LOC122326563 (LOC107579035,LOC107736917)


Basic Information

Item Value
gene id LOC122326563
gene name LOC107579035,LOC107736917
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056719.1
NCBI id CM032088.1
chromosome length 19199999
location 2631096 ~ 2656760 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043221533.1
AAAGACATGGGACTTGAAGTCAACAACAGTGGtgcttaattaattttttttattattactttttcacAGATGTACAGATTATCTATTCAGATATAACAGGCATACATTTTCTTCTAGAGCCATGTTTTCACTAGTAATATTCTCAGgTTTCTTTAGCCTCACACTGTGTGCCCCTCAGTATGTCTTTGTCAGTGAATCCAAGACTTGGGGAGAAGCTCAGAAATACTGTAGAGATAAATACACTGATCTGGCCACCGTTGAAAATCAACAACAGACGATTCAGTTAATGGACACAGTGAATAATGATTCCATTGATTTGGCCTGGATTGGACTCTATGATGATCTGAACAGTTGGAAATGGACTCTAGAGGACAGTGATTTCTTTAAGGCAGGGGAGAAAGACTTTAGGAACTGGTATAATCAAGGACCAGGCTATTATGGAGCACAaagtctgtgtgtttatataaacaatGGGATATGGTATACAGCAAGCTGCTCCAGTGCATTTTATCCTACGGTCTGCTATGACGgaagAGAAAATGCAGGTACAaagtatgttttcatttaccAGTACAGAACCTGGGCTGAAGCTCAGAGTTACTGCAGAGAACATCACACAGACCTCATCAGTAtcagaaatgatgctgaaaaccaAAAGATTCAGTATTTATTacgaaatatttattattacaatatttggATTGGACTGTACAGAACCTGGTCTTGGTCAGATCAGAGCAACTCTTCATTTACTTACTGGAGCACATATCAACCCGATACTTCAGGATCCTGCACCACAGTCTCATTCAGTGACTCTGGGAAGTGGACTGATGAAAACTGCAATTATGCCTTTCCTTTCATTTGCTACAGTGCATCAGCATCATCCCGTCAGTATCACTTTGTGAACGAGTCTAAGAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGATGAAATGAACAGACTGATTAACACAGTTAATGGGAGTTACAGCGGCTCAGCCTGGATTGGACTATATGGTGATATAAACAACTGGAGATGGTCACTGGAAAACAATGATTTCTATcagaaaggagagaaagatTTCAGAAACTGGTATCATGAACCAGACAATAATGGTGGGAACCAACTGTGTGCTTACATGAGTAGCGGAAATTGGTATGATCTCTCATGTGACAACATACTGCCATTTGTTTGCTATGATGGTAGAGAGACTGCCACAGAGAGGTACATTTTTATCTATAACTGGAGAACCTGGTCAGAGGCTCGTAAATACTGCAGAGATCATTATACAGATCTCGCCAATGTGAGAAATCAGACTGAGAACCAGATCATCTGGGGAAAAACATGGGGATATGGAGTCTGGATCGGACTGTACAGAAACAGGATTTGGTCAAACAGTCAGAATACTACATATCAAAACTGGAGGCCACAAATTCCTGGGTTACCGGCGCAACCAGACAATGGCAACTCTCAATATTCTGAGTATGGGTTTCAGCACTGTACTGCTGTATCATTCAGATATTCAGGCAGATGGACAGATGAGATGTGTTTATCCAGCATGCCTTTCTTCTGCTACAGCAGAAGCTGCACACAATCTTCATGCACCCGTGAGTATCACTTTGTGTCTGAGTCTAAGAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGATGAAATGAACAGACTCATTAAAACAATACGAGGAACTTACTTTGGATCAACTTGGATTGGACTCTATGATGATATAAACAGCTGGAAATGGTCACTGGATAATGCAGCATTAGATGGAGGTTTTAAAAGCTGGTATGTTCAAAAACCATTGAACTCGTATGGacagagtctgtgtgtgtacatgtcGTATTATCAGGGAACATGGAGTGAAGCCTTTTGCTCCAATCAATATCCTTTTGTTTGCTACGATGGAAGGGTGAACGCTAGTTCAAGTTATGTCTTCGTTTATCAATTCAAACCCTGGAGTGAAGCTCAGAGTTACTGCAGAGAACATCACACAGATCTTGTCAGTATCAGGAATGAGATTGAAAACTACAGGGTTAAATCATTACTTCAATATTATTCAGTTGCTTGGATTGGATTGTACAGAACCAGATCTTGGTCAGATCAGAGCAACTCTTCATTCAGTAACTGGAGGACAGGACAGCCAGATAATGCTGGAAACAGTCAATACTGCACTGCAGTGTCTTTTAGTGACTCTGGGAGCTGGACAGACGAAAACTGCAACATTGCATTACCTTTCGTTTGCTACAGCGCATCAGCATCATCCCGTCAGTATCACTTTGTGAATGAGTCTAAGAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGAGGAAATGAACAGACTGATTAACACAGTTAATGGAAGGTACAATGGTTCAGCCTGGATTGGACTGTATGATGATATAAACAGCTGGAGATGGTCACTGGAAAACAATGATTTCTAtcaggaaggagagagagatttcAGAAACTGGTATCATGAACCAGACAACTATGGTGGGAACCAGCTGTGTGTTTACATGAATTATAATGGGAAATGGTATGATATCTCATGTGACAGCATGGTGCCATTTGTTTGTTATGATGGTAGAGAAACTGCTATACAGCAGTACATCAGAATTAATAACCTGACAAACTGGTCAGAGGCTCGTAGATACTGCAGAGATCATTACACAGATCTCGCCAATGTGAGAAATCAGACTGAGAACCAGAGGATCCTTGAGATAGCAGTTGGAGGAGTCTGGATCGGACTGTACAGAAACAGGATTTGGTCGAATGGTCAGAATACCAAATATGAAGATTGGAGACCAGCCATTCCGTATTCACAACAGCAACCAGATAATGGAATATATGAGTATGCCCAGTGGTTTTCTCAGCACTGTACTGCTGTATCATTCAGTCATTTAGGTCGATGGACTGATGAGAACTGCTTATCCAGCATGCCTTTCATCTGCTACAGCAGAAGCTGCACACAGTCTTCATGCACCCACCAGTATCACTTTGTGTCTGCGAATAAGACCTGGACCGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACATTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGAGGAAATGAACAGACTGATTAAAACAGTGCATAGGACTTATGGCAAAGCTTGGATTGGACTCTATGATGATATAAACAGCTGGAGATGGTCAGTGGATAATACCTCATTAGATGGAGGTTTTAAAAGCTGGTATGTTCAGCAACCAGTAAATGTTAATGGacagagtctgtgtgtgtacatgtcATATACTCAAGGAATATGGAGTGAATCCCCTTGCCACTATACATATCGGTTTGTTTGCTATGATGgaAGAGTGAACGCTAGTGCAAGTTATGTCTTTGTTTATCAATACAAAACCTGGAGTGAAGCTCAGAGTTACTGCAGAGAACATCACACAGATCTTGTCAGTATCAGGAATGAGATTGAAAACTACAGGGTTCAGTTATTACTTCAATATTATTCAGTTGCTTGGATTGGATTGTACAGAACCAGATCTTGGTCAGATCAGAGCAACTCTTCATTCAGTAACTGGAAGACAGGACAGCCAGATAATGCTGGAAACAGTCAATACTGCACTGCAGTGTCTTTTAGTGACTCTGGGAACTGGACAGACGAAAACTGCAACATTGCATTACCTTTCATTTGCTACAGCGCATCAGCATCATCCCGTCAGTATCACTTTGTGAATGAGTCTAAAAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGATGAAATGAACAGACTGATTAACACAGTTAATGGAAGGTACAATGGTTCAGCCTGGATTGGACTGTATGATGATATAAACAGCTGGAGATGGTCACTGGAAAACAATGATTTCTAtcaaaaaggagagagagatttcAGGAACTGGTATCATGAACCAGACCATGGAGGCTATGCGGACAACATGTGCGTTTACATGAATAATTACGGAAACTGGTTTGATACGTCATGTGGcaatttttacacatttgtctGCTATGACAGCAGAAGAAACGCCACTCAGAAATATGTCCCTGTATTTAGTGGAATGACCTGGGCTGGAGCTCAGAGCTACTGCAGAGAGAAATACACAGACCTGGCCAGTGTGAGGAATGAGACAGAGCGTCAACAGATACTAAACGCTATGAGTAGTTCTTGGTATTGGTATTGGTATTGGTATTACGGATATTCTGTGTGGATTGGTCTGTACAGAAACAGACTGTGGTCAGATCAGAGCACCTCTTCTTTTACATATTGGCTGCCATACACTAATTTTATTGCTGCACAACCAGATAATGGTGCAAGTGTCCCAGGAGAGGAGGGAGCTCAACACTGCACAGCTACGTCTTTACAATATTTTGGCCAGTGGACAGATGAGAGCTGCTTTGACAGTCTGCCTTTCTTCTGTTACAGTGATGAATACgTGATGGGACTGAGAGTGGAAGTTACAAGTCTGGACAATCTGTCAGAATCTCAGATTGAAGAGCTGGTGATTCAACAGCTCCAGGAAGAATTAATTAGACAAGGACTTCCCAGCAACTTCACCATGCATTTGAGAAACTATCGAAAAACCAATccatgaggggaaaaaaggagCATTCCAGgatattaaaatggtttaacTAAACTATTCCTGAACATTTGCAGTTTGTGTGTTCTTTGCAAATTCCtatctttacagaaaataatcacaataatcacATATATACCCCCACtaaagactttttttcaaaataatgaatcGTATACAGCATATACTGTACTCATTTTTGGAACGTAATATGCTTTGTGATTACTTTGAGTAATTAAACTGATCGAATATTTTGTGTCATCagatattatttacagtaaaccTCTTAACTTTGCAATTAAAAGTTCTTTGTTAAATGTAGAGATGATTTGTCGatctgtatgtgtatttgtaattCTAATCCAAACATAACGATAAATCAGCTTTTTGGCATTTCAGGAATATGTCTACAGCAAATCTTTGTTCTCTCCTCTACATGGTCACATGGTTTATGGAGCTTTTGAATGGGTTCAAGCAGATAGACAGCATTTTTACTATACTTGCAGCGTGTTGTGGTAAATATGGACAAAGCATATAAATTGATTGTGCATTAGCAGTAGCATAAATTGACAGTAGCATTAATTACGGTAGCATTTTATTCTGAGGAGTAATAAGTGATAACTTGATGACTTCAGTAATATTTACTAAATTTGGTACTAAATAATATGTGCAAGACcaattaaaatacaacattttataatCTATGAATCTGATTTTAGTATTGTAGTATTTAAGGTTAAAACAGATTCCCTTTTTatgttatggttgaaccactgatggcagatggatgTTTCTAACAATGTCTTTTATCATTTTCTGGACCTTGAGTGTTCATTACATGGTCTCTGGTCTACAGTACAGTTCCACAAACAGATGAAGAAAGAAATCTGACTTGACTTAAAGATCATTTGTAGTTGTTTAGAcatgttttatctgttttatgGACTATGTTGTCATTgcctattttatattattttctagtTTATCATACActtgaataaataatcataaacaaC
>XM_043221534.1
AAAGACATGGGACTTGAAGTCAACAACAGTGGtgcttaattaattttttttattattactttttcacAGATGTACAGATTATCTATTCAGATATAACAGGCATACATTTTCTTCTAGAGCCATGTTTTCACTAGTAATATTCTCAGgTTTCTTTAGCCTCACACTGTGTGCCCCTCAGTATGTCTTTGTCAGTGAATCCAAGACTTGGGGAGAAGCTCAGAAATACTGTAGAGATAAATACACTGATCTGGCCACCGTTGAAAATCAACAACAGACGATTCAGTTAATGGACACAGTGAATAATGATTCCATTGATTTGGCCTGGATTGGACTCTATGATGATCTGAACAGTTGGAAATGGACTCTAGAGGACAGTGATTTCTTTAAGGCAGGGGAGAAAGACTTTAGGAACTGGTATAATCAAGGACCAGGCTATTATGGAGCACAaagtctgtgtgtttatataaacaatGGGATATGGTATACAGCAAGCTGCTCCAGTGCATTTTATCCTACGGTCTGCTATGACGgaagAGAAAATGCAGGTACAaagtatgttttcatttaccAGTACAGAACCTGGGCTGAAGCTCAGAGTTACTGCAGAGAACATCACACAGACCTCATCAGTAtcagaaatgatgctgaaaaccaAAAGATTCAGTATTTATTacgaaatatttattattacaatatttggATTGGACTGTACAGAACCTGGTCTTGGTCAGATCAGAGCAACTCTTCATTTACTTACTGGAGCACATATCAACCCGATACTTCAGGATCCTGCACCACAGTCTCATTCAGTGACTCTGGGAAGTGGACTGATGAAAACTGCAATTATGCCTTTCCTTTCATTTGCTACAGTGCATCAGCATCATCCCGTCAGTATCACTTTGTGAACGAGTCTAAGAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGATGAAATGAACAGACTGATTAACACAGTTAATGGGAGTTACAGCGGCTCAGCCTGGATTGGACTATATGGTGATATAAACAACTGGAGATGGTCACTGGAAAACAATGATTTCTATcagaaaggagagaaagatTTCAGAAACTGGTATCATGAACCAGACAATAATGGTGGGAACCAACTGTGTGCTTACATGAGTAGCGGAAATTGGTATGATCTCTCATGTGACAACATACTGCCATTTGTTTGCTATGATGGTAGAGAGACTGCCACAGAGAGGTACATTTTTATCTATAACTGGAGAACCTGGTCAGAGGCTCGTAAATACTGCAGAGATCATTATACAGATCTCGCCAATGTGAGAAATCAGACTGAGAACCAGATCATCTGGGGAAAAACATGGGGATATGGAGTCTGGATCGGACTGTACAGAAACAGGATTTGGTCAAACAGTCAGAATACTACATATCAAAACTGGAGGCCACAAATTCCTGGGTTACCGGCGCAACCAGACAATGGCAACTCTCAATATTCTGAGTATGGGTTTCAGCACTGTACTGCTGTATCATTCAGATATTCAGGCAGATGGACAGATGAGATGTGTTTATCCAGCATGCCTTTCTTCTGCTACAGCAGAAGCTGCACACAATCTTCATGCACCCGTGAGTATCACTTTGTGTCTGAGTCTAAGAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGATGAAATGAACAGACTCATTAAAACAATACGAGGAACTTACTTTGGATCAACTTGGATTGGACTCTATGATGATATAAACAGCTGGAAATGGTCACTGGATAATGCAGCATTAGATGGAGGTTTTAAAAGCTGGTATGTTCAAAAACCATTGAACTCGTATGGacagagtctgtgtgtgtacatgtcGTATTATCAGGGAACATGGAGTGAAGCCTTTTGCTCCAATCAATATCCTTTTGTTTGCTACGATGGAAGGGTGAACGCTAGTTCAAGTTATGTCTTCGTTTATCAATTCAAACCCTGGAGTGAAGCTCAGAGTTACTGCAGAGAACATCACACAGATCTTGTCAGTATCAGGAATGAGATTGAAAACTACAGGGTTAAATCATTACTTCAATATTATTCAGTTGCTTGGATTGGATTGTACAGAACCAGATCTTGGTCAGATCAGAGCAACTCTTCATTCAGTAACTGGAGGACAGGACAGCCAGATAATGCTGGAAACAGTCAATACTGCACTGCAGTGTCTTTTAGTGACTCTGGGAGCTGGACAGACGAAAACTGCAACATTGCATTACCTTTCGTTTGCTACAGCGCATCAGCATCATCCCGTCAGTATCACTTTGTGAATGAGTCTAAGAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGAGGAAATGAACAGACTGATTAACACAGTTAATGGAAGGTACAATGGTTCAGCCTGGATTGGACTGTATGATGATATAAACAGCTGGAGATGGTCACTGGAAAACAATGATTTCTAtcaggaaggagagagagatttcAGAAACTGGTATCATGAACCAGACAACTATGGTGGGAACCAGCTGTGTGTTTACATGAATTATAATGGGAAATGGTATGATATCTCATGTGACAGCATGGTGCCATTTGTTTGTTATGATGGTAGAGAAACTGCTATACAGCAGTACATCAGAATTAATAACCTGACAAACTGGTCAGAGGCTCGTAGATACTGCAGAGATCATTACACAGATCTCGCCAATGTGAGAAATCAGACTGAGAACCAGAGGATCCTTGAGATAGCAGTTGGAGGAGTCTGGATCGGACTGTACAGAAACAGGATTTGGTCGAATGGTCAGAATACCAAATATGAAGATTGGAGACCAGCCATTCCGTATTCACAACAGCAACCAGATAATGGAATATATGAGTATGCCCAGTGGTTTTCTCAGCACTGTACTGCTGTATCATTCAGTCATTTAGGTCGATGGACTGATGAGAACTGCTTATCCAGCATGCCTTTCATCTGCTACAGCAGAAGCTGCACACAGTCTTCATGCACCCACCAGTATCACTTTGTGTCTGCGAATAAGACCTGGACCGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACATTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGAGGAAATGAACAGACTGATTAAAACAGTGCATAGGACTTATGGCAAAGCTTGGATTGGACTCTATGATGATATAAACAGCTGGAGATGGTCAGTGGATAATACCTCATTAGATGGAGGTTTTAAAAGCTGGTATGTTCAGCAACCAGTAAATGTTAATGGacagagtctgtgtgtgtacatgtcATATACTCAAGGAATATGGAGTGAATCCCCTTGCCACTATACATATCGGTTTGTTTGCTATGATGgaAGAGTGAACGCTAGTGCAAGTTATGTCTTTGTTTATCAATACAAAACCTGGAGTGAAGCTCAGAGTTACTGCAGAGAACATCACACAGATCTTGTCAGTATCAGGAATGAGATTGAAAACTACAGGGTTCAGTTATTACTTCAATATTATTCAGTTGCTTGGATTGGATTGTACAGAACCAGATCTTGGTCAGATCAGAGCAACTCTTCATTCAGTAACTGGAAGACAGGACAGCCAGATAATGCTGGAAACAGTCAATACTGCACTGCAGTGTCTTTTAGTGACTCTGGGAACTGGACAGACGAAAACTGCAACATTGCATTACCTTTCATTTGCTACAGCGCATCAGCATCATCCCGTCAGTATCACTTTGTGAATGAGTCTAAAAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGATGAAATGAACAGACTGATTAACACAGTTAATGGAAGGTACAATGGTTCAGCCTGGATTGGACTGTATGATGATATAAACAGCTGGAGATGGTCACTGGAAAACAATGATTTCTAtcaaaaaggagagagagatttcAGGAACTGGTATCATGAACCAGACCATGGAGGCTATGCGGACAACATGCAGAAGAAACGCCACTCAGAAATATGTCCCTGTATTTAGTGGAATGACCTGGGCTGGAGCTCAGAGCTACTGCAGAGAGAAATACACAGACCTGGCCAGTGTGAGGAATGAGACAGAGCGTCAACAGATACTAAACGCTATGAGTAGTTCTTGGTATTGGTATTGGTATTGGTATTACGGATATTC

Function

NR:

description
PREDICTED: C-type mannose receptor 2-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043221533.1 True 5751 mRNA 0.40 17 2631096 2656760
XM_043221534.1 False 4279 mRNA 0.41 14 2631096 2654902

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122326565 LOC107579035 coding upstream 3743 2618235 ~ 2627353 (+)
LOC122326937 NA coding upstream 343808 2280581 ~ 2287288 (+)
slc31a2 LOC107661547 coding upstream 632049 1995787 ~ 1999047 (+)
LOC122326700 NA coding upstream 677870 1949736 ~ 1953226 (+)
zgc:113162 LOC107692271,LOC107584524,LOC107661621,LOC107736869 coding upstream 781611 1830684 ~ 1849485 (+)
smarcb1b smarcb1b,smarcb1,LOC107661349,LOC107736887 coding downstream 88127 2744887 ~ 2752853 (+)
chchd10 chchd10,LOC107736936,LOC107692329,LOC107737885,LOC107662830 coding downstream 125588 2782348 ~ 2784025 (+)
ddt ddt,LOC107736937,LOC107662822,LOC107737884,LOC107692330 coding downstream 127713 2784473 ~ 2786135 (+)
gstt1b LOC107548781,LOC107661340,LOC107595683,LOC107737872 coding downstream 129884 2786644 ~ 2789093 (+)
p2rx4a p2rx4,p2rx4a,LOC107737869 coding downstream 132747 2789507 ~ 2793545 (+)
G143385 NA non-coding upstream 87789 2487403 ~ 2543307 (+)
G143349 NA non-coding upstream 140896 2426489 ~ 2490200 (+)
G143356 NA non-coding upstream 227006 2402747 ~ 2404090 (+)
G143354 LOC107595722,LOC107662860,LOC107739708,LOC107548798 non-coding upstream 231027 2399072 ~ 2400069 (+)
G143340 NA non-coding upstream 292626 2336781 ~ 2338470 (+)
G143465 NA non-coding downstream 143970 2800730 ~ 2801348 (+)
G143491 NA non-coding downstream 206012 2862772 ~ 2863017 (+)
G143509 NA non-coding downstream 273502 2930262 ~ 2937617 (+)
G143578 NA non-coding downstream 658417 3315177 ~ 3315473 (+)
LOC122326852 NA non-coding downstream 679501 3336261 ~ 3336689 (+)
G143321 LOC107739705,LOC107661415,LOC107736881,LOC107692311,LOC107548771 other upstream 393901 2233659 ~ 2237195 (+)
stxbp1a stxbp1a,stxbp1,LOC107661518,LOC107736879,LOC108437460 other upstream 574417 2030104 ~ 2056679 (+)
LOC122326311 NA other upstream 1402041 1227998 ~ 1229055 (+)
glrx glrx,LOC107661879,LOC107665229 other upstream 1474954 1153104 ~ 1156142 (+)
entpd2b entpd2b,LOC107662923,LOC107580497,LOC107736658 other upstream 1575171 1050838 ~ 1055925 (+)
gnrh2 LOC107595723 other downstream 172354 2829114 ~ 2830356 (+)
LOC122326950 ehmt2,LOC107661424,LOC107739706,LOC107706570,LOC107566632,LOC107751678,LOC107694038,LOC107694747,LOC107557450 other downstream 641230 3297990 ~ 3320013 (+)
G143650 barhl1b,barhl1,LOC107556939,LOC100712077,LOC102792687,LOC107708351,LOC107595696 other downstream 1044669 3701429 ~ 3704397 (+)
G143725 si:ch73-287m6.1,LOC107565381,LOC107708362 other downstream 1450041 4106801 ~ 4213772 (+)
G143726 si:dkey-112m2.1,LOC107661187,LOC107708339,LOC107565378,LOC107684910,LOC107566201,LOC108437247 other downstream 1475676 4132436 ~ 4386212 (+)

Expression


Co-expression Network