LOC122358481 (LOC107575069,LOC107748074,LOC107682967)


Basic Information

Item Value
gene id LOC122358481
gene name LOC107575069,LOC107748074,LOC107682967
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056713.1
NCBI id CM032082.1
chromosome length 23709629
location 18054268 ~ 18072232 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU158857
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>TU158859
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>XR_006252610.1
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>XR_006252611.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU158859 False 642 lncRNA 0.40 3 18054268 18067118
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XR_006252611.1 False 3343 lncRNA 0.38 5 18060952 18072232

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122358680 frem2b,LOC107752721,LOC107683412,LOC107730863,LOC107704782,LOC107582282,LOC108433801 coding upstream 14969 18037113 ~ 18039299 (+)
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dclk1b LOC107752421,LOC107704780,LOC108433804,LOC107683036,LOC107730822,LOC107582281 coding downstream 212727 18284959 ~ 18317179 (+)
mab21l1 mab21l1,LOC107730834,LOC107683054,LOC107587182 coding downstream 316695 18388927 ~ 18396708 (+)
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G107688 NA non-coding downstream 453373 18525605 ~ 18526233 (+)
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G107713 pds5b,LOC107587120,LOC107582244,LOC107683122,LOC107730842,LOC107752691,LOC107704775 non-coding downstream 598098 18670330 ~ 18675897 (+)
G107574 frem2b,LOC107730863,LOC107587905,LOC107704782,LOC108433801,LOC106520551 other upstream 7364 18045017 ~ 18046904 (+)
trim3a trim3a,LOC107587229,LOC107704783,LOC108433799,LOC108278293,LOC103363426 other upstream 243065 17789845 ~ 17811203 (+)
lyrm9 lyrm9,LOC107756492 other upstream 1540047 16513308 ~ 16514221 (+)
G107148 nrip1a,LOC107587564,LOC107714172,LOC107666194,LOC107682571,LOC107756533,LOC107589737 other upstream 1817927 16089757 ~ 16236341 (+)
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G107756 LOC107752648,LOC107704772,LOC107587109,LOC107582275,LOC107683161 other downstream 684111 18756343 ~ 18758836 (+)
G107757 lsr,LOC107704772,LOC107587109,LOC107752648,LOC107683161,LOC107730812 other downstream 687350 18759582 ~ 18760497 (+)
si:dkey-30e9.6 LOC107683422,LOC107752859,LOC107588226,LOC107704721,LOC107582296,LOC107730865 other downstream 721848 18794080 ~ 18795982 (+)
G107777 NA other downstream 770044 18842276 ~ 18843855 (+)
LOC122358990 LOC107586958,LOC107704764,LOC107752630 other downstream 921113 18993345 ~ 18995991 (+)

Expression


Co-expression Network