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Chromosome Information

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Function

symbol description
pax2a Enables sequence-specific DNA binding activity. Involved in nervous system development. Acts upstream of or within several processes, including animal organ development; cilium assembly; and nervous system development. Located in nucleus. Is expressed in several structures, including immature eye; mesoderm; nervous system; neural keel; and pronephros. Used to study coloboma. Human ortholog(s) of this gene implicated in focal segmental glomerulosclerosis 7 and renal coloboma syndrome. Orthologous to human PAX2 (paired box 2).
pax2 Enables DNA-binding transcription factor activity and cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Involved in several processes, including kidney development; negative regulation of cellular metabolic process; and positive regulation of epithelial cell proliferation. Located in centriolar satellite and nucleoplasm. Implicated in focal segmental glomerulosclerosis 7 and renal coloboma syndrome. Biomarker of nephroblastoma.

NR:

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paired box protein Pax-2-A isoform X5

GO:

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KEGG:

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K15608 PAX2; paired box protein 2

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dnajb12a dnajb12a,LOC107716349,LOC107668821,LOC107707369,LOC107673930,LOC107585300,LOC107588700,LOC108443064 coding downstream 87284 10915644 ~ 10919671 (+)
spock2 spock2,LOC107668819,LOC107673954 coding downstream 96574 10924934 ~ 10951268 (+)
pald1b pald1b,LOC107588630,LOC107707320,LOC107668836,LOC107716354,LOC107673876 coding downstream 140983 10969343 ~ 10981784 (+)
qrfpra LOC107668764,LOC107673889,LOC107716286,LOC107564357,LOC107564360,LOC107588699 coding downstream 157725 10986085 ~ 10989734 (+)
LOC122357062 NA non-coding upstream 32391 10753233 ~ 10763691 (+)
G92675 NA non-coding upstream 93979 10657508 ~ 10702103 (+)
G92671 slc18a3,slc18a3a,LOC107708354,LOC107683739,LOC107716340,LOC108442244 non-coding upstream 150845 10642556 ~ 10645237 (+)
G92563 NA non-coding upstream 486306 10309237 ~ 10309776 (+)
G92552 NA non-coding upstream 519904 10275584 ~ 10276178 (+)
G92731 NA non-coding downstream 131060 10959420 ~ 10961696 (+)
G92746 NA non-coding downstream 154580 10982940 ~ 10983279 (+)
G92748 NA non-coding downstream 155878 10984238 ~ 10984645 (+)
LOC122356274 NA non-coding downstream 176550 11004910 ~ 11022056 (+)
G92767 NA non-coding downstream 374294 11202654 ~ 11203684 (+)
ly6pge si:ch73-28h20.1,LOC107716297,LOC107673896,LOC107585320,LOC105890420,LOC106578825 other upstream 375656 10416240 ~ 10420426 (+)
LOC122356813 adka,LOC107743514,LOC107666490,LOC107601874,LOC107655429,LOC107725426,LOC100196663 other upstream 546357 10205113 ~ 10249725 (+)
atoh7 atoh7,LOC107726941,LOC107601814,LOC107666420,LOC107743508,LOC107655428,LOC108426756 other upstream 1361477 9430178 ~ 9434605 (+)
zgc:153981 zgc:153981,LOC107725455,LOC107666543,LOC107601871,LOC107671561,LOC107552921,LOC108426808 other upstream 1631968 9161517 ~ 9164114 (+)
spef1 zgc:66426,LOC107601866,LOC107725472,LOC107666492,LOC107743614 other upstream 1706961 9080848 ~ 9089121 (+)
eif4ebp2 eif4ebp2,LOC107668794,LOC107588631,LOC107716353,LOC107564345,LOC107707337,LOC107673927 other downstream 136495 10964855 ~ 10968914 (+)
G92772 LOC107588620,LOC107707271,LOC107707282 other downstream 385166 11213526 ~ 11218175 (+)
cxcl12a cxcl12a,LOC107588617,LOC107707253,LOC107548639,LOC107673912,LOC107757152 other downstream 427234 11255594 ~ 11262620 (+)
arhgap22 arhgap22,LOC107668831,LOC107708000,LOC107673870,LOC107588697,LOC108443345 other downstream 561025 11389385 ~ 11413515 (+)
lrrc9 lrrc9,LOC107707153,LOC107588606,LOC107668786,LOC107757140,LOC107668789,LOC107708221,LOC107588691,LOC107673872,LOC107757098 other downstream 743300 11571660 ~ 11592600 (+)

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