dennd1b (dennd1b,LOC107712206,LOC107586420,LOC107664901,LOC107741568,LOC107556170)


Basic Information

Item Value
gene id dennd1b
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gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056720.1
NCBI id CM032089.1
chromosome length 18002998
location 15623093 ~ 15712086 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
dennd1b Predicted to enable phosphatidylinositol phosphate binding activity. Predicted to be involved in endocytic recycling and endocytosis. Predicted to be active in cytosol and nuclear speck. Is expressed in forebrain and hypothalamus. Orthologous to human DENND1B (DENN domain containing 1B).

NR:

description
PREDICTED: DENN domain-containing protein 1B-like isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K20160 DENND1; DENN domain-containing protein 1

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122327180 LOC107593352,LOC107717987,LOC107679830,LOC107593351,LOC107717988,LOC107679833 coding upstream 334201 15220447 ~ 15288892 (+)
ddx59 ddx59,LOC107717990,LOC107578347 coding upstream 428221 15189827 ~ 15194872 (+)
scamp4 scamp4,LOC107717975,LOC107699425,LOC107719549,LOC107679840,LOC107586414 coding upstream 487497 15130400 ~ 15135596 (+)
ubxn6 LOC107717977,LOC107679838,LOC107593331,LOC107719551,LOC107699423,LOC107586413 coding upstream 503264 15114186 ~ 15119829 (+)
LOC122327882 LOC107679839,LOC107717989,LOC107719633,LOC107699428,LOC107586446 coding upstream 620123 15001033 ~ 15002970 (+)
aspm LOC107712224,LOC107699437,LOC107586448,LOC107556171,LOC107577714 coding downstream 23815 15735901 ~ 15752487 (+)
LOC122327224 NA coding downstream 167168 15879254 ~ 15886245 (+)
LOC122327226 LOC107556173 coding downstream 189046 15901132 ~ 15938182 (+)
LOC122327890 NA coding downstream 231647 15943733 ~ 15956310 (+)
LOC122327228 LOC107565915,LOC107709523,LOC107680281,LOC107565908,LOC107706842,LOC107680280 coding downstream 386645 16098731 ~ 16099807 (+)
G153182 NA non-coding upstream 106941 15468050 ~ 15516152 (+)
G153178 NA non-coding upstream 110454 15451449 ~ 15512639 (+)
G153181 NA non-coding upstream 132825 15454912 ~ 15490268 (+)
G153180 NA non-coding upstream 168364 15453964 ~ 15454729 (+)
LOC122327701 NA non-coding upstream 312026 15290695 ~ 15311067 (+)
G153227 LOC107741548,LOC107664650,LOC107712228,LOC107586421,LOC107699436 non-coding downstream 17691 15729777 ~ 15734653 (+)
G153237 NA non-coding downstream 48419 15760505 ~ 15762668 (+)
G153239 NA non-coding downstream 54635 15766721 ~ 15767556 (+)
LOC122327891 NA non-coding downstream 61619 15773705 ~ 15893138 (+)
G153244 NA non-coding downstream 83353 15795439 ~ 15802159 (+)
kif14 kif14,LOC107679839,LOC107699428,LOC107719633,LOC107586446,LOC107717989 other upstream 403329 15195916 ~ 15219764 (+)
sirt7 sirt7,LOC107667823,LOC107705833,LOC107569249,LOC107706268 other upstream 834400 14782382 ~ 14788693 (+)
G152808 LOC107588428,LOC107689379,LOC107573874,LOC107753503 other upstream 931285 14686504 ~ 14691808 (+)
G152767 cp,LOC107572087,LOC107732248 other upstream 1160433 14458149 ~ 14462660 (+)
ptk7a ptk7a,LOC107702250,LOC107732247,LOC107588446,LOC107550662,LOC107697061 other upstream 1309957 14283892 ~ 14313136 (+)
G153322 LOC107565915,LOC107680281,LOC107709523,LOC107565908,LOC107680280,LOC107706842,LOC107576284 other downstream 292478 16004564 ~ 16035615 (+)
LOC122327825 LOC107565915,LOC107680281,LOC107709523,LOC107680280,LOC107565908,LOC107706842 other downstream 365495 16077581 ~ 16078895 (+)
LOC122327131 NA other downstream 451297 16163383 ~ 16171629 (+)
rpl32 rpl32,LOC107691188,LOC107719943,LOC107720357 other downstream 605301 16317387 ~ 16386176 (+)
G153432 slc6a6b,LOC107567309,LOC107676359,LOC107719944,LOC107562730 other downstream 781616 16493702 ~ 16499413 (+)

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