borcs8 (borcs8,LOC107728595,LOC107554813,LOC107599453)


Basic Information

Item Value
gene id borcs8
gene name borcs8,LOC107728595,LOC107554813,LOC107599453
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056720.1
NCBI id CM032089.1
chromosome length 18002998
location 9888163 ~ 9893507 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU223951
TTGAGAGCACACTCGTAACTCGGCAGCAGAGCTCGGAGAGTATATAAGAGGAAATTAATACCATacgttaatatttaataaaaatggagGATCAAGAAATGCAGTTGAAAGTAAAAAGAGTGACTGATAAATTCACAGAGAGTATGTATGTCCTGGCCAACGAACCGTCCATAGCGCTTTATAGGTTACAAGAGCACGTGAGAAGATCCCTGCCAGAGCTCGTGCAGCACAAGACAGACATGCAAAGTTGGGAGGAACAAAGTCAAGGAGCAATCTACACCGTTGAATATGCATGCAGTGCGGTTAAAAGCATGTCGAATAGCAGTCTCTATTTCAAGAACATAGACGGTCTGCTCCGGCAAGCCATTTCACTGAAGGAACAGATCGGCGGCTCGCAGGGTCGAAGGTTGGACTTACTATCCGTTTGAATGCGATTACATGCATCTACGttattacttttctttattttttggttttacataTCGCTTCActgtttaatgtaaatgtggCATCGGCTCCCTGTAACTTTTCTTTTGCTTGTTTGCTTCACTTTTAATTTGCTcgctttttctgtgttttaaacGCACATGCCACTTCAGTGCTGTGAAACCTGCAATTAATCCAAACgatacacccacacacacttcagTCACACCGCCCTGACTCATGGAAATCTTTCTCTCAGGTtagttttacttcatttttctttctttttctttctttctttctttcacgcATGCAGTGTTAGTGTTAATTTGACAGTTTACGTACAAAACtgattaatagtaataataataataataataataaaaacatttcatagtatttaatttttattgtgacagacatttaaaaacacagattcaaaTAGTTATCAGTTATGCCTTtctcttcactttttttattgttgtatcGTTCTGCTGCAAAGTATGGTTCTGTTCCAGAAGTCTTTCTGCTTAAAATATCACTATTACTAAAATATCATTACTACTTCAGTAGTAATTtcgcattattattattttgcgtTTCAACAATTAGAGAGATCTAACACCTGTGAGCTGATATTAagcgtacaaaaaaaaaaagattttgcttTAAACGtcacataaataatttaagCTGCAGTAATTTGATGAAAAAGCAGTCCtgttgtaaattattattactatttaaagtaACTatgtactattttaatatatttcattcgtatgcaaagctgaattttctgcatcattactctgGTCCCCGGCGTCACGGCTGTAATATTTCgccaatattattgtttttaccttaaatgttttcatcaaataaatgcagacttacAGAGcacaagagatttttttttttttgtaaaaacagaaaaacatggtaattattttaaactttggccacaactgtctatgcatatatattaaatgaggCCCGTTATATAAAGCCACATTATATAATGCCCATCTTAAAGAgtcagttcacccaaaagtgaaaagtcAGTCAAtgattactcgccctcatgatgatatttatgaaaattaagatatttttgattaaatccaaGACCTCTCCTACCCTCCGTAGACCTCAAGGGAACTTTCACAATAAAGGCtcagaaacatagcaaggacatcaataaaaaaaaaaaaaaaaaaaagtccatcaATGGTTCAACTGCAATTCTACGAAgctatgaaaatatttatgcacAAAGAAAACGATAATTaattctgtaacactttatttcgatattCCACTTCAGACACTCTACTAACAGGAAGTCATTTTGCATCTACATGTCatctagcagtcattagagtattagtagacgcTCTGCTTGATGTCTTCTAACACAGGGGTCATCAAACGtgatcctggagggccggagttctgcagagtttaggtctaacttgcctcaacacaccaGCCTGGAGGTTTTAAGTATACCTAGTAAGACcgtgattagctgcttcaggtgggTTTGATTAGCAtcggagctaaactctgcaggacccCCTAACAGGCTAATCTAAGAGCTAGGTAGAGACGTAGTTACAAAATTAccaacagaatgtgttaaaggcACTGTCAAAGTAAAGTGTAACCATTTATGCTCTCTATTCTGCCATTCTGTAGAGTACCCTTCCGAACGCAATCAACATAATGAGCGTTGTTTACGTTCAGCGCGCTCGCGAAGTCTGCCGAACAGAAACGGTGCTGATTGCGCTCTGGGCTACTCTCCAAAATGGAGGAGGACCGTAACTCGGGGATGAGAATTATGCCgctgttgttttctttgcgcattTTTTTTCCCGCCGTTTCATAgaattgaaccactgatgtcacatggattgtCTACAGAGGGACagagctctcagaattcatCAAGAGCAGCTTAATTAGGTTTCTGAAGACGAACGAAGGTCTTCCGTGTTCAGAGCGAGTAATTAACGACAGAATTGCCGTTTTTGGGGCGAACTGTCCCCTTCGCGTGAACCGGATGCGAAACCATTCACACTAAAGTCGAATCCTTGATGGTGGCTTTTCTAGCAAATACAGATCTCATCTCGCTGTTGACCCCGTTCCAGGGTTTGGCCTGCGCTTGAAACAGGCCGGACTCCGTGGAAAGCGTCCGTCCGCTCCCACCGCCGCCGTAGCCGTCCTTATCGCCCCGAGGGCCGTTAGACGCCGAGTAATGCGATTTAGGGTCGACGTGAACGGGGTTGATGAAATAGCTGTGCATGTTGGCTAAGCTGTGCTGCCGCCGTGGCTTTTCAGCGAGGCTTAGGTTCGACGTACGGATTCCAGCCACGTTTTCAGGCTCGCTGCGGTACGTGGTGTGGGCATGTTCACTGCGCGAGCGTTTGGCTGCGCGTGCGGCCCGTATTAGGGAGTGAATAATGATGAGTAACAGGACGAGGACTCCGGAGGACAGCACGCAGACGCTGGCTATGCCCGTCTCGACTTCAAACACCAGTAACATGTAAATAGACATGGCtgtgaggggggaaaaaattcaatatttatgtCAAATCACTCCATGCCGTGTCATCCGTACGGTGAATATCAACTAACGCATTGTTGTTTTCCACAGGAAAAGAACTTTGGATCCTAGCATGCTAAAGGACGGAGGAGAAAAGCACAGCTCTGGGATATAGACTGAAGAAGATCTGGATAAAAACGTATACCATATTCACCTTATTAATGATGACTGCTACTCTAGACTATGGAAGCCTGTTGTCaggtttaaaataagaaataaaatcatcataACACGAGTCATAATTGGGAGTTGCAACGCCGGGAATATATTGAAGTTGCGAGATTAAAGTTGCAAGTGtcaaaaatcaatgcatttgcGAGATTTAATGTAACATTGTAGCATAGTCgcattataacatttaaacacacaattgTGAAAATTACTGTTGAAGAAAAAAGTTGCAACTCCAAGGGAAAAAGATGCAATTGCGAAGATATTGGCATTGCGAGGTTTAATATTGCATTgtgaaataaattcaaattatgagatataattaaattttatagtGCAAGTAAATGATATAAAGTAGTGGTGCCATTTCTTTCTGAAACAGGCTTCCTTAAAGCAAATCCTTTGGTATGTAAggattaaacatgacatttataAGCTGCTTGGGGTGTTTTggttacagtttttttcacattttgcacATTAGTTCTTCATTTGTTATAACACGGTCAGCGTAATTGTTctgtaaatgtgtatataccGAACTCAATGATTAAA
>TU223952
TTGAGAGCACACTCGTAACTCGGCAGCAGAGCTCGGAGAGTATATAAGAGGAAATTAATACCATacgttaatatttaataaaaatggagGATCAAGAAATGCAGTTGAAAGTAAAAAGAGTGACTGATAAATTCACAGAGAGTATGTATGTCCTGGCCAACGAACCGTCCATAGCGCTTTATAGGTTACAAGAGCACGTGAGAAGATCCCTGCCAGAGCTCGTGCAGCACAAGACAGACATGCAAAGTTGGGAGGAACAAAGTCAAGGAGCAATCTACACCGTTGAATATGCATGCAGTGCGGTTAAAAGCATGTCGAATAGCAGTCTCTATTTCAAGAACATAGACGGTCTGCTCCGGCAAGCCATTTCACTGAAGGAACAGATCGGCGGCTCGCAGGGTCGAAGTGCTGTGAAACCTGCAATTAATCCAAACgatacacccacacacacttcagTCACACCGCCCTGACTCATGGAAATCTTTCTCTCAGGTtagttttacttcatttttctttctttttctttctttctttctttcacgcATGCAGTGTTAGTGTTAATTTGACAGTTTACGTACAAAACtgattaatagtaataataataataataataataaaaacatttcatagtatttaatttttattgtgacagacatttaaaaacacagattcaaaTAGTTATCAGTTATGCCTTtctcttcactttttttattgttgtatcGTTCTGCTGCAAAGTATGGTTCTGTTCCAGAAGTCTTTCTGCTTAAAATATCACTATTACTAAAATATCATTACTACTTCAGTAGTAATTtcgcattattattattttgcgtTTCAACAATTAGAGAGATCTAACACCTGTGAGCTGATATTAagcgtacaaaaaaaaaaagattttgcttTAAACGtcacataaataatttaagCTGCAGTAATTTGATGAAAAAGCAGTCCtgttgtaaattattattactatttaaagtaACTatgtactattttaatatatttcattcgtatgcaaagctgaattttctgcatcattactctgGTCCCCGGCGTCACGGCTGTAATATTTCgccaatattattgtttttaccttaaatgttttcatcaaataaatgcagacttacAGAGcacaagagatttttttttttttgtaaaaacagaaaaacatggtaattattttaaactttggccacaactgtctatgcatatatattaaatgaggCCCGTTATATAAAGCCACATTATATAATGCCCATCTTAAAGAgtcagttcacccaaaagtgaaaagtcAGTCAAtgattactcgccctcatgatgatatttatgaaaattaagatatttttgattaaatccaaGACCTCTCCTACCCTCCGTAGACCTCAAGGGAACTTTCACAATAAAGGCtcagaaacatagcaaggacatcaataaaaaaaaaaaaaaaaaaaagtccatcaATGGTTCAACTGCAATTCTACGAAgctatgaaaatatttatgcacAAAGAAAACGATAATTaattctgtaacactttatttcgatattCCACTTCAGACACTCTACTAACAGGAAGTCATTTTGCATCTACATGTCatctagcagtcattagagtattagtagacgcTCTGCTTGATGTCTTCTAACACAGGGGTCATCAAACGtgatcctggagggccggagttctgcagagtttaggtctaacttgcctcaacacaccaGCCTGGAGGTTTTAAGTATACCTAGTAAGACcgtgattagctgcttcaggtgggTTTGATTAGCAtcggagctaaactctgcaggacccCCTAACAGGCTAATCTAAGAGCTAGGTAGAGACGTAGTTACAAAATTAccaacagaatgtgttaaaggcACTGTCAAAGTAAAGTGTAACCATTTATGCTCTCTATTCTGCCATTCTGTAGAGTACCCTTCCGAACGCAATCAACATAATGAGCGTTGTTTACGTTCAGCGCGCTCGCGAAGTCTGCCGAACAGAAACGGTGCTGATTGCGCTCTGGGCTACTCTCCAAAATGGAGGAGGACCGTAACTCGGGGATGAGAATTATGCCgctgttgttttctttgcgcattTTTTTTCCCGCCGTTTCATAgaattgaaccactgatgtcacatggattgtCTACAGAGGGACagagctctcagaattcatCAAGAGCAGCTTAATTAGGTTTCTGAAGACGAACGAAGGTCTTCCGTGTTCAGAGCGAGTAATTAACGACAGAATTGCCGTTTTTGGGGCGAACTGTCCCCTTCGCGTGAACCGGATGCGAAACCATTCACACTAAAGTCGAATCCTTGATGGTGGCTTTTCTAGCAAATACAGATCTCATCTCGCTGTTGACCCCGTTCCAGGGTTTGGCCTGCGCTTGAAACAGGCCGGACTCCGTGGAAAGCGTCCGTCCGCTCCCACCGCCGCCGTAGCCGTCCTTATCGCCCCGAGGGCCGTTAGACGCCGAGTAATGCGATTTAGGGTCGACGTGAACGGGGTTGATGAAATAGCTGTGCATGTTGGCTAAGCTGTGCTGCCGCCGTGGCTTTTCAGCGAGGCTTAGGTTCGACGTACGGATTCCAGCCACGTTTTCAGGCTCGCTGCGGTACGTGGTGTGGGCATGTTCACTGCGCGAGCGTTTGGCTGCGCGTGCGGCCCGTATTAGGGAGTGAATAATGATGAGTAACAGGACGAGGACTCCGGAGGACAGCACGCAGACGCTGGCTATGCCCGTCTCGACTTCAAACACCAGTAACATGTAAATAGACATGGCtgtgaggggggaaaaaattcaatatttatgtCAAATCACTCCATGCCGTGTCATCCGTACGGTGAATATCAACTAACGCATTGTTGTTTTCCACAGGAAAAGAACTTTGGATCCTAGCATGCTAAAGGACGGAGGAGAAAAGCACAGCTCTGGGATATAGACTGAAGAAGATCTGGATAAAAACGTATACCATATTCACCTTATTAATGATGACTGCTACTCTAGACTATGGAAGCCTGTTGTCaggtttaaaataagaaataaaatcatcataACACGAGTCATAATTGGGAGTTGCAACGCCGGGAATATATTGAAGTTGCGAGATTAAAGTTGCAAGTGtcaaaaatcaatgcatttgcGAGATTTAATGTAACATTGTAGCATAGTCgcattataacatttaaacacacaattgTGAAAATTACTGTTGAAGAAAAAAGTTGCAACTCCAAGGGAAAAAGATGCAATTGCGAAGATATTGGCATTGCGAGGTTTAATATTGCATTgtgaaataaattcaaattatgagatataattaaattttatagtGCAAGTAAATGATATAAAGTAGTGGTGCCATTTCTTTCTGAAACAGGCTTCCTTAAAGCAAATCCTTTGGTATGTAAggattaaacatgacatttataAGCTGCTTGGGGTGTTTTggttacagtttttttcacattttgcacATTAGTTCTTCATTTGTTATAACACGGTCAGCGTAATTGTTctgtaaatgtgtatataccGAACTCAATGATTAAA
>XM_043223155.1
AACTAAATATTGGCCTGATGTTACTCCGGATGATGTTTTGAGAGCACACTCGTAACTCGGCAGCAGAGCTCGGAGAGTATATAAGAGGAAATTAATACCATacgttaatatttaataaaaatggagGATCAAGAAATGCAGTTGAAAGTAAAAAGAGTGACTGATAAATTCACAGAGAGTATGTATGTCCTGGCCAACGAACCGTCCATAGCGCTTTATAGGTTACAAGAGCACGTGAGAAGATCCCTGCCAGAGCTCGTGCAGCACAAGACAGACATGCAAAGTTGGGAGGAACAAAGTCAAGGAGCAATCTACACCGTTGAATATGCATGCAGTGCGGTTAAAAGCATGTCGAATAGCAGTCTCTATTTCAAGAACATAGACGGTCTGCTCCGGCAAGCCATTTCACTGAAGGAACAGATCGGCGGCTCGCAGGGTCGAAGTGCTGTGAAACCTGCAATTAATCCAAACgatacacccacacacacttcagTCACACCGCCCTGACTCATGGAAATCTTTCTCTCAGGAAAAGAACTTTGGATCCTAGCATGCTAAAGGACGGAGGAGAAAAGCACAGCTCTGGGATATAGACTGAAGAAGATCTGGATAAAAACGTATACCATATTCACCTTATTAATGATGACTGCTACTCTAGACTATGGAAGCCTGTTGTCaggtttaaaataagaaataaaatcatcataACACGAGTCATAATTGGGAGTTGCAACGCCGGGAATATATTGAAGTTGCGAGATTAAAGTTGCAAGTGtcaaaaatcaatgcatttgcGAGATTTAATGTAACATTGTAGCATAGTCgcattataacatttaaacacacaattgTGAAAATTACTGTTGAAGAAAAAAGTTGCAACTCCAAGGGAAAAAGATGCAATTGCGAAGATATTGGCATTGCGAGGTTTAATATTGCATTgtgaaataaattcaaattatgagatataattaaattttatagtGCAAGTAAATGATATAAAGTAGTGGTGCCATTTCTTTCTGAAACAGGCTTCCTTAAAGCAAATCCTTTGGTATGTAAggattaaacatgacatttataAGCTGCTTGGGGTGTTTTggttacagtttttttcacattttgcacATTAGTTCTTCATTTGTTATAACACGGTCAGCGTAATTGTTctgtaaatgtgtatataccGAACTCAATGATTAAAGTTTTTAAGTATAATTCA
>XM_043223156.1
AACTAAATATTGGCCTGATGTTACTCCGGATGATGTTTTGAGAGCACACTCGTAACTCGGCAGCAGAGCTCGGAGAGTATATAAGAGGAAATTAATACCATacgttaatatttaataaaaatggagGATCAAGAAATGCAGTTGAAAGTAAAAAGAGTGACTGATAAATTCACAGAGAGTATGTATGTCCTGGCCAACGAACCGTCCATAGCGCTTTATAGGTTACAAGAGCACGTGAGAAGATCCCTGCCAGAGCTCGTGCAGCACAAGACAGACATGCAAAGTTGGGAGGAACAAAGTCAAGGAGCAATCTACACCGTTGAATATGCATGCAGTGCGGTTAAAAGCATGTCGAATAGCAGTCTCTATTTCAAGAACATAGACGGTCTGCTCCGGCAAGCCATTTCACTGAAGGAACAGATCGGCGGCTCGCAGGGTCGAAGGAAAAGAACTTTGGATCCTAGCATGCTAAAGGACGGAGGAGAAAAGCACAGCTCTGGGATATAGACTGAAGAAGATCTGGATAAAAACGTATACCATATTCACCTTATTAATGATGACTGCTACTCTAGACTATGGAAGCCTGTTGTCaggtttaaaataagaaataaaatcatcataACACGAGTCATAATTGGGAGTTGCAACGCCGGGAATATATTGAAGTTGCGAGATTAAAGTTGCAAGTGtcaaaaatcaatgcatttgcGAGATTTAATGTAACATTGTAGCATAGTCgcattataacatttaaacacacaattgTGAAAATTACTGTTGAAGAAAAAAGTTGCAACTCCAAGGGAAAAAGATGCAATTGCGAAGATATTGGCATTGCGAGGTTTAATATTGCATTgtgaaataaattcaaattatgagatataattaaattttatagtGCAAGTAAATGATATAAAGTAGTGGTGCCATTTCTTTCTGAAACAGGCTTCCTTAAAGCAAATCCTTTGGTATGTAAggattaaacatgacatttataAGCTGCTTGGGGTGTTTTggttacagtttttttcacattttgcacATTAGTTCTTCATTTGTTATAACACGGTCAGCGTAATTGTTctgtaaatgtgtatataccGAACTCAATGATTAAAGTTTTTAAGTATAATTCA

Function

symbol description
borcs8 Predicted to be located in lysosomal membrane. Predicted to be part of BORC complex. Is expressed in brain and pharyngeal arch. Orthologous to human BORCS8 (BLOC-1 related complex subunit 8).

NR:

description
PREDICTED: protein MEF2BNB isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU223951 True 3760 lncRNA 0.40 4 9888200 9893489
TU223952 False 3567 TUCP 0.40 5 9888200 9893489
XM_043223155.1 False 1222 mRNA 0.38 6 9888163 9893507
XM_043223156.1 False 1136 mRNA 0.37 5 9888163 9893507

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122327676 nr2c2ap,LOC107687739,LOC107728548,LOC107554809,LOC107719618,LOC107599487 coding upstream 1946 9884512 ~ 9886217 (+)
hapln4 hapln4,LOC107728536,LOC107599484,LOC107719665,LOC107687742,LOC107554801 coding upstream 269048 9613879 ~ 9619115 (+)
tm6sf2b tm6sf2,LOC107599483,LOC107719666 coding upstream 275662 9602450 ~ 9612501 (+)
polr2eb polr2e,polr2eb,LOC107669821,LOC107599482 coding upstream 381872 9503550 ~ 9506291 (+)
hnrnpm hnrnpm,LOC107599446,LOC107728570,LOC107592680 coding upstream 415661 9465508 ~ 9472502 (+)
yjefn3 yjefn3,LOC107687717,LOC107655232,LOC107719609,LOC108429551,LOC107554805,LOC103041169,LOC108271278 coding downstream 102972 9996479 ~ 10028474 (+)
cilp2 cilp2,LOC107728576,LOC107687716,LOC107655229,LOC107719612,LOC107599460 coding downstream 137363 10030870 ~ 10044212 (+)
si:ch211-212d10.1 NA coding downstream 177309 10070816 ~ 10072852 (+)
cbarpb LOC107655224,LOC107554820,LOC107719602,LOC107728578,LOC107687734 coding downstream 295707 10189214 ~ 10208785 (+)
fstl3 fstl3,LOC107687713,LOC107728592,LOC107569933,LOC107655223,LOC107554822,LOC107719601 coding downstream 330083 10223590 ~ 10231309 (+)
G151308 NA non-coding upstream 125744 9762154 ~ 9762419 (+)
G151294 NA non-coding upstream 221030 9600556 ~ 9667133 (+)
G151210 LOC107669820,LOC107592722,LOC107655244,LOC107599472 non-coding upstream 372595 9514740 ~ 9515568 (+)
G151194 NA non-coding upstream 413132 9472986 ~ 9475031 (+)
G151178 NA non-coding upstream 522841 9360428 ~ 9365322 (+)
G151333 NA non-coding downstream 1539 9895046 ~ 9895327 (+)
G151334 NA non-coding downstream 3074 9896581 ~ 9896839 (+)
G151337 cirbpb,cirbp,LOC108271114 non-coding downstream 160411 10053918 ~ 10080145 (+)
G151358 NA non-coding downstream 188275 10081782 ~ 10082620 (+)
LOC122327864 NA non-coding downstream 243793 10137300 ~ 10140154 (+)
G151232 NA other upstream 308012 9577679 ~ 9580151 (+)
march2 march2,LOC107728591,LOC107669840,LOC107655247,LOC107592682,LOC107599445 other upstream 357998 9454838 ~ 9530165 (+)
G150965 NA other upstream 899472 8988186 ~ 8988691 (+)
G150946 NA other upstream 966196 8921698 ~ 8921967 (+)
G150945 NA other upstream 968383 8919279 ~ 8919780 (+)
mef2b LOC107687723,LOC107554810,LOC107728551,LOC107719669,LOC107655235,LOC107599488 other downstream 1934 9895441 ~ 9910793 (+)
LOC122328159 NA other downstream 30040 9923547 ~ 9963634 (+)
gatad2ab gatad2ab,gatad2a,LOC107599456,LOC107728574,LOC107554816 other downstream 77115 9970622 ~ 9993441 (+)
G151620 NA other downstream 912545 10806052 ~ 10837365 (+)
onecut3a onecut3,onecut3a,LOC107596910,LOC107676954,LOC107586457,LOC107719659,LOC107655183,LOC105938949 other downstream 980921 10874428 ~ 10892023 (+)

Expression


Co-expression Network