nova2 (nova2,LOC107669728,LOC107589717,LOC107685091,LOC107756760,LOC107548550,LOC103039352,LOC108440380,LOC108277822,LOC104927796,LOC100701682)



Basic Information


Item Value
gene id nova2
gene name nova2,LOC107669728,LOC107589717,LOC107685091,LOC107756760,LOC107548550,LOC103039352,LOC108440380,LOC108277822,LOC104927796,LOC100701682
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056713.1
NCBI id CM032082.1
chromosome length 23709629
location 15516104 ~ 15567549 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043258650.1
gtacaaatcaCATAACAATATTATAGtaaaattagaattattattgGCTAATAGACGAGCCATTTAGAACTACGACTTTTAGTTTTCTCATCCCTGCGCCTATTTTACAACGATGCTCTCGCATTTTCATCACCGCCACCTCCTCCTGTACTGTCATGTGACGAGCAGGATTTATACACCGCTTTGCCGGAGAAAAATCAAACCTCGACCAATCACAGCTCGAGGTGGGCGTGTCCGTTTCTTCACATTTGACAGCCGCGGTCTCGGCTGCGCATGACGTCACCCGCTGCCCCGCGCTCCGGCAGAAACGCGCAAAGATGCTCTGAAAGCAAGACTGCAGCATCTCCGAGTCAGAGCCTACAAAAACATCGCATCTCCTCCAAGCGCTCGTCCAGCGCTTCGTCGCCGTCCAGGGTCTGCCCACCTGCATGCGGGATccgctgttttttttgtctctctctcgcctCTTGTACATTTCCCGTTGCTATTTATTATCCGCGCGCATCttcccagtttttttttaaaagtagtgaATCCTATAAGTTCCGCTGACCGCTGAGGTCATATATTGTTTCCAGCAGGAGAGCGCCGTCGCAGAGCCACGAGCGAGGACGTTTCCCCACATCACTTGTTATTAATATCAGCCTGAGCATAATCGAGCCACTGGATATCGATGCGTCTTTCGTTCAGTATCTAGGCTGCTACGGAGGATCGACGCACCCCAAACATTCATATCATCGTGGTTTCACATTTAGAAACGACCATATCTGCGTACCGCGTCTAGGGAAAACGAGCGCGAGCCTAAAGcttctttataaaaaatgatGGCCGGTGGGGCAGTGCAGCAAAACGGGATTTTCTCCAATCCGCATCATCACAATCAACAGCCGCACATGGAGTCTGATCCCCCCGATTCCCGCAAAAGACCCCTGGAGACCCCGACGGAGGCCAGCAGCACCAAACGCACAAACACAGGAGAGAGATGCAACCAAGCGGCCATCCATGATCCACCATTTTCATCAGATTTTGTCGGATTTCACGAGGAAGGCGAATATTTCTTGAAGGTGCTGATTCCAAGCTATGCCGCAGGCTCCATTATTGGCAAGGGTGGTCAGACTATTGTCCAGCTACAGAAAGAGACAGGGGCCACCATCAAGCTGTCCAAATCCAAAGACTTCTACCCGGGAACAACAGAGCGTGTCTGCTTGATTCAGGGCACTGTAGAGGCGCTGAACAGTGTCCATGACTTCATCGCAGAGAAGGTGCGGGAGATGCCTCAGAGCGCTCAGAAAACAGAGCCGGTTAGCATACTTCAGCCACAGACCACCGTCAACCCTGACCGTGTCAAACAGGCCAAGCTCATAGTGCCCAACAGCACGGCAGGGCTGATCATCGGCAAGGGCGGAGCCACGGTGAAGGCCGTCATGGAGCAGTCGGGCGCCTGGGTCCAGCTCTCACAGAAACCAGAAGGCATCAACTTGCAGGAACGCGTTGTCACCATCAGCGGAGAGCCTGAGCAGAACCGCAAGGCCGTGGAGATCATTGTGCAGAAGATCCAGGAGGACCCACAGAGCAGCAGCTGTCTGAACATCAGCTACTCCAACATCTCTGGCCCCGTGGCCAACTCCAACCCCACCGGTTCCCCGTACGCCAACTCGGCAGAGGTGATGCCGGctgctgcagcagcagcagcggccaCAGCCTCCAGTCTCCTAGGGCAGGCCAGTCTGGCAGGTGTGGGCGCTTTCCCCACCACCATGTCCAGCTTCTCAGGGAATGACCTGCTGGCTATCACATCTGCGCTAAACACGTTAGCCAGCTACGGATACAATACCAACTCCCTGGGCCTAGGGCTCAACCCTGCGGCTGCCTCAGGGGTCCTCGCCGCTGTGGCTGCAAGCGCCAACCCCGCCGCAGCTGCGGCCGCTAACCTGCTAGCCTCATACGCCAATGACGCATCCACCAGCTCCGGCCACCCTGCGACCAGCCTGGGAGGCTTCACGCTAGGCTCGCTCGCTGCCGCCACCGGAGCCACCAATGGCTACCTGAGCGCCGCTTCCCCGCTGGTGGCGAGCTCCCTGCTGGCCACCGAGAAGCTGACCGAGGGGGCCAAAGATGTGGTGGAGATTGCTGTGCCGGAGAACTTGGTGGGCGCCATTTTGGGGAAGGGAGGCAAAACGCTTGTGGAGTACCAAGAACTGACGGGAGCCCGCATTCAGATCTCCAAAAAGGGAGAGTTTGTTCCTGGCACCAGAAACCGTAAAGTTACCATTACTGGATCGCCAGCCGCCACACAGGCAGCCCAATATCTTATCAGCCAGCGAATCACATACGAGCAGGGTGTGAGGGCCACCAATCCGCAGAAGGTGGGCTAAAAACAGGGAGTAtgaaaaaaggagagaaaaagagtggGGGATGGGGAAGATACAGAGAAAGATGGAGGGCGCGAATATCGACGAAAATTGCCCACATTCTTTGTGGGAAAAAtctcagtattaaaaaaaaaaatggaaagaaatcCTCTCAAAGTGGAAaatttgaaacagaaaaatgtgtaaaatgtaaatatgggTTTAATCCTTAAGTTCGGGATTTTTATtggttgattttgttttgtttttcttttgtttttgttttttttgtgcattttctggACAGCAGTGAATGGCATTTCAACCTGGCATGCTGCCGCGCTGCAGTTCCCAGCAGGTGGGCAAGGTGGTCGGATGGGGGACAATGGGGTGGAGCAATCCCAGGAATCGGCCCTTCCCCACCCCCATCCCCTCCTAGCTGAcagatttttgttctttaattttTTAGTCCTTAGTTTTAACTCCCACCCTTTCGCCCATGCCTTCTCTTTAAGAGGGCCTGAGACTGATTATTTACCCCCAGTCTGTGACACCCCATACCCCACCCCAGCCCCTCGCCCCAGCCCTCTCAATCCCAGCCGGCCCGACCCTGCTCCGCGAACGGGCAGGATAGGGCAGGGGATACGAGGCTGCTGCAGGGTCTCTCAGCGCCACTAGACATTGACCTGGGGTTCCAGTTGGACCAGGTGCATGCCACTACAGATGTTGTTAGCATAAGGGAAGCTTGTAGATCATGTTGCGGACATAGGCCAGGACGCAAAACGCACCTGAATCTTTCGTACCAGAGCTCCTAGAAAATTGTGGCATTCGTCTATGGGATTTGAGGTCTGGTGTTTATACAAatactattatcattattattattattattactactactattattattattacaaattatcaTCACCATCAacgttatttattaatatgatttcaCCCATAAGGACTGAGgtatttccttttgtttttcttaatctGTGAATTCAGGTTGACATGAATGTAAAGACAATAttttggatttagttttttatttaagtagATTGAATCGTGTGTCCATGTAATATATGTCTTATTTAACGTCCAGTGATAACTGCACCGTCGGCACCAACAGAGAGAATAGGGGCAGATGTACTGTACAGTGatattaatacaaacacacacactcagcaaaCTATTACCAGATTTAAACGCTGAAAATGCAACTAAACATACGCAGACTTGAAATCACACCGGGACTAGACAATTTATTCACATATCTACTGAAAGAGAATGTAGGTCTTTGCACAAGTCCAAGGGAGTGTCAGAATACGACTTTATATGaaagccaatctttttctgtaaCGTCCCAAAACATATCCCCATCTTTACTCAGTGCTGCCCCTCTGCAGCGTGAGAGATTGTGCACTTTGAGCCGCTGCAGTCGAATATCTGCGCAAATCTGCTGGAAAATTTGCGTAGATATTCCACATCAAGTCAGAAATTGGCCCTCAGAGCTCTGAGGCGTTTCATGAACAACATACTACTGAACGACTATGAACAAATTCTGATCTGCACAGGCTGCTCTGTAACATGGAAGCCCCAGGTTGTCTGTTctataacagtttttttaatatacgaGTCACCAGTAAATTCAATCCAAGAACGGCCGCCAGTGTGAAGATCGTCCTGTGCAGATCTGAACTACCCATGTGCGACTTATGTGCTGCTAATAAGGTCctatttcctttttgtttttgaatctgAGTACACTGAATTTCGTCTTAATGCACTGTGAAGTGTGGAGGCCGTGATGGAAGGCCAAAAAAAAGTCAGGGTTTCTATATCGTTATTGCATTGATGCATCACCATGATGGAATGTACTCATGTGGAACGTCTCATATTTATAACAACCTACATGGAGTCAAGGTATCGCTTACCGTAGGGCGGAAAGGAAGCCTGGATGGTTTGTTAGGTTGAGGTCAGACTCTTCGGACCAGTTTTTTGGCATCATGTTGCAGTATCCAACCTTAACTTTCCAAGTGTGCACTAACTACCCGCCAGCTGACTGTATATTTATCGTGAAGGGGCAGAGGATGGTATATTCTGTACGTTTAAACTCGAGGTGTCCTCCGAAATGATTCTGTGTCTAAACAACGACATATTGATTCTTTTCCCGGCTGGAATGAGCTTAAAAATACCAAACTGCTCCTTATTATCAAGACTTTAGGCCAGAGAGCATTTCCCAAAGAAGAATTAGACCAACAGAAAAAGACAGAgtttgtgctctctctctcccaatGACTAAAGTTATGATTCTTTCCTCTCCTTTGCTATTGGAGCACCAGGGAGAGTAAATCTGAACCGATTGGTAAGGAGGCTTCTTTATTCTCATCTAAAAACCATCACCTCCCCTCACCTCTTCTCAACACCCCTTTTTACCTTCGTGCACCCCCATTCTGACACATCAACCCAGAGACCCCCTTTTCTCTCACATCTCTCCATGGGTGGCGATGTCTGGTGTAACAGTGCATGTCTGCTTGCCCTTTCACAAAACAATGAACGTCGCGAAAGGGAAGATGCGCCTACAGAGTAGAACTAGAAGCTTGCAGTAGATCACGATTGCGCACATCACACCTTCAAAAAGGGACCTAATACGAGCCATCCATGTGTTTGTAtggtgtgcatgtgtgtgtaaatgcgtGATAAGTTTGGataaatatgaatgtgtttAGCAGTTGCGTCCAAGGTGAGGAGGTCTGAAACAGCAATGACTCCAGGTACTCTACTAGAAGATAGTTGCACGTTTTTGTTGAGgtgcaattttcaaacaatATGACGTAATAGTTCAGATTTGAAGATGAGGAAGCGATGGCAATCGAGCGCCTCCGCATTTTAGAGTGCATCTGTGTGTTCGGTTTTACCCATGATGCAGTACTTCATCAGACACTTCAGAGCTTGAACGAGTCTCGGTAGATCCCccagaaatttttttttcttgtttaaaaaaagcggTTACATCACCGTTTGATTTAAGACACATTAAAAGCAAGATATTACTGTGACAATTCAATGTGAAAACTATAAAAAGGTGCCAACATAGTGTCAAGGAGCagctttctgttttgttgtttttgtattcagtACTGAAAGTACATATGGGAGGGGGTCtcggtttttttattttgttttttgttagtaACTGGGAAAATAGATCAAATGTGATGAGTACTGAAAGCAATATACGTAGTAGCATGTCGTCATGTCTTGTCCTTTTATTCTGTCTGTGTAGGAGCTTTGGATTTACCTAGATGTTGAGTAGATTTGCATATACTATTTTTTAAGTTGTGAAGATGCTGCTATTGAATAAGTGATGTACTaaaatttaagattaaaaaacatatcTGGTCAGTCATTTAGCAGGATGTGGTAGTTGTAAGAGGtgtaactaaatgctacattgATAACGAAATAATTGCTATATCAATGGATTAAATAAACCTGTGCCAAAATAGATCTTTAcagatttaaatgtgatttaaacaCCATTAGTTAAGAGCAGACAtacttttgtaatttaaaaaaaagaaaaaaaatgtgaaaagtgcCAAACAAGCCACAGTTAAGATATAACTAGCGGGGGTAAAGTGACTagagaagcaaaaaaaatagacattagCACTATAAGGTTTTCTGCCCCCTTAAACTAACTAGTCCTTGTTAAAAAAGAAGGGTGGGATTCATCTCGTAGGCCAAACAAAAGCAGGGTGCCATGTGGCCATTAACACACATCCCCTGGGGCTAGAAGACTGCCGAGTTAGCTTAGCATGGTTAAAGTTTTATAAGTTATCAGCATTCTTAAGTCAGCCTTTTATagttctgaaaatgtattttgtgaaGATAGATGTTATCTTTTTTGCACGTCGATATTGCATGATACCAAGTGAAGcgtggatttaaaaaaaaaagtgaagacaaaaaattgtacaaaaaaaaaaaaacaattaggcAATGTGCATTCATTTTGAGGACAAATCTTTGCATGGCAACAACAGTTCGAGctattaaattagcttttttcacatttttacctttttatttttagttttgctaAGACCAAGCTGGAGTTTTTGTTGTCCATGAAAACTAGGCCACAGAAACCAAATCCATTCATAGTCATGGTCATATTCAGCGTCATAACTATAGCACTCATTTTGTACAGACTTATCAATGTTTTGTGATAATTTCTAAGAAAAATAACGGGAAAAGTTGGGTAATGGAGGGTTAATTTAGCGACATTAACATGGTCGTGAATGTATTCACCACTACATAAGTTTGCATATCACTCTTTCGATCATGATTTTAGGGCTTGTGTTTGCTGTGTCAGTACTAACATCATTAGGCTTCTGTTCTTTAGCTTGTTCTGCCATCACTGCACATTAAGCTTGACTCATTCTCGCGAGAATATGCACTTTATACTTCTCTTACGCTTCACGCCACCCCTGATAAGAGCAGCCCTGTTTCCGCTAAACTGCTTGAATCCTTTACCTCAGACCTCCACGATTAAAGGAAAGGGGCGGGACTTCCCGATGACGTCATAATGCAATGATGCGGCACTACTGTTTGCATGAGAAAGAATTGGCCAGATGTTCGAAGCTGACCAAAAATGGCAGAATAGTTTTTACAGAAATCGTTATTTTGacagtgttttttattcttACTGTTAATGATAATAAGTGCCAAAAAGGGCATGTCTGATATCATGAatattgtttctctctctctctctctctctctctctcaatttcAACGTCAAAATTGCACTGTGCTTAGTCATAGTTGCTATGTTTTCATGCTTAGAGGACACGACGcagttgtgtttttgtgcagtcGAGATGAATGCAAACTTATGGTTTAGCTGAGGTCGAGAAGGTCATTGCTTTTATGTGGGCGCATGGCTAGAGCTCGTCGCTCTTCCCAAACCCCACACGCCCCAGTCCAAACCCCACCCCCACGCCATCAGAAGACGACAGCCCGGGGTCACTCTTGAGCTCGTACCCATTGAAGCACCAGCAATGTTAGAATACATTTGTCATATCACTGTTCtgttctcttttttattttcctgtttttatttgtacgACACTCTCTAACCTAGACCAAGtataacaaaaatgtcattcataTGTATCCTGTTTACTCTCCCTTTTTCTCCCTTTTGCACTTTCACTGCTCCCCTTTTTTCCAACCACTCCCCACTCTTCTGCCGACCTCCCCCTCACACCCTCCCAGACTTTCTCCTGAGTgccaaacaaaaacagtacCATTCCAAACTTTTTGAGTTCTCTTGTATGTTGGACATCCATTGGACGCACCCATGAAGCCAGCATGTTTCTCCATAACATGATGTCAGTCATGACGCCTCAACATTACCCAAAAAGCGAGCAGTAAAAGCAAGACCTGGATTAACACGGTAAAAACACGGCTGGCTACCTCTCATAAACTGCTTTTCCTAATTCTGTCATCTCTTCAACCTCCAGGACATCACTGATTGTGTGCCATAATGTTGGGGGGCACTGTCACTCTCCTCACCCCCCGAGTCTCTCCATTTGATTTTCTCGATggaaaacattaagaaaaacaaaacaaaaaaaatccattttaatgGCAGGTTTCTTTTTGTTCCTTTAGCATAAAAACATGCTCAAAAAAGCTGAGGAGTGTGTAAACGTCAGCCGTGCAGCCATCTTCTGTCTTCTGAACTTTGAACTTCTCACCCCTCATGAACTTTATTGACCTTCTTCCTCCCCTTCTATGTTCATCAACTGTTTGGACTTAAAATCTCCATTCCATCTCCAAACCTTTTTGAGACTGTGCAATTCTAGTTGAGATGATTggatttatttctctttttttaagtcATCATTGGGGacgaaaaaaatcataataataaaaaaagacacacaaaagaaagaaaaaaaaatcaataagatCCAAACTGTTTCCTCcacaatttcattattttctctcATTGTAAATATCTGTCAGATTTGGTTGAACTGTAACCAGAAACGTGTTCAACGTAATGGGGCTGGCAGCATAAAATCGCTTTTGTGGAGTGCTCCTACGAGCCGCCGATAGGAAgttgaactaaactaaactaaagcagCTTCAAGAAAGAATGATTCGGTACTGCTATCAACAATTGAACACGGTGGTCACAAAGCCACTCGAGAAGTACCGAGACCATCAGGTGGTCAAAATCCAGATCCGGCCCCTCCACATAATGCATAATCACTACTAACCGCCAAGGTAGACTAAGATTAGTGTAGGTTTCATACTTGAACTGATGGTAGTTGCTAATCTCATTGTACATATCAGACGTGTCGAGTGTAAATTGTGATACGTGTCGATTAGGTGTCCTGATCATTGCAGCATCTGTTCACGAGACAAAATTGTTTCTCTGTGATGCCGAACGATCATTTTCATGCGTCTCAACCATGCTTGAGCTCCACATCTAATGTTTCTATGCTgccagctttgttttctgataaCCCTTCATgagcttatttattttcaaactaCTATACACTATTAATAAATGGCATCAAGAAACTAGACAAAAGGGAATGACTGGAAAGATgaattactgtttttgtttttagtattttagtggTTTCTTTTAACATCATCCATTAACTGacttaaaaaagtattaaatatttaatgtaactgTAGCATTGtgtttgtacaaaaaaatagtGAGTTGTGTTTCTTGACTTGTGGATTACCAGTGAAGTCAGCAATTTAGTGCTAATATCTATTAAGTcgttccttttctttttctctttttctttttttatttaagggTTATTATTTTCCGACAGCAACAGCAGTCattataaatgttcattttaccATCACCTGTCTTCTGTTGTCTTATTCTTCACCTCCCACTACACTCAGTTTCATCAAATAACACATTGCAAGTTCGTGCCTGAAACCATGTGCTCGGTCTTGGGGGAGGGGCCATGCTGCGTGAGTGATGCGAgcgaacgaacgaacgaatgCGACTGCTTGTGAGAGGCTTGGCCGGGTGGGTGTTATGTCTTCTGTCCACCTAAAGCTAAAATCTGTTTGGTTTCCATTTACCAATGGAACCTGCTGATGTTATAGCTCAATCCCATCATGTAAGCCTAGTTGATTTTGATCGTCCATAACTCCCCCTCCTCCGTTTGCCAACCACTTTCCACCACTACCTTTACCCTCCCCCCTTACGAGCCATTCCCTCGCCACGCACCTCCCACGCCATGTGATGTTCTCCATCGATAACATACTACTCGACCAGACCCACATTAACTCTGTTCTCATGCCTGCAGAGGAGGCGGTTGCCAGTCAACTCGCCCTCCGCTCATGATCCGCCACCATCCCTTATACCGGCTGCCAGGGCCAggttcaaattattaaataattgctaatttaaaaaaaaaaaaaagttaaaaaagaaaaaaaaaacgaaaaaaaaaaaaaacagacaagtgACTCTCAGGGTGTTTACGTAATCTACCTTACTCTGTGAACTCACAGAACCGCAACCCAGCTCTCCCTCAAGCTTTTTAAGGAGCCCAAAGACAATTTACCATGTACGATCGCTAATCAAGTCttcttcaagaaaaaaaaaaagacaacaacaactGAATGATATGCACCCAATTAAAGGAGCAAGCAAAATGCTGTAATGTTTACAATTTAACGAGACCAACGCTGTTGAAAGAATGTGTAGGAGTTCAAAGACAATTCTTTAATAATTACGTCATTACGAAGtgacttcattttaaatgataatttctATGTGACATGGAGTTATGTGTTAACTGAGGCATTTTGGAAACATTGCATGTTCCTCTTTTTTGCAAtgacttacatttttttaaatgtcagaatgGCTGGTACAGTGTAAAGTTAGAGCTACGTTTAGTTGCTAATAATAAACTACATTGATGTCAGTGTTCATCTCACATATCTTGGAGAAAGGTACCGGACTGCGGtccgaaaagaaaaaaaaattcatgtgaTTGCGTTACTGTATAgaatttgttcatatttgtatATGGTGACAGTGAAAATAAAGGATGTACTGGAAGTATCAGGGA
>XM_043258651.1
TAACAATATTATAGtaaaattagaattattattgGCTAATAGACGAGCCATTTAGAACTACGACTTTTAGTTTTCTCATCCCTGCGCCTATTTTACAACGATGCTCTCGCATTTTCATCACCGCCACCTCCTCCTGTACTGTCATGTGACGAGCAGGATTTATACACCGCTTTGCCGGAGAAAAATCAAACCTCGACCAATCACAGCTCGAGGTGGGCGTGTCCGTTTCTTCACATTTGACAGCCGCGGTCTCGGCTGCGCATGACGTCACCCGCTGCCCCGCGCTCCGGCAGAAACGCGCAAAGATGCTCTGAAAGCAAGACTGCAGCATCTCCGAGTCAGAGCCTACAAAAACATCGCATCTCCTCCAAGCGCTCGTCCAGCGCTTCGTCGCCGTCCAGGGTCTGCCCACCTGCATGCGGGATccgctgttttttttgtctctctctcgcctCTTGTACATTTCCCGTTGCTATTTATTATCCGCGCGCATCttcccagtttttttttaaaagtagtgaATCCTATAAGTTCCGCTGACCGCTGAGGTCATATATTGTTTCCAGCAGGAGAGCGCCGTCGCAGAGCCACGAGCGAGGACGTTTCCCCACATCACTTGTTATTAATATCAGCCTGAGCATAATCGAGCCACTGGATATCGATGCGTCTTTCGTTCAGTATCTAGGCTGCTACGGAGGATCGACGCACCCCAAACATTCATATCATCGTGGTTTCACATTTAGAAACGACCATATCTGCGTACCGCGTCTAGGGAAAACGAGCGCGAGCCTAAAGcttctttataaaaaatgatGGCCGGTGGGGCAGTGCAGCAAAACGGGATTTTCTCCAATCCGCATCATCACAATCAACAGCCGCACATGGAGTCTGATCCCCCCGATTCCCGCAAAAGACCCCTGGAGACCCCGACGGAGGCCAGCAGCACCAAACGCACAAACACAGGAGAGGAAGGCGAATATTTCTTGAAGGTGCTGATTCCAAGCTATGCCGCAGGCTCCATTATTGGCAAGGGTGGTCAGACTATTGTCCAGCTACAGAAAGAGACAGGGGCCACCATCAAGCTGTCCAAATCCAAAGACTTCTACCCGGGAACAACAGAGCGTGTCTGCTTGATTCAGGGCACTGTAGAGGCGCTGAACAGTGTCCATGACTTCATCGCAGAGAAGGTGCGGGAGATGCCTCAGAGCGCTCAGAAAACAGAGCCGGTTAGCATACTTCAGCCACAGACCACCGTCAACCCTGACCGTGTCAAACAGGCCAAGCTCATAGTGCCCAACAGCACGGCAGGGCTGATCATCGGCAAGGGCGGAGCCACGGTGAAGGCCGTCATGGAGCAGTCGGGCGCCTGGGTCCAGCTCTCACAGAAACCAGAAGGCATCAACTTGCAGGAACGCGTTGTCACCATCAGCGGAGAGCCTGAGCAGAACCGCAAGGCCGTGGAGATCATTGTGCAGAAGATCCAGGAGGACCCACAGAGCAGCAGCTGTCTGAACATCAGCTACTCCAACATCTCTGGCCCCGTGGCCAACTCCAACCCCACCGGTTCCCCGTACGCCAACTCGGCAGAGGTGATGCCGGctgctgcagcagcagcagcggccaCAGCCTCCAGTCTCCTAGGGCAGGCCAGTCTGGCAGGTGTGGGCGCTTTCCCCACCACCATGTCCAGCTTCTCAGGGAATGACCTGCTGGCTATCACATCTGCGCTAAACACGTTAGCCAGCTACGGATACAATACCAACTCCCTGGGCCTAGGGCTCAACCCTGCGGCTGCCTCAGGGGTCCTCGCCGCTGTGGCTGCAAGCGCCAACCCCGCCGCAGCTGCGGCCGCTAACCTGCTAGCCTCATACGCCAATGACGCATCCACCAGCTCCGGCCACCCTGCGACCAGCCTGGGAGGCTTCACGCTAGGCTCGCTCGCTGCCGCCACCGGAGCCACCAATGGCTACCTGAGCGCCGCTTCCCCGCTGGTGGCGAGCTCCCTGCTGGCCACCGAGAAGCTGACCGAGGGGGCCAAAGATGTGGTGGAGATTGCTGTGCCGGAGAACTTGGTGGGCGCCATTTTGGGGAAGGGAGGCAAAACGCTTGTGGAGTACCAAGAACTGACGGGAGCCCGCATTCAGATCTCCAAAAAGGGAGAGTTTGTTCCTGGCACCAGAAACCGTAAAGTTACCATTACTGGATCGCCAGCCGCCACACAGGCAGCCCAATATCTTATCAGCCAGCGAATCACATACGAGCAGGGTGTGAGGGCCACCAATCCGCAGAAGGTGGGCTAAAAACAGGGAGTAtgaaaaaaggagagaaaaagagtggGGGATGGGGAAGATACAGAGAAAGATGGAGGGCGCGAATATCGACGAAAATTGCCCACATTCTTTGTGGGAAAAAtctcagtattaaaaaaaaaaatggaaagaaatcCTCTCAAAGTGGAAaatttgaaacagaaaaatgtgtaaaatgtaaatatgggTTTAATCCTTAAGTTCGGGATTTTTATtggttgattttgttttgtttttcttttgtttttgttttttttgtgcattttctggACAGCAGTGAATGGCATTTCAACCTGGCATGCTGCCGCGCTGCAGTTCCCAGCAGGTGGGCAAGGTGGTCGGATGGGGGACAATGGGGTGGAGCAATCCCAGGAATCGGCCCTTCCCCACCCCCATCCCCTCCTAGCTGAcagatttttgttctttaattttTTAGTCCTTAGTTTTAACTCCCACCCTTTCGCCCATGCCTTCTCTTTAAGAGGGCCTGAGACTGATTATTTACCCCCAGTCTGTGACACCCCATACCCCACCCCAGCCCCTCGCCCCAGCCCTCTCAATCCCAGCCGGCCCGACCCTGCTCCGCGAACGGGCAGGATAGGGCAGGGGATACGAGGCTGCTGCAGGGTCTCTCAGCGCCACTAGACATTGACCTGGGGTTCCAGTTGGACCAGGTGCATGCCACTACAGATGTTGTTAGCATAAGGGAAGCTTGTAGATCATGTTGCGGACATAGGCCAGGACGCAAAACGCACCTGAATCTTTCGTACCAGAGCTCCTAGAAAATTGTGGCATTCGTCTATGGGATTTGAGGTCTGGTGTTTATACAAatactattatcattattattattattattactactactattattattattacaaattatcaTCACCATCAacgttatttattaatatgatttcaCCCATAAGGACTGAGgtatttccttttgtttttcttaatctGTGAATTCAGGTTGACATGAATGTAAAGACAATAttttggatttagttttttatttaagtagATTGAATCGTGTGTCCATGTAATATATGTCTTATTTAACGTCCAGTGATAACTGCACCGTCGGCACCAACAGAGAGAATAGGGGCAGATGTACTGTACAGTGatattaatacaaacacacacactcagcaaaCTATTACCAGATTTAAACGCTGAAAATGCAACTAAACATACGCAGACTTGAAATCACACCGGGACTAGACAATTTATTCACATATCTACTGAAAGAGAATGTAGGTCTTTGCACAAGTCCAAGGGAGTGTCAGAATACGACTTTATATGaaagccaatctttttctgtaaCGTCCCAAAACATATCCCCATCTTTACTCAGTGCTGCCCCTCTGCAGCGTGAGAGATTGTGCACTTTGAGCCGCTGCAGTCGAATATCTGCGCAAATCTGCTGGAAAATTTGCGTAGATATTCCACATCAAGTCAGAAATTGGCCCTCAGAGCTCTGAGGCGTTTCATGAACAACATACTACTGAACGACTATGAACAAATTCTGATCTGCACAGGCTGCTCTGTAACATGGAAGCCCCAGGTTGTCTGTTctataacagtttttttaatatacgaGTCACCAGTAAATTCAATCCAAGAACGGCCGCCAGTGTGAAGATCGTCCTGTGCAGATCTGAACTACCCATGTGCGACTTATGTGCTGCTAATAAGGTCctatttcctttttgtttttgaatctgAGTACACTGAATTTCGTCTTAATGCACTGTGAAGTGTGGAGGCCGTGATGGAAGGCCAAAAAAAAGTCAGGGTTTCTATATCGTTATTGCATTGATGCATCACCATGATGGAATGTACTCATGTGGAACGTCTCATATTTATAACAACCTACATGGAGTCAAGGTATCGCTTACCGTAGGGCGGAAAGGAAGCCTGGATGGTTTGTTAGGTTGAGGTCAGACTCTTCGGACCAGTTTTTTGGCATCATGTTGCAGTATCCAACCTTAACTTTCCAAGTGTGCACTAACTACCCGCCAGCTGACTGTATATTTATCGTGAAGGGGCAGAGGATGGTATATTCTGTACGTTTAAACTCGAGGTGTCCTCCGAAATGATTCTGTGTCTAAACAACGACATATTGATTCTTTTCCCGGCTGGAATGAGCTTAAAAATACCAAACTGCTCCTTATTATCAAGACTTTAGGCCAGAGAGCATTTCCCAAAGAAGAATTAGACCAACAGAAAAAGACAGAgtttgtgctctctctctcccaatGACTAAAGTTATGATTCTTTCCTCTCCTTTGCTATTGGAGCACCAGGGAGAGTAAATCTGAACCGATTGGTAAGGAGGCTTCTTTATTCTCATCTAAAAACCATCACCTCCCCTCACCTCTTCTCAACACCCCTTTTTACCTTCGTGCACCCCCATTCTGACACATCAACCCAGAGACCCCCTTTTCTCTCACATCTCTCCATGGGTGGCGATGTCTGGTGTAACAGTGCATGTCTGCTTGCCCTTTCACAAAACAATGAACGTCGCGAAAGGGAAGATGCGCCTACAGAGTAGAACTAGAAGCTTGCAGTAGATCACGATTGCGCACATCACACCTTCAAAAAGGGACCTAATACGAGCCATCCATGTGTTTGTAtggtgtgcatgtgtgtgtaaatgcgtGATAAGTTTGGataaatatgaatgtgtttAGCAGTTGCGTCCAAGGTGAGGAGGTCTGAAACAGCAATGACTCCAGGTACTCTACTAGAAGATAGTTGCACGTTTTTGTTGAGgtgcaattttcaaacaatATGACGTAATAGTTCAGATTTGAAGATGAGGAAGCGATGGCAATCGAGCGCCTCCGCATTTTAGAGTGCATCTGTGTGTTCGGTTTTACCCATGATGCAGTACTTCATCAGACACTTCAGAGCTTGAACGAGTCTCGGTAGATCCCccagaaatttttttttcttgtttaaaaaaagcggTTACATCACCGTTTGATTTAAGACACATTAAAAGCAAGATATTACTGTGACAATTCAATGTGAAAACTATAAAAAGGTGCCAACATAGTGTCAAGGAGCagctttctgttttgttgtttttgtattcagtACTGAAAGTACATATGGGAGGGGGTCtcggtttttttattttgttttttgttagtaACTGGGAAAATAGATCAAATGTGATGAGTACTGAAAGCAATATACGTAGTAGCATGTCGTCATGTCTTGTCCTTTTATTCTGTCTGTGTAGGAGCTTTGGATTTACCTAGATGTTGAGTAGATTTGCATATACTATTTTTTAAGTTGTGAAGATGCTGCTATTGAATAAGTGATGTACTaaaatttaagattaaaaaacatatcTGGTCAGTCATTTAGCAGGATGTGGTAGTTGTAAGAGGtgtaactaaatgctacattgATAACGAAATAATTGCTATATCAATGGATTAAATAAACCTGTGCCAAAATAGATCTTTAcagatttaaatgtgatttaaacaCCATTAGTTAAGAGCAGACAtacttttgtaatttaaaaaaaagaaaaaaaatgtgaaaagtgcCAAACAAGCCACAGTTAAGATATAACTAGCGGGGGTAAAGTGACTagagaagcaaaaaaaatagacattagCACTATAAGGTTTTCTGCCCCCTTAAACTAACTAGTCCTTGTTAAAAAAGAAGGGTGGGATTCATCTCGTAGGCCAAACAAAAGCAGGGTGCCATGTGGCCATTAACACACATCCCCTGGGGCTAGAAGACTGCCGAGTTAGCTTAGCATGGTTAAAGTTTTATAAGTTATCAGCATTCTTAAGTCAGCCTTTTATagttctgaaaatgtattttgtgaaGATAGATGTTATCTTTTTTGCACGTCGATATTGCATGATACCAAGTGAAGcgtggatttaaaaaaaaaagtgaagacaaaaaattgtacaaaaaaaaaaaaacaattaggcAATGTGCATTCATTTTGAGGACAAATCTTTGCATGGCAACAACAGTTCGAGctattaaattagcttttttcacatttttacctttttatttttagttttgctaAGACCAAGCTGGAGTTTTTGTTGTCCATGAAAACTAGGCCACAGAAACCAAATCCATTCATAGTCATGGTCATATTCAGCGTCATAACTATAGCACTCATTTTGTACAGACTTATCAATGTTTTGTGATAATTTCTAAGAAAAATAACGGGAAAAGTTGGGTAATGGAGGGTTAATTTAGCGACATTAACATGGTCGTGAATGTATTCACCACTACATAAGTTTGCATATCACTCTTTCGATCATGATTTTAGGGCTTGTGTTTGCTGTGTCAGTACTAACATCATTAGGCTTCTGTTCTTTAGCTTGTTCTGCCATCACTGCACATTAAGCTTGACTCATTCTCGCGAGAATATGCACTTTATACTTCTCTTACGCTTCACGCCACCCCTGATAAGAGCAGCCCTGTTTCCGCTAAACTGCTTGAATCCTTTACCTCAGACCTCCACGATTAAAGGAAAGGGGCGGGACTTCCCGATGACGTCATAATGCAATGATGCGGCACTACTGTTTGCATGAGAAAGAATTGGCCAGATGTTCGAAGCTGACCAAAAATGGCAGAATAGTTTTTACAGAAATCGTTATTTTGacagtgttttttattcttACTGTTAATGATAATAAGTGCCAAAAAGGGCATGTCTGATATCATGAatattgtttctctctctctctctctctctctctctcaatttcAACGTCAAAATTGCACTGTGCTTAGTCATAGTTGCTATGTTTTCATGCTTAGAGGACACGACGcagttgtgtttttgtgcagtcGAGATGAATGCAAACTTATGGTTTAGCTGAGGTCGAGAAGGTCATTGCTTTTATGTGGGCGCATGGCTAGAGCTCGTCGCTCTTCCCAAACCCCACACGCCCCAGTCCAAACCCCACCCCCACGCCATCAGAAGACGACAGCCCGGGGTCACTCTTGAGCTCGTACCCATTGAAGCACCAGCAATGTTAGAATACATTTGTCATATCACTGTTCtgttctcttttttattttcctgtttttatttgtacgACACTCTCTAACCTAGACCAAGtataacaaaaatgtcattcataTGTATCCTGTTTACTCTCCCTTTTTCTCCCTTTTGCACTTTCACTGCTCCCCTTTTTTCCAACCACTCCCCACTCTTCTGCCGACCTCCCCCTCACACCCTCCCAGACTTTCTCCTGAGTgccaaacaaaaacagtacCATTCCAAACTTTTTGAGTTCTCTTGTATGTTGGACATCCATTGGACGCACCCATGAAGCCAGCATGTTTCTCCATAACATGATGTCAGTCATGACGCCTCAACATTACCCAAAAAGCGAGCAGTAAAAGCAAGACCTGGATTAACACGGTAAAAACACGGCTGGCTACCTCTCATAAACTGCTTTTCCTAATTCTGTCATCTCTTCAACCTCCAGGACATCACTGATTGTGTGCCATAATGTTGGGGGGCACTGTCACTCTCCTCACCCCCCGAGTCTCTCCATTTGATTTTCTCGATggaaaacattaagaaaaacaaaacaaaaaaaatccattttaatgGCAGGTTTCTTTTTGTTCCTTTAGCATAAAAACATGCTCAAAAAAGCTGAGGAGTGTGTAAACGTCAGCCGTGCAGCCATCTTCTGTCTTCTGAACTTTGAACTTCTCACCCCTCATGAACTTTATTGACCTTCTTCCTCCCCTTCTATGTTCATCAACTGTTTGGACTTAAAATCTCCATTCCATCTCCAAACCTTTTTGAGACTGTGCAATTCTAGTTGAGATGATTggatttatttctctttttttaagtcATCATTGGGGacgaaaaaaatcataataataaaaaaagacacacaaaagaaagaaaaaaaaatcaataagatCCAAACTGTTTCCTCcacaatttcattattttctctcATTGTAAATATCTGTCAGATTTGGTTGAACTGTAACCAGAAACGTGTTCAACGTAATGGGGCTGGCAGCATAAAATCGCTTTTGTGGAGTGCTCCTACGAGCCGCCGATAGGAAgttgaactaaactaaactaaagcagCTTCAAGAAAGAATGATTCGGTACTGCTATCAACAATTGAACACGGTGGTCACAAAGCCACTCGAGAAGTACCGAGACCATCAGGTGGTCAAAATCCAGATCCGGCCCCTCCACATAATGCATAATCACTACTAACCGCCAAGGTAGACTAAGATTAGTGTAGGTTTCATACTTGAACTGATGGTAGTTGCTAATCTCATTGTACATATCAGACGTGTCGAGTGTAAATTGTGATACGTGTCGATTAGGTGTCCTGATCATTGCAGCATCTGTTCACGAGACAAAATTGTTTCTCTGTGATGCCGAACGATCATTTTCATGCGTCTCAACCATGCTTGAGCTCCACATCTAATGTTTCTATGCTgccagctttgttttctgataaCCCTTCATgagcttatttattttcaaactaCTATACACTATTAATAAATGGCATCAAGAAACTAGACAAAAGGGAATGACTGGAAAGATgaattactgtttttgtttttagtattttagtggTTTCTTTTAACATCATCCATTAACTGacttaaaaaagtattaaatatttaatgtaactgTAGCATTGtgtttgtacaaaaaaatagtGAGTTGTGTTTCTTGACTTGTGGATTACCAGTGAAGTCAGCAATTTAGTGCTAATATCTATTAAGTcgttccttttctttttctctttttctttttttatttaagggTTATTATTTTCCGACAGCAACAGCAGTCattataaatgttcattttaccATCACCTGTCTTCTGTTGTCTTATTCTTCACCTCCCACTACACTCAGTTTCATCAAATAACACATTGCAAGTTCGTGCCTGAAACCATGTGCTCGGTCTTGGGGGAGGGGCCATGCTGCGTGAGTGATGCGAgcgaacgaacgaacgaatgCGACTGCTTGTGAGAGGCTTGGCCGGGTGGGTGTTATGTCTTCTGTCCACCTAAAGCTAAAATCTGTTTGGTTTCCATTTACCAATGGAACCTGCTGATGTTATAGCTCAATCCCATCATGTAAGCCTAGTTGATTTTGATCGTCCATAACTCCCCCTCCTCCGTTTGCCAACCACTTTCCACCACTACCTTTACCCTCCCCCCTTACGAGCCATTCCCTCGCCACGCACCTCCCACGCCATGTGATGTTCTCCATCGATAACATACTACTCGACCAGACCCACATTAACTCTGTTCTCATGCCTGCAGAGGAGGCGGTTGCCAGTCAACTCGCCCTCCGCTCATGATCCGCCACCATCCCTTATACCGGCTGCCAGGGCCAggttcaaattattaaataattgctaatttaaaaaaaaaaaaaagttaaaaaagaaaaaaaaaacgaaaaaaaaaaaaaacagacaagtgACTCTCAGGGTGTTTACGTAATCTACCTTACTCTGTGAACTCACAGAACCGCAACCCAGCTCTCCCTCAAGCTTTTTAAGGAGCCCAAAGACAATTTACCATGTACGATCGCTAATCAAGTCttcttcaagaaaaaaaaaaagacaacaacaactGAATGATATGCACCCAATTAAAGGAGCAAGCAAAATGCTGTAATGTTTACAATTTAACGAGACCAACGCTGTTGAAAGAATGTGTAGGAGTTCAAAGACAATTCTTTAATAATTACGTCATTACGAAGtgacttcattttaaatgataatttctATGTGACATGGAGTTATGTGTTAACTGAGGCATTTTGGAAACATTGCATGTTCCTCTTTTTTGCAAtgacttacatttttttaaatgtcagaatgGCTGGTACAGTGTAAAGTTAGAGCTACGTTTAGTTGCTAATAATAAACTACATTGATGTCAGTGTTCATCTCACATATCTTGGAGAAAGGTACCGGACTGCGGtccgaaaagaaaaaaaaattcatgtgaTTGCGTTACTGTATAgaatttgttcatatttgtatATGGTGACAGTGAAAATAAAGGATGTACTGGAAGTATCAGGGA

Function


symbol description
nova2 Predicted to enable mRNA binding activity. Predicted to be involved in mRNA splicing, via spliceosome and regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome. Predicted to be active in cytoplasm and nucleus. Is expressed in nervous system; neural plate; and posterior cardinal vein. Orthologous to human NOVA2 (NOVA alternative splicing regulator 2).

NR:

description
PREDICTED: RNA-binding protein Nova-1 isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0003723 RNA binding molecular_function

KEGG:

id description
K14944 NOVA; RNA-binding protein Nova

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043258650.1 True 10501 mRNA 0.44 5 15516104 15567549
XM_043258651.1 False 10426 mRNA 0.44 4 15516116 15567549

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
ankrd13b ankrd13b,LOC107743633,LOC107548583,LOC107669714,LOC107756832,LOC107589713,LOC107685087 coding upstream 68631 15424339 ~ 15447473 (+)
pitpnaa pitpna,LOC107743636,LOC107669737,LOC107548584,LOC107685084,LOC107756865 coding upstream 114151 15395001 ~ 15401953 (+)
slc43a2a slc43a2,LOC107548581,LOC107685082,LOC107589710,LOC107669718 coding upstream 122015 15374883 ~ 15394089 (+)
si:dkey-118k5.3 LOC107743635,LOC107548579,LOC107756915,LOC107685081,LOC107589709 coding upstream 142106 15368087 ~ 15373998 (+)
myo1cb myo1c,LOC107756890,LOC107743634,LOC107685083 coding upstream 148338 15329872 ~ 15367766 (+)
LOC122359367 LOC107669715,LOC107548559,LOC107743735,LOC107757374,LOC107685158,LOC107589739 coding downstream 56667 15624216 ~ 15636880 (+)
LOC122358640 cryba1b,LOC107581934,LOC107731981,LOC107713158,LOC107587221,LOC107704801,LOC107675182 coding downstream 77014 15644563 ~ 15647849 (+)
LOC122358489 LOC107756729,LOC107589721,LOC107685095 coding downstream 91439 15658988 ~ 15661655 (+)
gipr gipr,LOC107548593,LOC107714193,LOC107685094,LOC107756746 coding downstream 233180 15800729 ~ 15819146 (+)
clip3 clip3,LOC107685098,LOC107714192,LOC107548591,LOC107669746 coding downstream 258612 15826161 ~ 15837908 (+)
G106926 NA non-coding upstream 4994 15510317 ~ 15511110 (+)
G106898 NA non-coding upstream 33432 15397722 ~ 15482672 (+)
G106873 sarm1,LOC107548548,LOC107669752,LOC107743642,LOC107685076,LOC107756984 non-coding upstream 224941 15290829 ~ 15291163 (+)
G106872 sarm1,LOC107743642,LOC107669752,LOC107548548,LOC107685076,LOC107756984 non-coding upstream 225618 15290156 ~ 15290486 (+)
G106863 NA non-coding upstream 270290 15245605 ~ 15245814 (+)
G106941 NA non-coding downstream 69625 15637174 ~ 15638029 (+)
G107113 NA non-coding downstream 326584 15894133 ~ 15894624 (+)
G107136 LOC107588392,LOC107666206,LOC107756564,LOC107682478,LOC107589735 non-coding downstream 432666 16000215 ~ 16002131 (+)
G107141 NA non-coding downstream 501935 16069484 ~ 16069741 (+)
G107145 NA non-coding downstream 572264 16139813 ~ 16167005 (+)
tbx4 tbx4,LOC107548556,LOC107664909,LOC107757041,LOC107685071,LOC107743740,LOC107589698,LOC106612866 other upstream 587879 14912911 ~ 14928225 (+)
aifm4 aifm4,LOC107585620,LOC107685174,LOC107664913,LOC107743746 other upstream 1554297 13957197 ~ 13961807 (+)
G106376 cluh,LOC107685050 other upstream 1598842 13916573 ~ 13917262 (+)
spa17 spa17,nrgnb,LOC107709112,LOC107696004,LOC107586300,LOC108278372,LOC107601687,LOC107657238,LOC107717271 other upstream 2667437 12837582 ~ 12848667 (+)
tnfaip1 tnfaip1,LOC107586309,LOC107729096,LOC107662792,LOC107657549,LOC107597551,LOC107728221,LOC108425816 other upstream 3418458 12093957 ~ 12097646 (+)
G106937 eml2,LOC107669753,LOC107743713,LOC107548590,LOC107685092 other downstream 138964 15706513 ~ 15712439 (+)
G107107 NA other downstream 313565 15881114 ~ 15883510 (+)
gdpd5b gdpd5,gdpd5b,LOC107714175,LOC107666190,LOC107682503,LOC107756554 other downstream 437320 16004869 ~ 16043265 (+)
G107148 nrip1a,LOC107587564,LOC107714172,LOC107666194,LOC107682571,LOC107756533,LOC107589737 other downstream 522208 16089757 ~ 16236341 (+)
lyrm9 lyrm9,LOC107756492 other downstream 945759 16513308 ~ 16514221 (+)

Expression



Co-expression Network