LOC122330733


Basic Information

Item Value
gene id LOC122330733
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 875247 ~ 890906 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU23011
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>TU23208
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>XR_006248076.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU23011 False 2531 lncRNA 0.49 2 875247 878298
TU23208 False 374 lncRNA 0.40 2 890428 890887
XR_006248076.1 True 2749 lncRNA 0.39 3 875671 890906
XR_006248077.1 False 2129 lncRNA 0.41 4 875671 890906
XR_006248078.1 False 2652 lncRNA 0.40 4 875671 890906

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122330100 NA coding upstream 28802 844603 ~ 846445 (+)
LOC122332312 NA coding upstream 82579 783410 ~ 792668 (+)
LOC122330397 NA coding upstream 121534 743953 ~ 753713 (+)
LOC122329668 NA coding upstream 163846 699715 ~ 711401 (+)
LOC122332267 NA coding upstream 235948 638828 ~ 639299 (+)
LOC122330251 NA coding downstream 120405 1011311 ~ 1013643 (+)
LOC122332569 NA coding downstream 126801 1017707 ~ 1019352 (+)
LOC122332610 NA coding downstream 144346 1035252 ~ 1045858 (+)
LOC122330262 LOC107561206,LOC107727046,LOC107679474 coding downstream 171370 1062276 ~ 1064324 (+)
LOC122330011 NA coding downstream 188027 1078933 ~ 1084889 (+)
G15607 NA non-coding upstream 22568 850016 ~ 852679 (+)
LOC122330703 NA non-coding upstream 25538 847287 ~ 849709 (+)
G15601 LOC107574600 non-coding upstream 37485 832259 ~ 837762 (+)
LOC122330666 NA non-coding upstream 60172 793250 ~ 815075 (+)
LOC122330767 NA non-coding upstream 92171 781983 ~ 783076 (+)
G15803 NA non-coding downstream 64601 955507 ~ 955804 (+)
G15806 NA non-coding downstream 68673 959579 ~ 960094 (+)
G15833 NA non-coding downstream 178783 1069689 ~ 1070138 (+)
G15882 NA non-coding downstream 224489 1115395 ~ 1115671 (+)
G15883 NA non-coding downstream 226317 1117223 ~ 1117666 (+)
LOC122330463 NA other upstream 99713 754430 ~ 775534 (+)
LOC122330407 NA other upstream 239008 625364 ~ 636239 (+)
G15563 NA other upstream 318166 553698 ~ 557081 (+)
LOC122331567 NA other upstream 565338 73544 ~ 309909 (+)
LOC122330774 NA other upstream 575926 55175 ~ 299321 (+)
LOC122330135 NA other downstream 115077 1005983 ~ 1009431 (+)
LOC122330066 NA other downstream 156106 1047012 ~ 1051151 (+)
G15939 NA other downstream 400063 1290969 ~ 1291564 (+)
G15955 NA other downstream 499833 1390739 ~ 1392850 (+)
LOC122330032 LOC107674481,LOC107727039,LOC107711806,LOC107563760 other downstream 504941 1395847 ~ 1408926 (+)

Expression


Co-expression Network