G108990


Basic Information

Item Value
gene id G108990
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056713.1
NCBI id CM032082.1
chromosome length 23709629
location 22949140 ~ 22953513 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU161070
TTTCATTCTGAGGCAAAAAAATCTTTAgtactattaaatataaaatatgaaacatttaatattaaacatggTCAGTATGCTTCGCATCAAGTCAAAGCAACAggtatttctatttctaaaaatacaattatttagaataaaaatgaattctaaaaattacTATTAATGTAACATTAAACAGTGACAATATGCTTCACGTCAAGTCAAAAATACAGGTATTTCTACTtgtaaaaaaggtaaaaacatatttggtaaaatataattaaacaataaaggCTAATACAGTCATTTAttgaacattaaacattacCGATATGCTTCGTCAAGCCCAAAATACAGGTTCTATTtgtaaaaaaagttacacaaaaaattaatacaaatggaaaaaaatatatagcttttattaaaatagtaaataataaattgagcATGACCACAATGCTTGCTTTTGCATAATTTCAATCATATTAAACCTTTTTCCTGTCTGTTTACAGAGAAAATGCAAATCACCCACAACCAAAACAAGACTGGATTTAATTGGATGGTGCGTTATTAAATTGCGTCATGAAAactcatttatattaaaatttcaatttgaaaTCAACATCACTCAGCAATCTGCTCAGCCtctattttttgttctttggagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatgcaattgcgCGTGGGTACAGAGTTTAATCTAAATCGGATCCCATCTGCGTTTCCGATGGGTTCATCCTCGACTGCTCTGCTTCGCTGTAATAGCCTCTGCTCTTTTAACCTCTGCCGTACGAGTTCGGGCGGGCTCGGAGACTCGCGGGCTGAGCTCCTGTCAATCGCAGAGAGGGGGGCGGGACTTTACAGCGCGAATGAAACGAAGACACCGGAGCCGAAACGCATACCTGCGCCTGAACATCAACGTTTTGTTAAAAGCAGGACCTTCCATACACACAGAGCTAATGGCCTGCTGATAAAAATAGACAGTggcagatggagagagagagagagactttagGAGGTGTAGGGCGGGAAAATAAACTCATCTCTTACATAAACGGGTCAGTTCTATGCATGTTCCCATCAGATATGTCATACTGGATATTGAAACTCGGTTTATATCCCATTGACTAACTGAAGCCAGTTCATTGAGCATCTTCCTCATCggaaaaagtcattaaaaaaaaggtttgtgcCTTTCTAAACAATTCAGTTTGAGGTTATTGAACATGCGTTGTGGATATAATGACGTTATAAGAATATAtctataaacaaatatacatataaacatggTATTTATTCAATGCTGTTCACTCTGCCTTAAAGGTGCTTCTTTTTTGCTCTGAAATCTCTCCCAGGAGGAGGGGTCTTCCTCCAGAAGGGGCGTGGCTTTGGACACCAGATCACTGAAACTTAACAGCGTGAATGAAAGGGGCGGAGCTTCACAAACGCTCCCGCTGTCCTCCTGCGACACGAAGAAGTATGATGTCATGAACTCGACCTCTAAAATCGTGTGAAAATCGTATGTAAACTCACTTCGGACGTGCTGATGTCTGGTTTTCCCAGCGCCACGGCGACGTGATGGTCTTTGTCCAATAAGCTctcctgaaagaaaaaaagtcaatttcGCGAGATGAAAAGTCCAGAGGAATGAAGAACGTGAGCCCTATCCAGGAAACGAGAAGCGCCTGTGATCTGTGTCACGTTCGCACGCTCCGACAGACACAGAGACGAAGCAGCACTGCAggactccacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacgggctgAGAGGATGACCTGCGTGCTGGTATATAAAACACACCTCAAATGTCCAGTCCTCTTCTTCATTGTCCAGGTACATCCGTGTCTGCCGGTACACTTGCCCCTCTCGCATCTGATTGGGCGAGATGTGAAACTCCGCCCTCTGCAGGTCGAAGCCCAGCCCTGTGCCAATGGCTTTGATGAAGCTCTCCTTCAGAGCCTTGAAGGACAGAAGAATGGACCAAACAGAGGTAATCGGGATATATTCAGAATAAAACGTCTAAATCGTTTACGGTGTCTACGCTGGAtgcttaaagtaatagttcacccaaaaataaaaattctgtcatcatctactcCCTCTCGAGACGTCCCAAGCCTGTATGAACTTCTtcgttctgccgaacacaaggaagatattttaaagaaagtttgtaacccgaaatgttaatttttgagtgaactattcctttaaatagtATATGCATGCAGCGTGTAAAACagtgtacaaaataaatgtttatttcgcAATAACTGGTGGTGAGTTGTGGAAGCACTTTaggaacttttttttagttcctgaaaaggaaaaataagtaataataataataataattattattatataatttattattattattattaataataattatataatttattaataacaaactATTTTcctaaataatattattatttaacaacgtatttttaatttgatgttattatatattagtgttataaaacccaaaacatattataaagattattttaaaaatgataaaaaaataatataaaaatattaatgtaatatttcatgaacataattttttttttttaattttataattggaaaaaaaatattaatcattacaatacaaaacatgttattttgGTCAAATCTAGATATTATtgcaacacatttatttatttttcaaaatcaatCTGCTTTgttataaaaccaaaaaaaatttaattactgCAAGATATTCTGTAGACATCCTCAAAGGTGTTATGattagcaaaaaaatgtttttttttaaagtaaaaatggaaaaatgcataTAGTGCTCTTGTAAGGGTAGGTTTGGACAgatagtgagtgtgtgtctgactgaCCACATTCTCACCTACAGCACATTTTACTGATCCaagtatacgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttataagagTCCTCAAATGACCACAGACTGGCATAACTGAGTCATGCTGAAGTGATGAGATCACATCGCCATGGAAACAGGGATCAGAATTGGAACAATTTCATCCAGCACAATTTCTCTCCCGCTGCGATATGcttatagatgtgtgtgtgtgtgtgtgtttatgtgtaagTGTGTGCACATCTTGTTTAcgagagatgatgatgatgatgatgatgatgatgctacAGGAAGGAGCGGTTGCTATAGTTACCCAGTGCCTATAAAACAAGTCCAGTTGGTCCCGGTCGGATCCTGCCGCTCGGATGCTGGTCCACTCCAGATCCGTGAACTGACGATTCATGATCCGGAAAAACTCCTGCACAGAGCTACTGCCTGAGgagcacgcaaacacacacaaatcatcCTTGAATTTGACTTTAGTGAAGGATTCTGCATTGAAAATCTCgtgcttcagttttttttccccccgcaATTTCCCCTTTTGATTCgttcaacgattcatttttccaaacaacAAAATCCCAAAATGGCACCTAGTATCAAACGatggtttttcattttcattcagaccagcAAGTGGGcagcaatatgctaatgtttcgtACTGACATGAACAAGACACTAATCGTTTTAAAACGACTCgcttcagtgattcagagtcgactcttttttgaatgcatttgtgtatataaaacacatttttgtaaaattctaaaataaaagtaataaaactaaattactatttattactgtaatagcTTGTgtacaattacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatatacacacatat
>TU161072
TTTCATTCTGAGGCAAAAAAATCTTTAgtactattaaatataaaatatgaaacatttaatattaaacatggTCAGTATGCTTCGCATCAAGTCAAAGCAACAggtatttctatttctaaaaatacaattatttagaataaaaatgaattctaaaaattacTATTAATGTAACATTAAACAGTGACAATATGCTTCACGTCAAGTCAAAAATACAGGTATTTCTACTtgtaaaaaaggtaaaaacatatttggtaaaatataattaaacaataaaggCTAATACAGTCATTTAttgaacattaaacattacCGATATGCTTCGTCAAGCCCAAAATACAGGTTCTATTtgtaaaaaaagttacacaaaaaattaatacaaatggaaaaaaatatatagcttttattaaaatagtaaataataaattgagcATGACCACAATGCTTGCTTTTGCATAATTTCAATCATATTAAACCTTTTTCCTGTCTGTTTACAGAGAAAATGCAAATCACCCACAACCAAAACAAGACTGGATTTAATTGGATGGTGCGTTATTAAATTGCGTCATGAAAactcatttatattaaaatttcaatttgaaaTCAACATCACTCAGCAATCTGCTCAGCCtctattttttgttctttggagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatgcaattgcgCGTGGGTACAGAGTTTAATCTAAATCGGATCCCATCTGCGTTTCCGATGGGTTCATCCTCGACTGCTCTGCTTCGCTGTAATAGCCTCTGCTCTTTTAACCTCTGCCGTACGAGTTCGGGCGGGCTCGGAGACTCGCGGGCTGAGCTCCTGTCAATCGCAGAGAGGGGGGCGGGACTTTACAGCGCGAATGAAACGAAGACACCGGAGCCGAAACGCATACCTGCGCCTGAACATCAACGTTTTGTTAAAAGCAGGACCTTCCATACACACAGAGCTAATGGCCTGCTGATAAAAATAGACAGTggcagatggagagagagagagagactttagGAGGTGTAGGGCGGGAAAATAAACTCATCTCTTACATAAACGGGTCAGTTCTATGCATGTTCCCATCAGATATGTCATACTGGATATTGAAACTCGGTTTATATCCCATTGACTAACTGAAGCCAGTTCATTGAGCATCTTCCTCATCggaaaaagtcattaaaaaaaaggtttgtgcCTTTCTAAACAATTCAGTTTGAGGTTATTGAACATGCGTTGTGGATATAATGACGTTATAAGAATATAtctataaacaaatatacatataaacatggTATTTATTCAATGCTGTTCACTCTGCCTTAAAGGTGCTTCTTTTTTGCTCTGAAATCTCTCCCAGGAGGAGGGGTCTTCCTCCAGAAGGGGCGTGGCTTTGGACACCAGATCACTGAAACTTAACAGCGTGAATGAAAGGGGCGGAGCTTCACAAACGCTCCCGCTGTCCTCCTGCGACACGAAGAAGTATGATGTCATGAACTCGACCTCTAAAATCGTGTGAAAATCGTATGTAAACTCACTTCGGACGTGCTGATGTCTGGTTTTCCCAGCGCCACGGCGACGTGATGGTCTTTGTCCAATAAGCTctcctgaaagaaaaaaagtcaatttcGCGAGATGAAAAGTCCAGAGGAATGAAGAACGTGAGCCCTATCCAGGAAACGAGAAGCGCCTGTGATCTGTGTCACGTTCGCACGCTCCGACAGACACAGAGACGAAGCAGCACTGCAggactccacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacgggctgAGAGGATGACCTGCGTGCTGGTATATAAAACACACCTCAAATGTCCAGTCCTCTTCTTCATTGTCCAGGTACATCCGTGTCTGCCGGTACACTTGCCCCTCTCGCATCTGATTGGGCGAGATGTGAAACTCCGCCCTCTGCAGGTCGAAGCCCAGCCCTGTGCCAATGGCTTTGATGAAGCTCTCCTTCAGAGCCTTGAAGGACAGAAGAATGGACCAAACAGAGagTCCTCAAATGACCACAGACTGGCATAACTGAGTCATGCTGAAGTGATGAGATCACATCGCCATGGAAACAGGGATCAGAATTGGAACAATTTCATCCAGCACAATTTCTCTCCCGCTGCGATATGcttatagatgtgtgtgtgtgtgtgtgtttatgtgtaagTGTGTGCACATCTTGTTTAcgagagatgatgatgatgatgatgatgatgatgctacAGGAAGGAGCGGTTGCTATAGTTACCCAGTGCCTATAAAACAAGTCCAGTTGGTCCCGGTCGGATCCTGCCGCTCGGATGCTGGTCCACTCCAGATCCGTGAACTGACGATTCATGATCCGGAAAAACTCCTGCACAGAGCTACTGCCTGAGgagcacgcaaacacacacaaatcatcCTTGAATTTGACTTTAGTGAAGGATTCTGCATTGAAAATCTCgtgcttcagttttttttccccccgcaATTTCCCCTTTTGATTCgttcaacgattcatttttccaaacaacAAAATCCCAAAATGGCACCTAGTATCAAACGatggtttttcattttcattcagaccagcAAGTGGGcagcaatatgctaatgtttcgtACTGACATGAACAAGACACTAATCGTTTTAAAACGACTCgcttcagtgattcagagtcgactcttttttgaatgcatttgtgtatataaaacacatttttgtaaaattctaaaataaaagtaataaaactaaattactatttattactgtaatagcTTGTgtacaattacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatatacacacatat

Function

NR:

description
PREDICTED: serine/threonine-protein kinase 24-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU161070 True 3825 TUCP 0.37 2 22949140 22953513
TU161072 False 2883 lncRNA 0.40 3 22949140 22953513

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
gucy1a2 gucy1a2,LOC107566890,LOC107706059,LOC107669873,LOC107725744 coding upstream 11208 22908551 ~ 22937932 (+)
cwf19l2 cwf19l2,LOC107670086,LOC107706063,LOC107728743,LOC107669872,LOC107566889,LOC107560834 coding upstream 51466 22877852 ~ 22897674 (+)
LOC122358713 NA coding upstream 91701 22856477 ~ 22857439 (+)
LOC122359065 NA coding upstream 92324 22853258 ~ 22856816 (+)
LOC122358712 NA coding upstream 96491 22839191 ~ 22852649 (+)
pdgfd LOC107689581,LOC107670136,LOC107756229,LOC107725770 coding downstream 137412 23090925 ~ 23114178 (+)
fzd4 fzd4,LOC107600811,LOC107551868,LOC107725773 coding downstream 304237 23257750 ~ 23262190 (+)
LOC122358508 parl,LOC107670111,LOC107689587,LOC107725764 coding downstream 419147 23372660 ~ 23378269 (+)
atg16l1 LOC107689588,LOC107551872,LOC107670107,LOC107600818 coding downstream 423065 23376578 ~ 23400826 (+)
cldn15lb cldn15lb,LOC107577838,LOC107725763,LOC107670109,LOC107689589,LOC107551871,LOC107578549 coding downstream 425197 23378710 ~ 23385104 (+)
G108981 NA non-coding upstream 111018 22837685 ~ 22838122 (+)
G108949 NA non-coding upstream 173567 22774778 ~ 22775573 (+)
G108906 LOC107731813,LOC107737424,LOC107558819,LOC107670133,LOC107669866,LOC107570104 non-coding upstream 282847 22660985 ~ 22666293 (+)
G108777 LOC107731820,LOC107570111,LOC107737423,LOC107670127,LOC107558840,LOC107669915 non-coding upstream 300795 22587935 ~ 22648345 (+)
LOC122358854 NA non-coding upstream 320028 22619676 ~ 22629112 (+)
G109006 LOC104959606 non-coding downstream 45017 22998530 ~ 23006786 (+)
LOC122358995 NA non-coding downstream 87557 23041070 ~ 23066216 (+)
G109017 NA non-coding downstream 158043 23111556 ~ 23113058 (+)
G109018 NA non-coding downstream 163316 23116829 ~ 23117749 (+)
G109030 NA non-coding downstream 186717 23140230 ~ 23141517 (+)
G108951 LOC107560855,LOC107670124,LOC107731823,LOC107558828,LOC107669926,LOC107706052 other upstream 171415 22775649 ~ 22777725 (+)
G108573 NA other upstream 1211453 21736680 ~ 21737687 (+)
G108572 LOC107745176,LOC107698871 other upstream 1213422 21735014 ~ 21735718 (+)
G108571 NA other upstream 1216033 21731981 ~ 21733107 (+)
LOC122358705 NA other upstream 1222874 21724404 ~ 21726266 (+)
msantd4 msantd4,LOC107566896,LOC107725759,LOC107670113,LOC107689580,LOC107756207,LOC107560841 other downstream 2198 22955711 ~ 22959679 (+)
G109132 NA other downstream 293262 23246775 ~ 23271291 (+)
G109193 NA other downstream 555919 23509432 ~ 23510315 (+)

Expression


Co-expression Network