LOC122345011


Basic Information

Item Value
gene id LOC122345011
gene name NA
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 15605437 ~ 15611094 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043238710.1
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>XM_043238711.1
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04142 Lysosome
ko05140 Leishmaniasis

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043238710.1 True 3946 mRNA 0.36 8 15605437 15611094
XM_043238711.1 False 3877 mRNA 0.36 7 15605437 15611094

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:dkey-65b12.6 LOC107746818,LOC107680961,LOC107552589 coding downstream 1105 15589884 ~ 15604332 (-)
atxn2 LOC107746814,LOC107680995,LOC107552590,LOC107708645,LOC107676658 coding downstream 50751 15534694 ~ 15554686 (-)
riok2 riok2,LOC107746813,LOC107681048,LOC107676637 coding downstream 70945 15530074 ~ 15534492 (-)
epg5 epg5,LOC107746812,LOC107681055,LOC107676662,LOC107708644 coding downstream 76091 15505966 ~ 15529346 (-)
dnajb5 dnajb5,LOC107746810,LOC107681063,LOC107708641 coding downstream 111767 15480180 ~ 15493670 (-)
LOC122345891 NA coding upstream 3373 15614467 ~ 15616462 (-)
ncor1 ncor1,LOC107676644,LOC107746860,LOC107553567,LOC107680951,LOC107552540 coding upstream 5507 15616601 ~ 15684436 (-)
flot2a flot2,flot2a,LOC107746832,LOC107676660 coding upstream 210775 15821869 ~ 15838717 (-)
LOC122345699 LOC107718358,LOC107553579,LOC107676641,LOC107680767,LOC107746876 coding upstream 231899 15842993 ~ 15843844 (-)
LOC122345991 LOC107718358,LOC107553579,LOC107676641,LOC107680767,LOC107746876 coding upstream 238727 15849821 ~ 15850648 (-)
G36969 NA non-coding downstream 40175 15564098 ~ 15565262 (-)
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G37067 NA non-coding upstream 118109 15729203 ~ 15729893 (-)
G37076 NA non-coding upstream 136428 15747522 ~ 15749497 (-)
G37079 NA non-coding upstream 166619 15777713 ~ 15783005 (-)
G37064 NA non-coding upstream 201821 15812915 ~ 15813933 (-)
alkbh2 alkbh2,LOC107746816,LOC107552593,LOC107676640 other downstream 26470 15568019 ~ 15578967 (-)
npr3 LOC107681138,LOC107746807,LOC107552598,LOC107602007,LOC107708637,LOC107661273 other downstream 238024 15350016 ~ 15367413 (-)
zfr zfr,LOC107746805,LOC107681158,LOC107552600,LOC107602019 other downstream 296997 15293856 ~ 15308440 (-)
pdzd2 pdzd2,LOC107746802,LOC107681406,LOC107661237 other downstream 340492 15205951 ~ 15264945 (-)
LOC122345141 LOC107752369,LOC107661250,LOC107567461 other downstream 1303056 14292063 ~ 14302381 (-)
cenpv cenpv,LOC107718355,LOC107676655,LOC107746825,LOC107680877,LOC107553589,LOC107552586 other upstream 92439 15703533 ~ 15709430 (-)
emc6 emc6,LOC107680863,LOC107746824,LOC107552584,LOC107553592,LOC107552561 other upstream 113933 15725027 ~ 15728108 (-)
fam222ba LOC107552581,LOC107746861,LOC107680853,LOC107676666,LOC107553569,LOC107680837,LOC107552580,LOC107746822,LOC107746829,LOC107680824,LOC107552579,LOC107676664,LOC107553594,LOC107718349 other upstream 131646 15742740 ~ 15808380 (-)
cxcl11.4 LOC107718357,LOC107746875,LOC107553578,LOC107676639,LOC107680777,LOC107552559,LOC107553571 other upstream 229232 15840326 ~ 15841678 (-)
LOC122345695 LOC107718358,LOC107553579,LOC107676641,LOC107680767,LOC107746876 other upstream 234942 15846036 ~ 15847036 (-)

Expression


Co-expression Network