G40711


Basic Information

Item Value
gene id G40711
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 30631028 ~ 30733360 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU60251
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>TU60253
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>TU60254
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>TU60256
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU60251 False 811 lncRNA 0.36 3 30631028 30733360
TU60253 False 2497 TUCP 0.43 2 30650941 30696688
TU60254 True 3544 lncRNA 0.38 3 30679158 30731238
TU60256 False 2201 TUCP 0.44 3 30631028 30696688

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122344972 NA coding downstream 50700 30576288 ~ 30580328 (-)
LOC122344973 NA coding downstream 88588 30540497 ~ 30542440 (-)
LOC122345715 LOC107687242,LOC107717337,LOC107558070 coding downstream 93113 30535834 ~ 30537915 (-)
LOC122345124 si:zfos-128g4.1,LOC107675886,LOC107577831 coding downstream 107609 30520606 ~ 30523419 (-)
mbd2 mbd2,LOC107717343,LOC107565141,LOC108438699,LOC108260323,LOC105902559 coding downstream 119749 30491031 ~ 30511279 (-)
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LOC122344907 NA coding upstream 32271 30765631 ~ 30769907 (-)
rabepk rabepk,LOC107743065,LOC107579283 coding upstream 97829 30831189 ~ 30835734 (-)
LOC122344688 LOC107743064,LOC107698017,LOC107734413 coding upstream 187457 30920817 ~ 30941882 (-)
cux2a NA coding upstream 209154 30942514 ~ 30951488 (-)
G40701 NA non-coding downstream 40388 30590197 ~ 30590640 (-)
G40698 NA non-coding downstream 60928 30567251 ~ 30570100 (-)
G40672 NA non-coding downstream 64872 30565684 ~ 30566156 (-)
G40670 ythdc2 non-coding downstream 66651 30564117 ~ 30564377 (-)
G40684 NA non-coding downstream 112573 30516065 ~ 30518455 (-)
G40739 NA non-coding upstream 37354 30770714 ~ 30772024 (-)
G40751 hspa5,LOC107687227,LOC107567952 non-coding upstream 87765 30821125 ~ 30846878 (-)
G40762 NA non-coding upstream 132883 30866243 ~ 30919600 (-)
G40760 LOC108429729,LOC107563441 non-coding upstream 187491 30920851 ~ 30925197 (-)
LOC122344700 LOC108429729,LOC107563441 non-coding upstream 187818 30921178 ~ 30925197 (-)
fubp3 fubp3,LOC107689604,LOC107687236,LOC106566971 other downstream 17887 30590843 ~ 30613141 (-)
rnf170 rnf170,LOC107721034,LOC107687247 other downstream 537452 30087966 ~ 30093576 (-)
LOC122344966 LOC107749532,LOC107566852,LOC107742171,LOC107565644,LOC107690083 other downstream 702353 29924702 ~ 29928675 (-)
eng LOC107562335,LOC107704777,LOC107741503 other downstream 975967 29614719 ~ 29655061 (-)
G40182 brinp1,LOC107715673,LOC107674904 other downstream 1140824 29460585 ~ 29490204 (-)
G40713 lzts3,LOC107567954,LOC107687254,LOC107574519,LOC795227,LOC107665914 other upstream 56273 30789633 ~ 30792719 (-)
G40752 hspa5,LOC107686379,LOC107743071,LOC107687227,LOC107567952,LOC107734417,LOC107734415,LOC107686377 other upstream 84372 30817732 ~ 30826358 (-)
LOC122344987 LOC107591496,LOC107663763,LOC107725109,LOC107734348,LOC107563429,LOC107654309 other upstream 597989 31331349 ~ 31350449 (-)
apooa apoo other upstream 969093 31702453 ~ 31711737 (-)
G41035 LOC107734367,LOC107665727,LOC107725151,LOC107591476,LOC107654325,LOC563292 other upstream 987910 31721270 ~ 31722906 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G395826 NA non-coding CI01000229 null 191143 ~ 196557 (+)