CI01000004_14815294_14818132


Basic Information

Item Value
gene id CI01000004_14815294_14818132
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000004
NCBI id null
chromosome length 17451736
location 14815142 ~ 14821516 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>CI01000004_14815294_14818132.mRNA
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>TU39193
TCTTTTTCTTCCTACAGTGCAAACATGACGATCCTTTGTGTTCTGCTTCTGCTATTGTTGATGAAAAGGGAGACATTTGCACAGTCAATAACACCGCTGGAAAACAAGGTGCTTAAATCTGCAGGAGACGAAGTCACTCTGTCCTGTAAATATAATGGATCTGTAAATAACCTGCACTGGTATCGTCAGTATCCGGGATCCAAACCAGAGTTCCTCGCAATAATTTATCCACATGGAGCCACAAGTAACCCTCTTCCT

Function

NR:

description
T-cell receptor alpha variable region, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
CI01000004_14815294_14818132.mRNA False 4478 mRNA 0.17 4 14815142 14821516
TU39193 True 258 lncRNA 0.43 2 14817726 14818156

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000004_14809409_14811408 NA coding downstream 3433 14809223 ~ 14811709 (-)
CI01000004_14808034_14808645 NA coding downstream 6173 14807938 ~ 14808969 (-)
CI01000004_14802126_14805324 NA coding downstream 9404 14801301 ~ 14805738 (-)
CI01000004_14794085_14794548 NA coding downstream 20549 14794032 ~ 14794593 (-)
CI01000004_14775109_14792782 NA coding downstream 22358 14774282 ~ 14792784 (-)
CI01000004_14827536_14831360 NA coding upstream 5980 14827496 ~ 14831526 (-)
CI01000004_14832429_14839825 NA coding upstream 10635 14832151 ~ 14840019 (-)
CI01000004_14843132_14843640 NA coding upstream 21397 14842913 ~ 14843979 (-)
CI01000004_14846825_14850092 NA coding upstream 25269 14846785 ~ 14851531 (-)
CI01000004_14860344_14863053 NA coding upstream 38770 14860286 ~ 14863448 (-)
G34478 NA non-coding downstream 8636 14806001 ~ 14806506 (-)
CI01000004_14770317_14773615 NA non-coding downstream 43541 14770286 ~ 14774000 (-)
CI01000004_14758580_14768474 NA non-coding downstream 46611 14758528 ~ 14768680 (-)
CI01000004_14756092_14758171 NA non-coding downstream 56912 14755814 ~ 14758237 (-)
G34474 NA non-coding upstream 16173 14837689 ~ 14838322 (-)
G34468 NA non-coding upstream 64309 14885825 ~ 14888056 (-)
G34470 NA non-coding upstream 68176 14889692 ~ 14893295 (-)
G34550 NA non-coding upstream 88565 14910081 ~ 14912736 (-)
G34558 NA non-coding upstream 99552 14921068 ~ 14921339 (-)
CI01000004_14749034_14751685 NA other downstream 63423 14748304 ~ 14753596 (-)
CI01000004_14742838_14744316 NA other downstream 70806 14742807 ~ 14744507 (-)
G34632 NA other upstream 189845 15011361 ~ 15025221 (-)
G34668 NA other upstream 229660 15051176 ~ 15052775 (-)
CI01000004_15086759_15087492 NA other upstream 265155 15086671 ~ 15087575 (-)
G34718 NA other upstream 459500 15281016 ~ 15281649 (-)

Expression


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