inpp5ka (inpp5ka,LOC107704774,LOC107582245,LOC107683418,LOC107730810)



Basic Information


Item Value
gene id inpp5ka
gene name inpp5ka,LOC107704774,LOC107582245,LOC107683418,LOC107730810
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056713.1
NCBI id CM032082.1
chromosome length 23709629
location 18712465 ~ 18720857 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


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Function


symbol description
inpp5ka Predicted to enable inositol bisphosphate phosphatase activity; phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase activity; and phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity. Acts upstream of or within lens development in camera-type eye; neuromuscular junction development, skeletal muscle fiber; and somite development. Predicted to be active in endoplasmic reticulum; plasma membrane; and ruffle. Is expressed in head. Used to study congenital muscular dystrophy with cataracts and intellectual disability and muscular dystrophy-dystroglycanopathy. Human ortholog(s) of this gene implicated in congenital muscular dystrophy with cataracts and intellectual disability. Orthologous to human INPP5K (inositol polyphosphate-5-phosphatase K).

NR:

description
inositol polyphosphate 5-phosphatase K isoform X2

GO:

id name namespace
GO:0046856 phosphatidylinositol dephosphorylation biological_process

KEGG:

id description
K24222 INPP5J_K; inositol polyphosphate 5-phosphatase INPP5J/K

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_043258447.1 False 2672 mRNA 0.40 13 18712465 18720857

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G107558 si:dkey-285b23.4,si:dkey-285b23.3,LOC107748074,LOC107559010,LOC107575068,LOC107575069 other upstream 595512 17832072 ~ 18116953 (+)
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Expression



Co-expression Network