G188633



Basic Information


Item Value
gene id G188633
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NW_025048363.1
NCBI id JAEQBD010000708.1
chromosome length 203102
location 139162 ~ 157964 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>TU279880
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>TU279881
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>TU279882
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU279880 False 1332 lncRNA 0.38 2 139162 157964
TU279881 True 5018 lncRNA 0.37 3 152748 157964
TU279882 False 1757 lncRNA 0.35 3 139162 157964

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC122335326 LOC107572768,LOC107756192,LOC107567524,LOC107686811,LOC107563091,LOC107557625,LOC107557627 coding downstream 24596 111147 ~ 114566 (-)
G188605 NA non-coding downstream 97059 41827 ~ 42103 (-)
G188642 NA non-coding upstream 615 158579 ~ 158808 (-)
G188644 NA non-coding upstream 5930 163894 ~ 165447 (-)
G188645 NA non-coding upstream 8005 165969 ~ 166664 (-)
G188646 NA non-coding upstream 8730 166694 ~ 166944 (-)

Expression



Co-expression Network


Homologous


species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G299609 NA non-coding CI01000086 null 2547583 ~ 2606396 (-)
tiger barb (Puntius tetrazona) G64228 NA unknown NC_056706.1 CM032075.1 14779531 ~ 14781710 (-)