G135691


Basic Information

Item Value
gene id G135691
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056718.1
NCBI id CM032087.1
chromosome length 27616869
location 2759097 ~ 2760884 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU200443
tttaatttagtcatttttggaGTCATTTCCACACTACTGCATAAGCTTCAGATTTTTTACGCTGGATGTATCAAAGTGTTTCAGATCAATTCAAACCAGTTGACTAAAGTAGTGGAAGTGCATGGAGTACACCAAAGATAGAACCAGGAATCAGATTCCTGTTGGATATTTGGTGTGTTGTGCTACATCCAGTGTTGAAAGCATCACTAGTTAACTTGTTTGCTTTTGTGGTAACACATTACAGTGCTTGTGTAGACATGGATCTGAACCAATATGAGGTTAAATatagaatgacagaattttgaaTTTGGGGTCAACCTTTCCTCACACATACACTCAACTGAAACACCGCTATTGCTGCACTATATATAGTAACACTTTTCTACAAGAGAATACTGGATTCGCAATGTAAAGATTCTATCAGTGAAAATTATTCAGTCCAATTCTTTATTGCATATTGCTAGGTTTTTAAAACAGACTTTctgttattcatttatacatttttacaaatgcactCTTAAATTTTAAGACACACTTTAGTACaccaaaaaatattacattacattatattagtcatggtcatttagcagatgcttttttctaaagcaacttacaaatAAGGATGATGGAATCAATCAAAATCATCAaaagagaaaactaaataaaaattctgttatttattcactcacatgttgttccaaacctgtattactTTCTTACTCATGTTTTACTACTTAAGTTGTACTTAAAATGTGgtctttaaatataattgtaatatatcaCGGTACAACCTAATACCAAAGAAGTGATGAATTACAGTTGTGttagagactgtgtgtgtgagtgttttaaaagattgtTTTGATTCCCTTCTttcaaaagatttaaagcatATGCCAAAATACTCTCCACTCTGATTTACATGAAATTTACAGCAATGAACCGAAGGTTTCAGCAAGTGTTAATAGAggttaattagttaaataattaatcaagTCAATGCAATTTATAAGATTTATTAAATCTGTCCTTGCTATGTACTCATGTGTTTTATGACTATATCAGTTGGCAAAAAAGctaaagaaaatggaaaaagttgTTTTCGTATAAGTTTGTTATAGGAAATAGTTATACAACATAAACTGAAATTGCCCaacaatcaatttatttaacTTAACATTCTTACATggatttataatttattttatttttcatggtgcccatatttattatgtaattttaaatgttgtattacattaatttatttaagaatTGTATTACAAAGAATCCGTTACTAAAGTTTTCAGACCattcattttgtaaaacatGCTGCAAGCATATTTGGCTCTTATTTCGGTGTGCTCAATGTTTTATTGAAGACTGGGATAGATTATGGTTATGATTCTTTGTTCTTTAATTGACATCAACAACTTGTCAATGCTGTAAATTCAAGCTGTTTTTTCCAAACCtctacatattttaaaagctgcataataatatcaataatatgatAAGTTTCAGCATTTTGCCCCTTAGTTAAAACATtagataaaaaatatcaaaaattgCTGAGAATGGATTTggttcatttttgaaaaacgaAACCCTAATATATAATTGATTGTTGGTTGTTGTATCATTATAtactttcttttacattttatggaagtttttttctacttcacctgaaacaacatttttatttgataaactccattttcaaattgtaaatgtttatttaaaaaaaaaacataaacatattttcttagcagAGTGATCAAGggacaa
>TU200446
tttaatttagtcatttttggaGTCATTTCCACACTACTGCATAAGCTTCAGATTTTTTACGCTGGATGTATCAAAGTGTTTCAGATCAATTCAAACCAGTTGACTAAAGTAGTGGAAGTGCATGGAGTACACCAAAGATAGAACCAGGAATCAGATTCCTGTTGGATATTTGGTGTGTTGTGCTACATCCAGTGTTGAAAGCATCACTAGTTAACTTGTTTGCTTTTGTGGTAACACATTACAGTGCTTGTGTAGACATGGATCTGAACCAATATGAGGTTAAATatagaatgacagaattttgaaTTTGGGGTCAACCTTTCCTCACACATACACTCAACTGAAACACCGCTATTGCTGCACTATATATAGTAACACTTTTCTACAAGAGAATACTGGATTCGCAATGTAAAGATTCTATCAGTGAAAATTATTCAGTCCAATTCTTTATTGCATATTGCTAGGTTTTTAAAACAGACTTTctgttattcatttatacatttttacaaatgcactCTTAAATTTTAAGACACACTTTAGTACaccaaaaaatattacattacattatattagtcatggtcatttagcagatgcttttttctaaagcaacttacaaatAAGGATGATGGAATCAATCAAAATCATCAaaagagaaaactaaataaaaattctgttatttattcactcacatgttgttccaaacctgtattactTTCTTACTCATGTTTTACTACTTAAGTTGTACTTAAAATGTGgtctttaaatataattgtaatatatcaCGGTACAACCTAATACCAAAGAAGTGATGAATTACAGTTGTGttagagactgtgtgtgtgagtgttttaaaagattgtTTTGATTCCCTTCTttcaaaagatttaaagcatATGCCAAAATACTCTCCACTCTGATTTACATGAAATTTACAGCAATGAACCGAAGGTTTCAGCAAGTGTTAATAGAggttaattagttaaataattaatcaagTCAATGCAATTTATAAGATTTATTAAATCTGTCCTTGCTATGTACTCATGTGTTTTATGACTATATCAGTTGGCAAAAAAGctaaagaaaatggaaaaagttgTTTTCGTATAAGTTTGTTATAGGAAATAGTTATACAACATAAACTGAAATTGCCCaacaatcaatttatttaacTTAACATTCTTACATggatttataatttattttatttttcatggtgcccatatttattatgtaattttaaatgttgtattacattaatttatttaagaatTGTATTACAAAGAATCCGTTACTAAAGTTTTCAGACCattcattttgtaaaacatGCTGCAAGCATATTTGGCTCTTATTTCGGTGTGCTCAATGTTTTATTGAAGACTGGGATAGATTATGGTTATGATTCTTTGTTCTTTAATTGACATCAACAACTTGTCAATGCTGTAAATTCAAGCTGTTTTTTCCAAACCtctacatattttaaaagctgcataataatatcaataatatgatAAGTTTCAGCATTTTGCCCCTTAGTTAAAACATtagataaaaaatatcaaaaattgCTGAGAATGGATTTggttcat

Function

GO:

id name namespace
GO:0036303 lymph vessel morphogenesis biological_process
GO:0001945 lymph vessel development biological_process
GO:0001946 lymphangiogenesis biological_process

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU200443 True 1788 lncRNA 0.29 1 2759097 2760884
TU200446 False 1589 lncRNA 0.30 1 2759296 2760884

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ndufaf7 ndufaf7,LOC107752688,LOC107670241 coding downstream 88242 2663778 ~ 2670855 (-)
lama4 lama4 coding downstream 126954 2596412 ~ 2632143 (-)
tube1 tube1,LOC107670257,LOC107703869 coding downstream 164301 2584067 ~ 2594796 (-)
si:dkey-119m7.4 si:dkey-119m7.4,LOC107704351,LOC107670234,LOC107565461,LOC107755002,LOC107709524 coding downstream 208398 2538637 ~ 2550699 (-)
fynb fyn,fynb,LOC107704353,LOC107755004,LOC103458010 coding downstream 225970 2480372 ~ 2533127 (-)
LOC122325188 LOC107714796,LOC107565462,LOC107670243,LOC107550532,LOC107676708,LOC107715681,LOC105017614,LOC106607890 coding upstream 262 2761146 ~ 2778825 (-)
rev3l rev3l,LOC107675651,LOC107705450,LOC107712405,LOC107676701,LOC107569208 coding upstream 26255 2787139 ~ 2848625 (-)
LOC122324357 tshr,LOC107657214,LOC107728338,LOC107569215,LOC107681439,LOC107549347,LOC107742823 coding upstream 371197 3132081 ~ 3179282 (-)
LOC122324803 rev3l,LOC107675651,LOC107705450,LOC107712405,LOC107676701 coding upstream 435429 3196313 ~ 3220549 (-)
LOC122324861 rhob,LOC107730407,LOC107704819,LOC107569216,LOC107549346,LOC107657220,LOC105907285,LOC103025336,LOC106607565 coding upstream 711110 3471994 ~ 3473405 (-)
G135674 LOC107715685,LOC107670242,LOC107714794 non-coding downstream 21208 2732603 ~ 2737889 (-)
G135658 marcks,LOC107709525,LOC107676707,LOC107570520,LOC107715691,LOC107670244 non-coding downstream 112016 2644181 ~ 2647081 (-)
G135629 NA non-coding downstream 179395 2579269 ~ 2579702 (-)
G135627 NA non-coding downstream 181609 2577132 ~ 2577488 (-)
G135546 NA non-coding downstream 400406 2358478 ~ 2358691 (-)
G135781 NA non-coding upstream 98383 2859267 ~ 3231374 (-)
G135782 NA non-coding upstream 105910 2866794 ~ 3238869 (-)
G135800 NA non-coding upstream 359457 3120341 ~ 3527057 (-)
G135819 NA non-coding upstream 626308 3387192 ~ 3387529 (-)
G135901 NA non-coding upstream 1136318 3897202 ~ 3897582 (-)
cep170bb LOC107670249,LOC107715684,LOC107714793,LOC107550527 other downstream 1667 2740552 ~ 2757430 (-)
G135548 NA other downstream 394273 2364053 ~ 2364824 (-)
G135527 LOC107731523,LOC107660498,LOC107575177,LOC107657216,LOC107549340,LOC107730404 other downstream 745570 2005549 ~ 2013527 (-)
myo6a myo6a,myo6,LOC107660505,LOC107707325,LOC107680308 other downstream 882805 1840128 ~ 1876292 (-)
pnrc1 pnrc1,LOC107731511,LOC107660527 other downstream 1098561 1655096 ~ 1660536 (-)
nrxn3b nrxn3b,LOC107747953,LOC108410406,LOC106571678,LOC102203786,LOC101486071,LOC105017684 other upstream 877405 3638289 ~ 3870066 (-)
LOC122325550 NA other upstream 1207879 3968763 ~ 3975258 (-)
LOC122324820 ccdc85cb,LOC107678669,LOC107747948,LOC107572128,LOC107555299,LOC107740595,LOC107751728,LOC107668618,LOC105902331 other upstream 1803472 4564356 ~ 4582097 (-)
si:ch73-111k22.3 LOC107742221 other upstream 2250497 5011381 ~ 5012580 (-)
selenol sell,LOC107679675,LOC107558766,LOC107742218,LOC107742854 other upstream 2263922 5024806 ~ 5029567 (-)

Expression


Co-expression Network