G18960 (paqr4a,paqr4,LOC107674132)


Basic Information

Item Value
gene id G18960
gene name paqr4a,paqr4,LOC107674132
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 11289747 ~ 11294605 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU28247
gtcAAACgagacaatttaaaaatataaacctcAATTTATTGCACAATTGCTGCAGGAGACCGTGGGGTTTGGAAGATCTGTCTTGTGTGAACAAATGTAACCGTGGACACACAAATAGACTGAGAGAGAAATATAGgcccataaaacaaacaaacagtgacACACGCTTGTAGATGAAACCATTTACAACaagaaatgtttatgtaaaaccAAAGTTATAGTAACTTTTGCAATAAATGAGTTGAGGACAcctaataaaacaacagaaaacaaagatACACGGCCAGCGGGGCTCAGTTCATCCAGGTCAGCTCGGTTTAACTGAACATCATTTATGCCGCTACCGACTCATAAAGGTCAATAGAGCGCTGTGGCCACCAGATGGTGccaaaaaacaaccaaattcaacaaaaacacacgAGCAGGAgcggaaacaaaaaaaacgacagATCTTTCAGAGACCTCCCGTCTTCCTCTGTGCATTAGTATTCTCAGCCTTTGTACTTAAATTAAGATTATCATTGATAGTGGTAACCCATCTcagaataatagtaataataacaatatatccattatcataataatgcaaaatgtaacTAATGATGAGtagtttttaaattatcattaacAGGCTATCCAGCACCTGCatactaagaaaaaaaaggtattatAGTTTCATACAtcatgtcattattattatttttttttttttaccacaggACATTAGAATATACAGACAGGAGAACATCATCCATGAGAATATCATCCTTGTTCCTCCTCTTAAACATGGGTTATGATGCAATCCATTTCCTTTAGGGCTCAATGTAACATGCTCTGCACATTCTCACATCACCTAACTAACTACATGAATAAACACATTCTTGATCAGCATTTACGGACACATTCGGCCCCACGAAGGCAATATGCATCAAGAAGGATGCACAGTTCAAATGCCTGATGGCTGACGAGCCATCGCGACCTTTGCCCTTAAAGACATACAACTGTCATCGatttttttcagtcttcagtttTAACCAGAACAAGCAAAGAAGACATGACaggatgaaaagaaaactgGCCCGAAATCAGTTGTTGAGGTCACTCGGTACAAGTGAGCACTGACAGGGCACCCTGAGAAGAGGAAACCCCAGGATGGCATGGTCTGAGCAAAACATGTTGGTGTGAACACACAAATCTGGTTCTTTTCAGGACTGGTAAAACATCTTGTTTTTGGAATTCACATGTACAaacatgtttctgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatacacacacacacacacacacacacacacacaatatatgtgtgtgtgtgtgtctgtgtacatATTTCGATTATGCATAGTTATCCAGTGGGTTTCAGAGGTAATAACATATCAGGACCCCCGTTTTCCAAACCAAAACATCTGTATGCCTCTCTGTACTtctcataatataaaaaaaaaaagaaattctacCAACCAAACTATATTACAATCCCTTCTAAACAGTTTAAAAACCGAAGACCGCGTTAATGACATTATGACATCATAGTAGTACAGACATATTATTATGACGTTAACCCTACTAAATAATCTAACAGCATTGTTAACTCTCCTGCCAGGCCTGTCATTGTGATGTCACAATTTTAGCTTTTTACAGATACAGAATGATCGAATCACTGCTGCCTTTGAAATGAAATCGGACAATTCATATTGAGTGTCGCTCTCTGAGATGAAATACGTTAACATTCAATATATCTTCTTATAACATTGttgctttatatattaatatgaatatataaaaatgtcagtaTGTATGCCGCttgcattttatgcatatacAGTCTACATACAGGTATTTACGTTACCTATATGGACTTTTTAAGTTCTTAATTGGTTTTCACTTTGATCCAAAGCCcttttggtaaaaaaataaacagtgcagTTAATTATTTGATATGGTAGTATTGCCTCTGGGCTGCTTTCTTGATTTCATTCCACTTCTAAAGACAGATATATTTGATGCATTAGCTCCGTTACTGCACATTAAGCACATATGTCAGTGGATGCATCGCGCAAGCATTAGGAATCGCATGTTGTGTTTTAAGGGGATTGGTTTACTAATATTACATGCACCACTTGATTGCAGAGTCTaatgtttatcatttaataGCATTAAAGGGGTCTGGGTAAACGTTCCCCAATTCTGAGGGACTATAGTGGTTTGCTTTTAAAACCACCCTGGTCTGCTAAGATCAGGACCGTCGTGCTCGACACCTGAGGCCCTAACACATCTAATTTGGCATAGAGTATGTGTAAGTGTTTGTCAGATACATCTGAGCAACATTCTACCTAACATGCACTGGTTCTACACTAATAGGTCTGATCTCTCTAGAGTACTGTAGTTGTGTAAAGACACATGATCCCCAACTGGTTAAAatgatacataaatattaaaaaaaaaacagtagtggtagcattaaaataaaatcttcaaaCATTGACAAATGTCAAAGCAAcaatctaaatataataaataatgatatggAGAGTGAGTAATTGAAATGAACGACCGGCCTCACTAAAAGTGTCAGTCAAGTGTCAGTGTTATTTGTTTGTCAGTTCTTTAAAACTTGTGAGCATGGAAGGGTTAAAAGTGTCATCCTTGGTTTGTTTTGATCAGTAGTATATTAGTGTGCAAAGCtaataaatccaaaaacagCATAATACAGCTGATTTGGAACAACGTCTCCATAGTGCAATCTGCAATAAGAGCTGTTTTAGTTTATGTTTATCACATTCTaaagtatatataaagtttAGCTTTAGTCTCTAAACAGCTCTGTTAAACCTGAAGTCTTTTGGCAACTCTTCTTAAATCGGAGGGGTCATTATGAATTATATCCAATCAAGTTCATCCTATTACCGGGGACTTAAATAATCTGCATGTATAGCATTAATTTAGCACAAGTGAGCAGTACCAATAATCCCGTAGTCTTCATTGGGGAATTCATAGTGTATTGGCATGCGTAATATTGCTCCATTCTGGAGTCTAATATTCATCTGCCACATCTGATGAGCGGGAACATCAGGTGCACAGTGGACGAGGATGGCCAGCAGAGAATTGAAGCCTTTGTGCAAACAGCACGccattaagaaaataatttgcCTTGTCTCGAATCCAAGGTTACATAGATAATTGAGGTTAAAGGTCAGGAAGAAATGAAATCTAATTTAGACCGGTACAAAGTCCAATCTTCCAAACTACAGATTAGGATATTAAAACCGCGAGTGTACGAGGCTGAATCGTCTGTTCTGCGGCACAGCAGAAACAATATGTTCTGCAGGCAACGTCAAATGCTTCCCAGGGTATTATTAAAGTCATGCTCCTGTTAAAAACCGCACTGAATGAATGCCCCTTAGATGTTAACAAACATGATCAAAGTCACAGAGGgcgctaaaaaataaaatgggcACTAACGTAAAAAATGGCTAGGCTACAAACCAAGGAATGATCCCTTCACCCTTCACTTACAGGTATCGGAGTGAGAATGTGGGAAATGTGGACCTGAACAGagagacaacaaaaaaagtgtgataaaacaagtaaaaatcaACTCAAGTATTTCCAGTAAATGTTGCTCTCAGACCTGGGCTTACagtacgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtggtcttaGCACTGCTGTAACATCTGATATGCTGCATAGTCTGCAATAGAGTAATAAGTTAAAAGTTGGAGGTGCATACATCATTTCTGCACCGGTGATCTTTGTTTGTCACCAGCAAAATAGAGATAAACTATAATTAGTTTTCGTAAAAGCCATGCTATTTTGTACAACGAATTTCAGATTACGCGATGCGTAAAATCTTACTTTTCGAGAGCCAATCATTTGAGGGCTCGATCACGTCTCTCACTGTTCAGCTACAACTAAATTTagagattatttattaaatgctttaaacgctggTGAACACATGACATCAAATAATGTCAGACCccatatgtgcatgtgtgtgcgccTATAGAATGTGTAGGTctcaaaccaaaataaataaataaatagcctttGTTTGAGCTAGCAGATCTAAACAGTGCCATGCACAGACAATGTTTATGCAAACGCAGATATGTACATTCTGGCTACTGACGGCACAAacaagcatgtgtgtcaaagcTGGCACTGGTGTCTcctaaaaaacatgtaaaacactTCTTATGGACTTTCgtgcacacatttatatacaaagCACAACAGCCTCCCCCCCACCCCAAACCACTCCTTGCCCAATTACGTCGCACCCCCAAACATCTCATTACTAAAAGAGGTCTTTACGCCCTATTACCCATGATTCCAGACTAGCAGGGGCCACTGTCAGTCTGAGGGACAGTGATACGTGTTGATCCACAGTAAGTCGTCCAGCACCCCCCAGTGTAGGTACAGTATGGACACCACCACCAGCACATGCATGATCTGGTGGCTGTTGCACCAGTAGTCAAAGAGGCCCGGGCGGAAGCGCTCGGGGATTCGCGTGATATTGATGACACCGCCCAACACCGCTAGTGCATCCATGGTGAGAAAGTGACGCAGCGAGGTGGGACTTCCTCCGCCCACACCTACCCAGCGCAGAAGGAAAAATGAGAAGCGGAAAAGCGCCTGCCAGGCGAAGGAACGCAGACGGCGCACTCTGCTGCGAGCTGTGATGGCACAGTAGATGGCGTAACTGGAGAGCAGGATGTACATCAGCAGAGCCACTGTGCGGGTGAAGGGGTAGCAGAGAAGAGTGCTGTACACGAT
>TU28248
gtcAAACgagacaatttaaaaatataaacctcAATTTATTGCACAATTGCTGCAGGAGACCGTGGGGTTTGGAAGATCTGTCTTGTGTGAACAAATGTAACCGTGGACACACAAATAGACTGAGAGAGAAATATAGgcccataaaacaaacaaacagtgacACACGCTTGTAGATGAAACCATTTACAACaagaaatgtttatgtaaaaccAAAGTTATAGTAACTTTTGCAATAAATGAGTTGAGGACAcctaataaaacaacagaaaacaaagatACACGGCCAGCGGGGCTCAGTTCATCCAGGTCAGCTCGGTTTAACTGAACATCATTTATGCCGCTACCGACTCATAAAGGTCAATAGAGCGCTGTGGCCACCAGATGGTGccaaaaaacaaccaaattcaacaaaaacacacgAGCAGGAgcggaaacaaaaaaaacgacagATCTTTCAGAGACCTCCCGTCTTCCTCTGTGCATTAGTATTCTCAGCCTTTGTACTTAAATTAAGATTATCATTGATAGTGGTAACCCATCTcagaataatagtaataataacaatatatccattatcataataatgcaaaatgtaacTAATGATGAGtagtttttaaattatcattaacAGGCTATCCAGCACCTGCatactaagaaaaaaaaggtattatAGTTTCATACAtcatgtcattattattatttttttttttttaccacaggACATTAGAATATACAGACAGGAGAACATCATCCATGAGAATATCATCCTTGTTCCTCCTCTTAAACATGGGTTATGATGCAATCCATTTCCTTTAGGGCTCAATGTAACATGCTCTGCACATTCTCACATCACCTAACTAACTACATGAATAAACACATTCTTGATCAGCATTTACGGACACATTCGGCCCCACGAAGGCAATATGCATCAAGAAGGATGCACAGTTCAAATGCCTGATGGCTGACGAGCCATCGCGACCTTTGCCCTTAAAGACATACAACTGTCATCGatttttttcagtcttcagtttTAACCAGAACAAGCAAAGAAGACATGACaggatgaaaagaaaactgGCCCGAAATCAGTTGTTGAGGTCACTCGGTACAAGTGAGCACTGACAGGGCACCCTGAGAAGAGGAAACCCCAGGATGGCATGGTCTGAGCAAAACATGTTGGTGTGAACACACAAATCTGGTTCTTTTCAGGACTGGTAAAACATCTTGTTTTTGGAATTCACATGTACAaacatgtttctgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtacatATTTCGATTATGCATAGTTATCCAGTGGGTTTCAGAGGTAATAACATATCAGGACCCCCGTTTTCCAAACCAAAACATCTGTATGCCTCTCTGTACTtctcataatataaaaaaaaaaagaaattctacCAACCAAACTATATTACAATCCCTTCTAAACAGTTTAAAAACCGAAGACCGCGTTAATGACATTATGACATCATAGTAGTACAGACATATTATTATGACGTTAACCCTACTAAATAATCTAACAGCATTGTTAACTCTCCTGCCAGGCCTGTCATTGTGATGTCACAATTTTAGCTTTTTACAGATACAGAATGATCGAATCACTGCTGCCTTTGAAATGAAATCGGACAATTCATATTGAGTGTCGCTCTCTGAGATGAAATACGTTAACATTCAATATATCTTCTTATAACATTGttgctttatatattaatatgaatatataaaaatgtcagtaTGTATGCCGCttgcattttatgcatatacAGTCTACATACAGGTATTTACGTTACCTATATGGACTTTTTAAGTTCTTAATTGGTTTTCACTTTGATCCAAAGCCcttttggtaaaaaaataaacagtgcagTTAATTATTTGATATGGTAGTATTGCCTCTGGGCTGCTTTCTTGATTTCATTCCACTTCTAAAGACAGATATATTTGATGCATTAGCTCCGTTACTGCACATTAAGCACATATGTCAGTGGATGCATCGCGCAAGCATTAGGAATCGCATGTTGTGTTTTAAGGGGATTGGTTTACTAATATTACATGCACCACTTGATTGCAGAGTCTaatgtttatcatttaataGCATTAAAGGGGTCTGGGTAAACGTTCCCCAATTCTGAGGGACTATAGTGGTTTGCTTTTAAAACCACCCTGGTCTGCTAAGATCAGGACCGTCGTGCTCGACACCTGAGGCCCTAACACATCTAATTTGGCATAGAGTATGTGTAAGTGTTTGTCAGATACATCTGAGCAACATTCTACCTAACATGCACTGGTTCTACACTAATAGGTCTGATCTCTCTAGAGTACTGTAGTTGTGTAAAGACACATGATCCCCAACTGGTTAAAatgatacataaatattaaaaaaaaaacagtagtggtagcattaaaataaaatcttcaaaCATTGACAAATGTCAAAGCAAcaatctaaatataataaataatgatatggAGAGTGAGTAATTGAAATGAACGACCGGCCTCACTAAAAGTGTCAGTCAAGTGTCAGTGTTATTTGTTTGTCAGTTCTTTAAAACTTGTGAGCATGGAAGGGTTAAAAGTGTCATCCTTGGTTTGTTTTGATCAGTAGTATATTAGTGTGCAAAGCtaataaatccaaaaacagCATAATACAGCTGATTTGGAACAACGTCTCCATAGTGCAATCTGCAATAAGAGCTGTTTTAGTTTATGTTTATCACATTCTaaagtatatataaagtttAGCTTTAGTCTCTAAACAGCTCTGTTAAACCTGAAGTCTTTTGGCAACTCTTCTTAAATCGGAGGGGTCATTATGAATTATATCCAATCAAGTTCATCCTATTACCGGGGACTTAAATAATCTGCATGTATAGCATTAATTTAGCACAAGTGAGCAGTACCAATAATCCCGTAGTCTTCATTGGGGAATTCATAGTGTATTGGCATGCGTAATATTGCTCCATTCTGGAGTCTAATATTCATCTGCCACATCTGATGAGCGGGAACATCAGGTGCACAGTGGACGAGGATGGCCAGCAGAGAATTGAAGCCTTTGTGCAAACAGCACGccattaagaaaataatttgcCTTGTCTCGAATCCAAGGTTACATAGATAATTGAGGTTAAAGGTCAGGAAGAAATGAAATCTAATTTAGACCGGTACAAAGTCCAATCTTCCAAACTACAGATTAGGATATTAAAACCGCGAGTGTACGAGGCTGAATCGTCTGTTCTGCGGCACAGCAGAAACAATATGTTCTGCAGGCAACGTCAAATGCTTCCCAGGGTATTATTAAAGTCATGCTCCTGTTAAAAACCGCACTGAATGAATGCCCCTTAGATGTTAACAAACATGATCAAAGTCACAGAGGgcgctaaaaaataaaatgggcACTCAGCAACTTTAACCAGCCAGTAAACGTAAAAAATGGCTAGGCTACAAACCAAGGAATGATCCCTTCACCCTTCACTTACAGGTATCGGAGTGAGAATGTGGGAAATGTGGACCTGAACAGagagacaacaaaaaaagtgtgataaaacaagtaaaaatcaACTCAAGTATTTCCAGTAAATGTTGCTCTCAGACCTGGGCTTACagtacgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtggtcttaGCACTGCTGTAACATCTGATATGCTGCATAGTCTGCAATAGAGTAATAAGTTAAAAGTTGGAGGTGCATACATCATTTCTGCACCGGTGATCTTTGTTTGTCACCAGCAAAATAGAGATAAACTATAATTAGTTTTCGTAAAAGCCATGCTATTTTGTACAACGAATTTCAGATTACGCGATGCGTAAAATCTTACTTTTCGAGAGCCAATCATTTGAGGGCTCGATCACGTCTCTCACTGTTCAGCTACAACTAAATTTagagattatttattaaatgctttaaacgctggTGAACACATGACATCAAATAATGTCAGACCccatatgtgcatgtgtgtgcgccTATAGAATGTGTAGGTctcaaaccaaaataaataaataaatagcctttGTTTGAGCTAGCAGATCTAAACAGTGCCATGCACAGACAATGTTTATGCAAACGCAGATATGTACATTCTGGCTACTGACGGCACAAacaagcatgtgtgtcaaagcTGGCACTGGTGTCTcctaaaaaacatgtaaaacactTCTTATGGACTTTCgtgcacacatttatatacaaagCACAACAGCCTCCCCCCCACCCCAAACCACTCCTTGCCCAATTACGTCGCACCCCCAAACATCTCATTACTAAAAGAGGTCTTTACGCCCTATTACCCATGATTCCAGACTAGCAGGGGCCACTGTCAGTCTGAGGGACAGTGATACGTGTTGATCCACAGTAAGTCGTCCAGCACCCCCCAGTGTAGGTACAGTATGGACACCACCACCAGCACATGCATGATCTGGTGGCTGTTGCACCAGTAGTCAAAGAGGCCCGGGCGGAAGCGCTCGGGGATTCGCGTGATATTGATGACACCGCCCAACACCGCTAGTGCATCCATGGTGAGAAAGTGACGCAGCGAGGTGGGACTTCCTCCGCCCACACCTACCCAGCGCAGAAGGAAAAATGAGAAGCGGAAAAGCGCCTGCCAGGCGAAGGAACGCAGACGGCGCACTCTGCTGCGAGCTGTGATGGCACAGTAGATGGCGTAACTGGAGAGCAGGATGTACATCAGCAGAGCCACTGTGCGGGTGAAGGGGTAGCAGAGAAGAGTGCTGTACACGAT

Function

symbol description
paqr4a Predicted to enable signaling receptor activity. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human PAQR4 (progestin and adipoQ receptor family member 4).
paqr4 Predicted to enable signaling receptor activity. Predicted to be integral component of membrane.

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU28247 True 4837 lncRNA 0.32 2 11289747 11294605
TU28248 False 4790 lncRNA 0.42 2 11289747 11294605

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cldni LOC107729510 coding upstream 8006 11278737 ~ 11281741 (+)
mybpc2a mybpc2,LOC107729557,LOC107687621,LOC107680879,LOC107732898 coding upstream 283113 10978149 ~ 11006634 (+)
akt1s1 akt1s1,LOC107729505,LOC107687628,LOC107551160,LOC107732888,LOC107577586,LOC107564011 coding upstream 335018 10948678 ~ 10954729 (+)
LOC122341641 LOC107729475,LOC107687632,LOC107551163 coding upstream 404124 10874237 ~ 10885623 (+)
ifi35 LOC107729476,LOC107687635,LOC107551164,LOC107680855,LOC107561363,LOC107732881 coding upstream 468800 10817730 ~ 10820947 (+)
prf1.9 LOC107729509,LOC107583107,LOC107658427 coding downstream 10720 11305325 ~ 11308557 (+)
prf1.1 prf1.1,LOC107658428,LOC107583105,LOC107729447,LOC107732857,LOC107674141,LOC107564016 coding downstream 14077 11308682 ~ 11313369 (+)
si:dkey-66i24.7 si:dkey-66i24.7,LOC107674138,LOC107732877,LOC107658448,LOC107563999,LOC107729523 coding downstream 49664 11344269 ~ 11345934 (+)
si:dkey-66i24.8 LOC107658431,LOC107583056,LOC107729444,LOC107732851 coding downstream 68378 11362983 ~ 11367115 (+)
clec19a clec19a,LOC107658453,LOC107583104,LOC107736754 coding downstream 113432 11408037 ~ 11413269 (+)
G18932 ppp1caa,pp1g,LOC105897688 non-coding upstream 18641 11270202 ~ 11271106 (+)
LOC122336311 NA non-coding upstream 96752 11189556 ~ 11192995 (+)
LOC122336295 NA non-coding upstream 126840 11161878 ~ 11162907 (+)
LOC122342197 NA non-coding upstream 127304 11162354 ~ 11162443 (+)
G18903 syt3,LOC107680842,LOC106593647,LOC107551154,LOC107563990 non-coding upstream 179322 11108748 ~ 11110425 (+)
G18982 NA non-coding downstream 76897 11371502 ~ 11375401 (+)
G18946 smg1,LOC107729485,LOC107583093,LOC107658410,LOC107732845 non-coding downstream 85668 11380273 ~ 11380790 (+)
G19123 NA non-coding downstream 142339 11436944 ~ 11437197 (+)
G19126 NA non-coding downstream 145901 11440506 ~ 11441338 (+)
G19184 NA non-coding downstream 418004 11712609 ~ 11719579 (+)
kcna7 LOC106518874,LOC108237811,LOC102213725,LOC102789930,LOC102292646,LOC101488024,LOC100711099,LOC105891650,LOC107729520,LOC107097254,LOC107551170,LOC102237047,LOC107551147,LOC107732850,LOC107729474,LOC107561361,LOC107680852,LOC108434931,LOC108278793 other upstream 447240 10752759 ~ 10842507 (+)
LOC122333995 LOC107561345,LOC107732849,LOC107680844,LOC107729518,LOC107551149,LOC107690331,LOC107732905,LOC107561346,LOC107551141 other upstream 591207 10691890 ~ 10698540 (+)
G18574 LOC107568067,LOC107690317,LOC107733849 other upstream 1186286 10025818 ~ 10103461 (+)
hbbe1.3 LOC107596825,LOC107596828,LOC107674643,LOC107754023,LOC107587921 other upstream 1489951 9798815 ~ 9799796 (+)
G18491 NA other upstream 1539867 9739796 ~ 9749880 (+)
LOC122331261 cox6a2,LOC107564019,LOC107658449,LOC107674165,LOC107583062,LOC103367329 other downstream 39136 11333741 ~ 11335825 (+)
G18949 NA other downstream 74288 11368893 ~ 11369752 (+)
kcnc3a kcnc3a,LOC107693499,LOC107548332,LOC107729449,LOC108427388 other downstream 478595 11773200 ~ 11833924 (+)
syt5a syt5a,LOC107658481,LOC107583026,LOC107730742,LOC107548337,LOC107689676 other downstream 591050 11885655 ~ 11893656 (+)
prr12b prr12b,LOC107689691,LOC107729421,LOC107583015,LOC107658420,LOC107554076,LOC107730729 other downstream 732544 12027149 ~ 12049422 (+)

Expression


Co-expression Network