ikzf4 (si:dkey-166n8.9,ikzf4,LOC107681936,LOC107695809,LOC107570458,LOC107563647)



Basic Information


Item Value
gene id ikzf4
gene name si:dkey-166n8.9,ikzf4,LOC107681936,LOC107695809,LOC107570458,LOC107563647
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056721.1
NCBI id CM032090.1
chromosome length 19062720
location 16009720 ~ 16019647 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


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>XM_043225433.1
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Function


symbol description
ikzf4 Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Orthologous to human IKZF4 (IKAROS family zinc finger 4).

NR:

description
PREDICTED: zinc finger protein Eos-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0046872 metal ion binding molecular_function
GO:0003676 nucleic acid binding molecular_function

KEGG:

id description
K09220 IKZF, ZNFN1A; IKAROS family zinc finger protein

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122329227 NA other downstream 292470 15621942 ~ 15717250 (-)
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LOC122328902 LOC107737500,LOC107673074,LOC107695835,LOC107564653,LOC108275744 other downstream 708038 14684890 ~ 15301682 (-)
LOC122328913 zgc:162898,c4h15orf61,LOC107738714,LOC107686305,LOC107583911,LOC107718314,LOC107596966,LOC107672207 other downstream 961376 15047152 ~ 15048344 (-)
G158288 LOC107708856,LOC107570569,LOC107716212,LOC107681953,LOC107695729 other upstream 124186 16143833 ~ 16169834 (-)
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G158609 NA other upstream 1319620 17339267 ~ 17343385 (-)

Expression



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