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Basic Information

Item Value
gene id cnih3
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gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056718.1
NCBI id CM032087.1
chromosome length 27616869
location 18608512 ~ 18634663 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
cnih3 Predicted to be involved in regulation of AMPA receptor activity. Predicted to act upstream of or within vesicle-mediated transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in dendrite and synapse. Orthologous to human CNIH3 (cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3).

NR:

description
PREDICTED: protein cornichon homolog 3-like isoform X2

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KEGG:

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tdrd6 LOC107732403,LOC107698349,LOC107719088,LOC107696190 coding upstream 282644 18316265 ~ 18325868 (+)
ephx1 ephx1,LOC107553477,LOC107732537,LOC107601524 coding downstream 125766 18760429 ~ 18764704 (+)
ncoa1 ncoa1,LOC107727606,LOC107710951,LOC107675037 coding downstream 151390 18786053 ~ 18829653 (+)
heca LOC107675110,LOC107553472,LOC107689451,LOC107558939 coding downstream 205074 18839737 ~ 18844505 (+)
gje1a cx23,LOC107675059,LOC107717056,LOC107553438,LOC107558943,LOC107689460,LOC107727597 coding downstream 378918 19013581 ~ 19015254 (+)
vta1 vta1,LOC107689447,LOC107558942,LOC107675102 coding downstream 381673 19016336 ~ 19043921 (+)
G139557 NA non-coding upstream 98490 18509569 ~ 18510022 (+)
G139555 NA non-coding upstream 131507 18476352 ~ 18477005 (+)
LOC122324773 NA non-coding upstream 137436 18467995 ~ 18471076 (+)
G139543 NA non-coding upstream 159082 18449019 ~ 18449430 (+)
G139520 LOC107696192,LOC107708867,LOC107601464 non-coding upstream 217317 18379205 ~ 18391195 (+)
G139756 NA non-coding downstream 46233 18680896 ~ 18686926 (+)
G139785 txlnba,LOC107553470,LOC107727608,LOC107710955 non-coding downstream 223945 18858608 ~ 18859582 (+)
G139847 NA non-coding downstream 409408 19044071 ~ 19044201 (+)
G139851 hivep2a,LOC107553466,LOC107689444,LOC107727600,LOC107716448,LOC107558946,LOC107675072 non-coding downstream 461623 19096286 ~ 19100392 (+)
G139857 NA non-coding downstream 480455 19115118 ~ 19115376 (+)
il17a/f3 stmn4,LOC107698329,LOC107553446,LOC107732387,LOC107719388,LOC103148820,LOC106907996,LOC106571034,LOC106608277 other upstream 574334 18029130 ~ 18034178 (+)
ivns1abpa ivns1abpa,LOC107732388,LOC107726450,LOC107553504,LOC107599089,LOC107696153 other upstream 806062 17789294 ~ 17802450 (+)
henmt1 henmt1,LOC107710559,LOC107698398,LOC107555628,LOC107601273,LOC107726462 other upstream 1106497 17496895 ~ 17502015 (+)
LOC122325444 rps7,LOC107668222 other upstream 2686232 15721861 ~ 15922280 (+)
G138869 LOC107732629,LOC107726464,LOC107693230,LOC107549112,LOC107601686 other upstream 2811484 15763114 ~ 15797028 (+)
srp9 srp9,LOC107553440,LOC107601484 other downstream 123966 18758629 ~ 18760209 (+)
abracl abracl,LOC107727609,LOC107553474,LOC107689463,LOC107558932 other downstream 201491 18836154 ~ 18839302 (+)
G139780 LOC107689450,LOC107553470 other downstream 211630 18846293 ~ 18852580 (+)
G139788 cited2,LOC107558941,LOC107727673,LOC107689449,LOC107553469 other downstream 236744 18871407 ~ 18873604 (+)
tatdn3 tatdn3,LOC107727653 other downstream 624134 19258797 ~ 19262323 (+)

Expression

cnih3(cnih3,LOC107601529,LOC107732540,LOC106607867,LOC108440801,LOC108248696,LOC106527994,LOC106571455,LOC107095392) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 10 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 50.
End of interactive chart.

cnih3(cnih3,LOC107601529,LOC107732540,LOC106607867,LOC108440801,LOC108248696,LOC106527994,LOC106571455,LOC107095392) Expression in each Bioproject

Bar chart with 2 bars.
cnih3(cnih3,LOC107601529,LOC107732540,LOC106607867,LOC108440801,LOC108248696,LOC106527994,LOC106571455,LOC107095392) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 200.
End of interactive chart.

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