dcun1d4 (dcun1d4,LOC107755250,LOC107597444)


Basic Information

Item Value
gene id dcun1d4
gene name dcun1d4,LOC107755250,LOC107597444
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056718.1
NCBI id CM032087.1
chromosome length 27616869
location 11692782 ~ 11704023 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
dcun1d4 Predicted to enable cullin family protein binding activity; ubiquitin conjugating enzyme binding activity; and ubiquitin-like protein binding activity. Predicted to be involved in positive regulation of protein neddylation; positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity; and protein neddylation. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be part of ubiquitin ligase complex. Orthologous to human DCUN1D4 (defective in cullin neddylation 1 domain containing 4).

NR:

description
PREDICTED: DCN1-like protein 4 isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K17824 DCUN1D4_5; DCN1-like protein 4/5

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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slc10a4 slc10a4,LOC107601950,LOC107718427,LOC107683944,LOC107597446,LOC107665333 coding upstream 93997 11798020 ~ 11801524 (-)
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anapc4 anapc4,LOC107683992,LOC107665412 coding upstream 120238 11824261 ~ 11833692 (-)
LOC122324332 NA non-coding downstream 61688 11623593 ~ 11631094 (-)
G137748 NA non-coding downstream 61767 11628624 ~ 11631015 (-)
LOC122325627 NA non-coding downstream 62421 11630241 ~ 11630361 (-)
LOC122325626 NA non-coding downstream 62941 11629720 ~ 11629841 (-)
LOC122325628 NA non-coding downstream 63533 11629128 ~ 11629249 (-)
G137779 LOC107718384,LOC107665346 non-coding upstream 13215 11717238 ~ 11751172 (-)
G137812 NA non-coding upstream 67246 11771269 ~ 11771660 (-)
G137784 LOC107683942 non-coding upstream 88527 11792550 ~ 11797951 (-)
G137821 NA non-coding upstream 132083 11836106 ~ 11836716 (-)
G137822 LOC107683982,LOC107755258,LOC107597468,LOC107601923,LOC107718414,LOC107665352 non-coding upstream 134447 11838470 ~ 11839366 (-)
G137773 LOC107755215,LOC107683983,LOC107601925,LOC107718419,LOC107665290,LOC107597464 other downstream 9464 11682405 ~ 11683318 (-)
gsx2 gsx2,LOC107601899,LOC107597471,LOC107683998,LOC107755223,LOC107718430 other downstream 324292 11366923 ~ 11368490 (-)
LOC122325476 cdh2,-,cdh4,LOC107561048,LOC107746014,LOC107571545,LOC107701519,LOC107684812,LOC108416271,LOC107656023,LOC107590155,LOC107728629,LOC107739294,LOC107553647 other downstream 510599 11141945 ~ 11182183 (-)
LOC122324412 nme6,LOC107589089,LOC107697297,LOC107723520 other downstream 556170 11131424 ~ 11136612 (-)
G137469 tdh,LOC107561940,LOC107723287,LOC107684809,LOC107589050,LOC107701506,LOC107746115 other downstream 968713 10721921 ~ 10724069 (-)
G137967 mdn1,LOC107601919,LOC107755265,LOC107683937,LOC107597457,LOC107665348,LOC107737285 other upstream 514740 12218763 ~ 12219639 (-)
G137949 mdn1,LOC107755265,LOC107601919,LOC107683937,LOC107597457,LOC107665348,LOC107737285 other upstream 518787 12222810 ~ 12224270 (-)
mdn1 mdn1,LOC107755265,LOC107737285,LOC107597457,LOC107683937,LOC107665348,LOC107601919 other upstream 537778 12241801 ~ 12280312 (-)
LOC122324483 NA other upstream 1556896 13260919 ~ 13264284 (-)
cracd kiaa1211,LOC107555764,LOC107737310,LOC107665299,LOC107556121 other upstream 1719935 13423958 ~ 13447388 (-)

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