23429646 ~ 23444063 (-)
borcs7 borcs7,LOC107695248,LOC107585367,LOC107588662,LOC107716326 other upstream 925898 24342749 ~ 24344657 (-)
fgf8a fgf8a,LOC107673879,LOC107585369,LOC107696243,LOC107588741,LOC107716294 other upstream 982272 24399123 ~ 24404715 (-)

Expression


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