LOC122330144 (tob2,LOC107572283,LOC107691089,LOC107745517,LOC107734722,LOC107672913,LOC107563731)



Basic Information


Item Value
gene id LOC122330144
gene name tob2,LOC107572283,LOC107691089,LOC107745517,LOC107734722,LOC107672913,LOC107563731
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 1693056 ~ 1700663 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043226996.1
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>XM_043227003.1
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>XM_043227012.1
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Function


symbol description
tob2 Predicted to enable transcription corepressor activity. Predicted to be involved in regulation of gene expression. Predicted to act upstream of or within negative regulation of osteoclast differentiation and positive regulation of ossification. Located in cytosol.

NR:

description
PREDICTED: protein Tob2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043226996.1 True 3721 mRNA 0.46 2 1695222 1700663
XM_043227003.1 False 3620 mRNA 0.46 2 1693056 1700663
XM_043227012.1 False 3696 mRNA 0.45 2 1694985 1700663

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122329645 NA coding upstream 113235 1567345 ~ 1579821 (+)
cdc42ep1b LOC107579628,LOC107711548,LOC107711549 coding upstream 127114 1558351 ~ 1565942 (+)
LOC122329718 LOC107575253,LOC107595184,LOC107748256,LOC107740842,LOC107718680 coding downstream 10632 1711295 ~ 1727693 (+)
LOC122332958 NA coding downstream 27707 1728370 ~ 1729997 (+)
LOC122330213 plbd1,LOC107563730,LOC107572281,LOC107672894 coding downstream 166961 1867624 ~ 1870610 (+)
LOC122333258 LOC107575253,LOC107595184,LOC107748256,LOC107740842,LOC107718680 coding downstream 225084 1925747 ~ 1941793 (+)
rangap1a rangap1,rangap1a,LOC107745514,LOC107722837 coding downstream 302016 2002679 ~ 2010431 (+)
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G15967 NA non-coding upstream 277857 1414215 ~ 1415199 (+)
LOC122330682 NA non-coding upstream 308162 1383248 ~ 1384894 (+)
G16027 LOC107691092,LOC107572810,LOC107722836 non-coding downstream 70094 1770757 ~ 1979709 (+)
G16028 NA non-coding downstream 76323 1776986 ~ 1989269 (+)
LOC122330751 NA non-coding downstream 124127 1824790 ~ 1826317 (+)
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trnar-ccu_1 NA other upstream 42328 1650656 ~ 1650728 (+)
G16003 pick1,LOC107734822,LOC106607154 other upstream 43562 1559387 ~ 1649494 (+)
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LOC122330032 LOC107674481,LOC107727039,LOC107711806,LOC107563760 other upstream 284130 1395847 ~ 1408926 (+)
G15955 NA other upstream 300206 1390739 ~ 1392850 (+)
trnar-ccu_2 NA other downstream 165050 1865713 ~ 1865785 (+)
G16222 LOC107751969,LOC107745511,LOC107572814,LOC107672897 other downstream 323685 2024348 ~ 2320138 (+)
G16223 txn2,LOC107745512 other downstream 411374 2112037 ~ 2114339 (+)
LOC122333054 LOC107708263,LOC107691115,LOC107755610,LOC107563748,LOC107672908 other downstream 459683 2160346 ~ 2165693 (+)
G16347 NA other downstream 867421 2568084 ~ 2568999 (+)

Expression



Co-expression Network