si:rp71-36a1.1



Basic Information


Item Value
gene id si:rp71-36a1.1
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056720.1
NCBI id CM032089.1
chromosome length 18002998
location 3325575 ~ 3366122 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043222634.1
ACAGGAGAACCTACAGGAGGACCAGCAGGAGGAACTGAACTAGGATGTGAAGGAGGAGTTGGAGGAGCTGGTTTTGAAACAGTCATTAATGTGTGAGAGGCACTGAAAGGAAGTCACTgtcagtgatggagggagattcagtcactctatACACTGATGTTCCTGAGATACAGACATATGATGTGATACGGTGGAGGTTTGGAAATGAGGAACCCTCTATAGCCGAAATCAACAGAACAGCTGAAATCTTCAGCACATCTGATGGTCCTGACGGTGTATTCAGAGACAGACTACAGCTGGATCATCAGACTGGATCCTTAACCATCAGGAACATCACAACCAAACACTCTGGATCCTATATGGTTGAGATCTACAGCAGTGGCATGAACGTAATATATAAGTTATTCACAGTGACTGTCAGTAAGTTTTATTATCTATAGCACAACACTCAAACTGTCTTTTGAATCATCTGAGATCTGAGACTGAAGCATATATTTTTCCTCAAGTAAAAATAGTTATACGTTAAATTTCTTGATGCAGCAGCAGACTATGTTAAAGGGTCTGTTAAAaagtttataattataattcccCACCAAcaggtttacatgcatttttttttacaatatgcaTTTGGTTTTACCTGAAGAATCTTTTCaaactgtttatttgcatgtgtcTACTCTGCTCTGATCAGTAATATAGTGTACTTATAAAGTTTGTAACCATTGTATAGCTCGATCTTTTATCATGACTCCAAGTAGACTGGAGAAAGAGTTTGTGATTACACTCCTACTGTTAAAGTGTAAActtaacagaaatgaaaatgacttgTTTAAGCAGTTCAGAGTCAACccttttttttgagagacaataactttattcatGATGCACTTTCAGCTTTACTTATATCTTTGCCAAATATTGTTCTATTCTAACAAATCATATACcaatagaaagcttatttatttaagtatcatatagacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatacacatatacatgtaatatttactAAAGTTGGTAAGTGAAACATCCTaatgttttcttgtttcttctgtaattttgtaaaattctgtaattttgttgtttgagACCAAACTGAaggataaataatatttcagttttataagTTTTATCTCTGACTGACTGTTTCTGTTTGATCATCAGGTGTGTTTGTTGGGTCATTgtcagtgatggagggagattctGTCACTCTACACACTTATGAAATCCTACAGGCATATGAAGCGATTGAGTGGAGTTTTAATGACACTCTTTTAGCTAGCGTGATTAACAACAACGCTAGATATGTCGATAATGTAAAATTCAAGGACAGACTGCAGCTGGACATTCAGACCGGAGATCTTAAGATCACAAACATCAGAACCACAGACACCGGACTTTATAGTATAAGACAATTCATAGACGCATACTCATCCAGATTAGCTTTGTTTGACGATTTTCTTATGTCTCCGTATTATGCATCACAGAAGacattcagtgtcacatgtgTGAACCAAACTGGAGTAATGTCACTgtcagtgatggagggagattcagtcactctatACACTGATGTTCCTGAGATACAGACATATGATGTGATACGGTGGAGGTTTGGAAAGCAGAAATGTCCTATAGCTGAAATAAGTAGAATGGCTGGAATCTTCTACACATATTTAAGTTATGGTGGAATGATCAAATACAGACTATTGCTGGATGGtgagactggatctctgacaaTCTCGAACACTGAAACAAGCCTTTCTGGAATTTATGAGGTTGATTTCACCAACAGCGGCGGCAAACACACCATGCACAAGTCAATCAATTTAACTGTCGATGTGTCTGGTGAGTCAGTAtcagtgatggagggagattctGTTACTTTACAGACTGATGTCACTAAATTACTGGAATATGAAGAGATTGAGTGGAGTTTTAACAACACTCGCATAGCTAGTGTGTTTAAGAACAAGGTTATATATGAGGATGATGTAAAATTTAAGGACAGACTGCAGCTGGACATTCAGACCGGAGATCTTAAGATCACAAACATCAGAACCACAGACACTGGACTTTATAAGTATGATATCTACAGAGTCAAGAAAATGCATTCACGTGATACATCACGGAAGACATTCAGAGTCTTATGTGTGAGAGGCACTGGAAGGAAGTCACTgtcagtgatggagggagattcagtcactctatACACTGATGTTCCTGAGATACAGAGATATGATGCGATACGGTGGAGGTTTGGAAAGCAGAAATCTCTTATAGCTGAAATCAACAAAACAGCTGGAATCTTTAACATATCTGATGGTCCAGACGGGAGATTCAGAGGCAGACTACAGCTGGAtcatcagactggatctctgaccatcaagAACATTGAAACCAGACACTCTGGACTTTATGAGGTTGAGATGAGAAGCTTCGGCAAATACGCCACATACAAGTCATTCAATGTGACTGTCAGCGGTAAAATGCAAACAGTATTAGTTATTGAGGGAGATTCTGCCATTCTACAGATTGAGCATGACAAAATGCATGCTGAAGAACTGATAGAGTGGATATTTGAAAACACTGCCATAGCTAAAATCCTTGAAGGATCTAGACCTGTTTATTTTGGTGGGATATTCGAGGGAAGACTGATGCTGAATGATtggactggatctctgaccattaAAAATGCCAGAACCACAGACTCTGGGCTTTATAAACTGAAGATCAGTCACAAAGGAAATCTAATAATTAATGTGGATGTCAATGTTACTGTAACAGCTTGGCCGATCACATGTGATTCAGGTCTGTCTTCAGGTGGTATAGCAggaatatgtgtttgtgttattgttttgctGATCGTTGCGGTTGTTGTGATTTACTGCCGCATAACCCGATAACTAAAACAGCTAACAGTGATCCAAACCACAAAAGAAGCAGAGCTCAGAGAAATTCCCTCTTCTACTTATTATTTAATCACTGTTAAGCAAAGTGTATTCTGTGACTCTATTGTGtaaatatggagaaaaatgtaatttcgtTGTGAGATTAATCAGTAAAACTGTGTAGGGAGATGGGCACCAATTTCTTTGGATTTTACAGTATACAGTAATTTGGTcttcatttgttaaaaaaaaatgttatttaaaacctTTAGGAAGTTCTAGTTTTATTACGATGATTATTATATGATTGTTTATTACTTGTGATGAGATATCCCTACAATCTTAAGAGACTGTGTTAATTATATCGCTCTCCAGCTGTAACATTGATAGATGTTTGAAATACATAATTGTTTTACCCATTTTGCCATGGCCTATGAAAGGGTA
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>XR_006247635.1
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XR_006247635.1 False 1568 transcript 0.38 2 3347420 3349172

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC122327410 LOC107712173 coding downstream 10498 3309263 ~ 3315077 (-)
LOC122327550 NA coding downstream 20371 3290510 ~ 3305204 (-)
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LOC122328131 NA coding upstream 376125 3742247 ~ 3744520 (-)
LOC122328132 LOC107570673,LOC107575767 coding upstream 378424 3744546 ~ 3747804 (-)
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G149123 NA non-coding upstream 170019 3536141 ~ 3556828 (-)
cers5 cers5,LOC107698577,LOC107590873,LOC107694004,LOC107718462,LOC107712190 other downstream 52524 3255396 ~ 3273051 (-)
dnase1l4.1 zgc:101000,LOC107566350,LOC107712182,LOC107702655 other downstream 93362 3224148 ~ 3232213 (-)
LOC122327369 LOC107566359,LOC107727552,LOC107702633,LOC107698598,LOC107549380,LOC107733351,LOC107733325,LOC107566366,LOC107727554 other downstream 260398 3051400 ~ 3065177 (-)
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LOC122328032 NA other downstream 1209392 2114320 ~ 2116183 (-)
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G149410 NA other upstream 325378 3691500 ~ 3878716 (-)

Expression



Co-expression Network