grik5 (grik5,LOC107717427,LOC107551699,LOC107700189,LOC107671209)


Basic Information

Item Value
gene id grik5
gene name grik5,LOC107717427,LOC107551699,LOC107700189,LOC107671209
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056714.1
NCBI id CM032083.1
chromosome length 28146790
location 13910503 ~ 13971229 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
grik5 Predicted to enable glutamate receptor activity and transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential. Predicted to be involved in glutamatergic synaptic transmission and modulation of chemical synaptic transmission. Predicted to act upstream of or within ion transport. Predicted to be located in membrane and synapse. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in postsynaptic membrane. Is expressed in brain; eye; retinal inner plexiform layer; retinal outer plexiform layer; and retinal photoreceptor layer. Orthologous to human GRIK5 (glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 5).

NR:

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cxcr3.2 LOC107700152,LOC107551671,LOC107717417,LOC107598452,LOC107671173,LOC107755594 coding downstream 66135 13841308 ~ 13844368 (-)
cxcr3.3 NA coding downstream 71799 13835520 ~ 13838704 (-)
znf574 LOC107717428,LOC107700188,LOC107551698,LOC107724156,LOC107582032 coding upstream 6528 13977757 ~ 13996272 (-)
gsk3ab gsk3ab,gsk3a,LOC107724158,LOC107671194,LOC107551697 coding upstream 27008 13998237 ~ 14011670 (-)
cicb LOC107717431,LOC107551694,LOC107700186 coding upstream 49734 14020963 ~ 14058189 (-)
erfl3 erfl3,LOC107582036,LOC107724159,LOC107671192,LOC107551693,LOC107700185,LOC107717433 coding upstream 89524 14060753 ~ 14103280 (-)
pou2f2a pou2f2a,pou2f2,LOC107717432,LOC107671217,LOC107551663 coding upstream 145308 14116537 ~ 14152861 (-)
G112449 NA non-coding downstream 767 13909324 ~ 13909736 (-)
G112448 NA non-coding downstream 8890 13901137 ~ 13901613 (-)
G112447 NA non-coding downstream 9427 13900864 ~ 13901076 (-)
LOC122360145 NA non-coding downstream 121417 13713860 ~ 13789086 (-)
G112426 NA non-coding downstream 124050 13785015 ~ 13786453 (-)
G112464 NA non-coding upstream 138919 14110148 ~ 14110462 (-)
G112473 NA non-coding upstream 237167 14208396 ~ 14210533 (-)
G112474 NA non-coding upstream 239464 14210693 ~ 14210939 (-)
G112479 NA non-coding upstream 321510 14292739 ~ 14296572 (-)
G112483 NA non-coding upstream 331895 14303124 ~ 14303535 (-)
zgc:92606 zgc:92606,LOC107724707,LOC107549485,LOC107598403,LOC107672985,LOC107744286,LOC108432344 other downstream 226594 13654060 ~ 13683909 (-)
rxrbb rxrbb,rxrba,LOC107596638,LOC107581542,LOC107752838,LOC107743171,LOC107566635 other downstream 1532054 12363785 ~ 12378449 (-)
LOC122361049 c16h2orf66,LOC107743229 other downstream 2043188 11865680 ~ 11867315 (-)
G111490 si:dkey-12j5.1,LOC107738871,LOC107549224,LOC107689883,LOC107717803,LOC108256403,LOC108426361,LOC107593733 other downstream 2498726 11410678 ~ 11411777 (-)
LOC122360600 enpp2,LOC107757440,LOC107745056,LOC107697648,LOC107574906,LOC107681346 other downstream 2523510 11333175 ~ 11386993 (-)
G112478 NA other upstream 263325 14234554 ~ 14301619 (-)
dicp3.3 NA other upstream 527034 14498263 ~ 14503136 (-)
LOC122359961 riiad1 other upstream 611250 14582479 ~ 14587869 (-)
si:ch211-105c13.3 si:ch211-105c13.3,LOC107673711,LOC107594941,LOC107582067,LOC107677027,LOC107735771 other upstream 927953 14899182 ~ 14904907 (-)
LOC122359907 LOC107594909 other upstream 937391 14908620 ~ 14913646 (-)

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