LOC122326565 (LOC107579035)


Basic Information

Item Value
gene id LOC122326565
gene name LOC107579035
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056719.1
NCBI id CM032088.1
chromosome length 19199999
location 2618235 ~ 2627353 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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CAAAACTGgtgtttaattactttttaacaatactttttaatgcttttctaatACAATATAACAGGCATCATTTTCTTCCTGAGCCATGTTTCCATTACTGATATTCTCAGgTTTCTTTAGCCTCACACTGTGTGCCCCTCAGTATGTCTTTGTCAGTGAATCCAAGACTTGGGGAGAAGCTCAGAAATACTGTAGAGATAAATACACTGATCTGGCCACCGTTGAAAATCAACAACAGACGATTCAGTTATTGGACACAGTGAATAATGATTCCATTGATTTGGCCTGGATTGGACTCTATGATGATCTGAACAGTTGGAAATGGACTCTAGAGGACAGTGATTTCTTCGATGTGGGAGAGAAAGACTTTAGGAACTGGTATAATCCAGGACCAATCAATTATGGAGGACAAAGACTGTGTGTTTCTATATACAATGGGATATGGTATACAGCACTCTGTTCTAATTTGATGTATACATTCTGCTATGATGGAAGAGAAAATGCCACTGCTAGTTATGTTCTCATTTACGAGTACAGAACCTGGGCTGAAGCTCAGAGTTACTGCAGAGAACATCACACAGACCTCATCAGTAtcagaaatgatgctgaaaaccaAAAGATTCAGTATTTATTACGAAATATTCATTATAACTATATTTGGATTGGACTGTACAGAACCTGGTCTTGGTCAGATCAGAGCAACTCTTCATTTACTTACTGGAGCACATATCAACCCGATTCTACAGAATCCTGCACTGTAGTGTCATTTAGTGACTCTGGGAAGTGGACTTCTACATACTGCTATTACGCCTATCCTTTCTTTTGCTACAGTGAATCAGCATCATCCCGTCAGTATCACTTTGTGTCTGAGTCTAAGAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGATGAAATGAACAGACTGATTAACACAGTTAATGGGAGTTACAGCGGCTCAGCCTGGATTGGACTGTATGATGATATAAACAGCTGGAGATGGTCACTGGAAAACAATGATTTCTAtcaagaaggagagagagatttcAGAAACTGGTATCATGAACCAGACAATAGTGGGGGAAACGAACTGTGTGTTTACATgaattataatgcaaaatggTATGATATCTCATGTGACAACACACTGCCATTTGTTTGCTATGATGGTAGAGAGACTGCCACAGAGAGGTACATTTTTATCTATAGTTTGAAAACCTGGTCAGAGGCTCGTAGTTACTGCAGAGATCATTATACAGATCTCGCCAATGTGAGAAATCAGACTGAGAACCAGAGGATCCTTGAGACAGCAGTTGGAGGAGTCTGGATCGGACTGTACAGAAACAGGATTTGGTCAAACAGTCAGAATACTACATATCAAAACTGGAGGCCACAAATTCCTGGGTTACCGGCGCAACCAGACAATGGCAACTCTCAATATTCTGAGTATGGGTTTCAGCACTGTACTGCTGTATCATTCAGATATTCAGGCAGATGGACAGATGAGATGTGTTTATCCAGCATGCCTTTCTTCTGCTACAGCAGAAGCTGCACACAATCTTCATGCACCCGTGAGTATCACTTTGTGTCTGAGTCTAAGAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGATGAAATGAACAGACTCATTAAAACAATACGAGGAACTTACTTTGGATCAACTTGGATTGGACTCTATGATGATATAAACAGCTGGAAATGGTCTCTGGATAATGCAACATTAGAGGGAGGTTTTAAAAGCTGGTATGTTCAACAACAAGAAAATTCAGGTGGacagagtctgtgtgtgtacatgtcAAATTATCAGGGAACATGGAGTGAAGCCTTTTGCTCCTATCAGTATCCTTTTGTTTGCTACGATGGAAACGTGAATGCTAGTTCAAGTTATGTTTTGGTGTACGAGTATAAACCCTGGAGTGAAGCTCAGAGTTACTGCAGAGAACATCACACAGATCTTGTCAGTATCAGGAATGAGATTGAAAACTACAGGGTTCAGTTATTACTTCAATATTATTCAGTTGCTTGGATTGGATTGTACAGAACCAGGTCTTGGTCAGATCAGAGCAACTCTTCATTCAGTAACTGGAAGACAGGACAGCCAGATAATGCTGGAAACAGTCAATACTGCACTGCAGTGTCTTTTAGTGACTCTGGGAACTGGACAGACGAAGACTGCAACATTGCATTACCTTTCATTTGCTACAGTGCAGAGTCAGCATCACCCCATCAGTATCACTTTGTGAATGAGTCTAAAAGCTGGACTGAAGCTCAGACATACTGCAGACAGAATTACACTGATCTGGCCACCATTGATAACATGGATGAAATGAACAGACTGATTAACACAGTTAATGGAAGGTACAATGGCTCAGCCTGGATTGGACTGTATGATGATATAAACAGCTGGAGATGGTCACTGGAAAACAATGATTTCTAtcaagaaggagagagagatttcAGGAACTTTTATCACGAACCTAATAACAATTTTGGGAATGAACTGTGTGTTTACATGgataataatgcaaaatggtttgatggatcatgtgacagttATAACTCATTTATCTGTTATGATGgcagAATAAACTCCTCTCAGCAGTATGTTTGGGTAACTGAGGTAAGGACCTGGGCTGGAGCTCAGAGCTACTGCAGAGAGAAATACACAGACCTGGCCAGTGTGAGGAATGAGACAGAGCGTCAACAGATACTAAACGTTATGAGTAGTAATTGGTATTGGAATAATTACGGATTTTCTGTGTGGATTGGTCTGTACAGAAACAGACTGTGGTCAGATCAGAGCACCTCTTCTTTTACATATTGGCTGCAAAACAGTCAAAGCTTTGCTGCACAACCAGATAATGGTGCAAATGTCCCAGGAGAGGAGGGAGCTCAACACTGCACAGCTACGTCTTTACAATATTTTGGCCAGTGGACAGATGAGAGCTGCTTTGACAGTCTGCCTTTCTTCTGTTACAGTGCCACCAATTCAGATGCATACGTGATGGGAATGCAAATAAAAGTTACAAGTCTTGAAAATTTGTCTGAATCTCAGATTGAACAGCTTGTGATTATGCAGTTACAAGAGGAGCTGATGAGGCTTGGACTTCCCAGAAACGTCACCATGAATTTAAGAGATTATCGTAAGATTAATCCTTGACAGAGAATGTTTCAACGGACCTGTTAAATCAGTAAAGGGCTTTGTAAgaaaatgaatgcagctttaatttcaattttaacattAACTGTAAAATTGAGCTTACAGTA

Function

NR:

description
PREDICTED: C-type mannose receptor 2-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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slc31a2 LOC107661547 coding upstream 619188 1995787 ~ 1999047 (+)
LOC122326700 NA coding upstream 665009 1949736 ~ 1953226 (+)
zgc:113162 LOC107692271,LOC107584524,LOC107661621,LOC107736869 coding upstream 768750 1830684 ~ 1849485 (+)
LOC122326489 camkk2,LOC107739694,LOC107736868,LOC108437385 coding upstream 788083 1809407 ~ 1830152 (+)
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ddt ddt,LOC107736937,LOC107662822,LOC107737884,LOC107692330 coding downstream 157120 2784473 ~ 2786135 (+)
gstt1b LOC107548781,LOC107661340,LOC107595683,LOC107737872 coding downstream 159291 2786644 ~ 2789093 (+)
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G143354 LOC107595722,LOC107662860,LOC107739708,LOC107548798 non-coding upstream 218166 2399072 ~ 2400069 (+)
G143340 NA non-coding upstream 279765 2336781 ~ 2338470 (+)
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G143321 LOC107739705,LOC107661415,LOC107736881,LOC107692311,LOC107548771 other upstream 381040 2233659 ~ 2237195 (+)
stxbp1a stxbp1a,stxbp1,LOC107661518,LOC107736879,LOC108437460 other upstream 561556 2030104 ~ 2056679 (+)
LOC122326311 NA other upstream 1389180 1227998 ~ 1229055 (+)
glrx glrx,LOC107661879,LOC107665229 other upstream 1462093 1153104 ~ 1156142 (+)
entpd2b entpd2b,LOC107662923,LOC107580497,LOC107736658 other upstream 1562310 1050838 ~ 1055925 (+)
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LOC122326950 ehmt2,LOC107661424,LOC107739706,LOC107706570,LOC107566632,LOC107751678,LOC107694038,LOC107694747,LOC107557450 other downstream 670637 3297990 ~ 3320013 (+)
G143650 barhl1b,barhl1,LOC107556939,LOC100712077,LOC102792687,LOC107708351,LOC107595696 other downstream 1074076 3701429 ~ 3704397 (+)
G143725 si:ch73-287m6.1,LOC107565381,LOC107708362 other downstream 1479448 4106801 ~ 4213772 (+)
G143726 si:dkey-112m2.1,LOC107661187,LOC107708339,LOC107565378,LOC107684910,LOC107566201,LOC108437247 other downstream 1505083 4132436 ~ 4386212 (+)

Expression


Co-expression Network