LOC122359963


Basic Information

Item Value
gene id LOC122359963
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056714.1
NCBI id CM032083.1
chromosome length 28146790
location 14633214 ~ 14638332 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU166357
tGCACAGACCTTCTTTAACATTAacacaatcaaatatatttttgatacaaATTTTAAACTTAATACCAAAATAAATCACTTGCATTTAAATCAGCATGAGTCGCTACGTTTTTGCatatgcattgttttatttctttaatacaaCACGGAGATCATTTTAGGCTTTTACTATGTGGAAAAGCCGCACCATGCAATGATAATGAATTAGAACTCAGTAACAGTTCgttctttagcttttttttttttttttcagcacaaaTGAAGTGTGCATTTGCGTGTTTGTTTAAAGTGAAACATAAAGCATCGCATGACCCCCTGCCAGGAAATCGCACATCTTCAGGAGACGAAGAGGGTGCAAGTTCTCCTGACTGGCTTCTTGTTCTCATCGTGGGGGGTGTCACTGTGTTTTCCATATCTGTTATCTGACTTTGTCGGAAGAAGATAAAagtgCGAGAGTATCTAGTGTCTTTTAGCAATAGGTCAGTTAGAACTAGTTAATCTTAGTCTTAGTTAGAATGTCTGAATACATTTGAACCTTTTCTGATGATATAAGGCAAGGCAAACCACTTGTCACGAGGGGTCCAGTCCCACTCCACCGATGACAACAAGAGAAGAGTGATAGAAACATGTAGTCTGGCGTGCCGACGCGGTGATGCTCAGAACAGACCAAAAACAGTTCGGCCTGAATCGGACCTCAACGTCTGGCACACTTACTGTATTTACAACACCCCAGCTCAGCAGTTCAGTTGAACGGATGAATCTCTTGAATACAAGAGAGCTGAGAGAagctcctcttcctcttcctcttcctcctcttcagaCGTTACGTGGGGCCGTCTGTGTCTCTTTGACTGGAGGCGGGTGTTAGTAACCCTTCCCCGGGACGCCCAGTGTCACTCTGCTCCTTCTCTGCATGGACTTTTTACTACGCTTGCCTGATCGTTTGCTTCTATGTGATATTTGCTCTCAGTGGATTGTTAAAGACTATCGTCGTCTCTCATCTTcatctctgtgtttgtttgcgcAACCTGAGCGTGACAGTGCGATCGCCCCGCCTACTCTcggaatgaaatgttttttgttatgtCAGCCAGTTACCTGAAGCTAATTTAGTGATTCATTGTGGCGGTATTCTCAGTAGCAGATGAACTCATATCCTCCCACAGTCTCAGCTTAACAGTGTAGGCTGCTTTCATAACTCGagagagttaaaaaaaataaaagctagaCGATACTGAGCACAATATTGCTGCTGTTTGAGGCTGCTTTACACCGCAATTTGCCTACCTAATTACAATTAAGTGGGCCTTTATGTGGAATACGACAGAAATACAGAAAGGGAGAAGTGTAGGAATAAGGAATAAGAATAAGCAAGGCTACGAAAAGAAAGGGTTTACCAGTAGTGCtcttatacaaaaaaaatggtgcTTGGTCGGAGCGGTCATGCATGACAAAAtgagaagtaaaaaaaagatacatttattttaatgcttgcTGCAAGAATTTAAATGAATCCTAATCTAATCGTATCCATTGAGAGCAGTGGAGCTACGATCAGTTTACTATGATTTTGGTAAATGCAGCAAAGTTGTCTTTGACGTTATAATGCTCGGTGTCGGTTGTTTTCGCATTTTCCTTTATAGTAAACG
>XR_006252747.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU166357 False 1649 lncRNA 0.41 3 14635563 14637393
XR_006252747.1 True 4485 lncRNA 0.38 4 14633214 14638332

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122360165 NA coding downstream 88472 14540215 ~ 14544742 (-)
LOC122360164 NA coding downstream 100139 14526845 ~ 14533075 (-)
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aqp10a aqp10a,LOC107673770,LOC107714675,LOC107596410 coding upstream 44496 14682828 ~ 14688168 (-)
si:dkey-92i15.4 LOC107714676,LOC107673754,LOC107594846,LOC107577098 coding upstream 49399 14687731 ~ 14697088 (-)
tuft1a LOC107582063,LOC107723549,LOC107714678,LOC107673742,LOC107594884 coding upstream 63566 14701898 ~ 14714966 (-)
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G112479 NA non-coding downstream 336642 14292739 ~ 14296572 (-)
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G112473 NA non-coding downstream 422681 14208396 ~ 14210533 (-)
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G113039 NA non-coding upstream 308263 14946595 ~ 14947384 (-)
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LOC122359961 riiad1 other downstream 45345 14582479 ~ 14587869 (-)
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G112478 NA other downstream 331595 14234554 ~ 14301619 (-)
zgc:92606 zgc:92606,LOC107724707,LOC107549485,LOC107598403,LOC107672985,LOC107744286,LOC108432344 other downstream 949305 13654060 ~ 13683909 (-)
rxrbb rxrbb,rxrba,LOC107596638,LOC107581542,LOC107752838,LOC107743171,LOC107566635 other downstream 2254765 12363785 ~ 12378449 (-)
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LOC122359907 LOC107594909 other upstream 270288 14908620 ~ 14913646 (-)
si:dkey-246i14.3 si:dkey-246i14.3,efna4,LOC107595001,LOC107714708,LOC107723547,LOC107677033,LOC107582070,LOC108269281 other upstream 332209 14970541 ~ 15015462 (-)
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LOC122360651 LOC107596174,LOC107714662,LOC107714661 other upstream 726856 15365188 ~ 15375304 (-)

Expression


Co-expression Network