ccdc106a (ccdc106a,LOC107596676,LOC107748769,LOC107685509,LOC107569999,LOC107699945,LOC107744702)



Basic Information


Item Value
gene id ccdc106a
gene name ccdc106a,LOC107596676,LOC107748769,LOC107685509,LOC107569999,LOC107699945,LOC107744702
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056714.1
NCBI id CM032083.1
chromosome length 28146790
location 8796757 ~ 8805113 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043260416.1
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>XM_043260418.1
CCATAATAGTGTCTTTCTTCACGTTGTTTTTAGCACTGCTGCTGAGGGTcatttaattgttattgttaGGAGGCTGATTCCTCAGCAAACACGAGAACAGATGAGAGTGTGCTGAGACACGCTTCAGATACGTGACAGCGAGGCACGTTCACGGGCGAACAACGGTTTGCGAAAATATGAATGATGCGGACGCAGCCTCAAGGAAGCACGCGAGTTCCCGGGAGCTCCAGACTCCCAAGAATGAGGACGCCTATGAAATCTCCATTCCTTTCGAAGACAACAACTTCGATCAGCAGGGAGGCTTTTACAACCAGAATGACCAGAACTTTGATGGTAGCGATCCTCCAGCACCGAGCAGCTCGTACCTGTTAATCACTAACTTGCGCACGCAACTCCAGATCTCACTGGAGAAAAATTCATGGCTGCAGAAACGCATTGAGGACCTGGAGGAGGAGAGGGACTTCTTGCGCTGCCAGCTCGATCGGTTCATCTTCTCGACCAAGAGTCAGGAAAGCAACGGTAATGATTCCAGGAGTTTTTCTTGGAGAAGGAGAAGAGAAAATGATCGGGATCAACAAGTGGAGAGCCAGCGTTCAGCCAACCGTCAGTCATTCCAGCAGAGGCCAACCCAACAGACTTCAGCCAATCCCAAGGCCCTGAGCTCTGTTCCTGGTCCAGTCAATGCTCAGATAAATTCCTTGTATGGGTCTCCCCACCCCCAGCCTCTCTTACAGGGCCACGGCGGAGGCAGCACCAGCAGCAGCTGTAGTAGCAACAACAGGTCCCTCAATGAACTGCAAGAATCCCTCACTCTTCTGGGAGATGAAGAAGAGGATGACTACCTTGAGGATAGCTACCTGGAAGAAGAGGAAATGATGTCAGGAGAGGATGTGATAACAGATAACATGTCACTTCGAAATATCGGCACAGCTGGAAGACCCGCCGGCAGTCACCCGGCTCTGAAGAGGCGGAGGGTTTTCAGAATCgccagagggagagaaagacagagagtgaaAGATGCAGCAGGTGTGCTGTTCCGTTATAAAAAGATCCTGGTAACGTACCAGAGGTTAAAGAACATGTCCAAGGCCTTCCAGATCCACGGAGTAGATCGTAATACGGTGGCCTCTACCACACCCATTGCTGAGCTTCTGCTGGTGGCTCCAGAGAAGGTGGCTGAGGTGGGTGAGTTTGACCCGTCTAAAGAAAAGCTTCTGGACTACGCCCGACGCTGTTATATCGCCCTCGACCCCCAGACTCTCAGCAAAGTGCAAGCACTTAAGAAAAACAACCTCCTCCTGCCCATCTCATACAGGTTGAAAGGAACGGATAATCGATAATTGGAAGAATTAATGAGGTGATTCTTATCCTACTATGCAGTGAAACCcttcactgtattttaatgtaacataCGCCACACATCTCCCATCTCAACCTTCACATTGTGCTGTTCAGATCCACTGTACTCTGAACCAAGTGTACTATTACCTCTGTTCACTCACGCTCGAAGCTGCGGGTGGGATGCACACTTAAGCTTTCAGGTTTGGTATATTAAAAGAGAACTTGCTTCTCAAACCCATTTTACACCATCCTTTCATATCGGAATTTTTAGTATCGTTTAATATTGTCGCTTTACTTTCCATTCTTTGTGATGTGTAGCTCTATAACAGTGTGTGTTGCTCAGAAGATCTGTTGGGTCTTTAGGTCCGCTCAGTTGTCCCAAGCGTGTGTCCTGATTCTCCGTGTCTCATAGCAGTTACTTGACAGCCTGAAAGACTTTTGAAATAGAGGTTCTTCTAAAAAATGGTGCACGCGTAGACCCATGCACTCCTCCTATTTTAACACTGTGCTACTCTTTGCAAGCGGCACCCGTACGTTCTCAGTAGAACCTTTTTGGATATGATTTGTGgagtgtttgtgcatgtgtctCCCTTAATCATGGCCTGTCTCCTATTAGATGACACTGACTGTTCAGCATGTGCAAAGTTTTATATAGTGTAAATCAGTGATACTACATGTTAAAACAGCTGGTAATAGTACTAGTCTGGTCTAGTCTAGTACAGCGTAGTGCAGATGATAATGTTAGGAGAGGAAATGAGTGCAGAGATGTCCCTGTTCTACCTGGTGCTGAAGTTCtcatgagagtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtggatttcaccGTCTATGTCTGGATGCATGTTGGATGTTTGTTAACGTGTGGCACGCTTGAGGTTAGACTACTCATGGCTCTTTCGAGCACATATTGAAACCTCCAGTGGCTAATAAAAAACAGCAAGTTTCTCTTTATATCACAATTTTCTTCTTCCTTACCATCAGataatatttgttaacattagttaatacattaGATATCATAAACTAAAATGAAGAACATTTACTATTGTTCAGTGTTGGTTTATTCCCGTTTATAcccatgaaaaataaatatactacgatgcatttaaaatgcaattatttcatgctaagtgtaccaaatatacttatatattataaatattacatatttatgtaagtATACTTAAAGTCTGCTGAAACGCAACAACTCATTTTGTGCTTAATGTAATTGTCCGGTCTAAGTAAAGATATaatgaagtatatttgattgcAAAATTGCGGTACgctttaaatatcttttatttaaataccaaTATTAAGAGCATACAATCTTAAATAGTGACGTTAAAAGAAGTTTAAGCTTAATGTTAAGAAATGTGAGTTGTACAGCAGTAGTACTCCAAAAAGagtttaattctaatttttatATCAGCGTCTTGAGTGATGTGTCagtaaatatatgtatagattTGGACTATACtaagaatgaaataaatgtattttaaatagcacTTTTTACTAGGgtgatatattatttataaaacctgaaattcaaaaaaactaaacaaaaaatgattctACGTATAAATGAACACTAACCtgaatttaatgttaaatgtattttttttgttagttcatgatacttaattaactaatgttaacaaatcaaACCCAATTGAGAAGAGTTACTGTATTTGCATTATCTTGTACTTTCATTGTCATTTTCCTGTCTGCTACTATTAATTACGGGTCAGGGCTGAAGGTGATTTGAATTTCACCTCAGGAACCAATCATTTCCAGTACAGGTTAGTTTATCGCAAAACCATTTTCCActgttgtggtttttttttttttttcctctccataTAACCAAGAAGCTGTTTATATAGCCTGTACTATTTTGTCactaaaagaaacattaatgAAATGTTCATTGATTCTTCATATTGTAAATCACACTAAAGCATTTGATTTCCTACTGAATCCTGTGCCACTCCGCTCTTTAATTCTGATTCTTCTTAAGGTCTTGTTATCTAATAGCATTCCCATAATTTGTCATAATGCACTTAAGACTAAAACCCCATCTGCTAAATAATGACATGTTCTTTGAGGAAACtaattatctgtttatttttaaagcacattacAGTCATATGCTAATCGGTTTGAACAGGAAGCAAAGATGGAATTGTtccataaaaaacataatacttttagcatttatgttaaaaacaaccTATATTATGTACATTGGGTATTGTACACTTTTTGGTCCTAAAAAGTAGCCATCTATAATTCTTGATCCTAAATAAAATTTGCACTTTGTTGAAGTCTA

Function


symbol description
ccdc106a Predicted to be active in nucleoplasm. Orthologous to human CCDC106 (coiled-coil domain containing 106).

NR:

description
PREDICTED: coiled-coil domain-containing protein 106-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_043260418.1 False 3695 mRNA 0.40 9 8796757 8805113

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122360801 LOC107684163,LOC107748751,LOC107596677,LOC103041564 coding upstream 29586 8834699 ~ 8835602 (-)
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tapbpl LOC107749174,LOC107684168,LOC107596689,LOC107741975,LOC107564859,LOC107656706 coding upstream 133434 8938547 ~ 8944648 (-)
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wu:fj39g12 nppcl,LOC107744681,LOC107699924,LOC107749278,LOC107685603 other downstream 160535 8633350 ~ 8636222 (-)
G110556 NA other downstream 480072 8312265 ~ 8316685 (-)
G110554 cbx3,LOC107596654,LOC107743152,LOC107744695,LOC107550827 other downstream 494512 8298789 ~ 8302245 (-)
G110544 NA other downstream 580162 8216029 ~ 8216595 (-)
mkxb mkxb,LOC107681765,LOC107566716,LOC107691300,LOC107550429,LOC107747522,LOC107708850 other downstream 704302 8082900 ~ 8092455 (-)
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G110974 NA other upstream 465858 9270971 ~ 9272605 (-)
gask1a fam198a,LOC107732434,LOC107657576,LOC107751903,LOC107704082 other upstream 1072098 9877211 ~ 9902981 (-)
LOC122361037 cables1,LOC107708521,LOC107747516,LOC107681774,LOC107691165 other upstream 1940463 10745576 ~ 10764305 (-)
LOC122360812 cobl,LOC107746964,LOC107684220,LOC107551210 other upstream 2052407 10857520 ~ 10883424 (-)

Expression



Co-expression Network