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Chromosome Information

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>XM_043218122.1
GCCAGCCCTTCTTCCTTAGAAGCGCCGAAGACTATCGAGAAGGTTTGCAGAGTGTCCCCAGAGCGGACTTTGGATTGAGTGGAGATAGACATTCGTGGGCCGTCCAGACTGTAGACCACCAAACAGAGCAACACCTAGAATGGCCACTGCAAGCACCTCTGGACAAAGCCCCTTCGGGCTGGGCAGGAAGAAGAGGTCCCCTGGTCTCCTGGATCAGATTGGCAGGTTCTTCGGAggagacaaaaagagaaagggaaaggGCTCATTTCGTGGTCATCTATCCTCCTCTCCACAGAGACCCCAGCACTCCTCCACCCGTCGTCGTGGAGATGTCAACCCTGTGGTGCATTTCTTCAGGAGCTTTGTGTCCTCTCCTCGTCCCAAATCGAGGTGGAGAGAACTTTTGGGCCTGGCTTCCCCGTCAGCGCGTGGCACGGAGAGCATTAGATCACCTCACAGACGCAGAAGGGAACAGAATACACTCTCCAGAATCTTCAACCTGGGAGAAAGCCGATCTCGCTCTCCACCCAAACGCTGGAGCACCATCTTCTGAGCCCTTCTCCGACCGGAAAAACACCAAGATGGAAGAGAGTGAAACGGACGAAAAGCAAAAACTTGAGAGGGAGGATCTCTGCCCTATAGATTCACAAGTCGCAGCGAGTTTAACAGACTAACATTGGCCATCTTCGCTTCCTAGATAGAGATACAATCCAAGTATCTGTTGTTACATGCCTGCAGGGTTTCATAAGCATGTGTTGACTGTATGTGTGCAAAACTGCTGCAATAGTTGTCAATGGTCAGGAGACGCGATAGTCAAACGTCTAGTTGCTTTATTGGAAGTCTCCCtccaaaattcagttttaaagtGGATCACCGTCCCTCAGAAATGCAGATTACCCAAAAGGTTTCATTTTTAGTCTTAACTGACTGAACTAGGCAGAATATTTCTCTGTACGAACcattaaacataaaagtaaGATATAACTGGCATCGAGACCCATTACTGTATAATTCTGAATTTACCTCAGATGTATTTTACACAACGGGTTGCTTGCCTGAAATTAGTCATTGTGCTACAGCGAAGAAGCCTCTCCATAGTTGAGATCAATGTTCAGCCTCAGCGATGTGCAGTGTATTTGTGGATGTTTATGTTAATCGTGGTCCTCGTGTTGCgttatatattagttatttcCTTTGTACCGAGAATTATGTATATAGGATTCTTTATTGTGTTTTgagcaacttaaaaaaaaaatgatgaccAGTTAACCTTTAGCTaacattaaatgtgatttatttgagTAATTATTTAGCTCTTTAATTAGAAACATGccttaaaaatgattaattaaaagacTAAAAACACGATTTTGTGAACTAGGGAATAGATTCTAAGCATATCTGACGCTTGGATTGTATGCCCTCAGATGTTGCACTGCAGTACGTGTGTTAAAACAGCCTGTAAATGTTGTCTGCGTCATTATGTCTGCAATTTTGATGTTATTTTAGAAAGGTCTCATGTAATTACCAGGGGTaggattaatatttaaataacagacATGCAGAAATCTAGGACAAACAGTCAGTGGGAGCATAAAGGGTATGAAACTGgcgggaaaaaaaaggaaagaaaccTGAAAGTGTACGAGGGATATTGCGGGAAAAGATAAACGAGGAATTCTGAAAGAGCACGGTGGAGTTTattcagctgatttttttttctctgtgacGTTTCTCACGTGTCTTAATAGTGTTCATTGTTTCGTGTCTTATAGACTATTTCTGTATGTACTGTTTCTGAAATACTGCTGAATAAACATTAGGTCAAGTATTCTCCCTGTCAGCGCTGGATTtgtctccaaaatggtgctacatttataaaatgcacaGGATATTCTGAAGTGGCCAGGTGTTCTGATGTAATATCTTTAACCCTccctttatttataaagtaacGTTAAATAAAGAATCGGAAATGTA

Function

symbol description
tshz1 Predicted to enable DNA binding activity and DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to act upstream of or within regulation of gene expression. Predicted to be active in nucleus. Is expressed in several structures, including central nervous system; head; hindbrain neural plate; neural tube; and pectoral fin bud. Orthologous to human TSHZ1 (teashirt zinc finger homeobox 1).
mbpa Predicted to be a structural constituent of myelin sheath. Located in myelin sheath and plasma membrane. Is expressed in several structures, including EVL; male organism; nervous system; otic vesicle; and periderm. Human ortholog(s) of this gene implicated in multiple sclerosis. Orthologous to human MBP (myelin basic protein).

NR:

description
myelin basic protein-like isoform X2

GO:

id name namespace
GO:0005886 plasma membrane cellular_component
GO:0043209 myelin sheath cellular_component
GO:0019911 structural constituent of myelin sheath molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU197531 False 1941 TUCP 0.42 4 16500945 16508560
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G133772 sall3,sall3b,LOC107696994,LOC107592031,LOC107739555,LOC107656642,LOC107563697 non-coding upstream 48846 16557441 ~ 16558450 (-)
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npy LOC107592012,LOC107748754,LOC107656665,LOC107688404 other downstream 356672 15922223 ~ 15924285 (-)
evx1 evx1,LOC107688412,LOC107602371,LOC107710323,LOC107654696,LOC107748750,LOC107592093 other downstream 540628 15736947 ~ 15740329 (-)
G133373 LOC107748749,LOC107592092,LOC107654694,LOC107710322,LOC107688413,LOC107602391 other downstream 620237 15659919 ~ 15660720 (-)
LOC122323308 LOC107748748,LOC107592064,LOC107710321,LOC107688414,LOC107602392 other downstream 632378 15644862 ~ 15648579 (-)
G133217 NA other downstream 911221 15366434 ~ 15369736 (-)
G133834 pkhd1l1,LOC107592039,LOC107748704,LOC107739541,LOC107656576,LOC107563710 other upstream 348384 16856979 ~ 16869564 (-)
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Expression


Co-expression Network