cnstb (LOC107732406,LOC107698361,LOC107719106,LOC107696101,LOC107553493)



Basic Information


Item Value
gene id cnstb
gene name LOC107732406,LOC107698361,LOC107719106,LOC107696101,LOC107553493
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056718.1
NCBI id CM032087.1
chromosome length 27616869
location 18123631 ~ 18133228 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043220333.1
CACAGATGCAGAGAGATAGGCAGGGCATCGAAACTGATTTCAGATCGGTGCGTGTCCGCCGGAGAGGGGTCCGGGGTCTCAGCTCGAGCAGCTCTGGGAACAGATACGAATGCCGCGCGTGCACGCGTCTACAGATGCGGACCGCGTTAACATCGATACGCAAACTAAACTTATGGAGGAGTCAGAGACGAGGAAGTCTGTAAGATGGAAAGAGACGAGCAGAATAACTCAGACTGAAGAGGACATCATTACTTCTTACCTAACAGTCTCCGATGAGAATCAGAACAAACTGCAGGAGGCAGAGGTAATGGAAGCGGTTAAACACGACTCAGAGAACAGGAGCCCCGAGGAGAGGTCTCCAACTAACATCAAGAGCCATAACTGCTCTTTAGATCGTGGTCAGCTCTCTGGAATTATGCCACCTGGACCTAGTCCTTCTCTTCTGGCCTCACTGCAGTCCCTCGTTGAACACAATGATCACATGCTACTCCCACATTCTTTACACCAGATAGCCGAGGGCTACTTCCTCGAAAAGGACTATCAGTGGGCAGTGGAGTTTCTTCATCTGGAGAAGCTGTATCATGAAAGACTGCTGTCTAATCTGGCCTCATTACAAGAGAAATGGGAGTGCCAGAGGAAAATCAGTGTCCAAACCGAAAGTAACTCTCCTGTGAACTCTGATggaagtgaaagagagagagagcatatgGAACTGTTGAATCATATCTGCAAAACACACCAGAGACCTATCCTATCTTTGCAAAAGAACATGGATGACATAAAACTATACAACAGCCCAGCCCTCGTGTCaaaagacagaagatcaaaacaAGAACAAGCTTCAGTGAACTCAACCGAGAGAGAGGACGGGGCGGAGGACTGCTCACGGCCAGAAGCTGAACAGGAGCCAGAAGAGGACTGTGAATTgaatgaggaggaggaggaggacgaggaagGTTTCGAGGAAGATGAGTGCTGGTATGAGGAGATGCAGGATGACACAGCCGTAGACGGCCAGCTTCCTGTGGATGAGCTGGCCAGCCTTATTCAGGTAGTAGAGAGGTTTCCCTCAGATGGCTTAGTGTCGATTTTAAAGAAGAGAGTCTGCGCCAGGGAAACGGAGAAAGCCTCGCTGCTAAAAGAATCGACCAAACGCAGAGTCCACTTCAGAGAGCCAGACGATGCTCTCGATCAAGATGAGTCCGCCAGAAAGTCTTGCCTCATCCTTCTCGTCTTGTGCGTGGCTACTGTGGTGATTAGCATGGGTGGGACTGCTCTTTATTGTCTCGTCGGAGAGGCGTACTCAAACGTGTGTGCCGACTTCTCGCAAAACGTGGACTTTTACTTTGGACCCGTACGAAGAGGAGTGGACGCTCTCACGCAGTGGCTCTCTTCTGATGCGTCATAGCAGCTATTTTATGCAGTGGAGCTATTTCTTCATATTATCATTTCCAGTGATTAACGACAGTATTACTCTTGAGATAATATGCACTAATGCACATTACCAGACTGGCCTTAATATATGTTGCTTTAGTGAGTCACAAAGGGCTTcctaatgcataaataaatttgtatagTGTATTTAATATTGGTACAAAAACAAGTTGTCGCAGATAATACTTATATGCCACTTATTACAGATAATCCTAATATACTGTACCACTGCCTTTCTTTGAATCGGTAACTATACATGCATTGAAATAACTGCCTTTGGAGCCAGTTATAtcgtttttgtacattttagtactttaaaacACTATATTCCAGGGTTACATTTGTATATAAGACTTGGCACTTTCCATTGGTGCTATAATCACTGAAATTGATACAGTATGCACAAAAATAAGCTTTATGGGTGTATGTTGAAGAagtagttcattcaaaaatgagaCTTGGCTCATAATTGACTCATCTTAAGGCCatctgagtttgtttctttatcttaacagatttggagaaaggtagcattacatcactctCTCACTAATGTATCATctaaagtgaatgggtgccgtcataatgtccaaacagctgataaaaaaacatcacaagaatCCAAAAGAAATTCATCTAATTCCAGTCCGTCTTGATAAAAGATAAGCTGcatttataagaaacaaattcatcattcAGGAGGAGATAGAAGACTCAAATTGTAACCGGAAGCAtctgtttaaagttaaaaaacgTCTtgataattaatttgtttattacaaacacacagcttttcacttcataagacacaatattaattgatggactatctgttctgataaaaagaaaacacgtCTACATTTTGAAAGACCTGACAGTGAGTAAATTGtcagtaatttttaatttttgggtgcaTTATTGCTTTAACTATGGGATATTAACTTatcaaaataactttattattaacAGAACTAGACAGGCTAAATAGTAGAAAAACGATGATCGATAGTTTTGAGTCTTGTTTATCCAACACTTGGTCAGCAggtacaaaataaatttaaaggttttataattgtacagtataaaatacaGCAATCAATCACTgtgttttaattacaaatatgatTTGTGTTCAGCAATCAAAGTGAGTATGAGTttttgtggaattttttttattttaaatgtttttttgtttttgtttttttaatatgatcAGAACCAGAAATCCCATTTTGCTGtatgtttctcttttttctgttcCAAGTAGTATGATCTCAGAATTATgtttggaaatgtgtttttatatttaaaaagtggtTTATGGTTTATGCTGTAGCTCTGTCTATAATAATATTGGATTGGTCCTCTGAATGGAAGAAAAGATGACGTAGCATTAAATGGAATTGGCACACGTAATAAAGCCTATGGTGAAGTAGGAGCATTTCTCTTTGGAAACCCACA
>XM_043220334.1
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>XM_043220335.1
TGGCTGTGTTTCGTCGTGAAGTGGCtctgttgaaaataaaacagtgacAAAGGGCAAGACGCTGCGAAGTGGACACGGGACGCTAAAGCACGCGCCCTTTACACCATCTTCCAGCGATGTGTCGGCTATTTGTGCGCAAGTTATGGAGGAGTCAGAGACGAGGAAGTCTGTAAGATGGAAAGAGACGAGCAGAATAACTCAGACTGAAGAGGACATCATTACTTCTTACCTAACAGTCTCCGATGAGAATCAGAACAAACTGCAGGAGGCAGAGGTAATGGAAGCGGTTAAACACGACTCAGAGAACAGGAGCCCCGAGGAGAGGTCTCCAACTAACATCAAGAGCCATAACTGCTCTTTAGATCGTGGTCAGCTCTCTGGAATTATGCCACCTGGACCTAGTCCTTCTCTTCTGGCCTCACTGCAGTCCCTCGTTGAACACAATGATCACATGCTACTCCCACATTCTTTACACCAGATAGCCGAGGGCTACTTCCTCGAAAAGGACTATCAGTGGGCAGTGGAGTTTCTTCATCTGGAGAAGCTGTATCATGAAAGACTGCTGTCTAATCTGGCCTCATTACAAGAGAAATGGGAGTGCCAGAGGAAAATCAGTGTCCAAACCGAAAGTAACTCTCCTGTGAACTCTGATggaagtgaaagagagagagagcatatgGAACTGTTGAATCATATCTGCAAAACACACCAGAGACCTATCCTATCTTTGCAAAAGAACATGGATGACATAAAACTATACAACAGCCCAGCCCTCGTGTCaaaagacagaagatcaaaacaAGAACAAGCTTCAGTGAACTCAACCGAGAGAGAGGACGGGGCGGAGGACTGCTCACGGCCAGAAGCTGAACAGGAGCCAGAAGAGGACTGTGAATTgaatgaggaggaggaggaggacgaggaagGTTTCGAGGAAGATGAGTGCTGGTATGAGGAGATGCAGGATGACACAGCCGTAGACGGCCAGCTTCCTGTGGATGAGCTGGCCAGCCTTATTCAGGTAGTAGAGAGGTTTCCCTCAGATGGCTTAGTGTCGATTTTAAAGAAGAGAGTCTGCGCCAGGGAAACGGAGAAAGCCTCGCTGCTAAAAGAATCGACCAAACGCAGAGTCCACTTCAGAGAGCCAGACGATGCTCTCGATCAAGATGAGTCCGCCAGAAAGTCTTGCCTCATCCTTCTCGTCTTGTGCGTGGCTACTGTGGTGATTAGCATGGGTGGGACTGCTCTTTATTGTCTCGTCGGAGAGGCGTACTCAAACGTGTGTGCCGACTTCTCGCAAAACGTGGACTTTTACTTTGGACCCGTACGAAGAGGAGTGGACGCTCTCACGCAGTGGCTCTCTTCTGATGCGTCATAGCAGCTATTTTATGCAGTGGAGCTATTTCTTCATATTATCATTTCCAGTGATTAACGACAGTATTACTCTTGAGATAATATGCACTAATGCACATTACCAGACTGGCCTTAATATATGTTGCTTTAGTGAGTCACAAAGGGCTTcctaatgcataaataaatttgtatagTGTATTTAATATTGGTACAAAAACAAGTTGTCGCAGATAATACTTATATGCCACTTATTACAGATAATCCTAATATACTGTACCACTGCCTTTCTTTGAATCGGTAACTATACATGCATTGAAATAACTGCCTTTGGAGCCAGTTATAtcgtttttgtacattttagtactttaaaacACTATATTCCAGGGTTACATTTGTATATAAGACTTGGCACTTTCCATTGGTGCTATAATCACTGAAATTGATACAGTATGCACAAAAATAAGCTTTATGGGTGTATGTTGAAGAagtagttcattcaaaaatgagaCTTGGCTCATAATTGACTCATCTTAAGGCCatctgagtttgtttctttatcttaacagatttggagaaaggtagcattacatcactctCTCACTAATGTATCATctaaagtgaatgggtgccgtcataatgtccaaacagctgataaaaaaacatcacaagaatCCAAAAGAAATTCATCTAATTCCAGTCCGTCTTGATAAAAGATAAGCTGcatttataagaaacaaattcatcattcAGGAGGAGATAGAAGACTCAAATTGTAACCGGAAGCAtctgtttaaagttaaaaaacgTCTtgataattaatttgtttattacaaacacacagcttttcacttcataagacacaatattaattgatggactatctgttctgataaaaagaaaacacgtCTACATTTTGAAAGACCTGACAGTGAGTAAATTGtcagtaatttttaatttttgggtgcaTTATTGCTTTAACTATGGGATATTAACTTatcaaaataactttattattaacAGAACTAGACAGGCTAAATAGTAGAAAAACGATGATCGATAGTTTTGAGTCTTGTTTATCCAACACTTGGTCAGCAggtacaaaataaatttaaaggttttataattgtacagtataaaatacaGCAATCAATCACTgtgttttaattacaaatatgatTTGTGTTCAGCAATCAAAGTGAGTATGAGTttttgtggaattttttttattttaaatgtttttttgtttttgtttttttaatatgatcAGAACCAGAAATCCCATTTTGCTGtatgtttctcttttttctgttcCAAGTAGTATGATCTCAGAATTATgtttggaaatgtgtttttatatttaaaaagtggtTTATGGTTTATGCTGTAGCTCTGTCTATAATAATATTGGATTGGTCCTCTGAATGGAAGAAAAGATGACGTAGCATTAAATGGAATTGGCACACGTAATAAAGCCTATGGTGAAGTAGGAGCATTTCTCTTTGGAAACCCACA

Function


NR:

description
PREDICTED: consortin-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043220333.1 True 2895 mRNA 0.40 10 18123631 18133228
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XM_043220335.1 False 2865 mRNA 0.40 10 18123631 18133025

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
sccpdhb sccpdhb,LOC107698360,LOC108439827,LOC107553427,LOC107578761 coding downstream 495 18116114 ~ 18123136 (-)
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paqr8 paqr8,LOC107698331,LOC107732380,LOC107553447 coding downstream 102055 18018219 ~ 18021576 (-)
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kif26bb LOC107732424,LOC107553492,LOC107698359,LOC107719102,LOC107696093,LOC107577345 coding upstream 960 18134188 ~ 18151673 (-)
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G139030 LOC107732636,LOC107693214,LOC107549128,LOC107726455,LOC107601514,LOC107696115 other downstream 1661415 16455468 ~ 16462216 (-)
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LOC122324507 sash1,sash1a,LOC107732642,LOC107601490,LOC107693212,LOC107696119 other downstream 2018904 16017318 ~ 16104727 (-)
adgrf3b LOC107732426,LOC107698325,LOC107553480,LOC107696096,LOC107601465,LOC107719098 other upstream 210235 18343463 ~ 18350122 (-)
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batf3 batf3,LOC107558935,LOC107676231,LOC107553434,LOC107727593,LOC107675089 other upstream 1121506 19254734 ~ 19256272 (-)
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angel2 LOC107676245,LOC107553457,LOC107727638,LOC107675074,LOC107558950 other upstream 1165006 19298234 ~ 19303968 (-)

Expression



Co-expression Network