cacnb1 (cacnb1,LOC106607253,LOC108413880,LOC107670911,LOC107689043,LOC107552492)


Basic Information

Item Value
gene id cacnb1
gene name cacnb1,LOC106607253,LOC108413880,LOC107670911,LOC107689043,LOC107552492
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 20254824 ~ 20284900 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
cacnb1 Enables voltage-gated calcium channel activity. Acts upstream of or within muscle contraction and voltage-gated calcium channel complex assembly. Part of voltage-gated calcium channel complex. Is expressed in several structures, including basal plate midbrain region; hatching gland; musculature system; nervous system; and polster. Orthologous to human CACNB1 (calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 1).

NR:

description
PREDICTED: voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1-like isoform X3

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LOC122341338 LOC107567476,LOC107754244,LOC107690310,LOC107653556,LOC107731194,LOC107570937 other upstream 185571 20064270 ~ 20069253 (+)
ypel3 ypel3,LOC106600728,LOC103040367,LOC107686999,LOC107590566,LOC107567778,LOC105012807,LOC104942727,LOC108259066 other upstream 851648 19399408 ~ 19403176 (+)
G21213 NA other upstream 962483 19291445 ~ 19292341 (+)
LOC122337427 ngfra,LOC107661207,LOC107708544,LOC107689096,LOC107568444,LOC107566195 other downstream 597298 20882198 ~ 20956574 (+)
G22087 taok2a,LOC107755091,LOC107590788,LOC107684637 other downstream 1010802 21295702 ~ 21414286 (+)
crhr1 crhr1,LOC107662410,LOC108261365,LOC108413653,LOC107754311 other downstream 1352843 21637743 ~ 21734127 (+)
G22301 LOC107683684,LOC107754312,LOC107585098,LOC107662430,LOC107740676,LOC107582950 other downstream 1690352 21975252 ~ 21976665 (+)
wnk4b wnk4b,LOC107585056,LOC107662403,LOC107740640,LOC107683678,LOC107582920,LOC107754305,LOC108429078 other downstream 1691609 21976509 ~ 22025911 (+)

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