LOC122345141 (LOC107752369,LOC107661250,LOC107567461)



Basic Information


Item Value
gene id LOC122345141
gene name LOC107752369,LOC107661250,LOC107567461
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 14292063 ~ 14302381 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>TU53907
CGAAAACGTCTTATTCTTAAGTAGCATGTTTGAATTTTGCAGCATACTTCAGAAATTTTGAGACCCGTTTGCAATCAAGATTCGCTTTATTTATACAGAGATCAGTAACATTAAGTCCCCACAAAACttggttatttatatatttgtgccATAGTTTAATGCCTGAGTACAATAGAAGTAATACAACTGTCGGTCACTCATGCCACTGAACTTTTCAATCTAAAGTCTTAATATTAGTGCACATGCAGGCTATGAAACACAATTATTACTTTGCAtacatcaaatgaaaaaaatacatttaatatatatgataaGAAGCAATTTATCTTCTATCACTTTCGCATTATCAGACCATACGTTgcacttttgtgtgtgtgttccacaTCATCTGAACTGTGGGGAAAATGCATAACTTGAATTAGATTATTGTTGCAGATGAAAAAACCATCACTTCATCCAGATAATCCTAAATCCAGTGTctaaaatcaaacattaataTGTACCAAACAATCAATATTACACTGTAATTTCTCACCTGCAATTTGTAAATTGCATAGAAAAGTAAAGCAGCGATAACTGCTTGAATGATATATTTACGAAGTTTCGGTTGATCCTAAAATGGAGAAAAgcatatattattactatatcaATTGTTTCAATAATGCAGAACATACAACaataacagaatataaaaaaatgatgactTATAAATTAACAATACTGTAGACCAAAAACATCTATATCTAcgttcagaatttatttttaattaaataaattaacctacccccaaaacaaaaataaataaacaaataaaaacaaaagctataTATGCATCTTAAAATTATAGCTTCCATAGCTTGTTTTGTCCCTTATTAATGCATggtcaactaaaaaaaaataataattatattgtggTTAAGTGATAATTACTTGAGGCTGAGGCTTGAGATGGAGAACAACTTTGGTCAGTGCCTCATCATTAGTTTTGCATTTCAACAACCCCATGTCTTCATGGAACAGACAGTCCACTGCGAGTACACCTCTCCTGTTTAAATACGTGCCGCTGTCCGGTACAGCCTTTTCACGATCAAATGTGTGATGGAACACCATGAATATAGCTGGTTTGGAAGCTGTTTTAAGATAAGATTGAAATAAgattgaaaatgtgaaaatagtATTCATACATCAATATCTAAGTACTTTTTCTGGTGCCTAGTCTTGAAGTTACCTGGATACGTATTAAGCTCATTCAAAGCAGCATCAATGTCGGTTCCGGCCCGTGAAACAATGGGGCAGAAAACCAGAATCACATCACAGTCTTCTACACTGCGCGTCTCTATCCATCCAGGCCTATGTTTTTGGAGATAACCTAAAACTTCCCTTCGAAAAATGTCCGATTTGCCCATCTCAACTATGAAGAAGTGCTTTCCTTTAAGATCAAGAACATTGTGCGCtgttattttgttgtgtttttgaaacaCGGACTTAAGACAAGGTTATGATTTTTGTGAATGAGTAGCCTAATTAAGACAGAAAAAGATCTTAAGATGCAATTTAAGCCTTATGCAAAGTGTTTCAGAAACATGTCTTGTAATGAATAATGGTTTTCCTTTAATGCTTACTTTATCAGTTCAGTAATCCAGAATCTTACCTTTAATAATTTCACTTTGGTGCTGGATcatatttcttgttttaaattaaCTGTTGTTTTGTCCTGGTTACTTGATTGTTGTTTAATCTTGTCCTGAAACAAATTTGAATGgacttttattaatgtttattaatgtgatcAGTCAGAACTCGATGAAACCAATATTTTCTATCTGCCTTTATCCATGATGCTGATTTTAGCTTAGTCACTGAGGCTGCCCCCTGTATGTGAGAGTCAGTATAACTAGTCTTTATtgctttcactttcattttctttataaaacgTTAAACGCCGACCATTACTGTACCTGTAACATATtcgttttgtttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacagttttcaaaatCGCGCATCATCACatggttttaataattttgacttcacattttaatgactgAAAGCGGAAATCTTTGCTCTCTGCGGTAACGAGGTAGTTATTAGGTAGTCAAACCTAGCGCTACACAAACTAaactacacaaaacacaccGAGAAACGCacaacacactctcacacgaaCAAAAATACACGAATATCACACATGCGTCTCTGTAGGCTGCAGACTGCGTCGGATCTAGCCCACTTACCGCTGCCTGCTGCCTGCTGCGCTCGGAATAAAATCAACaatacagaataaaagtccTTTCGCTTTCTGGGGGCCAAAGATCAGGCTGAAAATGGCAGAGTTTAAGCATATTCAGGACTCCAGCAGCAGCTCACAGAGCGATCTCTACTGTGTACTAAACGAAGATATAAACAGACCGTCTGAAAGGCCGTCACACACAAAGAAAGGTGGCTTGTGGAGTAAACAACATTGCTTTCTTCTGATGTGTGGCACTGTCATACTTTTCTCGGCTCTGTTAATCACAGTGTCTGTAAAATtgactGAAGTGGCCAATCAACAAGACCTGACAAAACACCAATACAGTAAACTGATTGAGATAGAGAATGAAGTGGCAAATCTGACATTGTCTTTAGCTTTGCTTTCTTCAAACCAACAAGATATATATGACAGATTTATCGAGATGTTTGGTGAACTGAAAGCTGATCTGAAGAGCAGGATAACAAATTTGACTCAGCGTAAGCAGtatcattataaattattaatacttttagcctaaatatagtatattgtgtttctctctgttcCTGTTCTTCTACCCTTTTTGCCCAGGTTTCTTGTTAAGGAAATAGTtaacctgaaaataaaaattaccatATGATAACTGTTCCTAGCGTCAAGGTCTCAACCATTTACTGCCTCTATTAAGCTtggcaaagcattttttttatatatatataactcccTCTGTTTTCATCTAAAACGAATATTTGTATAGACCTGGCTTGAGAGGAAGTAAGTcattatataattttcattttaaggtgaaccatccctttagtTTACCTATTTTATATGCTCCcagtttttttcagttctttgCCAGTTATTGCAGTTGCTGTTGGTCAAGTTAATAGACTGTATAATACCTCTTCTACAGTGATTAGCCAATCCTTGTGGATTtatggtaaaataatatttgaatctTCTTCCGTGTGACAGAACAAGTGGCCCAAATAATGAGTAAActgctgtgattttttttgtttgtttattgctcATTGTCAATCTCCTCTGCCTGGAGCAAAGGATTGCTCCCTTGAGGACCACGAAAGGGAATTTTTAGACCTGGCACCTTGACCTCCGGGGATCTTCGTCGTGTTTGTCGAGTGGTTGCTGGTGTTCTGTGGATCGCATTTTACCATTGACGCCAAAGAACATCACGAGCCCCACTTCCAAGACTGGTCCTGCCATCATCAGCTTGGAGTAATTGCCTGTGCCCATCACAGACAGAGAGCCAGAGCCTGCCGTGATAGAAGAGCCATGGAATGACACATCTGACCAGATAAACCTGTTCTAAACTGCAAAGCTGGGTGGCAACTTTTTCTTTCCAACTGCTATCAATTTTCCAGTAATAAAGTGAGCTGGCAAACAGCGCGTTCATACTGCGATGGACAAGGGACCCTGCTGCTCATTCTGGGGGAGGACTCCAGGGAGTGGGATTTTATTGTGAAACACGCTGTCCATTCCTCTCAATCCTACTGGATTGGTCTGACAGATGCTATAACTGGCCACTGGAGATGGGTTGATGGAACACCGTACACCATGAACAGCAGGCACtGGGAACCTGGTGAACCAAATAATTGGTTGGGTGAAGAGGACTGTGGAGAACTAACCACATCTGGAAAACTGAATGATGGCCACTGCTCCaaaaatttcagttttatctGTAAAGCACCAGCTAATGAAAACTAACTAGTAATTATATAACTGTACTGTAATGCAGGTAAAACAgtactaatattctaataaatatacagaatgGTATGGTGagtattaaaaaatactatatataatatgacGCATCCCCTGCACTTTAAAAACAGGTGAATCTGTCCCCCGGCCTTTTTTAAATGCCCCATTACCAGTATTTCCTCCCGTGTTCCCTGATTTGTTGCTTATTTGAGGGAATTAACATTAAGCCAATCACAAGGCGAATCATCTCTTGGGTGCATCTTCTGTTGCTTTTGcaatttctttcattcatttaattcttTGCTCTGTGCTGGTCCAGGGTGAAATGCACCCAAGAAAAAGCAGAAGGCAATTACGTCTTTCATTCAAAGTGCATTATGTGTGTTAAATATGACCACAAAACTCTTATAGGACATGTGTATTTGtagccaaaaacacattgtatgggtcaaaattcttaaagatcatgttccatgaagatattttgtaaatgtttgattagtaatatgcattgacttttatttggaccattttaaaagtgaatttcaaaaattattattttatttttttagattatattcCAGATTTGCTAAAACTCAACTAAATATTGTCCTCTCCCAACAAACCAGTAGAcaacttatttattcagctttctaatgatatataaatttcaattaaaaatgtgtgacttgttttgtgctccagggtcacaaatgctCTCCAACCTGTGTCTTGGcaattttaaaaacgactcTCACCATGTTAGAGACAAACTCAATAAATGatctttaaagattttattcttTTGCAAAGAAGGTCAGACAGTCATACAGAAACACAGTTTGCTGCAGAGTGCCACAAAGATGACAGGGCGGTCCTTACTTTTATATCTTGTGTCATCATTCAAGTTTACCATTCTTAATAGCTTTTCCACACATTGATTTTTAAAGGGGATAGAAAAAGTACCATGGATCCTCATGATCTCTTAGGTCAAGGGCAGACACCTATGGTTCCCATCTATTCCTCTCTCAtcagtataaataaattttcCACCACGCCTGCACTGCTTATGTGCGGAGTAGAGTTATTCTTTCTCAATATAGCAAATTTGTCAAAAGCTTATCCTATCATActttatcatatttttgtaaagctCCAATTAGTTttctatttagaatttattatatgaatatgaacTTACTTTCTACATTAAGCACGTCATTTATTAGAGGGTcacatcacctgaaagctgTCAACACCGCTTTGAAAATGGCTGCTACACCCCTGGTCATGGGCATctttcttttagtgttttttttagagTCGTCTCTGTTAACTGTTTTGTGGACACTTTCTACATGCTTTTGGTTCCTTTCTTCCTTTATTCAGTTCAGTTATCAGTTACCTGGTCATTCATTAAGATGACACCTGCCCTTAAACCGTTTCATTAGGtgctctgtgtttttaaattcttCTTGTTTTGCTATTTAGTTCCCCgtattgttttgtcattttcattttcacatctCCGGAACATGCAGTTTGCTATAtactataaaatgcattataatattgtttatggTTTATGTTTTGAGCAGTTGGGGTTgtacaaaaagacaaaataaaagaactGATGCATATATCTGTTTTAATTAGTCTTTATTAGTTCTTTTAAACTCACATGCAATTATTTGAGTGTTTATGGTTCAGTAATTGTTTAACTGTTTATCACAAAACACGTTATTAAAAAGTGAACTTCATGTAGAGGGACATTTTTTTCATAGAATCATGCTTACATAGACACTTATCACAGAATCAAACCTGTTATTAATATTCATCGTTTAATCCTCTATTCATGTGAAGCATTATTATGACATTTACTACAATTACTATTCTTTGCAGCAAGGCAGACAactacaacaacagcaacaaagaTTGTATGTCCATGCACGCAAACGGGACCAGAAAGTCGGCGCAGTCCCACGGTGCTTCTCTAaaacctttttcttcttcttttctcttttgttcgCCTCACTCACTGCAAGCAAGGGATGATCTTCTGCATTCTGGTTTGTGGATGGACAAGGAATTCCTTG
>XM_043238973.1
GTAAACCAAACCAGCAGATTCatcataaaatattgatttattctttgttttttaagaaatgcttAATAATAGTTCTACTTCCCTTTTGAGATCACTGCTATTCAGGACGTTTTGACTGGTTGGTTACATCTTGAAGGATGTGTTTCTTAAATGGAttaccatttttaatttaaaataacacaataaaataaccGCACCTATAGTTTAGGGATATGTAGAAAAAGACATGTTATTTCTGTTTGCAAGGCTGAAAATGGCAGAGTTTAAGCATATTCAGGACTCCAGCAGCAGCTCACAGAGCGATCTCTACTGTGTACTAAACGAAGATATAAACAGACCGTCTGAAAGGCCGTCACACACAAAGAAAGGTGGCTTGTGGAGTAAACAACATTGCTTTCTTCTGATGTGTGGCACTGTCATACTTTTCTCGGCTCTGTTAATCACAGTGTCTGTAAAATtgactGAAGTGGCCAATCAACAAGACCTGACAAAACACCAATACAGTAAACTGATTGAGATAGAGAATGAAGTGGCAAATCTGACATTGTCTTTAGCTTTGCTTTCTTCAAACCAACAAGATATATATGACAGATTTATCGAGATGTTTGGTGAACTGAAAGCTGATCTGAAGAGCAGGATAACAAATTTGACTCAGCATAAACCTGTTCTAAACTGCAAAGCTGGGTGGCAACTTTTTCTTTCCAACTGCTATCAATTTTCCAGTAATAAAGTGAGCTGGCAAACAGCGCGTTCATACTGCGATGGACAAGGGACCCTGCTGCTCATTCTGGGGGAGGACTCCAGGGAGTGGGATTTTATTGTGAAACACGCTGTCCATTCCTCTCAATCCTACTGGATTGGTCTGACAGATGCTATAACTGGCCACTGGAGATGGGTTGATGGAACACCGTACACCATGAACAGCAGtcagtGGGAACCTGGTGAACCAAATAATTGGTTGGGTGAAGAGGACTGTGGAGAACTAACCACATCTGGAAAACTGAATGATGGCCACTGCTCCaaaaatttcagttttatctGTAAAGCACCAGCTAATGAAAACTAACTAGTAATTATATAACTGTACTGTAATGCAGGTAAAACAgtactaatattctaataaatatacagaatgGTATGGTGagtattaaaaaatactatatataatatgacGCATCCCCTGCACTTTAAAAACAGGTGAATCTGTCCCCCGGCCTTTTTTAAATGCCCCATTACCAGTATTTCCTCCCGTGTTCCCTGATTTGTTGCTTATTTGAGGGAATTAACATTAAGCCAATCACAAGGCGAATCATCTCTTGGGTGCATCTTCTGTTGCTTTTGcaatttctttcattcatttaattcttTGCTCTGTGCTGGTCCAGGGTGAAATGCACCCAAGAAAAAGCAGAAGGCAATTACGTCTTTCATTCAAAGTGCATTATGTGTGTTAAATATGACCACAAAACTCTTATAGGACATGTGTATTTGtagccaaaaacacattgtatgggtcaaaattcttaaagatcatgttccatgaa
>XM_043238974.1
CTACACACCTAAGCATACTTTCATACGAAGCATGAAAGATGTGGCATTTTCCACATTTTGATGACATCACGAGTCTATATcgcaaacaaataatttttgGCTGAAAATGGCAGAGTTTAAGCATATTCAGGACTCCAGCAGCAGCTCACAGAGCGATCTCTACTGTGTACTAAACGAAGATATAAACAGACCGTCTGAAAGGCCGTCACACACAAAGAAAGGTGGCTTGTGGAGTAAACAACATTGCTTTCTTCTGATGTGTGGCACTGTCATACTTTTCTCGGCTCTGTTAATCACAGTGTCTGTAAAATtgactGAAGTGGCCAATCAACAAGACCTGACAAAACACCAATACAGTAAACTGATTGAGATAGAGAATGAAGTGGCAAATCTGACATTGTCTTTAGCTTTGCTTTCTTCAAACCAACAAGATATATATGACAGATTTATCGAGATGTTTGGTGAACTGAAAGCTGATCTGAAGAGCAGGATAACAAATTTGACTCAGCATAAACCTGTTCTAAACTGCAAAGCTGGGTGGCAACTTTTTCTTTCCAACTGCTATCAATTTTCCAGTAATAAAGTGAGCTGGCAAACAGCGCGTTCATACTGCGATGGACAAGGGACCCTGCTGCTCATTCTGGGGGAGGACTCCAGGGAGTGGGATTTTATTGTGAAACACGCTGTCCATTCCTCTCAATCCTACTGGATTGGTCTGACAGATGCTATAACTGGCCACTGGAGATGGGTTGATGGAACACCGTACACCATGAACAGCAGtcagtGGGAACCTGGTGAACCAAATAATTGGTTGGGTGAAGAGGACTGTGGAGAACTAACCACATCTGGAAAACTGAATGATGGCCACTGCTCCaaaaatttcagttttatctGTAAAGCACCAGCTAATGAAAACTAACTAGTAATTATATAACTGTACTGTAATGCAGGTAAAACAgtactaatattctaataaatatacagaatgGTATGGTGagtattaaaaaatactatatataatatgacGCATCCCCTGCACTTTAAAAACAGGTGAATCTGTCCCCCGGCCTTTTTTAAATGCCCCATTACCAGTATTTCCTCCCGTGTTCCCTGATTTGTTGCTTATTTGAGGGAATTAACATTAAGCCAATCACAAGGCGAATCATCTCTTGGGTGCATCTTCTGTTGCTTTTGcaatttctttcattcatttaattcttTGCTCTGTGCTGGTCCAGGGTGAAATGCACCCAAGAAAAAGCAGAAGGCAATTACGTCTTTCATTCAAAGTGCATTATGTGTGTTAAATATGACCACAAAACTCTTATAGGACATGTGTATTTGtagccaaaaacacattgtatgggtcaaaattcttaaagatcatgttccatgaa

Function


NR:

description
PREDICTED: C-type lectin domain family 10 member A-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU53907 True 6082 TUCP 0.36 10 14292063 14302381
XM_043238973.1 False 1544 mRNA 0.39 9 14293749 14299801
XM_043238974.1 False 1397 mRNA 0.40 9 14293749 14299976

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC122344799 nyap1,LOC107746410,LOC107599218,LOC101885998,LOC107596102,LOC107661215,LOC107734142 coding downstream 17926 14240339 ~ 14274137 (-)
atp1b2b LOC107746408,LOC107599200,LOC107663400,LOC107596104,LOC107661212,LOC107734137 coding downstream 53717 14225990 ~ 14238346 (-)
chrne chrne,LOC107663376,LOC107599201,LOC108428951,LOC108260097,LOC106603603 coding downstream 71983 14212659 ~ 14220080 (-)
pld2 pld2,LOC107746406,LOC107663402,LOC107734122,LOC107661209,LOC107596108 coding downstream 79746 14191695 ~ 14212317 (-)
mink1 mink1,LOC107746403,LOC107596107 coding downstream 101591 14156523 ~ 14190472 (-)
cnot6l cnot6l,LOC107752360,LOC107663397,LOC107567468,LOC107746779 coding upstream 31837 14334218 ~ 14346680 (-)
paqr3a paqr3a,paqr3,LOC107661222,LOC107567467,LOC107599192,LOC107663396 coding upstream 191208 14493589 ~ 14500572 (-)
antxr2a antxr2,antxr2a,LOC107663391,LOC107746853,LOC107661223,LOC107602005,LOC107744869 coding upstream 271174 14573555 ~ 14616878 (-)
prkg2 prkg2,LOC107746786,LOC107599184,LOC107744862,LOC107602032 coding upstream 403996 14706377 ~ 14717330 (-)
rasgef1ba rasgef1ba,rasgef1b,LOC107599189,LOC107663389,LOC107744864,LOC107746854 coding upstream 416143 14718524 ~ 14778259 (-)
G36385 LOC107596209,LOC107734118,LOC107661259 non-coding downstream 314993 13975352 ~ 13977070 (-)
G36337 NA non-coding downstream 472729 13818248 ~ 13819334 (-)
G36297 NA non-coding downstream 578643 13712680 ~ 13713420 (-)
G36224 LOC107700249,LOC107746377,LOC107548465,LOC107710575,LOC105912484,LOC105027847,LOC106603104,LOC106563440 non-coding downstream 580104 13708100 ~ 13711959 (-)
G36279 NA non-coding downstream 654740 13633670 ~ 13637323 (-)
G36561 NA non-coding upstream 8243 14310624 ~ 14310860 (-)
G36562 NA non-coding upstream 8581 14310962 ~ 14311328 (-)
G36537 NA non-coding upstream 9387 14311768 ~ 14320994 (-)
G36567 NA non-coding upstream 46727 14349108 ~ 14349936 (-)
LOC122344807 NA non-coding upstream 161923 14464304 ~ 14467777 (-)
znhit1 znhit1,LOC107752359,LOC107661214,LOC106567874 other downstream 9443 14279674 ~ 14282620 (-)
rnf214 LOC107663407,LOC107746393,LOC107599207,LOC107596114,LOC107734124,LOC107661199,LOC107599223 other downstream 235358 14040982 ~ 14056705 (-)
tmprss13b LOC107746439,LOC107663381,LOC107599230 other downstream 282527 14001934 ~ 14009536 (-)
LOC122345901 NA other downstream 443993 13845403 ~ 13848070 (-)
G36336 NA other downstream 473121 13817742 ~ 13818942 (-)
pdzd2 pdzd2,LOC107746802,LOC107681406,LOC107661237 other upstream 903570 15205951 ~ 15264945 (-)
zfr zfr,LOC107746805,LOC107681158,LOC107552600,LOC107602019 other upstream 991475 15293856 ~ 15308440 (-)
npr3 LOC107681138,LOC107746807,LOC107552598,LOC107602007,LOC107708637,LOC107661273 other upstream 1047635 15350016 ~ 15367413 (-)
alkbh2 alkbh2,LOC107746816,LOC107552593,LOC107676640 other upstream 1265638 15568019 ~ 15578967 (-)
cenpv cenpv,LOC107718355,LOC107676655,LOC107746825,LOC107680877,LOC107553589,LOC107552586 other upstream 1401152 15703533 ~ 15709430 (-)

Expression



Co-expression Network