G18048


Basic Information

Item Value
gene id G18048
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 8513349 ~ 8742302 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU26932
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>TU26936
TTGTAATGATTAGCAGTACTCGCTTGATCAATCTTGATCTTTGACACCACCAGACCGTGACAGCTATGGGAATGTTTCTTTAATGTCATTGGAAAAAATAAACGTAAAACATACAGATTTCAGTCATACAGCAAGAGAATGAAATATTCAGGACAACATTGTAACAGACAGCGAGTAACAGAGTTGCAAATCACTAACATTAAAGCAGTAAAATAAGACCTGACATTGAGCTTTATCATGTATCATgataaattaaacaaagcatTACAAACTACAGGAGATGCCAGGAGAAACCCGTTTGACTTTAATTTGCTGCAGTTTAGATTGAAGAGttgaacagaaatgttaaaatggtgCAGTTCAGACACACATATGTGATTCCCTTGACCTTTGACCAAAGTCATCCGTCCGTCAGACAGACGAGTGGAGGCTCAGTAGATGGATGGAGAAGAGTAGAAAGACGTCTTGAGGCTACTACAGAGCACAGAGCTGCAGATGAGCGCCAGCAGCTGtcgagcagagagagagaaagagagaaagagagaggggttATATGATGAGTCGGGCATCTGGAGCGGCGGCTGCGGCGGCGGGTGGAGAGCTGAGGAGCAGGTACGCAGGAGGAGATGCATGAGACACCGAGTCATGTCTTCTGAGAACACAGCTGCAGATCAGTGCCAGCGTCTGAGGACCATGATTCCTGCCATCCCCAGAAATCCTCCCAGCACCAGTGGAGCGTTGGAGTTGAAGGCGTTGTGGATCATGCCGGGAcagctctacacacacacactggtgagTGCCTGCCCTCCTCAGACATCACACAGAAATCAGAGCAAGACGATCAGTAAGTGACTCACAGAATAGGTGAGCTGCTTCAGCAAGTTGCCGTCTGGACAGGTGTCTCGCACAAACATCTCAATCGTTCCCCCGATGCCACAGCAGTcgaactgaaaacacacacacatgcctgtCATACCAcacgtgagtgtgtgagtgtgagagtgtgtgagtgtgtgtttcttaCAGCGTTGTGGAATAATTTGAGGGTGACCGCTTGACCGGGACTTCTGGTGTTCAGATACTGAGCGTAGATGGTGGTGTAGAATTTAACCAACTCATCTGAAACCtgcaacacaacacacacaacacacacaacacacacaacacacagcgTGCATGAGAGTGGAAACCAGAAAACCTTCAGCGAGGCTCTAAGGCAATACAAAGGAACACTCCGCTGGAAAAAAGCCCAATTTCTGCAGGACCAGtttgaagaaataataaaaaagaacaataaattcaaacaaattCTGGGATAAATGGAATGTACTATACAAATCAACTCAAGAAGATCTGGTTATCCAAGATGAGGAGATAtggaaaaataattttcaagaaTTATATATCTCAGCTGAAGTTCAAAGCTCTGACtaaaattaaataatgaaatttgtttttggaaaaatcaatcaaaacaaAGCAACCCTTTAGATTTccccataacaataaaagaatCAAATCCATGTGCTGTTAAAACTGGAGACGTGGAATATATtgttccaaatatttttttatgtatatgttctCTTTTCCTATGCATGCTTTGGAAatgcaaaatgtgcttttgtaatGCCAATAAATCTAAGTGAACTGAATTGAATAGAGTGAGAGAATGAGTGTAAGAGTGTATGTGAGAGCatgagagtgagtgaatgagagtTTGTGAGATTGCGAGTGTGAGAacttgtgtgtgagagtgtgtgtgagagagtgagtgagagagtgagtgagtgagactGTATGTGACATGAGAGCAAGAGTGtatttgtgcatgtgtgagagagtgagagcgTGAGGGTGTGTACATGTGTGGGAGCATGAGTGTGAGCCTGAGAGCATGAGAAAGTGAGAGAATGAGTgtatgtgagagtgtgagagcgtgagtgagtgagtgagagagagaacgagtgtgagagtgtatgtAAGAGCGTGAGTGTGAAAACACAAGCgtgtgagagaatgtgtgtgagagtgtatatgaCTGTGAATATGAGACTGAGAGTGTGAAAGAGTGagagaatgagtgtgtgtgagagcgtgagagtgagagtgtgagactGAGAGCTCGAAAGAGTGtatgtgagagtgagagtgtcaACATGAGGGAATTACTGAGAGTTGTTGTGAGAGTGTAAGTaaatgagtgtgagagagagtgtgcatgtgtttgtgtgagagagagtgagtgtgtatgtgagtgagaGAATGAGTGTGAGAGCGTATAAGagtgtgaatgagtgtgagaGCAAGAGtgatttgtgcatgtgtgtgtgagagagtgtgtgtgtttgtgtgagagtgtcaatcaatcaatcagttttatttatatagcatttttaacaacacagatttgATCAAATCACCCTCTATCAAATAGACTGAGAGTGTGTTTTACCTGGTCGTGCCACATGAACGCCATCACGCCGGCTGCGATTTCAATGATGATCAGAAAGGACAGCAGGCCAGAAAACTGAACAtcaaaaaatccaaaatgttatgaaataacTCTCTATTCTCATTCATAGCTATGAacgaagaaaagagaaagaagagaagagcCATGCGTTTTTGagcttctcttcttctcttgaCAGGTGTGTGTAGATCTGACCAGGGACGTCAGATGAGTGTGAGGTGTTTGCAGCGATGGTCTTCCTCACCACTGCGAGAGCTGATTTGCTGTTGTTGCAGGCTCCACAGTCACCGATGATGGCCACCAGCAGCATCAGGACGCCGGTGACCACTAGCACGGTCActcctgcagacacacacacacacacacacacacacggagcaTCACAGCTTGATATCACGCAAGTAACATGGGGCAGTGACAAACAGCAGAGGAAATGAGAAACACACCGATGTTGAACTGAGCTGTGTTCAGGTCAATGTCGAAGAATCCTCGGGTCTCTGCACCGAACCGAAGCCACATTCCCAGAGCCACCAGACCGAAGCCCACCAGCAAATAGAACGTTAAACAGGATCAGGAAACATTTACACATCTGCGCGCACCCGTCCATGGCGATCCGTTTGATTTCCCTGCAACAAAACGCCATAAGAATCTCTTAAAGAACTACAACTCACACAATCCTCTTAACGAACATAATGACAAGTTTTTTATATGAGTAAATACTTAGAGCATAGAATTTGGGAAGCCTTCCGATGTAACGCATGCAACAGAATGGCCACAGggtaaataaacttgccttgttCAGTATGTAGTTAAAAATGAGGAGCGCTCGCGTCCTGCTTCTCTCTTTGCGGATCCCCGCTGCTGTGCGCGTGCCCGCCGCGG
>TU26937
CCCCTTGATTACAATCGGGACACTTTCCTGAGATGTGGAAAGATaatctaataaatgcaatttttaaacaAGGTGGGATGTGCGACCCAAATTATTGAGCAGTAACTTCGGAAAACTGTTCTGTTCCATcgttaatgataaaataattcactttattcaagattttaaaatattgtcaaATTGGATTTATGCCTAAACAAAGAACATCAAATCATTTGTACGCTCCATAGATTcgtacaaaaatatgtttaattagaCAAAACAAGGATTGATTTGTGGCTGcttcattgattttaaaaagcctttGGTTCGGTGTGGCACAATGGTCTTTTTCTAAAACTCATTCAAAGTGAAACAGGAGGTAAGACCTATGACATTTACAACGGGAACAAGTTCTGTGTGAAGATCAACGAGAGACGGACTGATTTTTTCAGTCAGACTAGCTGCAGTCTCAGCCCGACTCTATTTAACATCTATATTAATGAATTAGAATCAAGTCTTCTTGTCCTGGTCTGACCCTCGAGGGCTGAAAGACGATCTTCTGTTGAAGAGGGACTACACCAAAGCCTCTCAATCTTAGaaaagatgcacaccagtaatgcttttaaaggtatgtttatgaaaattacttaaatgtcatAATTAAACTAAGCCCTGTCTACGTAACCAGGCCCAAGTGAATTCTAATGGATTCTAAAGCAGCTGGTCTTCATCTTGTTCCCTTGCTCGCCCTGATctagatctctctctcttttcatatagctatatgaataaatgtgtaGTTGTCGTATTGTATAAAACCTTTAATTAGGATAAAACCATAAATTAAAGACTATTAGTAACATTTATCAGTAAAAGTATGTGActacaacaaataaacaagagtGCCATTAAGGGCTGTATGATCTGTGTGATCTCAGTAATATCTCAAATTGATAGTATAGATGATGTCACCGTTTATAATAAACCCGGCACACATGTGCTGAGCTGAGGGCGGGGTGTTTAGACACGCACTGGAGGCGCTTTAGCCAATCACAGCTTGCTGGGCTAGttgaccaatcagagctcaTTTCTGAGGGCGAAGCTTCATAAACAGCACATGATCGGTGCGTCTTTCAGAGAATCAACAGAGCGGTGTGGAATTAAGGTTATACTGAAGCCCTTGAACACAAGAAAGCCTAGAAAAAACCCTTAACGTGAACAACACTTCAgctgaaaaataatgctgttaAAAACACTTTAGGTGACAAATACTTAACACTTATTAATGAAGTAGACTATAAGCATAAGAAAACCGTTTAATGCTTAATGtattaaaactcaaaaaataCCAAACTCAGACATTGCTTTAATGCATTAAGCTAAATGAAGCACATTCCTGCCCTTAGGAAAACActtaaaggtcccatattgtacacctttttagagttttattttaggtgttgatgaccttaagaatatataattgtggtataagtaacaaaaaccacctcaaaatgtttttacagttcCTTTCTCATGAGCTGTCAAAAACAGGTCGATTTTGGCCTAATTAATATTCGTAAGTCTAccttctgattggccagttTTTTCTGAGTGACTCAtgaccaggccaatcaaatgtaatgaCTTCACAATAATGTTAGCGCTAactggatgcaaaacaaagagaagacCAAGGCAgctcatttaaacaaaaagcagaTTCAGAAACataaggagcttaaaatatcatcttgttTGTCAGAATGTTTCAGATTTgacaatatgggacctttaacatgtaattaaatgtactgCATTCTTATTCTGGACTCATGTGGTTGTCTGTAAATAGtgtactttattaataatatgtttgcTGAGTTTGGTCTTTTTAACCCCTGGGGTCCACTTAAATCACACTTCAGTACTGATCATACAGTGTTACGTCCCCGGATGAATGGTTTTTTTCCTTCCCTTTGTATtgttccctccctctctctccctctgtctctctctctctctctctctctgtgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctct

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko05162 Measles

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU26932 False 2830 TUCP 0.40 2 8513349 8516454
TU26936 True 3358 TUCP 0.44 4 8513349 8524734
TU26937 False 2055 lncRNA 0.39 2 8514149 8742302

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122341287 LOC107758354,LOC107569871 coding upstream 15070 8493695 ~ 8498279 (+)
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poldip3 poldip3,LOC107661083,LOC107580331,LOC107714893,LOC107666602,LOC107579899 coding upstream 285995 8219924 ~ 8227354 (+)
LOC122342001 cpt1cb,LOC107747872,LOC107667163,LOC100333227,LOC107730771,LOC107689673 coding downstream 92827 8835129 ~ 8854765 (+)
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lmx1al lmx1al,LOC107672514,LOC107670451,LOC108429662,LOC108256788,LOC107567229 coding downstream 301136 9043438 ~ 9064147 (+)
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G18025 fam234b,LOC107576065 non-coding upstream 296318 8216524 ~ 8217031 (+)
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G18261 hs3st2,LOC107550309,LOC107703334,LOC107741797,LOC107574133,LOC107674621 non-coding downstream 138896 8881198 ~ 8882122 (+)
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G18429 NA non-coding downstream 742133 9484435 ~ 9484736 (+)
LOC122341282 LOC107690132,LOC107722730,LOC107572760 other upstream 360455 8150743 ~ 8152894 (+)
G18008 LOC107572757,LOC107745393,LOC107676178,LOC107574638,LOC107690127 other upstream 453492 8056659 ~ 8059857 (+)
G17988 si:dkey-182i3.10,LOC107718276,LOC107690448,LOC107683827 other upstream 547155 7964749 ~ 7966194 (+)
LOC122341279 LOC107730542,LOC107679029,LOC107563335 other upstream 550373 7960071 ~ 7962976 (+)
G17985 ighv4-5 other upstream 561985 7950854 ~ 7951364 (+)
LOC122341292 LOC107729471,LOC107687638 other downstream 238289 8980591 ~ 8988810 (+)
pgls pgls,LOC107672478,LOC107711179,LOC107757376,LOC107567243,LOC107670497 other downstream 267748 9010050 ~ 9012178 (+)
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LOC122341719 pet100,LOC107563330,LOC107672445,LOC107587949 other downstream 442097 9184399 ~ 9185660 (+)
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Expression


Co-expression Network