G109132



Basic Information


Item Value
gene id G109132
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056713.1
NCBI id CM032082.1
chromosome length 23709629
location 23246775 ~ 23271291 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>TU161296
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>TU161297
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>TU161299
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU161296 True 7056 TUCP 0.40 2 23264176 23271291
TU161297 False 2884 lncRNA 0.39 2 23264176 23267187
TU161299 False 988 lncRNA 0.41 2 23246775 23265187

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
pdgfd LOC107689581,LOC107670136,LOC107756229,LOC107725770 coding upstream 132597 23090925 ~ 23114178 (+)
gucy1a2 gucy1a2,LOC107566890,LOC107706059,LOC107669873,LOC107725744 coding upstream 308843 22908551 ~ 22937932 (+)
cwf19l2 cwf19l2,LOC107670086,LOC107706063,LOC107728743,LOC107669872,LOC107566889,LOC107560834 coding upstream 349101 22877852 ~ 22897674 (+)
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LOC122359065 NA coding upstream 389959 22853258 ~ 22856816 (+)
LOC122358508 parl,LOC107670111,LOC107689587,LOC107725764 coding downstream 101369 23372660 ~ 23378269 (+)
atg16l1 LOC107689588,LOC107551872,LOC107670107,LOC107600818 coding downstream 105287 23376578 ~ 23400826 (+)
cldn15lb cldn15lb,LOC107577838,LOC107725763,LOC107670109,LOC107689589,LOC107551871,LOC107578549 coding downstream 107419 23378710 ~ 23385104 (+)
LOC122359600 NA coding downstream 121464 23392755 ~ 23393038 (+)
LOC122359596 NA coding downstream 122566 23393857 ~ 23394137 (+)
G109130 NA non-coding upstream 3005 23243545 ~ 23243770 (+)
G109048 NA non-coding upstream 41271 23205260 ~ 23205504 (+)
G109047 NA non-coding upstream 43052 23203472 ~ 23203723 (+)
G109030 NA non-coding upstream 105258 23140230 ~ 23141517 (+)
G109018 NA non-coding upstream 129026 23116829 ~ 23117749 (+)
G109131 NA non-coding downstream 45891 23317182 ~ 23320626 (+)
G109161 NA non-coding downstream 82016 23353307 ~ 23374953 (+)
msantd4 msantd4,LOC107566896,LOC107725759,LOC107670113,LOC107689580,LOC107756207,LOC107560841 other upstream 287096 22955711 ~ 22959679 (+)
G108990 NA other upstream 293262 22949140 ~ 22953513 (+)
G108951 LOC107560855,LOC107670124,LOC107731823,LOC107558828,LOC107669926,LOC107706052 other upstream 469050 22775649 ~ 22777725 (+)
G108573 NA other upstream 1509088 21736680 ~ 21737687 (+)
G108572 LOC107745176,LOC107698871 other upstream 1511057 21735014 ~ 21735718 (+)
G109193 NA other downstream 238141 23509432 ~ 23510315 (+)

Expression



Co-expression Network