LOC122332310


Basic Information

Item Value
gene id LOC122332310
gene name NA
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_025047688.1
NCBI id JAEQBD010000033.1
chromosome length 2000000
location 1793870 ~ 1816106 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043229631.1
ACTTTGTTCTCTGGAGCTCAGTGGTTCTCTGAGGTGTCCCACTCTCATGTAACCACTTCCCCTCGTTCCTGTCTGCAGACTTTCTCAGTTCAATCAGAAGCGCTCAAAATGCTGAACGGTGAGTGAGACATTCGTTTCTGCTGGCATGGAGGTTTTTCAAAAAAGGGTCCTGCATCTGAATTTGTGCATCCTTACTTTGCTGACCAACGCAGtgttttcttcagatTATTCCAGATGTAGTCCAGAGCTAAAGGTTCGTCAGCACATCAACAAAACAGTGTCTGTGGGGGAAACAGTTACACTTCACTGCAACAAAACCAAAGTTGATGATGATTTCGGGTGGAAGATGAACGGCTCTGTTATTTTTAGGCTGGTCTCTAATATGAACGTAACTAGAACAAACTTCAGCTCAAACAGGATTCACATCGACCCAAGATCTCCAGGAGAATTAATAATACATCAAATACAAGAGTCTGATGCTGGAAACTACACCTGCTTCCCAGCGGCAATGAGATGGACATTAACAGTCACAGACACAACCGGACTAGAAACACTCAAACAAATGTCCCTGcacatcttcatcatcaccatcTCATGTTGTGGAGTCATTATGGTCGGTCTGATAATCACTATCAGCATCTACATTCAACGgagctgtaaaaacaaaaaacaaagtcaCAGAGAAACGGGACGGGACTTTCCACAGCCACCGGCCAGAGGAAGGATACGGACTCAAAACAGTCAATACTTTGAAAGATACAATTCAGTTTATGGACAATTATGATCAATTGCattctttttgtatttcagaTTAACATAACcctaaaaattttaaatcttacCTTAGGTatctttaatacattaatacttAGCTAAACTGAGTAGCATACAATTAAACCGAATGTTTATGTCACATAACACTCATAGGGTATTAGTATATAAAATGATGATAGTATGTAAGAAAAAGCAAGCTATACAACGGGGACCCTCAAATCAGTTTAGCTCCAGCCCTGATTAAACTCATCTAAATATGATTTTcaaatgatcctgaagacaccgACTCacgtgttcatgtgtgtttgatcaaggttagagctaaactctgcaagaAAGTAGAGAGAGCCAGATATGCTCTACAGtgaatatgtattttgtctttACGTATTTGTGAGTACATGTTCATGTCAAAATACAACTCAcaatcaaatgtaattatacataattttgttgatttttttaataaacgtgTAATGATTTCATATGAATACTTGTCTGCCCTTAAGATTgaacaaataaattgaaaaaggGGAGTTAACTGAGAAACTACATCAACGCTTACACATCAATTACACCGAgtgtaattatgttttaagaTATCCATTGTTGAcagaaaatcaatatttttggcTTTATGTTATGCTTGTAAATCAAGTGATGATTATAAAGCACATAAGCAGTAAAGCCAGCTGTCCACAGTGAGTATACACAGGCTGgacaaaattaattattcaatgaTATGAATGACATTTCAGTATCATTTGACATTAgtcaaaaaggtttttaaaatcttaatctCAGATGTGAtagaatgccttctccaaatccacaaagtaCAAAACTCCCACGAACCCTCCAGTAGCCTGCAGACGTTATCGAGCTAGTCCAGTGTTCCACAACCAGGACGAAAGTCGCATTATTCCACCGAGATCCGAGGTTCGACTACCGGACAAAGGAGGAGCCACCATGTTGCAGAGGCATGTCAGCCAAGACTGGTCCACAGCATTCAGAGTGGATCTTATCCaaccctggtgccttgccaaaGAGGagcttcagcttgacggcattcCTTCCAGTGTCCACCACCAGCTTCTATTCAGCTTCATCCCCTGCCAatggatccaactcaccaccaggtggggatcagttgacagctacgcccctctcttcacccaaGTGTCCAAGGCATATGGCCGGGGGTCGAATgaaacaaccacaaagtcgattaCCAGAGTAGCGATGAGTCCAGCCcttttcgaggagatgggttccaaaGCCCGAGCTGCGTGTGGAgatgagcccgactatctctagtcGGTACCTCTCAACCTTCCTGCACTAACTCAGGCTTCTTCCCCCCCAGTGAGGTgacattccatgtccctagagCCAGATTCTGTGTCCGAGGATTGGGTCGCCAAGGTCCCCGCGGCTGCCGCTCAATGCACAGTGCACAGGCCCCTTACAGTCCCTCACACAGGAGGTTGGCCCCACGTAATGCACTATTTTGACATCTTTCATACTGGTCCTTAATAGAGTTATTTACCAAGCAGTCAATGGGAAAGTCACaaaggaaatatatttttatgaaagttTGCTACCAAAtcgttttgggtcaccattgacatCCATAGTGggacaaaaaaatactatggaagtcagtggtga
>XM_043229632.1
AAATAACTGACAACACTTTCTGCATTCCCTAATCCTCCGGTTACAGGTTGTGTGTGCATACACACTGGGGGGAAAGAGTTaatcatcatttaaaatcacttgtaaatgatttataactCCATCTACTAAACATAGacaaacatattaacatatgaattattaatcatCTATGAACACATCATTAAGTTTTGTAAACGATTAGTTCATCACTAACTTATCACTTATAAACGCCTTATATCTGGACGTTATTATAAAGTGTGACCTTATATTCTgtgtaagtattttttttgttcaatgcTCTTCCGTTTTATAAAAGCACGCTGTCTTTGGCGTTGCCCTCTGTGTCTTCTTCCTTTACTAGTTCAGACTCTATGGCACGTCTGCAAGATCCTGAGCGGACAGTAAGACAGATTAAACTCAGTCACAGACCCTAAACCCAGCGGCCTGTTATGGCAAATGTAGGAAAAACTTGTATTCTTCGTCTGGATCTCTGTGCTGTTATTATTGTCCTGATTCATGCAGatTATTCCAGATGTAGTCCAGAGCTAAAGGTTCGTCAGCACATCAACAAAACAGTGTCTGTGGGGGAAACAGTTACACTTCACTGCAACAAAACCAAAGTTGATGATGATTTCGGGTGGAAGATGAACGGCTCTGTTATTTTTAGGCTGGTCTCTAATATGAACGTAACTAGAACAAACTTCAGCTCAAACAGGATTCACATCGACCCAAGATCTCCAGGAGAATTAATAATACATCAAATACAAGAGTCTGATGCTGGAAACTACACCTGCTTCCCAGCGGCAATGAGATGGACATTAACAGTCACAGACACAACCGGACTAGAAACACTCAAACAAATGTCCCTGcacatcttcatcatcaccatcTCATGTTGTGGAGTCATTATGGTCGGTCTGATAATCACTATCAGCATCTACATTCAACGgagctgtaaaaacaaaaaacaaagtcaCAGAGAAACGGGACGGGACTTTCCACAGCCACCGGCCAGAGGAAGGATACGGACTCAAAACAGTCAATACTTTGAAAGATACAATTCAGTTTATGGACAATTATGATCAATTGCattctttttgtatttcagaTTAACATAACcctaaaaattttaaatcttacCTTAGGTatctttaatacattaatacttAGCTAAACTGAGTAGCATACAATTAAACCGAATGTTTATGTCACATAACACTCATAGGGTATTAGTATATAAAATGATGATAGTATGTAAGAAAAAGCAAGCTATACAACGGGGACCCTCAAATCAGTTTAGCTCCAGCCCTGATTAAACTCATCTAAATATGATTTTcaaatgatcctgaagacaccgACTCacgtgttcatgtgtgtttgatcaaggttagagctaaactctgcaagaAAGTAGAGAGAGCCAGATATGCTCTACAGtgaatatgtattttgtctttACGTATTTGTGAGTACATGTTCATGTCAAAATACAACTCAcaatcaaatgtaattatacataattttgttgatttttttaataaacgtgTAATGATTTCATATGAATACTTGTCTGCCCTTAAGATTgaacaaataaattgaaaaaggGGAGTTAACTGAGAAACTACATCAACGCTTACACATCAATTACACCGAgtgtaattatgttttaagaTATCCATTGTTGAcagaaaatcaatatttttggcTTTATGTTATGCTTGTAAATCAAGTGATGATTATAAAGCACATAAGCAGTAAAGCCAGCTGTCCACAGTGAGTATACACAGGCTGgacaaaattaattattcaatgaTATGAATGACATTTCAGTATCATTTGACATTAgtcaaaaaggtttttaaaatcttaatctCAGATGTGAtagaatgccttctccaaatccacaaagtaCAAAACTCCCACGAACCCTCCAGTAGCCTGCAGACGTTATCGAGCTAGTCCAGTGTTCCACAACCAGGACGAAAGTCGCATTATTCCACCGAGATCCGAGGTTCGACTACCGGACAAAGGAGGAGCCACCATGTTGCAGAGGCATGTCAGCCAAGACTGGTCCACAGCATTCAGAGTGGATCTTATCCaaccctggtgccttgccaaaGAGGagcttcagcttgacggcattcCTTCCAGTGTCCACCACCAGCTTCTATTCAGCTTCATCCCCTGCCAatggatccaactcaccaccaggtggggatcagttgacagctacgcccctctcttcacccaaGTGTCCAAGGCATATGGCCGGGGGTCGAATgaaacaaccacaaagtcgattaCCAGAGTAGCGATGAGTCCAGCCcttttcgaggagatgggttccaaaGCCCGAGCTGCGTGTGGAgatgagcccgactatctctagtcGGTACCTCTCAACCTTCCTGCACTAACTCAGGCTTCTTCCCCCCCAGTGAGGTgacattccatgtccctagagCCAGATTCTGTGTCCGAGGATTGGGTCGCCAAGGTCCCCGCGGCTGCCGCTCAATGCACAGTGCACAGGCCCCTTACAGTCCCTCACACAGGAGGTTGGCCCCACGTAATGCACTATTTTGACATCTTTCATACTGGTCCTTAATAGAGTTATTTACCAAGCAGTCAATGGGAAAGTCACaaaggaaatatatttttatgaaagttTGCTACCAAAtcgttttgggtcaccattgacatCCATAGTGggacaaaaaaatactatggaagtcagtggtga
>XM_043229633.1
ttaccagttaatagttaatatgtTACTAAACActtataaatcattaaaacttCAACATTGTACTATTATCTACTGACACGTGAGTAAATAACTGACAACACTTTCTGCATTCCCTAATCCTCCGGTTACAGGTTGTGTGTGCATACACACTGGGGGGAAAGAGTTaatcatcatttaaaatcacttgtaaatgatttataactCCATCTACTAAACATAGacaaacatattaacatatgaattattaatcatCTATGAACACATCATTAAGTTTTGTAAACGATTAGTTCATCACTAACTTATCACTTATAAACGCCTTATATCTGGACGTTATTATAAAGTGTGACCTTATATTCTgtgtaagtattttttttgttcaatgcTCTTCCGTTTTATAAAAGCACGCTGTCTTTGGCGTTGCCCTCTGTGTCTTCTTCCTTTACTAGTTCAGACTCTATGGCACGTCTGCAAGATCCTGAGCGGACAGTAAGACAGATTAAACTCAGTCACAGACCCTAAACCCAGCGGCCTGTTATGGCAAATGTAGGAAAAACTTGTATTCTTCGTCTGGATCTCTGTGCTGTTATTATTGTCCTGATTCATGCAGatTATTCCAGATGTAGTCCAGAGCAAAATGTTCGACAGCACATCAACAAAACAGTGTCTGTGGGGGAAACAGTTACACTTCACTGCAACAAAACCAAAGTTGATGATGATTTCGGGTGGAAGATGAACGGCTCTGTTATTTTTAGGCTGGTCTCTAATATGAACGTAACTAGAACAAACTTCAGCTCAAACAGGACTCACATCGACTCAAGATCTCCAGGAGAATTAATAATACATCAAATACAAGAGTCTGATGCTGGAAACTACACCTGCTTCCCAGCGGCAATTAGATGGACATTAACAGTCACAGAAAACCAGATCAGACCAGAATCAGCCAAACaaaccatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcatgtcaTTTTATGGACTCATTATGATCTGTCTGATCATCAGAATCAGCATGTTCACTCACAGGAAACTGAGGCAGGAAATCAACTCTGGTTCAGAGAATGTGGCGATGGTCTCAGACAGTGACCGACACACATTAACGGTCTGTGTCTACAGTCTTCACACAGCTTCATGAACGCGATCTTTTCTGCTCAAGTCAGTGTGTGTTCGTCTGACACCGATCAGATAAGCATTTCAATAAAGGGAGATGTTTATTAGTATGAGATTGTCAGTCATTTTTGactattgcttttttattgaatttgtcccaaaaatgttatttgattATCAGATTTCATATACTTCTAAATGCATGGGCCAGGGACATTGTACTAATTCAATTTCAATCTTTCCGacagtcatttttataatcTCATGTAGCCAGATTTTCAGACGGTGTTCGGTTACCAGGTTAAACTAAAATGGCTGCTCTTGCAATGCTCTTGTATTTTCATCAATGTAAGATTGCATTAGCTCAGTATGTATATCATCTTTAAAGTTTCAAGTGAGTGTCACAGATCGTGTACATGCACTTCATGTGCtttctgtattttactgtaGCTTGGTGGATCGAgttgtttctctgtttttagcTCTGCTTGGTTTATTCTTGTCAATCTTACTGCATCATCATGTGTTCAGCATCACGAGTGTCTCTTGTAGTACTCTGCTCATTACATAAATTCACTCCAAAAGTTTAACTAAAGGCATGGCTAATTTCAATTAGAAAATTATCAACTTTGCTAAggataaaaatgaatgcttaattaatgtaaaaacgAATGTAACTGCTTTGCCATTTACCAAACTgccattaaagacatttataaaatatcatatttttgaataacttattcaaacacttttttctGAGTGTATATGTTGTATGTAGCTACTGAATTCAGTATCAATTAAATGGATAATAGTGTGAAGTTATATCACATGATCTATTATATTGcttttgcttta
>XM_043229634.1
CACTCTCATGTAACCACTTCCCCTCGTTCCTGTCTGCAGACTTTCTCAGTTCAATCAGAAGCGCTCAAAATGCTGAACGGTGAGTGAGACATTCGTTTCTGCTGGCATGGAGGTTTTTCAAAAAAGGGTCCTGCATCTGAATTTGTGCATCCTTACTTTGCTGACCAACGCAGatTATTCCAGATGTAGTCCAGAGCTAAAGGTTCGTCAGCACATCAACAAAACAGTGTCTGTGGGGGAAACAGTTACACTTCACTGCAACAAAACCAAAGTTGATGATGATTTCGGGTGGAAGATGAACGGCTCTGTTATTTTTAGGCTGGTCTCTAATATGAACGTAACTAGAACAAACTTCAGCTCAAACAGGATTCACATCGACCCAAGATCTCCAGGAGAATTAATAATACATCAAATACAAGAGTCTGATGCTGGAAACTACACCTGCTTCCCAGCGGCAATGAGATGGACATTAACAGTCACAGACACAACCGGACTAGAAACACTCAAACAAATGTCCCTGcacatcttcatcatcaccatcTCATGTTGTGGAGTCATTATGGTCGGTCTGATAATCACTATCAGCATCTACATTCAACGgagctgtaaaaacaaaaaacaaagtcaCAGAGAAACGGGACGGGACTTTCCACAGCCACCGGCCAGAGGAAGGATACGGACTCAAAACAGTCAATACTTTGAAAGATACAATTCAGTTTATGGACAATTATGATCAATTGCattctttttgtatttcagaTTAACATAACcctaaaaattttaaatcttacCTTAGGTatctttaatacattaatacttAGCTAAACTGAGTAGCATACAATTAAACCGAATGTTTATGTCACATAACACTCATAGGGTATTAGTATATAAAATGATGATAGTATGTAAGAAAAAGCAAGCTATACAACGGGGACCCTCAAATCAGTTTAGCTCCAGCCCTGATTAAACTCATCTAAATATGATTTTcaaatgatcctgaagacaccgACTCacgtgttcatgtgtgtttgatcaaggttagagctaaactctgcaagaAAGTAGAGAGAGCCAGATATGCTCTACAGtgaatatgtattttgtctttACGTATTTGTGAGTACATGTTCATGTCAAAATACAACTCAcaatcaaatgtaattatacataattttgttgatttttttaataaacgtgTAATGATTTCATATGAATACTTGTCTGCCCTTAAGATTgaacaaataaattgaaaaaggGGAGTTAACTGAGAAACTACATCAACGCTTACACATCAATTACACCGAgtgtaattatgttttaagaTATCCATTGTTGAcagaaaatcaatatttttggcTTTATGTTATGCTTGTAAATCAAGTGATGATTATAAAGCACATAAGCAGTAAAGCCAGCTGTCCACAGTGAGTATACACAGGCTGgacaaaattaattattcaatgaTATGAATGACATTTCAGTATCATTTGACATTAgtcaaaaaggtttttaaaatcttaatctCAGATGTGAtagaatgccttctccaaatccacaaagtaCAAAACTCCCACGAACCCTCCAGTAGCCTGCAGACGTTATCGAGCTAGTCCAGTGTTCCACAACCAGGACGAAAGTCGCATTATTCCACCGAGATCCGAGGTTCGACTACCGGACAAAGGAGGAGCCACCATGTTGCAGAGGCATGTCAGCCAAGACTGGTCCACAGCATTCAGAGTGGATCTTATCCaaccctggtgccttgccaaaGAGGagcttcagcttgacggcattcCTTCCAGTGTCCACCACCAGCTTCTATTCAGCTTCATCCCCTGCCAatggatccaactcaccaccaggtggggatcagttgacagctacgcccctctcttcacccaaGTGTCCAAGGCATATGGCCGGGGGTCGAATgaaacaaccacaaagtcgattaCCAGAGTAGCGATGAGTCCAGCCcttttcgaggagatgggttccaaaGCCCGAGCTGCGTGTGGAgatgagcccgactatctctagtcGGTACCTCTCAACCTTCCTGCACTAACTCAGGCTTCTTCCCCCCCAGTGAGGTgacattccatgtccctagagCCAGATTCTGTGTCCGAGGATTGGGTCGCCAAGGTCCCCGCGGCTGCCGCTCAATGCACAGTGCACAGGCCCCTTACAGTCCCTCACACAGGAGGTTGGCCCCACGTAATGCACTATTTTGACATCTTTCATACTGGTCCTTAATAGAGTTATTTACCAAGCAGTCAATGGGAAAGTCACaaaggaaatatatttttatgaaagttTGCTACCAAAtcgttttgggtcaccattgacatCCATAGTGggacaaaaaaatactatggaagtcagtggtg

Function

GO:

id name namespace
GO:0002376 immune system process biological_process
GO:0044459 obsolete plasma membrane part cellular_component
GO:0005886 plasma membrane cellular_component
GO:0042611 MHC protein complex cellular_component
GO:0042613 MHC class II protein complex cellular_component
GO:0098796 membrane protein complex cellular_component
GO:0098797 plasma membrane protein complex cellular_component

KEGG:

id description
ko04640 Hematopoietic cell lineage
ko04612 Antigen processing and presentation
ko04658 Th1 and Th2 cell differentiation
ko05310 Asthma
ko05320 Autoimmune thyroid disease
ko05330 Allograft rejection
ko05332 Graft-versus-host disease
ko04940 Type I diabetes mellitus

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043229631.1 False 2445 mRNA 0.42 5 1812971 1816106
XM_043229632.1 True 2743 mRNA 0.41 5 1793955 1816106
XM_043229633.1 False 2000 mRNA 0.36 6 1793870 1796906
XM_043229634.1 False 2393 mRNA 0.42 5 1813010 1816105

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122332307 NA coding upstream 4546 1786546 ~ 1789324 (+)
nr1i2 nr1i2,LOC107715907,LOC107661291 coding upstream 124924 1647479 ~ 1668946 (+)
cfap91 maats1,LOC107551982,LOC107559508,LOC107721571 coding upstream 147272 1634177 ~ 1646598 (+)
sik1 sik1,LOC107715911,LOC107557923,LOC107559505,LOC107721609 coding upstream 252019 1531606 ~ 1541851 (+)
LOC122332318 fmnl2,fmnl2a,LOC107688848,LOC107705607,LOC107566322,LOC107660092,LOC107745270,LOC107559537,LOC107657404 coding upstream 306236 1446645 ~ 1487634 (+)
si:ch211-141e20.2 NA coding downstream 3770 1819876 ~ 1829982 (+)
fgf9 LOC107688669,LOC107572408 coding downstream 28703 1844809 ~ 1847284 (+)
tmprss3a tmprss3,LOC107748899,LOC107713697 coding downstream 33464 1849570 ~ 1861337 (+)
wdr4 LOC107748892,LOC107661303,LOC107551989,LOC107713721 coding downstream 70750 1886856 ~ 1890960 (+)
zgc:152951 LOC107661305,LOC107748888,LOC107551988,LOC107713722 coding downstream 108541 1924647 ~ 1933749 (+)
G173468 NA non-coding upstream 17031 1776301 ~ 1776839 (+)
G173454 lrrc58b,lrrc58,LOC107721825,LOC107559501,LOC102790154,LOC107715899,LOC107688662,LOC107551992 non-coding upstream 46065 1739368 ~ 1747805 (+)
G173465 NA non-coding upstream 59115 1733523 ~ 1734755 (+)
G173449 NA non-coding upstream 101963 1669552 ~ 1691907 (+)
G173410 NA non-coding upstream 241443 1542535 ~ 1552427 (+)
G173477 NA non-coding downstream 19724 1835830 ~ 1838337 (+)
si:ch211-214p13.7 NA other upstream 173418 1616609 ~ 1620452 (+)
si:ch211-214p13.8 NA other upstream 195136 1590384 ~ 1598734 (+)
G173275 fmnl2a,LOC107745270,LOC107671284,LOC107657404,LOC107737514,LOC107591117,LOC107673110,LOC107593905,LOC107716156,LOC107668346 other upstream 347875 1206216 ~ 1445995 (+)
G173493 NA other downstream 98692 1914798 ~ 1917331 (+)
G173505 NA other downstream 147105 1963211 ~ 1964710 (+)

Expression


Co-expression Network