G139567 (ivns1abpa,LOC107696153,LOC107726450,LOC107732388,LOC107553504,LOC107683098,LOC107599089)


Basic Information

Item Value
gene id G139567
gene name ivns1abpa,LOC107696153,LOC107726450,LOC107732388,LOC107553504,LOC107683098,LOC107599089
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056718.1
NCBI id CM032087.1
chromosome length 27616869
location 17795484 ~ 17799866 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU206135
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>TU206136
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>TU206139
TGCGGCGATGAGTCGGCCATTCAGAGCTGCAATGCCCAGGCCGGAGCGAGCATAGTGCATGGGTGCCAGAAGCTTTTCGGGTTCCTCTTCCAGTGGCTGGCCCTCAAAGCTCAGGCTTTTGGTCAGACAAGGTGTGGCCGAGGGAGAGGCCTGGGGACTGCTGCGCCCATGCAGAAAGATCACGCACAGCATGCCGTTCAACACGGCCAGACACAGATACGTATTGTCTGTggggagagaaagaggacaGAGGTGACTTGAAGGAACTGTAGATAagttttgaaaatctaaagACATCAAAAGGTGCACACGTACTGGTGGTCTTCTCGGAAGCAATGTATTTCCACTCTTGCTTGCAGGTATGTTTGGCGGATCCAGGGGAGAGGCTGCCAGAGGAGCTGGTGCTCAGCTGTCGGTGTACATTCTCACGTGGGGGCTTCTTCTGCAAAGGCACAGCGCAGCTACAGACTCCGAGCCCATGGTCCACATACACACAACCTCACACAGTCCCAGACCCCGTCTAGGTATAAGCCTGACTCAACAACTTACCAGATGTTTTGGCCTGCATCAGGTTAAAGGAACATTCTGGGTTCAATACAACTTAAGCTCAATCGACAGCAATTGTGGCATAATGCTGGATGTGAACAGAGCACGCGCGTCCCATTATTTAATCGTTTGGTAAgcacttgtcaaagggagcgatgtcatttcctcattaaCTTCAACTGGggtgttcccatgacaacggaTGCAGCAGATTTGTCAAGGGgcggcataaaaaaaaaattacactaatatatatatatattagtttttatatattagcatattttaaaaacattataagatataaaaatgtgtctATTTGCAAGTAATGCTaacaacaaaaagacatttacaacATTAAAGCAGCAACATCTGCTGATGCACATCATGCTGCGCATCATGCTCacgggaacatcccagctgaagataatgaggaaataaCATTGCTCCCTTTGAAAAGTGCATTCCAAATGACTAagtaataacacacacacatgctctgcTCACTGAAGTCCTCACTAAAAAGGGGATGAGGATGATCACCTTGATTCGGAAAATGCCTGTGAACCGCAAGACAGACGATAAACGATACACCCCTAGAAGGAAGGCAATGCAAAGaagttttttgggtttttttacagCTTGGCACTGCACAGCATCTTTATCATTTGGCTTATTCACCtctatttaaactatattagtAAATCAGTGAATGGGGCAAAACAGCCAGCAGTGTAGATGCTGCACTGATCTTTTTACACTGAAGCGATGTTTAGCTATGCTTATTTAATAAGTTGTACATTccacaagcttttattttagaagACTGGCTTCAATAAGTATGTTTTAGACCAACAGGACATTTTGAGTTTTACAGGatgtttttacagtacaatgaccttgtcaaaaaaaataaaaaaataataaagctaaTTTTGGTTTCTCGGTTTCTAATCCCTAGTTTAGTAAGGTACTTTTTTTAGGGAATTTTAAAGAATACAAAGCTTTATAAAAgtcttaaaattaatttatcttttaaagTGAGTGCATGATATAAGCTTTAAAAAATAGCTCAAATCGTTTAGTCATTTCAGGCCATTATGTTGTCATAAGCACCAGAGTTGCATATAAAGTTACACAGAAAAGATTAgcaggcagtttttttttcaaaccagaGATAAGTTAACAtgcatattgtttatattttgtggCTATACTATTGGAACAGTGAGTATTTAAGCATTAAACATAACAGATTAATTACTTGTACTGTAAGTGCCATGCTGTAATCCAGATTTTtgatgctttcttttttttaaggataaACCACAGCACAACACAGATGCTTTTGAATGAGCTTGTACTGAACCTTGGACAATTCTTTTAACCTTACATCTACTTTAATCTAATCCCAAACTAAAGCCACACTATAAGCAGCACTAAAACCCAATCCACACACTCATCACGCACACATCGTGATCGCTCTAGCTCAAAACGCTCAGACTCAACAGCCCAGCACAACAAAGCAGCTGCTCTGCTAGCATTAAATCTTGCGATCGCTACGGCCTGCTGCGGTCCAGCCTGAGAAGAGCTCGGCGCTGGTTGTGTACCTGCACAAACTGGATGTGGTCATCCTCAGTGCCGAACACCTCAGCCTGCCCGTCAAGCAGGCTCCCATCGAGCAGCTTGTGATCGGCCGAATAGTACAGCGTTTGCACctgcaaaacacacagcaaCAACAGAACCCATGTGGCTGTCTCCATGACAACAGAGCACCCAACTACGTGGGTCAAGGGAAGAAGGAAAGTTAAGAAGGGAAGGGCCAAAGCACTCGTTTGCTGCAAGATGCTGGTAAAAAACTTCTTAAAGAATAAGAACAGTGTTGTTGTGGATTCAGGAGCATTTCCAAAGATCTTCTGGACTTTTCACTGCACTGAAAACAGCAGAATGTGGATCACAATACTGTTCGCTGCAAAGCATCTTGGGAACCTTCATTTGTCAACAagtttgaagaagaaaaatagaCAAATAAGCTCCATCAGTGCATGTTCGGCTGTCATCCATCCTTTCAGCTGAGGGGGTTAGTCAAGTCAGATGTCATTACACAAACTCCAGGACAACACTGGTTAGCGGTTTTCAACTCATACAGCTCAAAAAGGAGTgcttcatttagaaaaaaaaaatgttggattGTCTTCAAGCTTAAACAAAGTTTTTTCGAAATTAAATGCCATACAAAATTTAGTTCAAATAACTGAAAAGAATTCCACTGAAATTGGACCCCCCAAAAAAGTGCATCGATGTCACTATTGCATTTCTATGTTTTGTCTATGGGCACTTGCAGATATATTAAGGACACAAGCATGGTTGCGTCACTATTTTCAGTGTCTTGCACAATCTGAAGTCAAAAAATTTGCTTCCCTTGACCAACTGTGTATAGTCTTGATGCCAAGTAAACAGGACCAGTATGTACtgctgaaacaaaaaataagtaatttgtGTATAACTATAGTAGTGTTTTATAGTTTGATAGaattagaaaaaaagtcatgtttcaATGTTTCCATGACTGACTGCTGTCACTTCCTGTGCCCATCCCTGTATCCAAAAGCAGATTAAAAGGAACTAGGAACTGAGAGCAACTTCAGAACATCTCTTTAAGCTGTACTCAGTTCTCACTTCCTTTATTTAGGATGAAACTTACTGTAGGTGCCATCATTAAGCCTTTAAAGGAAGGCTTTCATTCATAATTAATCAATATTCAGGAGTATACtgtgcatgtatttgtatgttaatTGCCTTAGTGGCATAAAGCATCCATACATGTGTGCCTATCATTTGAATATtcagtaatgtaaatgtatgcatgaGCAACTGAGTGACATGCTTTGCATGCATATGTGAGTTATAGTAAGTTAAATTAATGTGTGAATGTTTTGGTGGATCCAACATGGTGGTGCTCAGACATCTgaagtgtcattttaaatgaactgtgtACTGTTAGTGAGTGCATCTGTTTAAGAGGCAGGAGCCTAGCGCTCGTTTCGCCACAGCTCCCTCttgttcttttgttattttctttcattcactGACTCATTACCCTGGAGGGCCCCAGTCTTGGCTTCTTCAGTCTTGTGAGAATCCTGCTGATGTTTGCTCTAATAAACCTAAGGAGAGATAAATCAGTGGGGAGGAAGAACTGTTAGTGCTGGTTCCCAGAGCAAGCACACTCACTCAAACATTCACACACCTGCTTAGAGAAGAGAGAGATGTCATTGGGACGGCAACATGTCATGTCACTCTCTGTGAGCAGACAAAGTAGCTGCAGTTACTGCACAGCACTGAGCATTCAGGAGGCTTTTAGTTTGGCTCACCTGGACTACCCACTCGCCTTTGCGGAGGGTGTAACAGCCCCGTTCTGTACCTAAATGTATATTCTTTAAGGCCCGGGGTGATTTGAGTGTGAAGGGGGAGaggaaacaaaaaatataatggaaGGCAGAGAGAACAAACCCAACCAACCTCTACCATTAAGATGGCTGGTGTGACCTGTTAAATCTGTGAATGGGATGAATTACGAGGGGGAAAAAGGGGGGGAAGGGAGAGAGGAGCTCACAGTGGAGCGCAGTGCTCACCTCCTCCATCAGTCGCTCCAGGGGTTCGCCATTTTCCCACAGGCTGCGTTGCACCCAGCCAATCACCTTGGAGTACAGCTTGCCATTACTAGGCAAGGTCAAGTTATCCTCCAGCATCACCTCCAA

Function

symbol description
ivns1abpa Predicted to be located in cytoplasm; cytoskeleton; and nucleus. Is expressed in several structures, including ectoderm; pronephric duct; pronephric mesoderm; sensory system; and solid lens vesicle. Human ortholog(s) of this gene implicated in immunodeficiency 70. Orthologous to human IVNS1ABP (influenza virus NS1A binding protein).

NR:

description
PREDICTED: influenza virus NS1A-binding protein homolog A

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU206135 False 4320 lncRNA 0.42 2 17795484 17799866
TU206136 False 4331 lncRNA 0.42 2 17795484 17799866
TU206137 False 4317 lncRNA 0.42 2 17795484 17799866
TU206138 True 4349 lncRNA 0.42 2 17795484 17799866
TU206139 False 4307 lncRNA 0.42 2 17795484 17799866

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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pdcb pdcb,LOC107553506,LOC107698383,LOC107732392,LOC107726497,LOC107696164,LOC107599093 coding downstream 129118 17663502 ~ 17666366 (-)
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kifap3a kifap3a,kifap3,LOC107726482,LOC107696146,LOC107698375,LOC107732413,LOC107553501,LOC107599114 coding upstream 43673 17843539 ~ 17861031 (-)
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G139386 NA non-coding downstream 179785 17615148 ~ 17615699 (-)
LOC122324574 NA non-coding downstream 236014 17555855 ~ 17559470 (-)
LOC122324490 NA non-coding downstream 385989 17396342 ~ 17409495 (-)
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G139653 NA non-coding upstream 366260 18166126 ~ 18166731 (-)
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G139030 LOC107732636,LOC107693214,LOC107549128,LOC107726455,LOC107601514,LOC107696115 other downstream 1333268 16455468 ~ 16462216 (-)
fndc1 fndc1,LOC107693219,LOC107732645,LOC107549078,LOC107726397,LOC107696111 other downstream 1428685 16347201 ~ 16366799 (-)
LOC122324507 sash1,sash1a,LOC107732642,LOC107601490,LOC107693212,LOC107696119 other downstream 1690757 16017318 ~ 16104727 (-)
LOC122325494 LOC107693148,LOC107734075,LOC107594136,LOC107710410,LOC107653994,LOC107552018 other downstream 1801839 15990149 ~ 15993645 (-)
swt1 swt1,LOC107698376,LOC107732364,LOC107696141,LOC107726449 other upstream 1536 17801402 ~ 17824201 (-)
adgrf3b LOC107732426,LOC107698325,LOC107553480,LOC107696096,LOC107601465,LOC107719098 other upstream 543597 18343463 ~ 18350122 (-)
G139706 LOC107683600,LOC107601464 other upstream 606161 18406027 ~ 18446949 (-)
batf3 batf3,LOC107558935,LOC107676231,LOC107553434,LOC107727593,LOC107675089 other upstream 1454868 19254734 ~ 19256272 (-)
LOC122324949 LOC107676261,LOC107727654,LOC107553459 other upstream 1461600 19261466 ~ 19262952 (-)

Expression


Co-expression Network