cdkn1d (LOC107699204,LOC107719868,LOC107562144,LOC107601015,LOC107758204,LOC107687563)



Basic Information


Item Value
gene id cdkn1d
gene name LOC107699204,LOC107719868,LOC107562144,LOC107601015,LOC107758204,LOC107687563
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056702.1
NCBI id CM032071.1
chromosome length 29200999
location 15565499 ~ 15655278 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>TU42719
taatatttttttatttgaataatttgaagCTATTAATTCCATTAATTGAATGAAAATTTACTCTTGCAAAATcaactgaacattttaaaatcataactaaatgaaaaagaaattactgagagcataaaatgaaaaataaaatgaaagcgatttactaaaactaaaaatttagtTCCCTCATTTTACTAAATCATACGCTTTATTTGCTAATTCGTTGCCTTATTGTGATAAATGTTGCACACAATTTACTAATTCATTCTCTCATTCATAAATCGTGTGCAAGATTTAGCAAATCAAGGGAACAAAATAGTAAATGGTGCACACGATTTagccaattttttttgtttttttttttcaaaatgtaggaatgcactatataaatagtgtgttaataattttttgttgtgcACTGAATATTCAGTATCTATACACAAACAATTACTGTGAACTGTTTACAGAAATGCACTATAGAAAGACTGTTTGGTCATAAAATTTAAACTTTTCAGATTCAAAATGCATCGATAACCGACATCAGTGTGCATAATCTATAAGCTAACAGTGTCATACCATTATTCtggtctgcttttatttattttctagtttttattacaaaaaaagggtaacactttagtttggGGTCCAGTTATAACAATGTAtaattactagcatattggctgtttattagtacttattaatgccttattctgcattaTCATTTTTTAGGTTATTTAATCTACTGCATATCCAAACTTCactaccttattaactattaataaaaggGCTTATtaggatttttaaaattaggattgtattgaggcaaaagtcatagacGGTCCCCAAACTAAAATGTGACCCAAAAAAATGATGTATCCTGAgccattaatgtttttaatgaagcatgttaaaaatgacagttgATGCGACTCTCTTGTTATAGACATAAGATATGCTTTGATATCTTTGAAGTTATATTAACCAAAATTTataatcatgtttaaaaaaggatattgccttttaaaatatttttttgggtACTGGCCAATCTGACAAGTGTGCATGAGGTCTTGCAGACCTGGGGAAAACTGAATATGTAtcttaagtttaagtttaagttttacTTTAAGCATTAGCATATCAATCGCAAGGTCATTGTAACCAATCATTTGTACAGTAattttaatactgtatttttgctttGTGCATGTGGAGATATAACGTATAAGATGTGCTTgagatttgacattttttgatattaaaaaggCAGCTGATGTAATTAACAAAAGCAATTTCTCCACAATAAATAGGATGCTTAAAAGTAAttgtatgcaatttttttttacctttttatttcttagtTTTAGAATCATTCTaatgattcattgatttataACGAAGCTGTtgtcttctgtttctttcatacattcatttatgttttcaaGTAGGCTATGTAATTCTTTTGAGCGGGTCCAGAGTTCAGTGTAAAAGGCAGATTGCTTATGTTAACAAGCAGCGCACTAGGCACATCGTTTTATGTTATACAGCCACCCACTGTATATACTGAGCGATATATTTAGAACATGCAGTTCCACTCACAAATTTGcagaaatacacaaaacaacaaagagTTGCTTTAAAGTCCTGTTAAATTAAGCCCACATTCCCCTAAACTGCAGAATTAGTTTGGAGACTTCAAAAATTcggatatattttttttcttgccttCATTCAAAGTTCACTCGGTTACTCTTAAAGCAGTCCATTAAATTgtaatcttttcaaaatatgttcataataatatattagtgctCTACCTCATCAACTGACAAGGACCTTCAGtttttacacacatatgtacatatattaaaaaagtaaaatgtagcAGTTTTTATCATGgatgcactgtttttttttttttttttatcaagtatTTTGCATAAGGTTTACAACCtgttgtgtgtgtactgttatttgtttagaaaaaaaacaaaaaaacaaaacggttGCCTTATTCTGTGCCAGGAAGTGcctctataatttttttaaatttgtattatgaTCTACATGTTGGCATAAATGATGACATTACCAGCTTCTGTTGCAGATTtgtcaaaagtatttttttttacatggtaTCTTGGGAATTAGTAGCTATGTGTACTCATATCATATTACTtgttaaaacatgttaatgCTAGCTGACTTCACATTTTGAATTATGTAAATTTGTATGTAAAAGTCACCTATAAAATGTATGCAC
>TU42722
GGGGCTCCTCCCCGTCACGTTGCACATCAACGTGACTGGAGTTCTTGGGCGCGCGCCCGAGCTGATCTTGACAAGAGCAAAACACTGAATGTGTGTCACGCGCGGGGGTTCTGGGGGATTTGACCTACTTTCCACAGAAACCTAGCTGCAGCGTTTAGACGTGGAAAAGGAACATGTCCATGATACGAGATGCATGTTATTTTGGGCTGCTGGAAGGGCAGGAAGAGGACATTAAGCCTCAGACGGCAGTGGTTCGGCGGAACCTGTTTGGCCCAGTGGACCACCAGCAGTTACAGCAGGACTTCCAGAGGCTATTCTGCATGAATGTGGAGATCGCCAAACAGCGCTGGAACTTTGACTTTCAGATGGACCAACCAGTCCCAGGGTGCATTGAGTGGGAGGAGCTGCGGTGCCAGGATGTGCCAGTGTTTTACCATAGCTGTGTATTCAGGCACGGTGTGGCAAAGCAAACGGTGGAAGCTTGTTCGTCTCCAGCTATGGCCACAGAGAAGTATCTGGAGCTGCGAACCCGAGGACCTCTGAGGGGAACCAAGCAAGAGAAGAGAATGGCTGCATTGCAAGGGGTCAAACGCAAACAAGCAAGCATCACAGACTTTTTCAGAGTGACAAAAAGAAGATTTCCTGATCACAAAGCTTCATCAGGACAGTAATAGACATTGGACCTTTATTATATAAGTGTAAATACACTATCTGCACAAGTAGCTTTTCTAACTGACCAGAAAAGGCTTAATAGGatgtatataatgtacatagacaaacatgcatacaaacatacaaacacacacacacacacacacacatacatatatatatatatattatatgcaCAAATGTGTGTCTATTTTTTTACCAAGTGCAGTACCTATTAAAGGTACCTATTTTATTGTTACAACATGGAATCAggtgaaaaaagtaatttgaagCTATTAATTCCATTAATTGAATGAAAATTTACTCTTGCAAAATcaactgaacattttaaaatcataactaaatgaaaaagaaattactgagagcataaaatgaaaaataaaatgaaagcgatttactaaaactaaaaatttagtTCCCTCATTTTACTAAATCATACGCTTTATTTGCTAATTCGTTGCCTTATTGTGATAAATGTTGCACACAATTTACTAATTCATTCTCTCATTCATAAATCGTGTGCAAGATTTAGCAAATCAAGGGAACAAAATAGTAAATGGTGCACACGATTTagccaattttttttgtttttttttttcaaaatgtaggaatgcactatataaatagtgtgttaataattttttgttgtgcACTGAATATTCAGTATCTATACACAAACAATTACTGTGAACTGTTTACAGAAATGCACTATAGAAAGACTGTTTGGTCATAAAATTTAAACTTTTCAGATTCAAAATGCATCGATAACCGACATCAGTGTGCATAATCTATAAGCTAACAGTGTCATACCATTATTCtggtctgcttttatttattttctagtttttattacaaaaaaagggtaacactttagtttggGGTCCAGTTATAACAATGTAtaattactagcatattggctgtttattagtacttattaatgccttattctgcattaTCATTTTTTAGGTTATTTAATCTACTGCATATCCAAACTTCactaccttattaactattaataaaaggGCTTATtaggatttttaaaattaggattgtattgaggcaaaagtcatagacGGTCCCCAAACTAAAATGTGACCCAAAAAAATGATGTATCCTGAgccattaatgtttttaatgaagcatgttaaaaatgacagttgATGCGACTCTCTTGTTATAGACATAAGATATGCTTTGATATCTTTGAAGTTATATTAACCAAAATTTataatcatgtttaaaaaaggatattgccttttaaaatatttttttgggtACTGGCCAATCTGACAAGTGTGCATGAGGTCTTGCAGACCTGGGGAAAACTGAATATGTAtcttaagtttaagtttaagttttacTTTAAGCATTAGCATATCAATCGCAAGGTCATTGTAACCAATCATTTGTACAGTAattttaatactgtatttttgctttGTGCATGTGGAGATATAACGTATAAGATGTGCTTgagatttgacattttttgatattaaaaaggCAGCTGATGTAATTAACAAAAGCAATTTCTCCACAATAAATAGGATGCTTAAAAGTAAttgtatgcaatttttttttacctttttatttcttagtTTTAGAATCATTCTaatgattcattgatttataACGAAGCTGTtgtcttctgtttctttcatacattcatttatgttttcaaGTAGGCTATGTAATTCTTTTGAGCGGGTCCAGAGTTCAGTGTAAAAGGCAGATTGCTTATGTTAACAAGCAGCGCACTAGGCACATCGTTTTATGTTATACAGCCACCCACTGTATATACTGAGCGATATATTTAGAACATGCAGTTCCACTCACAAATTTGcagaaatacacaaaacaacaaagagTTGCTTTAAAGTCCTGTTAAATTAAGCCCACATTCCCCTAAACTGCAGAATTAGTTTGGAGACTTCAAAAATTcggatatattttttttcttgccttCATTCAAAGTTCACTCGGTTACTCTTAAAGCAGTCCATTAAATTgtaatcttttcaaaatatgttcataataatatattagtgctCTACCTCATCAACTGACAAGGACCTTCAGtttttacacacatatgtacatatattaaaaaagtaaaatgtagcAGTTTTTATCATGgatgcactgtttttttttttttttttatcaagtatTTTGCATAAGGTTTACAACCtgttgtgtgtgtactgttatttgtttagaaaaaaaacaaaaaaacaaaacggttGCCTTATTCTGTGCCAGGAAGTGcctctataatttttttaaatttgtattatgaTCTACATGTTGGCATAAATGATGACATTACCAGCTTCTGTTGCAGATTtgtcaaaagtatttttttttacatggtaTCTTGGGAATTAGTAGCTATGTGTACTCATATCATATTACTtgttaaaacatgttaatgCTAGCTGACTTCACATTTTGAATTATGTAAATTTGTATGTAAAAGTCACCTATAAAATGTATGCAC
>TU42723
taatatttttttatttgaataatttgaagCTATTAATTCCATTAATTGAATGAAAATTTACTCTTGCAAAATcaactgaacattttaaaatcataactaaatgaaaaagaaattactgagagcataaaatgaaaaataaaatgaaagcgatttactaaaactaaaaatttagtTCCCTCATTTTACTAAATCATACGCTTTATTTGCTAATTCGTTGCCTTATTGTGATAAATGTTGCACACAATTTACTAATTCATTCTCTCATTCATAAATCGTGTGCAAGATTTAGCAAATCAAGGGAACAAAATAGTAAATGGTGCACACGATTTagccaattttttttgtttttttttttcaaaatgtaggaatgcactatataaatagtgtgttaataattttttgttgtgcACTGAATATTCAGTATCTATACACAAACAATTACTGTGAACTGTTTACAGAAATGCACTATAGAAAGACTGTTTGGTCATAAAATTTAAACTTTTCAGATTCAAAATGCATCGATAACCGACATCAGTGTGCATAATCTATAAGCTAACAGTGTCATACCATTATTCtggtctgcttttatttattttctagtttttattacaaaaaaagggtaacactttagtttggGGTCCAGTTATAACAATGTAtaattactagcatattggctgtttattagtacttattaatgccttattctgcattaTCATTTTTTAGGTTATTTAATCTACTGCATATCCAAACTTCactaccttattaactattaataaaaggGCTTATtaggatttttaaaattaggattgtattgaggcaaaagtcatagacGGTCCCCAAACTAAAATGTGACCCAAAAAAATGATGTATCCTGAgccattaatgtttttaatgaagcatgttaaaaatgacagttgATGCGACTCTCTTGTTATAGACATAAGATATGCTTTGATATCTTTGAAGTTATATTAACCAAAATTTataatcatgtttaaaaaaggatattgccttttaaaatatttttttgggtACTGGCCAATCTGACAAGTGTGCATGAGGTCTTGCAGACCTGGGGAAAACTGAATATGTAtcttaagtttaagtttaagttttacTTTAAGCATTAGCATATCAATCGCAAGGTCATTGTAACCAATCATTTGTACAGTAattttaatactgtatttttgctttGTGCATGTGGAGATATAACGTATAAGATGTGCTTgagatttgacattttttgatattaaaaaggCAGCTGATGTAATTAACAAAAGCAATTTCTCCACAATAAATAGGATGCTTAAAAGTAAttgtatgcaatttttttttacctttttatttcttagtTTTAGAATCATTCTaatgattcattgatttataACGAAGCTGTtgtcttctgtttctttcatacattcatttatgttttcaaGTAGGCTATGTAATTCTTTTGAGCGGGTCCAGAGTTCAGTGTAAAAGGCAGATTGCTTATGTTAACAAGCAGCGCACTAGGCACATCGTTTTATGTTATACAGCCACCCACTGTATATACTGAGCGATATATTTAGAACATGCAGTTCCACTCACAAATTTGcagaaatacacaaaacaacaaagagTTGCTTTAAAGTCCTGTTAAATTAAGCCCACATTCCCCTAAACTGCAGAATTAGTTTGGAGACTTCAAAAATTcggatatattttttttcttgccttCATTCAAAGTTCACTCGGTTACTCTTAAAGCAGTCCATTAAATTgtaatcttttcaaaatatgttcataataatatattagtgctCTACCTCATCAACTGACAAGGACCTTCAGtttttacacacatatgtacatatattaaaaaagtaaaatgtagcAGTTTTTATCATGgatgcactgtttttttttttttttttatcaagtatTTTGCATAAGGTTTACAACCtgttgtgtgtgtactgttatttgtttagaaaaaaaacaaaaaaacaaaacggttGCCTTATTCTGTGCCAGGAAGTGcctctataatttttttaaatttgtattatgaTCTACATGTTGGCATAAATGATGACATTACCAGCTTCTGTTGCAGATTtgtcaaaagtatttttttttacatggtaTCTTGGGAATTAGTAGCTATGTGTACTCATATCATATTACTtgttaaaacatgttaatgCTAGCTGACTTCACATTTTGAATTATGTAAATTTGTATGTAAAAGTCACCTATAAAATGTATGCACAAAGCAATTTATCTGGAAGTATGTCTttatgtgattgtgtgtgtcggaattgaaatagtttttttagtgGTTTATGCAAAATCGGCAATGTTCTTTT
>XM_043236427.1
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>XM_043236428.1
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Function


NR:

description
cyclin-dependent kinase inhibitor 1-like isoform X2

GO:

id name namespace
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GO:0016310 phosphorylation biological_process
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0004861 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity molecular_function
GO:0016301 kinase activity molecular_function

KEGG: NA

RNA


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TU42723 False 2354 lncRNA 0.29 2 15565499 15655278
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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tafa5a fam19a5a,fam19a5,LOC107552289,LOC107689731,LOC107563619,LOC107721159,LOC106609108,LOC103356475 other upstream 1082678 14400029 ~ 14482821 (+)
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Expression



Co-expression Network