alkbh2 (alkbh2,LOC107746816,LOC107552593,LOC107676640)


Basic Information

Item Value
gene id alkbh2
gene name alkbh2,LOC107746816,LOC107552593,LOC107676640
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 15568019 ~ 15578967 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU54482
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Function

symbol description
alkbh2 Predicted to enable DNA-N1-methyladenine dioxygenase activity; cytosine C-5 DNA demethylase activity; and ferrous iron binding activity. Predicted to be involved in DNA dealkylation involved in DNA repair and oxidative DNA demethylation. Predicted to act upstream of or within DNA repair. Orthologous to human ALKBH2 (alkB homolog 2, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase).

NR:

description
DNA oxidative demethylase ALKBH2

GO:

id name namespace
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GO:0016706 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity molecular_function

KEGG:

id description
K10859 ALKBH2; DNA oxidative demethylase

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122345695 LOC107718358,LOC107553579,LOC107676641,LOC107680767,LOC107746876 other upstream 267069 15846036 ~ 15847036 (-)

Expression


Co-expression Network