LOC122342092 (LOC107758479)


Basic Information

Item Value
gene id LOC122342092
gene name LOC107758479
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 12322244 ~ 12332841 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043235875.1
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>XM_043235876.1
GTTTGCGCCGAGCTGGTGTCTGTCTGACTCAGAGAACATGTGAAGAGCAACAGatataaacagcacacacaTCGATCAATGAAAGGACAGAAATGCTGAGAATGCTCCTTGATTTTATacttgTCATGGTTTTGCATAACGACCTGGTTACTGGAACTCCGTCCGCCAGACTGATGAATGGTTTAGATGGCTGTTCAGGAAGAGTTAATGTCATTACTAACACACCGTGGACAGTGTGTGGTGACTCCTGGGACATTAATGCTGCATCTGTGGTGTGTAGAGAGTTGAGATGTGGAAGAGCAGTTATTGCAGATAGCCTGGCTCTTTTTGGGGTAGAGGATCGAAACGTGAGTACGATCAGATGCCAGGGGGATGAGTTATCCATCAAAGAGTGCTCTTTAAAATGGACTGAAAATAATTGTTCTCAGAGAAATGCTGGAGTCATATGTTCAGGTATGAGCATTTAAATTTTCCCttgattaaaattgtaattttcaaGAGTGCTGGTGTACACCGTGATCTGTGATAACAATCTTACAGTACAATATCAGTTGCTAGAACTTTACCGTAAGAAATGCGGTACCAACATTTTACAGGCAGGTTTTATGGACTTAAAGTCacagtaaatttttttttacagtaataaaattatatattattacattgtaTACGTAACTAGTATAGTGGtaagaaaatagaaaaacacatttcaaagtactaatatttgttttatactagtgtaatacactgataaccCCTAAAGTCAGGTGGTCATGAGGAAGTCACATGATAAATCATAATTGGCTAAGGAGGGAATACTAATACAGAAGGTGCacacagtgtcattcacacaaacgcTAAACACCACCATGGTAACaaaaatgatactaaaatatcaTTGTTTCTGCTGGTCAAGTCAGCAAAACTGCTTTTCCATGAGTGAAACCTATTGTACATAGGGAATTATTCCCTCATGCGAAAATCCTGTGTGACCAGACCTTGATGCATGAATAATCTATTAAAACAATTAGCTGAAAAATATGGGATCATTCAGCCGTTCTGAGGATAGGGTGCACTCttgttaatgcattatacaCCTTTTCTTCAGCTTCTTCAATTATTATCATTGGTGCTGTGGTCACAGCTGTACTGTTCATATTGTCTGCACTGATAATCATTTTCCTGGTGAGGAGGAGacgaaaacaaaagaaaatccaAATATGCTCTAATTCAAAAGATGCTGTTAATATGCGAGATGTGCTCCACAATAACCAGAATGAAGACGATGCTGAGGATGACTATGAGGTTGTAGATATGGATGATAGCGCTCATGAAGATGTAAACTCTGACTCTGATCAGGATTATGTTAATGTAGATCAAAATGACTCTGAACCGGACTACGTCAATGTGGAAACAGACGATTCAGATTCACAAGACTATGTCAATGTCGATATTACAGAACACAGAAGTTCACTGCGCAATAACTGAAGatttatgaaaatgtgaattattcattatatcTAATAAGCATTGTCCAGATATGAATTGTTCTTTGTATATGAAGAGAACAAAGACTCTTCGGTCATTATTAAGCACTAACATTAAATAAGAGACTCGTGAATTCTCTGTAACGTGAATCAGAATTCTCTTTTCCTGTTGTGAAGTATCAGTTTGTCTACTTCGCTGAAAATAATGGCACTTGCAAATTAGCAGTTGTTAACAGAGCTTTGGCAACaagtatgaatatttattagtaGTGTTTTTGACAGCAAGAAATAAGGAACCTCATAGTGTGACACAACTTCCCACAACCCCTCTGCTGTATGTCTTctctcgttttttttattttaagacacCTGGTAACGAGTTACTGATACTTTGTGATGTATGCCTTTTATTATGAGTGCCCACTGGGTACctgaataattttatttaaattaaaatctgttaaaGCAACATTTAATATGTTTGTAGAGTTTCCTCTGAATACAACTGCCAGAGTCTCTCCACTTCCTCAAATCGACCTCAGAGCTAAATCAAAGTATTAGCATACTCAGAAAACAGCTATTcttcaatgttttaaaaatgcatctggCTAATCAGGAAAATGAAGCGGAAATCCAGCTGAACGCAACTCTTTAACTCCATTTCAGAGTACTGCATATctgatgtggtttcttaattcCCTTTTGCAATTTCTATCACATGTAAACAGTTTCACTTCTTTGCATGAGATCATTTAATAGTTTGCATATGAAGTCATTCCATCACTCCTTCTTCTACAGATGCGAACTAAACAAACTCTAATATGTCATTTGAAGCACTATACAGCATACCAGCTGGGTCCTGAACTCCCCATGAAAAGAGTGAGGGTCacattttactgatttttagCACTAAGCAATATTTTagaccataaatatatttagaccataatcatatatatcataaaagGTGCTGTCTTCATATACAGACTGTTTAATGGGCAAGTGCAGCATTTATGTTCATTCACAGCTCAACctttaaatacaacataaatacAAAGTTTTATTCACACATTCAAACAATTTATGGTGTAAATTACAgtgtatgtaatgtaaaaaatgtctttttttaggaaaaaattGAAAGTTAGCCATAAGTGTGCATAGTAAAAGATTTATTTCTCACATTTATGGGCCAAGAAGTATGCTTTTGCTTTTGTATAgatgtttgctttaaaatagaaatcaattAGAATCTTGGCTAATTTATAGTCTTCTAAGAAACAGTGAGTGATGAGTTTAAAGAGTTAGTTAAAAGTAGTTGAAAGGGCTGTATATTGCTCAAGTTTGTCGTATCATTGTGAATTTCTCTTCGTAATGCAATTCTTGGAAAGAGGTTGGGTAAAAAAGGGATGTTTAATTTgattgaaaaatgcattttttaaatagctaaaaAGGGAAGTGAATTGGCAAGTTTGCAGTTTTGGTTCAGAACATCTTAAGTGCATTTTGAAACAACACAATGTCAAGACCTTCTCTTCTCACTCTGATAATagCCAGTGCTCTTTCTGTTGCAGCTGGAGAAAATAGTATCAGACTGGTGAATGGTGCAAATAACTGCTCTGGAAGAGTGGAGATCCTCTATAATGGCCAGTGGGGAACAGTGTGTGATGACTCCTGGGACATGAATGATGCTGCTGTGGTGTGCAGACAGCTGGGATGTGGAATAGCTGTAAGTGCACATGGCAGTTCTCATTTTGGCGAGGGTAGTGGTCAGATCTGGCTGGATGATGTGGAATGTTCAGGAAGTGAATCATCGCTCACGCAGTGCTCACAGCTTTCTATTGGAAAACATAACTGTGAACATTCTGAAGATGCAGGTGTCGTCTGCTTACAAGACGTAAGATTGGTCAGTGGGTCTGATTCATGCTGTGGGAGAGTGGAGATCCTCTATAATGGCCAGTGGGGAACAGTGTGTGATGATAACTGGGACATGAACGATGCTGCTGTGGTGTGCAGACAGTTACAGTGTGGATCAGCCATCCGTGCACCTCATGGAGCTGCCTTTGGTCAAGGTAGTGGTCAGATCTGGCTGGATGATGTTGAATGTTCAGGAAGTGAAGGAGCCCTCAGACAGTGTTCACACAGTGGATTAAAAAAGCATAACTGCAATCATGGTGAAGATGCTGGTGTTGTATGTTTAGgtGAGCTGCAGATGCCGACCTTTTCCTTGACCTCAGTACATGCAGCCGTTTCTCCTGGAGAAAGCGTCCAGTTCAGATGCACAGCACCTAAACCTAGATGCAACACTACTGCTGAGTTCCAGCTCCTCAGAAACGGACCGCCTGTATCCTCTCAGACACACGAATCAAGTGTGACTTTCAACCTTTCTAATGTAGACGTCTCTCTTCAGGGCAGCTACAGCTGTCTTTACTCCTACCTAAACAACGCTGTCAAATCACCTTTCAGCAGCATTATTACCATCACTGTGGTGGACTTGCAGAAGCCCAGCATTTCTCACAGTTATCCTGACGGGTCTCAGGGGCCGGTGATCACCAGGGGCCACAGTTTCACTATCATCTGTTCAACTCAATCTCAGCATCCTGGAGGCTCTTTTCTCCTGTTCAGAGGATCAGACATCACCGGGACTGAGTCAGATGTTAATCTCTCTTCCTCCTTCTTCTTTCCTGAGGCAGATTACTCACACGAGGGAAACTACAGCTGTGTTTATGAAGTCAGTGTCTCCTCTCGCTCCTTCCGTTCATCTGCCTCTGATCTGCTGCTCATCACTATCACAGcCTCCCTGCTTCCTGTCATTGGTGCTGCAGTGTCAGCTGTGCTGCTCTTGTTGTCTGGTCTCATAATCTTCCTCCTGCTCAAGAGAAGACGACAGCAAAGGAACACGGAAACAGTCTTGAAGTTCTCCTTTAGAAACGGTACGGATAATACATATGCAGGTGCATCACATGGCAATAAAAATGAAGAGGACGATGAGGATGATTATGAAAATGcagaactgtattttaaaaacaataattgtgATGATTCTGAAGAGGACTATGTCAATCCAGACACATATGACTCTGAAGAGGACTATGTCAATGCAAAGGAGAATAAAAGTGTGCTAGAGAAATctgatgaaaacatttatgaaagcTATTGTGATGAATACTAGTAGTTTGTAAACTACTAGAATTAATAAGTCTAAAGATGACAGTGATTGATATgtaaatagagtaaaaaaaatctttgttcgGCTtcactttcttttaaaaatgaggATTGCTTTGAgataaagaaatatagaaatgtgCATATTATACAGCACACATACTACACAGTTTTCTGGCATATATACGTcaaatgttgaaaaatgaataaaagcaatGTAATATCAGTAGCAGGAGGCTATGAGTccacacttttaaaagtgtaattttagcTCCAAGATGGAGGGAGTCATGTATACATTTCAGGAGTGTTAAATTGGACTCAAATTGAGTTCTTTGTTCATTGTGTGGTCAGTGTTcatgtaaaacaataaataaataaatacacaaaacaatgtgtttacataattttttttttttatttcccctGCACCAAAATATCTTCACATGCAGTGTTTTTAGCACATGTAAAGAAGTAACAACAATTAACATAATGctaaagaaaatcaaaatacatATACTTATTTGGTACATatatgtcacgtctttggactttgttattgtttctgtctcatgccatgtgttccgtgtgacctaatttagtttattgtcttcagctgtgtgagttaatttagtcatttacccggtgtatttaagtcctgtgttttcagttctctttgtccgatctcgtccttATTTTCGTGTGGTTTTGTGCTGCCTGTACTTGTATAGTT

Function

NR:

description
PREDICTED: deleted in malignant brain tumors 1 protein-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043235875.1 False 4733 mRNA 0.39 12 12322244 12332841
XM_043235876.1 True 5388 mRNA 0.38 11 12322244 12332841

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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kat7a LOC107689642,LOC107554133,LOC107737751,LOC107729527,LOC107582986,LOC107658517,LOC108437993 coding downstream 34368 12279708 ~ 12287876 (-)
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G19518 LOC107729456,LOC107658501,LOC107582995,LOC107554123,LOC107689649,LOC107737759 non-coding downstream 91865 12226575 ~ 12230379 (-)
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LOC122332187 NA non-coding upstream 739719 13072560 ~ 13072828 (-)
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LOC122341756 NA other downstream 401477 11909775 ~ 11920767 (-)
G19383 NA other downstream 441285 11853748 ~ 11880959 (-)
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LOC122342093 LOC107583078,LOC107754431,LOC107583076 other upstream 6346 12339187 ~ 12343872 (-)
G19606 LOC107583095,LOC107690711,LOC107723203,LOC107571501,LOC107689702,LOC107737775 other upstream 289942 12622783 ~ 12679800 (-)
cacna1aa LOC107690704,LOC107571502 other upstream 349149 12681990 ~ 12763090 (-)
G19676 LOC107690708 other upstream 673155 13005996 ~ 13068190 (-)
G19700 NA other upstream 714200 13047041 ~ 13047494 (-)

Expression


Co-expression Network