G113149 (LOC107723544,LOC107714703,LOC107657612,LOC107723413,LOC107699537,LOC107596479,LOC107596180,LOC107595112,LOC107596500,LOC107714702)


Basic Information

Item Value
gene id G113149
gene name LOC107723544,LOC107714703,LOC107657612,LOC107723413,LOC107699537,LOC107596479,LOC107596180,LOC107595112,LOC107596500,LOC107714702
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056714.1
NCBI id CM032083.1
chromosome length 28146790
location 15381431 ~ 15397665 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU167066
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>TU167073
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>TU167075
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>TU167076
CCAAAAGTCAGGACAGCATGtgtctttatttgcttttaataattaaacaagactactatatatataataataactatattataggaataaatagtatattataagaaagaaacacaacCTGGTTCAAAATGAACTGTCAATGGTGTGTCAAAAGACAAACTTCAAATACAGCATATGCAAGAATACAAtcaattatcatttatttatttattttcttcagggCAATGCTCAGTAcgttttgtgtttgcataatTTCTTTGTATGACACTATTTATCATTTGCctgaaacagtattttttacCACTAGAGTGCACTGTCACTGTTAGCGACGCCTTATGAgtattccttttatttatttatacaaaaaatgtcataatggATGTTATTATCAATTTCTGCACGGAAGCAAATTATTGGGATATTGGGACATTAGTACACAAAACTGAAGtgataaaacaaactcaaatgAAGCATTCATAGAAAATCTCTCAAATTTAgctaaaatattgataaaagtCTAAATTATTAAGGCATCTCAAGACAACTTATTGTGCCCcctgaaatgtattatttgctGAAATGAACTATAATAGAATTAATAATGTgcataattcaataataaatcTTCTTAACATAGTCTGGCATAATAGTGCCAGCACAGAGATATTAAGCTCGTACGTTTTCCTAAATTGGACATGCAGTCTTATTTATCAGCCACAAATGATAATGGATGCCATGCGTTTGATTACTGCAATAgtaagaaaagacaaaaaaatactaaaaacatcacaatgtaGCAGAATTGGTAAAGAGAACTCCAAAATAACTTTGCAGATTAATTACGGGCCTGGGGATCTCGAGGTGATGCagcaaaatacatttgcatttcccTCAGATATTGGCTCATATTATCCTTGATCTCAGCAGTGTAGGGCTCCAGCTGAGCCTGCAGCTCCTTCACGCTCTGCTCCAGGTTTCCTTTCAGCTCCTCGCTCTTCTGGAGCAGAGTGGCCTTCAGGGTCTCAGAGTCCAGGTTGTCAGCATACGGAGCCATGGCCGTCCTGAGCTCCTCCACTCTCTGCTGGATCTGGCTCTTCAGGTTGTCAGCATATGGCTCCAGTTTGTCTCTCACGCTGATCAGGTCTTGGCCCAGACGCTCCCTCAACACTTCAGCTTCCTTGGTGATTTTGGTCATTAGCTCTTCAGTCAGAGGATCCATCTGCTTCTTGATGGTGACGGCGTATTCGCTGGCCATATCAGCACCCTGGGTCAGTCTGGTACTGTAATGCGAAAAGGTGAAAggtttatttgcattaatgcaactcaatatttaagtatttcaaacacagactgtaacatttatacattactTACTTGACTTCCTGACCAAGTTGAGATTCTCTGATCATCTTCAGCGTGTCCTCTGCAGTGCGTGTGGCCTGGGCAACATAGCTCCAGAAAGCATCGGTCAGCTGCTCCAGCTGTGGCTTGGGCTCATCAGCATAAAACAGGTTGGCTTGGCAGCCtggtaaaatacaaataactaGGTTTAAGCCTACTAGTCTTTTCACAAATCTGCTCAAACAGctaaatattacagtatgtCATGTTCTGTGGTttctttgtatatttacatgacAAGTTGCAATGCAGATCTTAGCATAGttctaatataattttaattgataaatacatatatattttgcttcTTGGCCATATCAGATTTACCTGTGAATGCCACGAAGGCAAGTACCAGAtacaatttcattttcaaagttgtttgctaaaaaaaagagagagagataaatattatttacattgacATATTCTAAAGCattgcatatttgtttagacgttacttttcattttgttgaagcattttagtaatttattattgcCAGCAAGCTTATATTACCTTCAGGTTCCACAGTTATTTCTTAGTCCAGTAAGCATTAGTGAGTACAGACACTGGCTATATAtatgac

Function

NR:

description
PREDICTED: apolipoprotein A-I-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU167066 True 2428 lncRNA 0.38 5 15381431 15397665
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TU167076 False 1985 lncRNA 0.37 3 15381431 15385780

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122360842 NA coding downstream 38660 15342331 ~ 15342771 (-)
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LOC122360651 LOC107596174,LOC107714662,LOC107714661 other downstream 6127 15365188 ~ 15375304 (-)
rps27.2 rps27.2,LOC107699547,LOC107582081,LOC106605923,LOC108429942,LOC107589412,LOC106598061 other downstream 74820 15301874 ~ 15306611 (-)
si:dkey-246i14.3 si:dkey-246i14.3,efna4,LOC107595001,LOC107714708,LOC107723547,LOC107677033,LOC107582070,LOC108269281 other downstream 365969 14970541 ~ 15015462 (-)
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si:ch211-105c13.3 si:ch211-105c13.3,LOC107673711,LOC107594941,LOC107582067,LOC107677027,LOC107735771 other downstream 476524 14899182 ~ 14904907 (-)
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G113203 fpr1,LOC107714672,LOC107699476,LOC107593626,LOC107657616,LOC107595349,LOC107723415,LOC108429924,LOC108265369 other upstream 419314 15816979 ~ 15819086 (-)
G113220 LOC107714743,LOC107699517,LOC107595378,LOC107657670,LOC107593630,LOC107723558 other upstream 459934 15857599 ~ 15861893 (-)
adnp2a LOC107714821,LOC107699502,LOC107723537,LOC107595567,LOC107657688 other upstream 603648 16001313 ~ 16006471 (-)

Expression


Co-expression Network