LOC122360078


Basic Information

Item Value
gene id LOC122360078
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056714.1
NCBI id CM032083.1
chromosome length 28146790
location 27584654 ~ 27592026 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU172536
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>XR_006252760.1
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Function

GO:

id name namespace
GO:0005770 late endosome cellular_component
GO:0044440 obsolete endosomal part cellular_component
GO:0031902 late endosome membrane cellular_component
GO:0010008 endosome membrane cellular_component

KEGG:

id description
ko04144 Endocytosis

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU172536 False 3199 lncRNA 0.40 3 27586903 27592021
XR_006252760.1 True 4540 lncRNA 0.40 4 27584654 27592026

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122361070 tppp,LOC107659066,LOC107677661,LOC107565752,LOC107754442,LOC107601987 coding downstream 356086 27214090 ~ 27228568 (-)
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LOC122360376 rpz5,LOC107728472,LOC107688231,LOC107592460,LOC107726664,LOC107671422,LOC107592128 coding upstream 98414 27690440 ~ 27693938 (-)
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G116834 rpz3,LOC107688230,LOC107592462,LOC107671478,LOC107592463,LOC107728473 non-coding upstream 109100 27701126 ~ 27704934 (-)
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LOC122360079 NA other downstream 4788 27520190 ~ 27579866 (-)
G116745 plekhg4b,LOC107569053,LOC107659069,LOC107601962,LOC108426379,LOC107729806 other downstream 223825 27358707 ~ 27360829 (-)
LOC122360878 NA other downstream 586295 26993974 ~ 26998359 (-)
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LOC122359885 rab25b,LOC107756889,LOC107592474,LOC107688282,LOC107671436,LOC107592134 other upstream 30603 27622629 ~ 27627660 (-)
G116836 rpz,LOC107688232,LOC107592467,LOC107728474,LOC107726667,LOC107671398 other upstream 115690 27707716 ~ 27804770 (-)
G116868 NA other upstream 371462 27963488 ~ 27964958 (-)

Expression


Co-expression Network