G131982 (LOC107574713,LOC107670279,LOC107724345,LOC107710403,LOC107653857,LOC107556406)


Basic Information

Item Value
gene id G131982
gene name LOC107574713,LOC107670279,LOC107724345,LOC107710403,LOC107653857,LOC107556406
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056717.1
NCBI id CM032086.1
chromosome length 20532727
location 10026891 ~ 10402167 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU194899
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TGTCCAAATCTAAACTTTAGTCATTATTCATCACcaagacaataaaaacagccaaagaaaaactcaaaaagcacCAAATGCACCATGAATATTTCTACTCACAGCAACTTCTATCTCGAAAACCAATTCCATATCAGAGTCCTCCAGAACCATGGCTGCCGATAGTAATTAATAGTACTGATGAGAATGAACAGGTAAGATCCGATTGAAAGTAAGCTCCTGTTTCAGCACTTTGCTAATATTCGCCTGTGTGCAGGGTTTTATACCCCTGTTGTCGTCGCTCGACCTAAGCCCCATgctcccagcatgctttgcacCAAGATCAAAACAAGTTAATTCTGGTTAACGACATCCGTAAATTGGATCAGCCTGTGTCAGATGCTTGGAGTAGCCGCCTCTAGGCCATCGGAAACTTAGGCGAGTGCAGCCAAACAAAAATGTGATGGAGGTGTGCACTGATTAACTCTTGTCTATTAGCAATAAGGATGaataaaaagcagtaaaatgcaatttaatcagAATCTCGCATGATCAAGGccgatattttatatattagataCTCGTAAAACAAACTAACGGTCTACttagagttagtagacatgtagttgtaaATTAATGAGGATTTGTTGATATGTGGTTGCGTAGTTACTGCTAGTTAGTAAGTTAGTAAgtaaactaacaaaataaagtgtagacctgtatttgtatgtttttgcattttttaaaatagccaCTAAACCCAACAAAGCATGAATCATTGGATCGAACGTTAACTTTCGATTTAACTTTTTTGGAGTTAATTTAACACTAGGGACAAACAATGACAAATAGCCACCGTGCAATGCAAAAGTCATTGAGAAAAGTCTTTGAGTGCAAGCCACCTATCAAAGATCAACCGGCTGACGCTGCAGAAACTAGTTTCAGCTGCATCAGGCTGCAGCACAAGCTGCTAAGAAAGTCAAATAACATCTTTAACACTGACAAGGACATAAACTTCTTCCGCTTGGCTTTGTATAGCGACTGAACACAAACATATGTTGTCTCCCTACTGGCACTAATCTCTTTAAACGGGACGAGCCCTGTGTGAGCGCCTCGGGCAGATGGCCAGTGTCTCTCTCAGCAGCCCACGTCATTGGTCTAGAGGCTCTTATTAAACACATGACCTGCAAACTTCGGGACTTTAATCTGTGAGGATCAGCACGAGAGGCTCGTTGGATGCGAATCTGCACTGTGTCAGTACCGTTGTAACGCCATGGTGTCAGCAAAAAGATTTTTGAATTaagtcaaaagcaaaaaaaaggggggaaaaatgCTTGCCTTAATCACCAGCTGCTGGACAGCCTCTCTTAGCCCCTGAGATAGAGAAGAAAACAGTATAAGTCACCGCAAAATTTGTTCACCATATTgtcatgtataaatatgtaaacttaATACAAATCTTTgcaaaaatgttgtgttttacaTACTTGCAAATCCCTGTCCGGGATGAGGGGCTTTGACTCAACTACTTGAATATCATCCATTCTCAACAAGGACACCTAGAGGTAGGGAAAAGGTAACATAAATACAACCTTGTTACAGTTAGGGCACTTCACATAACATACCGCAATCTTCCTTTAAGGTCACAGAAGGAAGTGTCAAATTACTAGTTCCTTGTTTCTGTTGCCGTGTAATTCAGATTTGGCAGTAACTATGCACAACAGCATTACTGGAGCTCATGAATAGATtagatagaaaataaaataaaaaattttctctGGACCGTTCAGGGcgtttttatttcagaatttgcCATTTTCTATTTTCGAGTTAAAGATATCATCACATACACGTTACAGCCGATGTACTGCGGTGACATTCTTCTATCTAGTTTCTCATCCCGCAGCGCAACAAGAatatatgacaaataaaaaagtgaaaaaagtaatatggtagaaataataataacatgtaatatttgaccattaaaacaacaacataacattatttttgaagCTGTAACCTAAGGTAAATTTATACAATGCTGTgcagtattaaatattatcaaTGCGTGCAATGTAAATGTGGCTTCTGATGAAGCCTTTGAACTTTGTACCACTTCCCACATTTGGCACATTAAAAGATACATTCCTTGGCATTTTTTCTTTGATTAGATCCTCAGCTCTTCAAACAGCCAAATCTGTTTTGGATGATGCACATCATGCATTTCAAAAGGACAACAGTTTTAATGTCGACGTGCATGTAAATGGGAGCATGAACAGGCTCTTTGTCTGTCTGAGGTTTCTAAAGGTCACATGTCAGGCTTTTCCTCTGTAGCTGGCCTGGACGCTACACACAGGAAGCCACTGACACAGCTGCTTCCACGGCTCCCGCGGTCAGTCCCTCCACCCCTTTAACACTAGCCGGGTTTTTTTCAGCTTTGCTCCAAAAGCCAGCATGAAAGCCTTTGTGTCTTATCATCCCACAGGTTCAAGGAGTGTTCCTGTACCAAGCCCCTATAAAAAAAGCAGCGACTGAGCACAGACGAGCTCTAGGAGACGAGCCAAGATGTTTATCAAGAGGAATTTCTGTATTTCAAAAACCATGATTGTGTAATTCACCATTTGCTGAGGTCTCTACAGCAAACCCCTACACAAATTCTTGACCAGAACCATGTGGCAACTGAAACCACTTATGAATTACTAGACCAAGCGAGAAGAAATCAGCTTAATGagactttctttaaaatgtgtgtcatatatatatatatttaaatataagaaaaGTTAACAAATAATGTATGGCTGTCAAGTAGGTCACCTGCTTGTTTTTAAGCTGTGTGCCCTTATGGCCTCTTTTGAATAATCTTTTACCTGGGAGTGTCTGTACCGTCTCAGCAGGATATAAACCAGAGCAACATAGGGACAGATCCCGCCCTTCCCGTGCCCTAGAATACTCACTATACTTTAAAACAACTGATTCACCCGTTCGCTTCTCAGGACCAGCTTTCCATTAAAGTGTACAATGATTAACGAGACTTTTAATTAATGCCTTACTAATAAAGTACTAACTTAGGAGCCGATCCATATTGGAATGGCTCAGACACCTTTGTACtgtgtatttgtataaatacatatatgttttCATCATTTCGTCAATGTCCGAAAGTACGTTTATGTTGGAACACAAGCATCGTGGCAGTTGCAGAGGAGAGGAAAACGCCTGTTTCACTTCCCATAaccactttcttcttcttcttcttttctgaaATCCAATTCAtggaacatatttttatactgaGAGAGATACCGAACTCAATGCGCATTAGACCAGTCACTGCAGGGGTCCTAAAAAATGCTATTCCCCAATTAATACTTGTCTGCATACAATATATAATCAGTATAAAATAATCTCAGATTTTCTTGCTTATGtgttacatgcatgcatgcacacactaTTTTGCTATGTACGGAcaagcatatatttaattaggTATATTACTCATTcaacatatttattcatgttgatATGCATGTATAGATTAACATATTCCTGGTTTTATATTTCGAATGataatttcattcaaattaaatgggTTAGCTATTAGTATTTCACTTTTAGCTGCGTCTTAAACGCAGTCACAGACTAAAAACTACCGCAAAACAAACACTGTTAAGGCAGAATAATGTGCCTGACGATGCAAACACACCTGTTACGTTTAACCCTGAACGTTTGATAAACGCTCGGCTCTAATCCAGCACAGTGGCTTTCGTCGTCTCATTAGGAAAGAGCGCTATAAAATGAGCTTCGAGTGcgacagatatttaaaaaacatacaaaataggCAGTGCGTTGGTTCCCATGCAGGCCAGCAGTTTTCgctagttattttagtacatgtACTCTGTTCGTTGGCCATTTGTTTCCCCCTCTAACTTACTCTACTTTGTTGACATGCACGTGCAACCACACGCACGCGCGTAGCAAGATaaacaacacattaaaaacgATCTCATCCGCAAACTATATACTAGCGTAGAGTTTATTGTTGTCGTGTggttcattaaaacattttacaccGGATATCCTCATTTCAAAGCGGATAAATATACCTTGTTCGATATTATACCAGAGGCGTTTTAGAAATAGACTGCGGAGTTATTAGATACAGAAATAGCcaacattttaactaaaaaaaaaaaaaaacgaactcgaaaaaataaaatagcactcTTCGTGACTTACCGGTTAATTGTCCACAAAGATGAAAACAagaaagtccaaaaaaaaaaataaactaaaaagttTTTGCAGAGTTACAGCTGAGTACGTGCTGCTCGCGACAGGATGTTG

Function

NR:

description
PREDICTED: protein NDRG1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU194899 True 9332 lncRNA 0.40 3 10026891 10402167

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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pex1 pex1,LOC107724360,LOC107556332,LOC107710270,LOC107556352,LOC107702066 coding upstream 100088 9915613 ~ 9926803 (+)
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fam91a1 fam91a1,LOC107724353,LOC107702086,LOC107710596 coding upstream 421528 9586257 ~ 9605363 (+)
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LOC122323768 LOC107726138,LOC107664713,LOC107563276,LOC107555946,LOC107698981 coding downstream 1105105 11507272 ~ 11510522 (+)
LOC122323771 NA coding downstream 1109176 11511343 ~ 11513891 (+)
G131966 NA non-coding upstream 42585 9977593 ~ 9984306 (+)
G131958 NA non-coding upstream 81966 9942080 ~ 9944925 (+)
G131932 NA non-coding upstream 114135 9873151 ~ 9912756 (+)
G131913 NA non-coding upstream 270967 9754504 ~ 9755924 (+)
LOC122323289 LOC107702073,LOC107556364,LOC107710198,LOC107653841,LOC107724322 non-coding upstream 363186 9661351 ~ 9663705 (+)
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G132014 macf1,macf1a,LOC107724266,LOC107653864,LOC107670270 non-coding downstream 37526 10439693 ~ 10440259 (+)
G131985 NA non-coding downstream 122539 10524706 ~ 10580552 (+)
G131987 rnf19b,ak2,LOC107710473,LOC107653815,LOC107670272,LOC107724316,LOC107564491,LOC107556415,LOC107556372,LOC107670285,LOC107710539,LOC107724312 non-coding downstream 180583 10582750 ~ 10601467 (+)
G132081 NA non-coding downstream 230481 10632648 ~ 10697836 (+)
triqk triqk,LOC107724370,LOC107710222,LOC107702072 other upstream 273335 9734220 ~ 9753556 (+)
G131801 trib1,LOC107724318,LOC107565192,LOC107702074,LOC107710180,LOC107556392,LOC107653840 other upstream 387930 9636973 ~ 9638961 (+)
si:ch211-215i13.3 LOC107579802,LOC107724304,LOC107702091 other upstream 488389 9536318 ~ 9538502 (+)
LOC122323856 LOC107745707,LOC107709282,LOC107691523 other upstream 860797 9160370 ~ 9166094 (+)
yars1 yars,LOC107687080,LOC107691530,LOC107724337,LOC107709269 other upstream 1651024 8370706 ~ 8375867 (+)
zgc:91910 zn706,LOC107556412,LOC107574718,LOC107710523,LOC107670289,LOC104962755,LOC108425704 other downstream 13473 10415640 ~ 10418096 (+)
LOC122323782 smim12,LOC107664707,LOC107726140,LOC107563281,LOC107712635,LOC107555952,LOC107698988 other downstream 1120062 11522229 ~ 11523881 (+)
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gngt1 gngt1,LOC103023645,LOC108257427,LOC107085869 other downstream 2021123 12423290 ~ 12425078 (+)
jtb jtb,LOC107706175,LOC107591609,LOC107731414,LOC107593543 other downstream 2619250 13021417 ~ 13026026 (+)

Expression


Co-expression Network