G20915 (LOC107550314,LOC107703374,LOC107719177,LOC107565769,LOC107741796)


Basic Information

Item Value
gene id G20915
gene name LOC107550314,LOC107703374,LOC107719177,LOC107565769,LOC107741796
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 17553374 ~ 17563364 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU31072
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Function

NR:

description
PREDICTED: interleukin-21 receptor-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU31072 True 9480 lncRNA 0.37 3 17553374 17563364

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
hs3st2 hs3st2,LOC107741797,LOC107550309,LOC107574133,LOC107703334,LOC107674621,LOC108433116 coding upstream 103882 17423288 ~ 17449492 (+)
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LOC122341850 LOC107727127,LOC107674682,LOC107745580,LOC799265,LOC108433148,LOC105013234 coding upstream 455409 17089814 ~ 17097965 (+)
litaf litaf,LOC107727125,LOC107703380,LOC107674718 coding upstream 508082 17043049 ~ 17045292 (+)
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baiap3 baiap3,LOC107719179,LOC107550313,LOC107703313,LOC107674731,LOC107565767,LOC107749910 coding downstream 15376 17578740 ~ 17622221 (+)
gpr146 LOC107565765,LOC107710650,LOC107674685,LOC107703371,LOC107550312,LOC107719180 coding downstream 95070 17658434 ~ 17668692 (+)
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unkl unkl,LOC107550311,LOC107674636,LOC107565763,LOC107710649,LOC107703366,LOC106601098 coding downstream 128542 17691906 ~ 17715622 (+)
G20908 usp31,LOC107703377,LOC107550315,LOC107674671 non-coding upstream 36945 17503896 ~ 17516429 (+)
G20803 NA non-coding upstream 444680 17107992 ~ 17108694 (+)
G20831 NA non-coding upstream 477200 17075788 ~ 17076174 (+)
G20830 NA non-coding upstream 477799 17075353 ~ 17075575 (+)
G20829 NA non-coding upstream 478550 17074622 ~ 17074824 (+)
G20927 NA non-coding downstream 8766 17572130 ~ 17572473 (+)
G20953 NA non-coding downstream 87403 17650767 ~ 17651301 (+)
G20951 h3f3b,H3F3A,LOC105909691,LOC101073377,LOC107388308,LOC102790198,LOC107572204,LOC106578873 non-coding downstream 126051 17689415 ~ 17690288 (+)
G20994 NA non-coding downstream 298703 17862067 ~ 17863081 (+)
G21045 NA non-coding downstream 416803 17980167 ~ 18067318 (+)
LOC122341316 NA other upstream 352744 17137930 ~ 17200630 (+)
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micall2a micall2,micall2a,LOC107703317,LOC107745593,LOC107568921,LOC107674716 other upstream 768563 16770545 ~ 16784811 (+)
LOC122331507 psmg3,LOC107703392 other upstream 853892 16690703 ~ 16699482 (+)
gna12a gna12,gna12a,LOC107703403,LOC107753491,LOC107674729,LOC107758336 other upstream 1345528 16179620 ~ 16207846 (+)
G20950 igfals,LOC107703367,LOC107719182,LOC107674637,LOC107565761,LOC107710645 other downstream 155818 17719182 ~ 17723423 (+)
mrtfbb LOC107725018,LOC107572174,LOC107703365,LOC107674669 other downstream 306813 17870177 ~ 17901491 (+)
polr3k polr3k,LOC107703329 other downstream 341220 17904584 ~ 17906643 (+)
si:ch211-66e2.5 si:ch211-66e2.5,LOC107572173,LOC107703361,LOC107596817,LOC107754045,LOC107735828,LOC107674574 other downstream 357553 17920917 ~ 17929634 (+)
LOC122341796 pde6g,LOC107690252,LOC107733865,LOC107685924,LOC107590586 other downstream 510711 18074075 ~ 18075616 (+)

Expression


Co-expression Network