vgll4a (LOC107675174,LOC107736947,LOC107713758,LOC107684880,LOC107555803,LOC107574679)



Basic Information


Item Value
gene id vgll4a
gene name LOC107675174,LOC107736947,LOC107713758,LOC107684880,LOC107555803,LOC107574679
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056721.1
NCBI id CM032090.1
chromosome length 19062720
location 865477 ~ 882184 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>TU227919
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>TU227921
GTTGAGTTGAATGTGCTTAACTTTCAGACAATGTTTGttcagagttttatttttattgctcatTGTTATGTAATCGCATGTCTGCAATAAATATTAgtaacaagaacaaaaaataaacaaaaaactatagCTTTCATCCATTGTGGCAAATACATTTCACCATATTTTATAACACTTTCACAATACTATAAGTGCATACAGTATGATATCTATTATTTTAACAGTGATGTCACGAAAGAAAATACACACCTTACCTTTAAcacacaatgacacacacacatttgatcatgcaattaaatgttcatttatatgtTATAGTCTCCATTCATGTATGTATAACACCAttcgcacatgcacacacacacacacacacaaacatactggttttaatgttttatgggTTTATTCCATAgacgtaatggtttttatattgtacaaactgttttttttacccTAATATACCCTTTAACCTACCCCTCACGCACAACTTTCTGCACTTTTACTTTTTCCCAAAAATTGCATGATTTATAAGCGGTTTCCCTCATGAGGACTAAAAAAATATCCCCACAAGGACAAAatttactgatatttttatACTAGCTGgaacatttggtccccataatgCAGCGAACACCATTTACTAAAACGTAACACAagagacaattaaaaaaataagtacaaggAAAAAGTGGCACTGAACACTAGGCACAATCTGCTGTATCACCACACAACAACCCTGAAGAGACAACCGCTTCACATAGAAACAAAGCAACCATCACAAGCGCAGAACAGTGAAAGTTACACAGTACAGACTGAAATACAGATCAGGCCCAAACTAAGACTTTTCTTATAGATTATTTGTTGCCTTGCACCTCAGGTCACCGTCTGAATGTTTGAACACAACCTGTCAGGAGCTTAAATGCTTCAAGCCTTCACGTTTAGTTCGCCTGCACTAATTTTGGTCCCACTGCAACGCCATTACAGTCAAGGATGTACTGCAAGCAGCCTTGTGGAGGAGCTTTCTGTGGAGGGCCATTCTTTACTTCAACCACCATGTCTTTCTCAACAGCATTCTTTTTTTGGCTGAATAGCAGTTGGCCTTTTGGGATTTTGTGCCTTAACGTTATTCATTTTGGCAATGACCATGTCTGCTATCAGCTGCTGATCTTCGGCCTGATGTTCCCCCACCAGTGGCATGGACGAACCCATGACCTGATGAAATCACCATCGTTGTTAGCAAAACACGTTGCTTGAATTTGTAGAAAACCTACAACACATTTCTACAAAACATCTCAGCTGTACAACACACTCTTAAAACCCTGCGGccttatatatattataaatataatCAACTGCTGGAACAGtgtgttctatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataaaatttctaACCTGTTTCGTGAGATGTGTATGCAGCTGGTTAGGCCTCTGGAAAGGCACTGACACATGCAGTATCTGGCTTAATTGAGTTTTAACTTAACGTTTAACTTTGTACTCTTTTCATAATCCGCTACAACACATTTTTCTGTAATGATCAATACAACTAAATCAGTAAGTGTTAACACCGCTGTGGGAGTTACCGTAAATCTGTCTCTTTCGTGATTTCCATAATCCTTCTTTGTAATCCacttttatggaaagtaatcaGAGCGCCAATAGTGgtctttttgtgtttgctgttgGACACagcaacattaaataatttggtATTGTTTGCCATGTAGGTTTACCCTAGTATAGTTTACTACTATGctgtggaaatgtaaaaaaagggtTCATACGTGAACACTTTCTGATTTGCATATTCTAATAccaattaatatatttactttaattgcACATTGACCTGAACATGAGTATCCACTCTTTCTATGTTCCAGCTTTATTGCTTTCAGTGAATTAattgtttgtctgtttattattattattaatcgaCTAGTAACCagaattaaatgtaatctttgtGTGTGGTGTCATAATGCAGGATGCacactaaattatttaatttctttatctttcttttttttttttttccttatttgttcaacttccagaatataaaatatgacaatCATTATGCTGTGCGTGATGAATATAGTTACTCATATGAAACTATCTGTCATTAACTATTGTGCATGCTCTTCTTTTCTTCGTAATGTACCTGCTGAATATTAATTTAGATGTAATATGTTGAGCCGTCTAACTATGCTAAACTGAAAACTGTTTAGTTGTTAATTGAACAAAGTCTCACGAATGTCCCGTTTGACATGGGtaaagcatttcaaaataatgaaatgaaagggCAATATAACAAATTTTGACATGACAGTGGCTGTGCCGTTA
>TU227922
GTGTATGCAGCTGGTTAGGCCTCTGGAAAGGCACTGACACATGCAGTATCTGGCTTAATTGAGTTTTAACTTAACGTTTAACTTTGTACTCTTTTCATAATCCGCTACAACACATTTTTCTGTAATGATCAATACAACTAAATCAGTAAGTGTTAACACCGCTGTGGGAGTTACCGTAAATCTGTCTCTTTCGTGATTTCCATAATCCTTCTTTGTAATCCacttttatggaaagtaatcaGAGCGCCAATAGTGgtctttttgtgtttgctgttgGACACagcaacattaaataatttggtATTGTTTGCCATGTAGGTTTACCCTAGTATAGTTTACTACTATGctgtggaaatgtaaaaaaagggtTCATACGTGAACACTTTCTGATTTGCATATTCTAATAccaattaatatatttactttaattgcACATTGACCTGAACATGAGTATCCACTCTTTCTATGTTCCAGCTTTATTGCTTTCAGTGAATTAattgtttgtctgtttattattattattaatcgaCTAGTAACCagaattaaatgtaatctttgtGTGTGGTGTCATAATGCAGGATGCacactaaattatttaatttctttatctttcttttttttttttttccttatttgttcaacttccagaatataaaatatgacaatCATTATGCTGTGCGTGATGAATATAGTTACTCATATGAAACTATCTGTCATTAACTATTGTGCATGCTCTTCTTTTCTTCGTAATGTACCTGCTGAATATTAATTTAGATGTAATATGTTGAGCCGTCTAACTATGCTAAACTGAAAACTGTTTAGTTGTTAATTGAACAAAGTCTCACGAATGTCCCGTTTGACATGGGtaaagcatttcaaaataatgaaatgaaagggCAATATAACAAATTTTGACATGACAGTGGCTGTGCCGTTAAGTGGTgtactaaaaagaaaaactattgaTGTAATTTGAtatgtaactttattttttcttgaattactatttatatatatatatatatatatatatattttgttttacatcaaATAAAGTCACCTCAAAATATATGATTTCTGGTGCTTTATTCTGCACTCACATTAGATTTAGCCTCAATAACAGAATCCCTCTTAAAGGATGTAATTTTGTATTGTTAAATTTAGTCAAGTTTATATTTACGATATTATTACCAGTAACCTATGAATGAAACTTGTTAGTATTTTTTGCAGGTcgaacatttattaatgtta
>XM_043225308.1
ATTTCACATGTAAATACACGAACCACGCtttgttaaaaatgcaatgtaataagtaaatattGCTTGTTTGGAAACTCAAACGCTCGACTTTTCAGTTGAATTTTTTTCATGCGGAAACACACGGACTCCTGCCGAGCAGCGTTAGCattgtactatttttattattattttttttttacaatcgtAAAAGCTACTCGTCACCTGCTTACCTACTTTATTTaccattaatataaaaaagaggTCGTGCTTGACGAGTTTGATTCAGTATTTTGGATTTAAGTCACTAAACTAAACTTTAGACGGACATACTAGCATCTTGCAGCCCGAGCTAATAGCTAAAATAGCCCAGTAGGCTAAAAACAACGCACAcgttttagatttttattttaaaattttgctCAGTTGTTGtaatgttgcttttgttttcccATCTGAAAGACCATATTCTTTACCGTTACTAACAGCCGAGCTGTTCGATTAGATTTATGccttaaataactttaaatgtttatgttaacaTGGATATCTTGGTTAATAATTTCATCAATAAAATGAACGAAAACATCAGCAGGCTGCATTGTAATACATATGAGGATGATTCAAGAGCATCTAGTCTTCCTGTGCATAACTCAGGATGTACACCCATGAGCCCAACCAAGAGAAAACACCACGAAAACTCTCTGAATCATCAAAAAGCCTCTGATGCAGAACAGATGAACAAAATGAGATGCTTATTAGGATCACACCTGAGAAATTCTATTGGAGACACTGGAAATCAGGAGCTATGGAATTATAGTCACACATCTCTGAGTGGTCTTCATAACCATCACGTATTTGCACCTTTCCCTATTTTTGCGGTGGATGAACCCCTTGAGATGGCCAAACACAGCTTGGATTCTACTAGGAGCATGCTTCTAGCTCCTGAATGCAACACAAGTCTCCAGCAGAATCGTCCATCTGTAATCACCTGTGCTCCGGCCAGCAACCGTCCTTGCAGTCTTTCCAGCTGCCACAAGTCCCCTAACAGCTGCACAACTGGATCCACTAACAAGACCGCAGCAAACACTGTGTGTGATGACCCTGTGATTGAGGAGCATTTCCGCCGCAGTCTTGGGAAGATCTACAAAGAGCCAGCGCCTGTCTCTAACTCAGTGAGCATCACGGGCTCAGTTGATGACCATTTCACTAAAGCGCTGGGGGATGCCTGGTTACAGATCAAAGCCAAAGGCAATGGTGGTGCAACGCCAAATCATGAGAGTCAATGATAAACTAAACCACAGACATTAAAACTGTGAGGTTAGTTCACTAGAGAAGTGTGCTTAAGACCAGATCCATTTAGCATTGGAAAAAGCATATCATTTATACAATTTCTATCAAATCTTTGTGAGTTAAGTTTGAGTTTGTTGACCAGGGGTGGGTGGTATTGTtgagatttttgttttccttcagtATAAAGATGTATGTCACAACATTATTGTAAGTAAATAGAcagaacaaagtaaaaaaaaaaaagtaaaataaaatgagcgcTGCTTAAAGTTTCTGTGGCAGGTAGcgttaaaaaaagtaaaagttacgCTAAAGTTCATTAACACTAAAGACTACATTTTGACATGTTAGATATGCGTACAATGCTTTTTTGCGTCTTCGGGTGCACGCTAAATTGAGTACAAAATTCTTTTCACAGCCTATATAGGtagaaataacacttttttttaatttcatgaaCATGCTATTTCTATTATTCACATGTATACACAGAACCTGAGCTTTTCCCAGTTGGTGTCATTTTAATAGTTGGTCTCTTTTTTCgattttctttgttcttcactcagattatctttatttttgtcattgatATGATCAAGATAAGCAACTGCTGGAACAGtgtgttctatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataaaatttctaACCTGTTTCGTGAGATGTGTATGCAGCTGGTTAGGCCTCTGGAAAGGCACTGACACATGCAGTATCTGGCTTAATTGAGTTTTAACTTAACGTTTAACTTTGTACTCTTTTCATAATCCGCTACAACACATTTTTCTGTAATGATCAATACAACTAAATCAGTAAGTGTTAACACCGCTGTGGGAGTTACCGTAAATCTGTCTCTTTCGTGATTTCCATAATCCTTCTTTGTAATCCacttttatggaaagtaatcaGAGCGCCAATAGTGgtctttttgtgtttgctgttgGACACagcaacattaaataatttggtATTGTTTGCCATGTAGGTTTACCCTAGTATAGTTTACTACTATGctgtggaaatgtaaaaaaagggtTCATACGTGAACACTTTCTGATTTGCATATTCTAATAccaattaatatatttactttaattgcACATTGACCTGAACATGAGTATCCACTCTTTCTATGTTCCAGCTTTATTGCTTTCAGTGAATTAattgtttgtctgtttattattattattaatcgaCTAGTAACCagaattaaatgtaatctttgtGTGTGGTGTCATAATGCAGGATGCacactaaattatttaatttctttatctttcttttttttttttttccttatttgttcaacttccagaatataaaatatgacaatCATTATGCTGTGCGTGATGAATATAGTTACTCATATGAAACTATCTGTCATTAACTATTGTGCATGCTCTTCTTTTCTTCGTAATGTACCTGCTGAATATTAATTTAGATGTAATATGTTGAGCCGTCTAACTATGCTAAACTGAAAACTGTTTAGTTGTTAATTGAACAAAGTCTCACGAATGTCCCGTTTGACATGGGtaaagcatttcaaaataatgaaatgaaagggCAATATAACAAATTTTGACATGACAGTGGCTGTGCCGTTAAGTGGTgtactaaaaagaaaaactattgaTGTAATTTGAtatgtaactttattttttcttgaattactatttatatatatatatatatatatatat

Function


NR:

description
PREDICTED: transcription cofactor vestigial-like protein 4

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU227919 True 3212 lncRNA 0.37 2 878522 882184
TU227921 False 2385 lncRNA 0.35 4 865811 882184
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XM_043225308.1 False 3005 mRNA 0.35 5 865715 871569

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122328452 wnt7a,LOC107684886,LOC107736972,LOC107713763,LOC107555800,LOC568110,LOC108276349,LOC107564804 coding upstream 127719 1009903 ~ 1018911 (-)
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smim29 si:dkey-226k3.4,LOC107690111,LOC107567962,LOC107724208,LOC107738791,LOC107678078,LOC107571229 other upstream 625514 1507698 ~ 1512329 (-)
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Expression



Co-expression Network