LOC122327402



Basic Information


Item Value
gene id LOC122327402
gene name NA
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056720.1
NCBI id CM032089.1
chromosome length 18002998
location 3736141 ~ 3741922 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043222744.1
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Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko00600 Sphingolipid metabolism

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_043222745.1 False 3953 mRNA 0.39 6 3736141 3741022
XM_043222746.1 True 4087 mRNA 0.38 6 3736141 3741922

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC122327357 NA coding downstream 151 3730511 ~ 3735990 (-)
LOC122327542 NA coding downstream 176327 3556132 ~ 3559814 (-)
LOC122327410 LOC107712173 coding downstream 421064 3309263 ~ 3315077 (-)
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LOC122327353 NA coding downstream 449625 3280609 ~ 3286516 (-)
LOC122328131 NA coding upstream 325 3742247 ~ 3744520 (-)
LOC122328132 LOC107570673,LOC107575767 coding upstream 2624 3744546 ~ 3747804 (-)
LOC122327546 NA coding upstream 142591 3884513 ~ 3887580 (-)
LOC122328145 NA coding upstream 155061 3896983 ~ 3898464 (-)
LOC122327439 NA coding upstream 162009 3903931 ~ 3905997 (-)
G149413 LOC107753735,LOC107704490,LOC107663689,LOC107755986,LOC107702613,LOC107704403,LOC107704499,LOC107566340,LOC107702610 non-coding downstream 14954 3720171 ~ 3721187 (-)
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G149447 NA non-coding upstream 186764 3928686 ~ 3929766 (-)
G149460 NA non-coding upstream 232241 3974163 ~ 4021597 (-)
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LOC122328127 NA other downstream 84132 3644927 ~ 3652009 (-)
LOC122327341 NA other downstream 284712 3378032 ~ 3451429 (-)
LOC122327463 NA other downstream 292267 3424346 ~ 3443874 (-)
G149102 NA other downstream 321430 3388260 ~ 3414711 (-)
si:rp71-36a1.1 NA other downstream 370019 3325575 ~ 3366122 (-)
LOC122327411 NA other upstream 234009 3975931 ~ 4042369 (-)
G149491 NA other upstream 414570 4156492 ~ 4158981 (-)
LOC122327462 LOC107741386,LOC107698560 other upstream 530629 4272551 ~ 4281768 (-)
LOC122327456 NA other upstream 686883 4428805 ~ 4433500 (-)
LOC122327455 NA other upstream 740899 4482821 ~ 4486925 (-)

Expression



Co-expression Network