LOC122328911 (LOC107570149,LOC107668556)


Basic Information

Item Value
gene id LOC122328911
gene name LOC107570149,LOC107668556
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056721.1
NCBI id CM032090.1
chromosome length 19062720
location 15316727 ~ 15324022 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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>XM_043224995.1
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Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC107570149 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043224993.1 True 3579 mRNA 0.36 8 15316727 15324022
XM_043224995.1 False 3576 mRNA 0.36 8 15316727 15324022

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122328916 iqch coding downstream 242845 15049366 ~ 15073882 (-)
LOC122328901 LOC107549209,LOC107689901,LOC107738870,LOC107681562 coding downstream 383721 14905836 ~ 14933006 (-)
LOC122328919 kcnn3,LOC107723559,LOC107657645,LOC107699550,LOC107714686,LOC107595057,LOC108280396 coding downstream 507950 14772091 ~ 14808777 (-)
LOC122328900 rsbn1,LOC107668555,LOC107570136,LOC107737499,LOC107716162,LOC107564641,LOC107695834,LOC100330644 coding upstream 15037 15339059 ~ 15347198 (-)
tmem269 LOC107570193,LOC107726151,LOC107695831,LOC107668567,LOC107568457 coding upstream 155018 15479040 ~ 15490268 (-)
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LOC122328921 NA non-coding downstream 127089 15188148 ~ 15189638 (-)
G157999 itga8,LOC107689880,LOC107717802,LOC107681583 non-coding downstream 471049 14836361 ~ 14845678 (-)
LOC122328920 NA non-coding downstream 485878 14830264 ~ 14830849 (-)
G158024 si:ch73-206d17.1,LOC107571682,LOC107726152,LOC107695830 non-coding upstream 152465 15476487 ~ 15477769 (-)
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G158208 NA non-coding upstream 488259 15812281 ~ 15812927 (-)
LOC122328902 LOC107737500,LOC107673074,LOC107695835,LOC107564653,LOC108275744 other downstream 15045 14684890 ~ 15301682 (-)
LOC122328913 zgc:162898,c4h15orf61,LOC107738714,LOC107686305,LOC107583911,LOC107718314,LOC107596966,LOC107672207 other downstream 268383 15047152 ~ 15048344 (-)
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G157909 LOC107673054,LOC107737519,LOC107716153,LOC107591065 other downstream 985943 14326966 ~ 14330784 (-)
zbtb48 LOC107673103,LOC107716144,LOC107591072,LOC107687447,LOC107737528 other downstream 1083676 14222809 ~ 14233051 (-)
magi3a magi3,magi3a,LOC107695739,LOC107564661 other upstream 23395 15347417 ~ 15474390 (-)
LOC122329227 NA other upstream 297920 15621942 ~ 15717250 (-)
G158231 NA other upstream 684084 16008106 ~ 16008915 (-)
G158288 LOC107708856,LOC107570569,LOC107716212,LOC107681953,LOC107695729 other upstream 819811 16143833 ~ 16169834 (-)
tac3a LOC107708854,LOC107571761,LOC107681951,LOC107586540,LOC107695797 other upstream 916788 16240810 ~ 16243395 (-)

Expression


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