G17993 (LOC107566823,LOC107739961,LOC107574374,LOC107576777,LOC107659785,LOC107565530,LOC107742984,LOC107710146,LOC107725412,LOC107717634,LOC107655767,LOC107571898)


Basic Information

Item Value
gene id G17993
gene name LOC107566823,LOC107739961,LOC107574374,LOC107576777,LOC107659785,LOC107565530,LOC107742984,LOC107710146,LOC107725412,LOC107717634,LOC107655767,LOC107571898
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 7989126 ~ 8092242 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU26844
GCGCTCAGAAACCGGACTAAAGTGAGTGATTTTACTTCAGTTGCTTGATTAACATCAGTGACTTGGACAATAGCAACTGAATTAGGCTGCTATATCTTTAAAACCAAATTCACGGATGAAATGTACATGTTCTCTCTACCGTTTACGTTCACTTAAAGCGAAATATACTATGTTTACGTGAATGGTTGACAAAACGGACAATTCGACatcattttgtgtgtatttctcCATTGAGTGTGTACAAGCTTCAGTGTCTGCGCTCAGAAACCGGACTAAATTGAGTTCTCTTTTGCATCATCTAATATGCCTGCATATGCCTCCTCTTTCCTTACACCCACATAGTGAGATTTATGAAGGGTTTGAGACGTGCAGTAAGTATATGTTGGTTTATGTCCTGCAGGAGAGATCAATAGTTTCTATGTTGGAATGAAAGTTACGCATCTAACCTCTGAACCACGCAGCAGATTCGTTCTGAATGAATCTTATCTCAAATCATCCCTCCCTAACATTTTCATCTCGCTTTTATTTGTTGATGAAAATGTCAATGGATTTTCACAAtagtttatgtaatttaaaattagtttttgctCGTTAACGTCTCGTTTTcactggtgaaaaaaaaataatttcaagatGCAATTGAATTCTCCAAGCAGCTCAGATCTGCAATTAGAAattctcatcatcatcatcatcacacactcTCTGGACGATAGAGGACTCAGTCACACCACTGTATTTCCAGACCCACAATTAAACTTATGGATACTAAATTACCACCGATAACCAAATCCTGGAATCACACAAATGTACGTTCAGTCACACAGCTGGAATATATTTGTTACTAGAATAAAATGGACATGctgtatctaaaaaaaaaaacaattatggtGTAACCGTGGCAGTTGGCCTAGCATaagttaacatatttttaacatataagtTAACTTCTAACCTATGAAAATGAAGGAGATACTGTATGTAAATGCCAATATTTGtgtccaacaaaaaaaaaaaaaaactttttctgatattgatttttgttttaaattctcatagtttgtgttattttttttagcataaaagatcaaaaggattaacaatacAGATTCAGACAGAATGCAGAAAGACAGCCTTCGTTTATCATATTTATCAAGGGTGCACCTTGGTGCAGTAAGATTCTCACGTTGTGGAAGAGACAGGGTGAGTTTTTCGTGAGTTTCTGTGCTAAAGTGCTCTTCTGCCATACATTATAGTTAACTTTTATCCGCCTAGAAAATtgccacattttattttgtgtaatgattattttgatattcGATTAATTGgacaatagtttttttcccgATTAATTGGATAAACAATAATTGCCACGGACAACTggcaaaaacacattctgtgCAATTTCCTTCAACATATCAACTGGATGCTTTGACAGTGTTAAACAAAGTCCTCCTATAATGTcctcactataaaaaaaaatggctgatGAGTAATTTCTTACTgctaaaatcagaaaaattCTGAGGCCAAATAATGTAGAATACTTCAACCATTGATGTCTACTCTGTCAactcttcttcatcagttagccCCGAATGATTTAGTACctctgtactgtactgtactctTTTATCCCTTATAATCCTCCATGTCTTTGGTGGGTGGCAGATCCtcttcctatctagcacctaaactctggatcaatctccctaacactgttcgggaggcagacacactctgtcagtttaaatctagattgaAGACACGTCTCTTTAAACTGgcttaaatgtaacattaatacGCTTCTAATATTAAAATCTTCCAATAACATGATGTAGGCTACTTGTTACATCATAAGAACAacggcatctatgctaatatttgtCTCTTGTTTCTTTCGTATTCCAAGGCCACTGCAGCCACCAGATCCAGTCCGTATCAGGATCAGATGTGGATCAGTAATGTCCAGTGATACTGTCAACTTGATAGCACAGTCTCgatttaaactgaactgagctgagCCATTACATCAATAATGCACAtgaaatgcagttaaataaaaatgtaatgtaatgtaatcctGTCTACACTGACACTTTATTTTCCTACTTGACACTTTTAAGTGCTTATGATGCAATCTTATTTGTTAaaggtgctatataaataaaggtgaattGGCTAATTAAGTTAACTATTAAACACTTACTGAGCTTTTCTGCAATTGATCACAGCTGGTATCAGTCGTCTTCTCCCCTCATCTGATGTGTTGTATTTCTTGAGGTCCAACTCATCCAGAGGCTCATCTGACATCTGAAGCATGTAGGAGATTGCTGAGCAGTGAGAAGGAGAGAGTTTCTTCTCTGAGTGTTTGTCTGATTTCACAAACTCCTGAATCTCTCTGGACAGAGTCTGATCTTTCACTTCCAGTAGACAGAggaacagattgatggattGACCAGCTGAGAGATGATAACTATTATATGCATCTTTGATCTTATCTTTAATGTCCTGTGTGGTTTCTTTGATGCTCTCTGATCTGTTCTCGGTGTGTGACAGTAGATCctgtaagagtctctgattggactTCAGTGTGACGCCCAGCAAGAACCGCAGGAACAGATCCAGGTGTCCATTCTCACTCTGGAGTGCTTTATTTACCGCTGATCTTATTAGATTATACAGCGAGACTTTAAATCTGTTACATTTAAATCCATGCAGAAAAATCTCCAGTGGCTTCTTGTTCTTTGTTAAATAGCagtaaaacagataaaaagcAGCAAGAAACTCCTGAATGCTCAGATGGATGAAGCTGTAGACCTTCCTCTGATGAATCACAGATTCCTCCTTAAAGATCTCAGTGcaaatcccagaatacactgaAGCGTCAGTGACATCTATACCGCTCTCAATCAGGTCCTCCTCATAAAACATCACATTGCCCTTCATCAGCTGTCTGAAAGCCACGTCAGCTAGTTTCACAATCACTTCTCTGTTGGACTGCAGGAGTTCCTTTGGATGTTTCTCTTCATACTTCTGGCTCCTCGTGTTGATCTGAATCAGCAGGAAgtggatgtacatttcagtcagagtttgagggATTTCTGCACTCAGATCTTCTTCCAGGAGCTTCTGAAGCACAGtggatgagatccagcagaagacagggatgtggcacatgatgtggagGCTTCTTGTTCTTctaatgtgtgagatgattctgctggcttgatgctggtcactgattctcttccggaaatattcctccttctgaggATCAGTGAACCCCTGTATTTCTGTCAGACGGTTGATGTACTCGggagggatctgattggctgctgctggtctggaggtgatccagatgagagcagagggaagcagcTCTCCTTTTATGAGGTTTGACATCAACACACCCACCAATGAAGTCTCAGTCACATCACAAACCTTCTGATaatctgaaaacatcagtgggattctgctttcatccagaccatcaaagatgaacacaatTTTACACTCCTCATAAATCTTTGAGTCCAGATTTTGAAGTTCAGGATGAAAGTCCagcagaagtctgtgaagactGTACTGATGATCTCTGATCAAGTTCAACTCTCGAAAtggaagcacaaacatgaaatcgacatcctgattggcttttccctcggcccagtccagaatgaacttctgcacagagacggtttttccaattccagcaatgcctttagtaagaacagtcttGATCTGGTCTTTCTCCTCACATCCTGGTTCAGGTGAGGCTTTAAAGATTTCATTGCAGTGGATTGAAGTGTCTTGTGAGCTTTGTATTCTGGTTGTGTTCTCTATCTGTAACacctcatgttcttcattcactccttcactctctccctctatgATGTAGAGCTGTGTGTAGATCCTGTCCAGGAGGCTTTCATTCCCCTGGAGTGTCATTCCCTCAAATAATCTCTCATATTTCTTCTTCATGCTGGTTTTGAACTGGTCTTTGACTCTCAGATCACTGTTTGTAATTAATGGAGTTTAATAACAAAACTTTGTGTGCTTTTCGTATTCTAGTTAAATCATTTTGCTTAgtcttgttttatataattattagatATTGTCATGATTTTAAATTTATCTCTTACATTTTCactgcaagttttttttttttttttacttagtatTTTTTCTATGtaagtgcatgtgtgtttattgagTCTTGTATTGTCCCATAAATCATTTATCCTCACCTGGGATTACACATCATCAGATGATTACTGAAATGATGAGGATCAAGCATGAATCTGAAGCTCTTCAGAGACACACAACTGGTATCTGCATATGAAGacctcttcctcctcctgaAGATCctgatatacacacagacataattcttattctcattttaaaatacatggtTCTATTGTATTTGATCAC
>TU26845
GCTTTTCTGCAATTGATCACAGCTGGTATCAGTCGTCTTCTCCCCTCATCTGATGTGTTGTATTTCTTGAGGTCCAACTCATCCAGAGGCTCATCTGACATCTGAAGCATGTAGGAGATTGCTGAGCAGTGAGAAGGAGAGAGTTTCTTCTCTGAGTGTTTGTCTGATTTCACAAACTCCTGAATCTCTCTGGACAGAGTCTGATCTTTCACTTCCAGTAGACAGAggaacagattgatggattGACCAGCTGAGAGATGATAACTATTATATGCATCTTTGATCTTATCTTTAATGTCCTGTGTGGTTTCTTTGATGCTCTCTGATCTGTTCTCGGTGTGTGACAGTAGATCctgtaagagtctctgattggactTCAGTGTGACGCCCAGCAAGAACCGCAGGAACAGATCCAGGTGTCCATTCTCACTCTGGAGTGCTTTATTTACCGCTGATCTTATTAGATTATACAGCGAGACTTTAAATCTGTTACATTTAAATCCATGCAGAAAAATCTCCAGTGGCTTCTTGTTCTTTGTTAAATAGCagtaaaacagataaaaagcAGCAAGAAACTCCTGAATGCTCAGATGGATGAAGCTGTAGACCTTCCTCTGATGAATCACAGATTCCTCCTTAAAGATCTCAGTGcaaatcccagaatacactgGAAGCGCCAGTGACATCTATACCGCTCTCAATCAGGTCCTCCTCATAAAACATCACATTGCCCTTCATCAGCTGTCTGAAAGCCACGTCAGCTAGTTTCACAATCACTTCTCTGTTGGACTGCAGGAGTTTCTTTGGATGTTTCTCTTCATACTTCTGGTTCCTCGTGTTGATCTGAATCAGCAGGAAgtggatgtacatttcagtcagagtttgagggATTTCTGCACTCAGATCTTCTTCCAGGAGCTTCTGAAGCACAGtggatgagatccagcagaagacaggGATGTGGGCACATGATGTGGAGGCTTCTTGTTCTTctaatgtgtgagatgattctgctgGAAgtggatgtacatttcagtcagagtttgagggATTTCTGCACTCAGATCTTCTTCCAGGAGCTTCTGAAGCACAGtggatgagatccagcagaagacagggatgtggcacatgatgtggagGCTTCTTGTTCTTctaatgtgtgagatgattctgctggcttgatgctggtcactgattctcttccggaaatattcctccttctgaggATCAGTGAACCCCTGTATTTCTGTCAGACGGTTGATGTACTCGggagggatctgattggctgctgctggtctggaggtgatccagatgagagcagagggaagcagcTCTCCTTTTATGAGGTTTGACATCAACACACCCACCAATGAAGTCTCAGTCACATCACAAACCTTCTGATaatctgaaaacatcagtgggattctgctttcatccagaccatcaaagatgaacacaatTTTACACTCCTCATAAATCTTTGAGTCCAGATTTTGAAGTTCAGGATGAAAGTCCagcagaagtctgtgaagactGTACTGATGATCTCTGATCAAGTTCAACTCTCGAAAtggaagcacaaacatgaaatcgacatcctgattggcttttccctcggcccagtccagaatgaacttctgcacagagacggtttttccaattccagcaatgcctttagtaagaacagtcttGATCTGGTCTTTCTCCTCACATCCTGGTTCAGGTGAGGCTTTAAAGATTTCATTGCAGTGGATTGAAGTGTCTTGTGAGCTTTGTATTCTGGTTGTGTTCTCTATCTGTAACacctcatgttcttcattcactccttcactctctccctctatgATGTAGAGCTGTGTGTAGATCCTGTCCAGGAGGCTTTCATTCCCCTGGAGTGTCATTCCCTCAAATAATCTCTCATATTTCTTCTTCATGCTGGTTTTGAACTGGTCTTTGACTCTCAGATCACTGTTTGTAATTAATGGAGTTTAATAACAAAACTTTGTGTGCTTTTCGTATTCTAGTTAAATCATTTTGCTTAgtcttgttttatataattattagatATTGTCATGATTTTAAATTTATCTCTTACATTTTCactgcaagttttttttttttttttacttagtatTTTTTCTATGtaagtgcatgtgtgtttattgagTCTTGTATTGTCCCATAAATCATTTATCCTCACCTGGGATTACACATCATCAGATGATTACTGAAATGATGAGGATCAAGCATGAATCTGAAGCTCTTCAGAGACACACAACTGGTATCTGCATATGAAGacctcttcctcctcctgaAGATCctgatatacacacagacataattcttattctcattttaaaatacatggtTCTATTGTATTTGATCAC
>TU26849
GCTTTTCTGCAATTGATCACAGCTGGTATCAGTCGTCTTCTCCCCTCATCTGATGTGTTGTATTTCTTGAGGTCCAACTCATCCAGAGGCTCATCTGACATCTGAAGCATGTAGGAGATTGCTGAGCAGTGAGAAGGAGAGAGTTTCTTCTCTGAGTGTTTGTCTGATTTCACAAACTCCTGAATCTCTCTGGACAGAGTCTGATCTTTCACTTCCAGTAGACAGAggaacagattgatggattGACCAGCTGAGAGATGATAACTATTATATGCATCTTTGATCTTATCTTTAATGTCCTGTGTGGTTTCTTTGATGCTCTCTGATCTGTTCTCGGTGTGTGACAGTAGATCctgtaagagtctctgattggactTCAGTGTGACGCCCAGCAAGAACCGCAGGAACAGATCCAGGTGTCCATTCTCACTCTGGAGTGCTTTATTTACCGCTGATCTTATTAGATTATACAGCGAGACTTTAAATCTGTTACATTTAAATCCATGCAGAAAAATCTCCAGTGGCTTCTTGTTCTTTGTTAAATAGCagtaaaacagataaaaagcAGCAAGAAACTCCTGAATGCTCAGATGGATGAAGCTGTAGACCTTCCTCTGATGAATCACAGATTCCTCCTTAAAGATCTCAGTGcaaatcccagaatacactgGAAGCGCCAGTGACATCTATACCGCTCTCAATCAGGTCCTCCTCATAAAACATCACATTGCCCTTCATCAGCTGTCTGAAAGCCACGTCAGCTAGTTTCACAATCACTTCTCTGTTGGACTGCAGGAGTTTCTTTGGATGTTTCTCTTCATACTTCTGGTTCCTCGTGTTGATCTGAATCAGCAGGAAgtggatgtacatttcagtcagagtttgagggATTTCTGCACTCAGATCTTCTTCCAGGAGCTTCTGAAGCACAGtggatgagatccagcagaagacaggGATGTGGGCACATGATGTGGAGGCTTCTTGTTCTTctaatgtgtgagatgattctgctggcttCTCGTGTTGATCTGAATCAGCAGGAAgtggatgtacatttcagtcagagtttgagggATTTCTGCACTCAGATCTTCTTCCAGGAGCTTCTGAAGCACAGtggatgagatccagcagaagacagggatgtggcacatgatgtggagGCTTCTTGTTCTTctaatgtgtgagatgattctgctggcttgatgctggtcactgattctcttccggaaatattcctccttctgaggATCAGTGAACCCCTGTATTTCTGTCAGACGGTTGATGTACTCGggagggatctgattggctgctgctggtctggaggtgatccagatgagagcagagggaagcagcTCTCCTTTTATGAGGTTTGACATCAACACACCCACCAATGAAGTCTCAGTCACATCACAAACCTTCTGATaatctgaaaacatcagtgggattctgctttcatccagaccatcaaagatgaacacaatTTTACACTCCTCATAAATCTTTGAGTCCAGATTTTGAAGTTCAGGATGAAAGTCCagcagaagtctgtgaagactGTACTGATGATCTCTGATCAAGTTCAACTCTCGAAAtggaagcacaaacatgaaatcgacatcctgattggcttttccctcggcccagtccagaatgaacttctgcacagagacggtttttccaattccagcaatgcctttagtaagaacagtcttGATCTGGTCTTTCTCCTCACATCCTGGTTCAGGTGAGGCTTTAAAGATTTCATTGCAGTGGATTGAAGTGTCTTGTGAGCTTTGTATTCTGGTTGTGTTCTCTATCTGTAACacctcatgttcttcattcactccttcactctctccctctatgATGTAGAGCTGTGTGTAGATCCTGTCCAGGAGGCTTTCATTCCCCTGGAGTGTCATTCCCTCAAATAATCTCTCATATTTCTTCTTCATGCTGGTTTTGAACTGGTCTTTGACTCTCTGTAGTTTATCCTTCACTGGCTGATCATGTTTATTCACAGACACTGTAACGTTCATGTTGTTCAGACAGAAGACATGGGCAGCTCTTGAAAGCTTCCATCTCGATCTGCTCTGCTGAAAtaact

Function

NR:

description
PREDICTED: NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU26844 True 4437 lncRNA 0.38 3 7989126 8092242
TU26845 False 2387 lncRNA 0.41 3 7991099 8092242
TU26849 False 2113 lncRNA 0.40 2 7991099 8091669

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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ptger1c ptger1c,LOC107757344,LOC107567231,LOC107672434,LOC107670435,LOC107711161,LOC107587998 coding upstream 181364 7801296 ~ 7807762 (+)
LOC122334406 LOC107587953 coding upstream 192473 7786116 ~ 7796653 (+)
chmp6a chmp6a,LOC107744992,LOC107599353,LOC107711234,LOC107672453,LOC108432238 coding upstream 333936 7649629 ~ 7655190 (+)
ttyh2l ttyh2l,LOC107744973,LOC107670532,LOC107599325,LOC107711233,LOC107672455,LOC107587999 coding upstream 340180 7619650 ~ 7648946 (+)
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LOC122339678 NA coding downstream 92306 8184548 ~ 8189293 (+)
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G17937 NA non-coding upstream 143081 7845224 ~ 7846045 (+)
G17936 si:dkey-210j14.3,LOC107672496,LOC107757375,LOC107711245,LOC107711244,LOC107670496 non-coding upstream 144909 7843581 ~ 7844217 (+)
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G18055 NA non-coding downstream 382051 8474293 ~ 8490417 (+)
G17988 si:dkey-182i3.10,LOC107718276,LOC107690448,LOC107683827 other upstream 22932 7964749 ~ 7966194 (+)
LOC122341279 LOC107730542,LOC107679029,LOC107563335 other upstream 26150 7960071 ~ 7962976 (+)
G17985 ighv4-5 other upstream 37762 7950854 ~ 7951364 (+)
LOC122331768 LOC107710248 other upstream 38709 7949761 ~ 7950417 (+)
LOC122341274 LOC107711242,LOC107672448,LOC107588011,LOC107757354,LOC107670494 other upstream 147457 7838956 ~ 7841669 (+)
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LOC122342110 wbp11,LOC107751605,LOC107678993 other downstream 167842 8260084 ~ 8563379 (+)
G18048 NA other downstream 421107 8513349 ~ 8742302 (+)
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Expression


Co-expression Network